- •Глава 1 история медицинской генетики
- •Глава 2
- •Типы наследственных болезней
- •Груз наследственных болезней в популяциях человека
- •Глава 3
- •Молекулярные основы
- •Генетический код
- •Информационная рнк и процесс транскрипции
- •Биосинтез полипептидной цепи
- •Тонкая структура гена
- •Общая характеристика генома человека
- •Глава 4 мутации в генах как причина моногенных заболеваний
- •Ггт гццлагцгтц тат цца цгг 7тцг цаг ата
- •Функциональные эффекты мутаций
- •Глава 5 моногенные наследственные болезни
- •Концепция фенотипа
- •Правила наследования менделя
- •Особенности проявления менделевских правил наследования в медицинской генетике
- •Аутосомно-доминантное наследование
- •Аутосомно-рецессивное наследование
- •Сегрегационный анализ
- •Механизмы аутосомной доминантности
- •Наследование, сцепленное
- •Генетические механизмы определения пола
- •Наследственные формы тугоухости
- •Тип наследования, ген, локализация
- •Клинические симптомы
- •Тип наследования, ген, локализация
- •Наследственные глазные болезни
- •Наследственные остеохондродасплазии
- •Наследственные заболевания нервной системы
- •Тип наследования, ген, его локализация
- •Т Белок, функции Клинические симптомы ип наследования, ген, его локализация
- •Тип наследования, ген, его локализация
- •Тип наследования, ген, его локализация Клинические симптомы
- •Клинические признаки (кроме атактической походки)
- •Аномаль
- •5.9.6. Наследственные кожные заболевания
- •Т Белок, функции Клинические симптомы ип наследования, ген, его локализация
- •Клинические симптомы
- •5.10. Молекулярная диагностика моногенных наследственных болезней
- •Глава 6 неменделевское наследование наследственных болезней
- •Глава 7 генетическая инженерия и проект «геном человека»
- •Рестрикционные ферменты
- •Рекомбинация фрагментов днк
- •Внедрение фрагментов днк в клетку хозяина с помощью векторов
- •Скрининг клеток-хозяев на рекомбинантный вектор и отбор интересующих исследователя клонов
- •Создание геномных библиотек
- •Клонирование последовательностей днк с помощью полимеразной цепной реакции (пцр)
- •Создание генетической карты генома
- •Создание физической карты генома
- •Некоторые особенности организации генома человека
- •Глава 8 хромосомы человека. Митоз и мейоз. Хромосомные мутации. Хромосомные болезни
- •50 Нм петли образуются нити диаметром 50 нм.
- •Клеточный цикл
- •Численные хромосомные мутации
- •Структурные хромосомные мутации
- •Пери центрическая инверсия
- •Номенклатура хромосомных мутаций
- •8.6. Хромосомные болезни
- •Глава 9 картирование и клонирование
- •Картирование с помощью гибридизации in situ
- •Гибридизация соматических клеток
- •Заболевание (иногда № в omim, если он отличен от номера в omim для гена, вызывающего заболевание)
- •X Тирозинемия, тип 1
- •9.6. Создание моделей наследственных болезней человека с помощью трансгенных животных
- •Глава 10 медицинская популяционная генетика
- •Равновесие харди-вейнберга
- •Глава и мультифакториальное наследование
- •Моногенный контроль метаболизма лекарственных препаратов
- •Генетический контроль
- •Ассоциации между генетическими полиморфизмами и метаболизмом лекарств
- •12.4. Патологические реакции на прием лекарственных препаратов у больных с некоторыми наследственными болезнями
- •Естественный иммунитет
- •Генетическая основа синтеза
- •Генетика рецепторов т-клеток
- •Тип наследования; символ гена, локализация
- •Тип наследования; символ гена, локализация
- •Механизмы превращения протоонкогенов в онкогены
- •Гены-супрессоры опухолевого роста
- •Медико-генетическое
- •15.4. Лечение наследственных болезней обмена веществ
- •Обмена веществ
- •Болезней обмена веществ
- •15*5. Генотерапия
- •Глава 16 этические, правовые
- •Часть 308 Последовательности днк 48 Потеря импринтинга 138 Правила наследования Менделя 61, 63
X Тирозинемия, тип 1
Фумаровая кислота +
+ ацетоукусусная кислота
ние соединения прекращается, а оно само начинает накапливаться, обусловливая иногда токсический эффект. Теоретически так могут быть обнаружены все ферментозависимые реакции на пути превращения любого метаболита через мутации генов, контролирующих синтез соответствующих ферментов. Важно при этом подчеркнуть, что генетический подход предполагает наличие мутаций в генах, имеющих отношение к тому или иному метаболизму.
Анализ генконтролируемых событий для изучения последовательности их осуществления и взаимозависимости был успешно применен не только к метаболическим путям, но и некоторым физиологическим реакциям. Примером может служить система свертывания крови, представленная на схеме 9.2. Из схемы 9.2 следует, что свертывание крови запускается активированием фактора X свертывания крови за счет либо внешнего, либо внутреннего пути активации. «Внешний» путь активации представляет собой комплекс, состоящий из активированного фактора VII свертывания крови, тканевого фактора, белка GLA матрикса и фосфолипидов. Мутации в гене фактора VII, который картирован, как и ген фактора X в 13q34, приводят к его неспособности активировать фактор X и проявляются кровоточивостью. Сходным образом наследственная недостаточность факторов VIII и IX
Крупные точки поставлены у тех белков, мутации в генах которых приводят к их наследственной недостаточности и возникновению синдрома повышенной кровоточивости. Перечеркнуты блокирующиеся в результате наследственных дефектов белков отдельные этапы свертывания крови. Буква «а», стоящая у соответствующего фактора, означает его активированное состояние. Видно, что практически для всех основных белков, участвующих в свертывании крови, известны неактивные мутантные варианты, что позволяет установить последовательность реакций свертывания крови.
Комплекс активации фактора X «внешнего» пути (Фактор VII, •
тканевый фактор, другие факторы)
Ф
> Комплекс активации
к—Фактор V
актор X • Фактор Ха
К
Комплекс активации фактора X «внутреннего» пути
(Фактор VIII, •
Фактор IX, • другие факторы)
Фибриноген* *->Фибрин
Протромбин* -к—►Тромбин
протромбина
(Фактор Va • Фактор Ха • другие факторы)
омплекс белка С(белок С, • белок S, • другие факторы)
►Фактор XIII *
i
Фактор XIHa
Поперечно- связанный фибрин
свертывания крови, являющихся частью комплекса активации фактора X «внутреннего» пути, также блокирует активацию фактора X. Наследственная недостаточность факторов VIII и IX свертывания крови проявляется соответственно гемофилией А и В. Фактор X теряет также способность к активации из-за наличия мутаций в гене этого фактора. Наследственная недостаточность фактора X наследуется как ауто- сомно-рецессивный признак и проявляется эпистаксисом, гемартрозами, гематурией и другими признаками нарушения свертываемости крови.
В норме активированные факторы X и V активируют превращение протромбина в тромбин. Мутации в гене фактора X и фактора V (недостаточность фактора V наследуется как аутосомно-рецессивный признак и проявляется повышенной
кровоточивостью) блокируют этот процесс. Кроме того, известна наследственная недостаточность протромбина, наследующаяся аутосомно-доминантно, при которой нарушается активация протромбина при нормальном содержании факторов X и V.
Протромбин, превращаясь в тромбин, активирует фибриноген и фактор XIII свертывания. Этот процесс блокируется при врожденной афибриногенемии, которая может быть обусловлена мутациями в любом из 3 генов фибриногена (альфа, бета и гамма) и которая наследуется как аутосомно-рецессив- ный признак. Фактор XIII не может активироваться тромбином, когда есть мутации в гене субъединицы А или гене субъединицы В этого фактора. Мутации в генах фибриногенов, а также генах фактора XIII сопровождаются повышенной кровоточивостью, наиболее выраженной при врожденной гипо- фибриногенемии, когда кровь вообще теряет способность к свертыванию.
Таким образом, анализ мутаций в генах белков, участвующих в системе свертывания крови, способствовал расшифровке последовательности событий, которые приводят в конечном счете к образованию сгустка крови и прекращению кровотечения.
На схеме 9.2 показано также, что тромбин может активировать ингибиторы свертывания, представленные белками С и S. Процесс ингибиции свертывания является достаточно сложным, мы не будем здесь касаться его деталей, но заметим, что мутации его отдельных компонентов оказались столь же важными в расшифровке последовательности реакций ингибиции свертывания, как и для процесса свертывания крови.
Мутации генов как инструмент для изучения генетического контроля и молекулярных основ различных признаков и процессов, протекающих в живых организмах, в настоящее время широко используют в самых разных биологических и медицинских дисциплинах. Например, так выглядит список генов, влияющих на поддержание нормальных функций сетчатки (табл. 9.2).
Из табл. 9.2 следует, что к 2002 г. был уже известен 131 ген, мутации в котором специфически нарушают функцию сетчатки. Из них 82 гена, т.е. более половины, уже были клонированы в ходе выполнения программы «Геном человека». Термин «клонирование» означает, что ген картирован, специальными приемами выделен, изучена его структура. Клонирование гена означает также, что известен белок, синтез которого контролируется соответствующим геном.
Приводим табл. 9.3, в которой суммированы данные по идентифицированным генам, вызывающим дегенерацию фоторецепторов, полученные только за 2 последних года.
Таблица 9.2. Гены, обусловливающие поражение сетчатки (модифицировано из: Daiger S.P., Sullivan L.S., Rossiter B.J.F. Cloned and/or mapped human genes causing retinal degeneration or related diseases. http://utsph.sph.uth.tmc.edu/www/utsph/RetNet/ home.htm)
Заболевание |
Число генов |
Число клониро ванных генов |
Синдром Барде—Бидла, аутосомно-рецессивный |
6 |
3 |
Дистрофия палочек и колбочек, аутосомно-доми- нантная |
7 |
3 |
Дистрофия палочек и колбочек, аутосомно-рецес- сивная |
2 |
0 |
Дистрофия колбочек или колбочек и палочек, А'-сцепленная |
1 |
0 |
Врожденная стационарная ночная слепота, аутосомно-доминантная |
1 |
1 |
Врожденная стационарная ночная слепота, аутосомно-рецессивная |
2 |
2 |
Врожденная стационарная ночная слепота, А-сцепленная |
i 2 |
2 |
Врожденный амавроз Лебера, аутосомно-рецессивный |
6 |
4 |
Макулярная дегенерация, аутосомно-доминантная |
8 |
4 |
Макулярная дегенерация, аутосомно-рецессивная |
1 |
1 |
Болезнь развивающегося глаза—сетчатки, аутосомно-доминантная |
1 |
0 |
Атрофия зрительного нерва, аутосомно-доминант- ная |
2 |
1 |
Атрофия зрительного нерва, А'-сцепленная |
1 |
0 |
Пигментный ретинит, аутосомно-доминантный |
12 |
10 |
Пигментный ретинит, аутосомно-рецессивный |
15 |
10 |
Пигментный ретинит, А'-сцепленный |
5 |
2 |
Синдромальная или системная ретинопатия, аутосомно-доминантная |
3 |
2 |
Синдромальная или системная ретинопатия, аутосомно-рецессивная |
12 |
8 |
Синдромальная или системная ретинопатия, А'-сцепленная |
2 |
1 |
Синдром Ашера, аутосомно-рецессивный |
10 |
6 |
Ретинопатия, аутосомно-доминантная |
8 |
3 |
Ретинопатия, аутосомно-рецессивная |
10 |
7 |
Ретинопатия, митохондриальная |
5 |
5 |
Ретинопатия, А'-сцепленная |
9 |
7 |
Всего |
131 |
82 |
Таблица 9.3. Гены, ассоциирующие с прогрессирующей дегенерацией фоторецепторов (из: Clarke G., Heon Е., Mclnnes R.R. Recent advances in the molecular basis of inherited photoreceptor degeneration. Clin. Genet., 2000, 57, 313—329, модифицировано)
Заболевание |
Локус заболе вания |
Картиро ванные гены |
Белки, функция |
Аутосомно- |
RP1 |
RP1 |
Белок с неизвестной функ |
доминантные формы пигмент |
|
(8qll-ql3) |
цией, регулирует уровень ок- сигенации |
ного ретинита |
CORD6 |
RETGC-1 (17р 13) |
Специфическая для палочек и колбочек гуанилатциклаза, необходимая для восстановления нормального уровня cGMP после световой стимуляции |
|
RP27 |
NRL (14ql 1.2) |
Обеспечивает транскрипцию родопсина и других генов сетчатки |
Аутосомно- |
RP19 |
ABCR |
Белок для транспорта метабо |
рецессивные формы пигмент |
|
(1р21) |
литов в наружном сегменте палочек |
ного ретинита |
RP14 |
TULP1 (6р21) |
Функция белка не ясна |
|
arRP |
SAG (2q37.1) |
Аррестин или S-антиген |
|
RP12 |
CRBl (iq3i) RPE65 (1р31) |
Белок, возможно определяющий взаимодействие между клетками Белок, необходимый для образования 11-цис-витамина А. Мутации обусловливают примерно 2 % АР ПР и 16 % врожденного амавроза Лебера |
Л'-сцепленные формы пигмент |
RP3 |
RPGR (Xp21) |
Регулятор ГТФазы |
ного ретинита |
RP2 |
RP2 (Xpll/2) |
Гомология с кофактором С, вовлеченным в складывание бета-тубулина |
Дистрофии палочек и колбочек |
ADCA2 |
SCA7 (3pl3) |
|
Колбочко |
CORD2 |
CRX |
Фоторецептор-специфический |
палочковые, или |
|
(19q 13.3) |
транскрипционный фактор |
колбочковые |
ADCD, |
GUCA1A |
Белок активатор гуанилатцик- |
дистрофии |
COD3 |
(6P21.1) |
лазы |
Врожденный |
LCA1, |
RETGC-1 |
Ретиноспецифическая гуани |
амавроз Лебера |
CORD6 |
(17p 13) |
латциклаза |
|
LCA3 |
CRX (19q 13.3) |
Фоторецепторный транскрипционный фактор |
Заболевание |
Локус заболе вания |
Картиро ванные гены |
Белки, функция |
|
LCA2, RP20 |
RPE65 (1р31) |
Точная функция неизвестна |
Синдром Ашера |
USH1B |
MY07A |
Миозин |
|
USH2A |
USH2A (lq41) |
Новый белок, сходный с лами- нинами |
Макулярная дистрофия Беста |
BMD |
Vmd2 или BMD (1lql3) |
Бестрафин, белок с неизвестной функцией, возможно участвует в транспорте или процессинге липидов |
Из табл. 9.3 следует, что в последнее время было идентифицировано около 20 генов, мутации в которых приводят к дегенерации фоторецепторов. Функция многих белков, контролируемых этими генами, остается не вполне ясной, некоторые белки являются структурными или транспортными, другие участвуют в фототрансдукции.
Механизм фототрансдукции в настоящее время представляется уже достаточно сложным процессом, в котором участвует большое количество белков. Фотоны захватываются оп- синами (родопсин в палочках и опсин в колбочках), для чего в структуре опсинов существуют фоточувствительные хромофоры (11-цис-ретинальдегид). Фотоактивация начинается с абсорбции фотона рентинальдегидом, который, превращаясь в транс-форму, делает родопсин каталитически активным. Активная форма родопсина взаимодействует с трансдуцином. Родопсин также катализирует превращение гуанозиндифос- фата в гуанозинтрифосфат на альфа-субъединице трансдуци- на, что приводит к активации последней. Молекула родопсина может активировать образование нескольких сотен молекул активированного альфа-трансдуцина. Альфа-трансдуцин активирует фосфодиэстеразу с высвобождением ее альфа- и бета-активных субъединиц. Высвободившись, эти субъединицы катализируют гидролиз циклического гуанозинмонофос- фата до 5’-гуанозинмонофосфата. Уменьшение уровня внутриклеточного цГМФ приводит к закрытию ионных каналов, снижению внутриклеточного содержания Са2+. Выброс положительных ионов гиперполяризует фоторецептор, закрывает Са2+ -каналы синапса и уменьшает высвобождение нейротрансмиттера глутамата. Возвращение фоторецептора в тем- новое состояние требует выключения ферментативного каскада и восстановления внутриклеточного уровня цГМФ. Родопсин инактивируется АТФ-зависимым фосфорилировани- ем с помощью родопсинкиназы. Затем фосфорилированный родопсин связывается с аррестином, что приводит к прекращению его взаимодействия с трансдуцином. Уменьшение уровня внутриклеточного Са2+ активирует белок, являющийся активатором гуанилатциклазы,. последняя обеспечивает превращение ГТФ в цГМФ; цГМФ способствует открытию ионных каналов и деполяризации фоторецептора.
В приведенном схематическом описании процесса трансдукции легко увидеть аналогию с метаболическими цепями, и так же как в случае наследственных метаболических заболеваний, наследственные болезни сетчатки проявляют отдельные генконтролируемые этапы сложного процесса фототрансдук- ции. Как следует из данных приведенных выше таблиц, некоторые наследственные болезни сетчатки связаны с мутациями в генах, кодирующих белки фотоактивации. Так, мутации в гене родопсина вызывают доминантную и рецессивную форму пигментного ретинита и стационарную ночную слепоту, мутации в гене фосфодиэстеразы — рецессивную форму пигментного ретинита и стационарную ночную слепоту, мутации в гене альфа-субъединицы цГМФ-контролируемого канала — рецессивную форму пигментного ретинита, а мутации в гене альфа-трансдуцина — стационарную ночную слепоту.
Сходным образом обстоит дело и с наследственными болезнями сетчатки, обусловленными мутациями в генах, кодирующих белки, которые необходимы для возвращения фоторецептора в темновое состояние: мутации в гене родопсинкиназы обусловливают стационарную ночную слепоту, в гене гуанилатциклазы — врожденный амавроз Лебера и дистрофию палочек и колбочек, в гене аррестина — стационарную ночную слепоту, а в гене белка-активатора гуанилатциклазы — аутосомно-доминантную дистрофию колбочек. Таким образом, для перечисленных выше генов, вызывающих прогрессирующую дегенерацию фоторецепторов сетчатки, общим исходным звеном в развитии заболевания является нарушение фототрансдукции, однако непонятно, каким образом это приводит к развитию других клинических проявлений этих заболеваний (в частности, к дегенерации фоторецепторов), как мутации в одном гене могут обусловливать разные по клинике заболевания и, напротив, как мутации в разных генах обусловливают заболевания с практически одинаковыми клиническими проявлениями. Из табл. 9.3, кроме того, следует, что аналогичные по клинике заболевания дают мутации в генах, не имеющих непосредственного отношения к процессу фототрансдукции. Функция значительного числа белков, контролируемых генами и участвующих в обеспечении нормальной функции сетчатки, остается непонятной. Это означает, что наши представления о физиологии световосприятия все еще остаются неполными и требуют коррекции.