- •Введение
- •Генодиагностика
- •Олигонуклеотиды для определения принадлежности бактерий к родам Neisseria, Streptococcus и Haemophilus на основе гена 16s рнк.
- •Олигонуклеотиды для определения серогрупповой принадлежности n. Meningitidis на основе генов, участвующих в синтезе капсулы.
- •Условия амплификации для определения родовой принадлежности возбудителя
- •Условия амплификации для определения серогрупповой принадлежности менингококков
- •Данные, необходимые для вычисления чувствительности и специфичности нового теста.
- •Испытания в модельных экспериментах на бактериальные штаммах.
- •Испытания с использованием клинических образцов спинномозговой жидкости: определение родовой принадлежности возбудителей гбм.
- •Результаты диагностики бактериологическим методом, методом латекс-агглютинации (ла) и с помощью полимеразной цепной реакции (пцр).
- •Определение серогруппы менингококка, вызвавшего гбм.
- •Генотипирование
- •Годы изоляции определенных субгрупп n. Meningitidis серогруппы а, Москва 1969-1997 гг.
- •Серологическая характеристика n. Meningitidis серогруппы а, Москва 1969-1997 гг.
- •Аллели генов, отличающие различные генотипы менингококков серогруппы а, эпидемической субгруппы III.
- •Заключение
- •Литература
Годы изоляции определенных субгрупп n. Meningitidis серогруппы а, Москва 1969-1997 гг.
|
Число штаммов |
|||||
Субгруппа |
III |
X |
VI |
III |
прочие |
всего |
Сиквенс-тип |
СТ-5 |
CТ-74, 75, 76, 77 |
CT-2, 68, 69, 70, 71, 72, 73 |
СТ-7 |
|
|
Годы |
|
|
|
|
|
|
1969-71 |
14 |
|
1 |
|
1 |
16 |
1973-77 |
3 |
|
|
|
|
3 |
1983-85 |
|
21 |
6 |
|
|
27 |
1986-93 |
|
|
24 |
|
|
24 |
1994-95 |
|
1 |
8 |
2 |
1 |
12 |
1996-97 |
|
1 |
1 |
19 |
|
21 |
Всего: |
17 |
23 |
40 |
21 |
2 |
103 |
Существенно, что подобный эпидемиологический анализ не мог быть проведен с помощью серологических методов типирования, поскольку штаммы менингококков субгруппы III, сиквенс-типов 5 и 7, не отличаются по серотипу и серосубтипу (Таблица 6). Менингококки субгрупп X и VI также не дискриминируются по серотипу и серосубтипу. При этом менингококки субгруппы X до настоящего момента не были обнаружены где-либо, кроме Москвы и могли быть эндемичны для данного региона; менингкококки субгруппы VI были ответственны на эндемическую заболеваемость в Москве и Восточной Европе (ГДР) в конце восьмидесятых годов.
Таблица 6.
Серологическая характеристика n. Meningitidis серогруппы а, Москва 1969-1997 гг.
Субгруппа |
Число штаммов и % от общего числа штаммов данной субгруппы |
Серотип |
Серосубтип |
III |
34/38 (89%) |
21 |
P1.20,9 |
VI |
6/39 (15%) |
21 |
P1.10 |
VI |
12/39 (31%) |
4,21 |
P1.10 |
VI |
17/39 (44%) |
4,21 |
P1.5,10 |
X |
17/24 (71%) |
4,21 |
P1.10 |
X |
6/24 (25%) |
21 |
P1.10 |
Периоды преобладания в Москве менингококков субгруппы III совпадают с эпидемией (заболеваемость более 10 случаев на 100000 человек в год в 1969-73 гг.) и крупной вспышкой менингококковой инфекции, поразившей сотни человек (1996). Сравнительный анализ МЛСТ типов и последовательностей гипервариабельных генов iga, tbpB, opaB, opaD, вставочного элемента IS1106 у штаммов менингококков, выделенных в разных странах мира, указывает на то, что как в конце шестидесятых, так и в середине девяностых годов патогенные менингококки субгруппы III могли быть импортированы в Москву из Китая (Таблица 7). Изучение гипервариабельных генов позволяет дополнительно разбить штаммы, относящиеся к субгруппе III, на восемь различных генотипов [Achtman 2001]. Генотип 2, ответственный за эпидемию 1969-75 гг., наиболее близок к генотипу 1, выявленному ранее в Китае. Некоторые авторы (Костюкова и др.) связывают начало эпидемии с прибытием в центральную часть России вьетнамских рабочих, ехавших на поезде через Китай. Генотип 8, выявляемый во второй половине девяностых годов, мог произойти из "пандемического" генотипа 3 путем постепенной эволюции в Китае, где в 1982-1992 гг. выявлялись "промежуточные" штаммы N.meningitidis. Затем генотип 3 начал пандемическое распространение по всему миру.
Таблица 7.