- •Введение
- •Генодиагностика
- •Олигонуклеотиды для определения принадлежности бактерий к родам Neisseria, Streptococcus и Haemophilus на основе гена 16s рнк.
- •Олигонуклеотиды для определения серогрупповой принадлежности n. Meningitidis на основе генов, участвующих в синтезе капсулы.
- •Условия амплификации для определения родовой принадлежности возбудителя
- •Условия амплификации для определения серогрупповой принадлежности менингококков
- •Данные, необходимые для вычисления чувствительности и специфичности нового теста.
- •Испытания в модельных экспериментах на бактериальные штаммах.
- •Испытания с использованием клинических образцов спинномозговой жидкости: определение родовой принадлежности возбудителей гбм.
- •Результаты диагностики бактериологическим методом, методом латекс-агглютинации (ла) и с помощью полимеразной цепной реакции (пцр).
- •Определение серогруппы менингококка, вызвавшего гбм.
- •Генотипирование
- •Годы изоляции определенных субгрупп n. Meningitidis серогруппы а, Москва 1969-1997 гг.
- •Серологическая характеристика n. Meningitidis серогруппы а, Москва 1969-1997 гг.
- •Аллели генов, отличающие различные генотипы менингококков серогруппы а, эпидемической субгруппы III.
- •Заключение
- •Литература
Аллели генов, отличающие различные генотипы менингококков серогруппы а, эпидемической субгруппы III.
|
|
Локус (ген) и его аллель |
|||||
Тип штамма |
Число штам-мов |
tbpB |
iga |
pgm |
IS1106 |
opaB |
opaD |
Генотип 1, СТ-5, Китай 1966 |
3 |
1 |
2 |
3 |
A10 |
92 |
131 |
Генотип 3, СТ-5, первая пандемия: Китай 1984, Западная Европа 1969-85, Бразилия 1973-76 |
43 |
1 |
2 |
3 |
A4 |
92 |
131 |
Генотип 8, СТ-7, третья пандемия: Китай 1993, Монголия 1994-95, Африка 1995-99, Великобритания 1997-2000 |
43 |
55 |
2 |
19 |
A7 |
92 |
131 |
Генотип 2, СТ-5, Москва, 1969-1973 |
14 |
38 |
2 |
3 |
A10 |
140 |
131 |
Генотип 8, СТ-7, Москва, 1994-1997 |
21 |
55 |
2 |
19 |
A7 |
92 |
131 |
Примечательно, что в 1991-99 годах наивысшая заболеваемость менингококковой инфекцией в России регистрировалась в дальневосточных районах, граничащих с Китаем. Быстрое и широкое распространение генотипа 3 указывает на его высокий эпидемический потенциал и должно вызвать настороженность органов эпиднадзора.
Ожидаемый эффект от внедрения метода
Последовательное и широкое применение генотипирования предоставляет принципиально новый инструмент в руки эпидемиолога и, в некоторых случаях, инфекциониста, поскольку морфологические, биохимические и серологические методы типирования дают недостаточно детализированные и трудно поддающиеся стандартизации результаты. В идеале применение генотипирования способно помочь как непосредственно проследить эпидемическую цепочку, так и решать общие задачи эпидемиологии и молекулярной эволюции патогенных микроорганизмов. Обсуждаемые в данном пособии подходы представляют собой только первые этапы создания нового научно-практического направления, которое несомненно получит дальнейшее развитие.
Заключение
1. Обсуждаемые в данном пособии методики являются не заменой традиционных и апробированных микробиологических методик, но их существенным и необходимым дополнением. Широкое применение генодиагностики и генотипирования позволит повысить уровень диагностики менингококковой инфекции и гнойных бактериальных менингитов и предоставит возможность более полного эпидемиологического слежения за распространенностью различных вариантов их возбудителей на территории России.
2. В современных условиях далеко не всякое лечебно-диагностическое учреждение России располагает возможностями для генодиагностики и, тем более, генотипирования бактериальных менингитов, хотя число подобных учреждений неуклонно расширяется. Однако, это не повод для недостаточного внимания к хорошо себя зарекомендовавшим и прогрессивным подходам. ЦНИИ эпидемиологии МЗ РФ готов оказать необходимую методическую помощь для создания специализированных ПЦР-лабораторий и внедрения методов ПЦР-диагностики широкого спектра бактериальных и вирусных инфекций, в том числе ГБМ, а также развивать обмен опытом с учреждениями, уже ведущими ПЦР-диагностику. Интенсивно разрабатываемые и экстенсивно распространяющиеся генетические методы нуждаются в стандартизации, сертификации и контроле качества, что невозможно без широкомасштабного сотрудничества специалистов различного профиля.