Добавил:
Upload Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:
Платонов и др. (2001)_Генодиагностика менингитов.doc
Скачиваний:
10
Добавлен:
13.02.2016
Размер:
310.27 Кб
Скачать

Данные, необходимые для вычисления чувствительности и специфичности нового теста.

 

Результат "общепризнанного" диагностического теста

 

Положительный

Отрицательный

Результат "нового" диагностического теста

 

 

Положительный

Число истинно-положительных результатов нового теста (ИП)

Число ложно-положительных результатов нового теста (ЛП)

Отрицательный

Число ложно-отрицательных результатов нового теста (ЛО)

Число истинно-отрицательных результатов нового теста (ИО)

Специфичность и чувствительность теста не есть его абсолютные и неизменные характеристики. Они непосредственно зависят от материала, на котором испытывается "новый" тест. Кратко говоря, количество предположительно отрицательных и предположительно положительных образцов в материале, на котором испытывается тест, должно приблизительно соответствовать условиям, в которых тест будет применяться на практике [Платонов 2000б]. Не следует путать понятия чувствительности и предела или точности измерения теста. Если ПЦР позволяет обнаруживать до 10 копий генома бактерий в пробе - это именно точность измерения, а не чувствительность ПЦР-диагностики.

Результаты испытаний предлагаемых методик

Испытания в модельных экспериментах на бактериальные штаммах.

В работе были использованы ДНК штаммов N.meningitidis серогрупп А, В, С (35, 47 и 10 штаммов соответственно), выделенных от больных менингококковой инфекцией в 1990-96 гг., а также 38 образцов ДНК иных микроорганизмов, способных вызвать воспалительные процессы на оболочках головного мозга (6 штаммов Haemophilus influenzae, по 1 штамму N.meningitidis серогрупп 29E, W135, X, Y, Z, N. cinereae, N. elongata, N. flavescens, N. gonorrhoeae, N. mucosa, N. sicca, N. subflava, Streptococcus pneumoniae, S. agalactiae, S. milleri, S. mitis, S. mutans, S. pyogenes, S. salivarius, S. sanguis, S. suis, S. viridans, H. parainfluenzae, H. haemolyticus, Escherchia coli, Klebsiella pneumoniae, K. oxytoca, Listeria monocytogenes, Moraxella catarrhalis, Pseudomonas aeruginosa, Proteus mirabilis, Staphylococcus aureus), полученные из коллекций ЦНИИ эпидемиологии, ГИСК им. Л.А.Тарасевича (г.Москва) и Нидерландской референтной лаборатории гнойных бактериальных менингитов.

При постановке ПЦР с помощью "родоспецифических" праймеров не было отмечено ни одной ложно-положительной перекрестной реакции. При этом все штаммы N.meningitidis, H.influenzae, S.pneumoniae, были правильно классифицированы, как относящиеся к родам Neisseria, Streptococcus, Haemophilus, соответственно. Методика позволяла обнаруживать, как минимум, 10 копий бактериального генома на пробу. Напротив, ПЦР с ДНК штаммов, не относящиеся к родам Neisseria, Streptococcus, Haemophilus (то есть штаммами Escherchia, Klebsiella, Listeria, Pseudomonas, Proteus, Staphylococcus) дало отрицательные результаты, даже если подобная ДНК присутствовала в избытке, до 107 копий/мкл. Негативными были также результаты исследования избыточных количеств человеческой ДНК. Таким образом, в модельных экспериментах чувствительность и специфичность предлагаемых методик равнялась 100%.

При постановке ПЦР с помощью серогрупповых праймеров на ДНК штаммов N. meningitidis серогрупп А, В, С во всех пробах точно выявлялось ДНК возбудителя соответствующей серогруппы, при этом не было отмечено ни одной ложно-положительной перекрестной реакции. Методика позволяла обнаруживать, как минимум, 10 копий генома соответствующих менингококков на пробу. ПЦР с ДНК 38 иных микроорганизмов (см. выше) дало отрицательные результаты, даже если подобная ДНК присутствовала в избытке, до 107 копий/мкл. Негативными были также результаты исследования избыточных количеств человеческой ДНК. Таким образом, в модельных экспериментах чувствительность и специфичность предлагаемых методик равнялась 100%.