- •Содержание:
- •История изучения нуклеиновых кислот. Методы молекулярной биологии.
- •Молекулярная биология
- •Строение нуклеиновых кислот. Нуклеопротеиды.
- •Гидролиз нуклеопротеидов
- •Выделение дезоксирибонуклеопротеидов (днп) из тканей
- •Синтез нуклеотидов. Распределение нуклеотидов в организме.
- •Распределение нуклеотидов в организме
- •Структура и функции днк и рнк.
- •Количественное определение нуклеиновых кислот.
- •Количественное определение нуклеиновых кислот в крови
- •Спектрофотометрическое определение суммарного содержания нуклеиновых кислот в тканях органов
- •Количественное определение днк колориметрическим методом
- •Количественное определение рнк колориметрическим методом
- •Структура генома. Экспрессия генов.
- •Литература:
Спектрофотометрическое определение суммарного содержания нуклеиновых кислот в тканях органов
ПРИНЦИП РАБОТЫ:
В основе спектрофотометрического метода определения суммарного содержания нуклеиновых кислот, разработанного А.С. Спириным, лежит экстракция их из биологического материала горячей хлорной кислотой с последующим определением поглощения экстрактов в ультрафиолетовой области спектра при 270 и 290 нм.
РЕАКТИВЫ и ОБОРУДОВАНИЕ:
1) НСlО4, 0,2 н. и 0,5 н. растворы; 2) пробирки обычные, мерные и центрифужные; 3) водяная баня; 4) центрифуга с холодильником; 5) СФ-46.
ХОД РАБОТЫ:
1. 100-200 мг измельченной на холоду ткани помещают в центрифужную пробирку с 5-10 мл охлажденного 0,2 н. раствора хлорной кислоты. Содержимое пробирки тщательно перемешивают и осадок отделяют центрифугированием при 3000 об/мин в течение 10 мин при охлаждении.
2. Надосадочную жидкость отбрасывают, а осадок повторно отмывают хлорной кислотой (такая обработка необходима для удаления кислото-растворимых нуклеотидов): к осадку добавляют 5-10 мл 0,5 н. раствора хлорной кислоты и, закрыв пробирки пробками с воздушными холодильниками, нагревают их на кипящей водяной бане 30 мин. Эта процедура необходима для количественной экстракции нуклеиновых кислот из исследуемой ткани и кислотного гидролиза.
3. Гидролизаты охлаждают и центрифугируют 10 мин при 3000 об/мин.
4.Надосадочную жидкость сливают в отдельную чистую пробирку.
5. Осадок подвергают повторной экстракции 0,5 н. раствором хлорной кислоты: к осадку добавляют 5-10 мл 0,5 н. раствора хлорной кислоты и, закрыв пробирки пробками с воздушными холодильниками, нагревают их на кипящей водяной бане 30 мин.
6. Гидролизаты охлаждают и центрифугируют 10 мин при 3000 об/мин.
7.Надосадочную жидкость сливают в отдельную чистую пробирку и объединяют с полученной в п.4. Точно измеряют общий объем.
8. Определяют поглощение на спектрофотометре при 270 и 290 нм против 0,5 н. раствора хлорной кислоты. При необходимости исследуемый раствор разводят 0,5 н. раствором хлорной кислоты.
9.Рассчитывают содержание фосфора нуклеиновых кислот в 1 мл исследуемого раствора по формуле:
Сфосфора = А270 - А290/0,19 (мкг),
где 0,19 - значение ΔА (А270 – А290), которое имеет гидролизат нуклеиновых кислот, содержащий 1 мкг нуклеинового фосфора в 1 мл раствора.
При дальнейших расчетах учитывают общий объем гидролизата и разведения.
10.Для пересчета количества нуклеинового фосфора на количество нуклеиновых кислот пользуются пересчетным коэффициентом 10,3:
Снк = Сфосфора ∙ 10,3 (мкг).
11. Рассчитывают содержание нуклеиновых кислот в 1 г исследуемой ткани.
РЕЗУЛЬТАТЫ и ВЫВОДЫ:
Работа №5
Количественное определение днк колориметрическим методом
ПРИНЦИП РАБОТЫ:
Метод основан на способности дезоксирибозы, входящей в состав ДНК, давать синее окрашивание с дифениламиновым реактивом.
РЕАКТИВЫ и ОБОРУДОВАНИЕ:
1) дифениламиновый реактив, 1% раствор; 2) водный раствор ДНК; 3) пробирки обычные и мерные; 4) кипящая водяная баня (!); 5) КФК, кюветы шириной 5 мм.
ХОД РАБОТЫ:
1. В опытную пробирку наливают 1 мл исследуемого водного раствора ДНК и 2 мл дифениламинового реактива.
2. В контрольную пробирку наливают 1 мл дистиллированной воды и 2 мл дифениламинового реактива.
3. Обе пробирки нагревают на кипящей водяной бане 10 мин.
4.После охлаждения измеряют оптическую плотность при красном светофильтре (КФК, кюветы шириной 5 мм) против контроля.
5.Построение калибровочного графика.
В 3 пробирки помещают по 1 мл раствора ДНК с концентрациями 50, 100 и 200 мкг/мл соответственно. Добавляют в каждую пробирку по 2 мл дифениламинового реактива и нагревают на кипящей водяной бане 10 мин. После охлаждения измеряют оптическую плотность (см. п. 4).
Калибровочный график строят, откладывая на оси абсцисс концентрации использованных растворов ДНК, а на оси ординат - значения оптической плотности.
Данные для построения калибровочного графика:
|
Пробирка №1 |
Пробирка №2 |
Пробирка №3 |
Станд. р-р ДНК |
1 мл |
1 мл |
1 мл |
Концентрация ДНК |
50 мкг/мл |
100 мкг/мл |
200 мкг/мл |
Дифениламиновый реактив |
2 мл |
2 мл |
2 мл |
Оптическая плотность |
|
|
|
РЕЗУЛЬТАТЫ и ВЫВОДЫ:
Работа №6