Номенклатура и классификация вирусов

Вирусы были открыты в конце прошлого столетия Бейеринком и Ивановским (вирус табачной мозаики), Леффлером и Фрошем (вирус ящура) и Ридом и Кэрролом (вирус желтой лихорадки). В основе этого открытия лежало измерение единственной физико-химической характеристики вирусов - фильтруемости. В сущности это была такая оценка размера вирусов, которая ставила их особняком от «микробов». В то время определение других физико-химических свойств было невозможным, и большинство исследований было направлено на изучение инфекционного процесса и реакции на него со стороны организма - хозяина. Поэтому первые попытки классификации вирусов основывались на сходстве их патогенных свойств (например, «вирусы гепатита» включали возбудителей, известных теперь как вирусы гепатита А, гепатита В и вирус желтой лихорадки), органотропности (например, «пневмотропные вирусы» включали такие агенты, как вирусы гриппа, риновирусы, аденовирусы; нейротрогшых, эпителиотропных, энтеротропных), а также на общности экологического статуса (например, «арбовирусами»ранее называли возбудителей, которые теперь известны как тогавирусы, буньявирусы и рабдовирусы).

Становление вирусологии началось в 30-х годах с фундаментальных работ, посвященных изучению природы вирусов, но вплоть до 50-х годе биохимические и морфологические данные об этих агентах были слишком разрозненными, чтобы послужить основой для их классификации, начале 50-х годов была предпринята первая попытка сгруппировав вирусы, исходя из их физико-химических свойств: так появились групп миксовирусов, шоковирусов и герпесвирусов. В это же врем было открыто огромное множество новых вирусов человека и животных. Это побудило некоторых исследователей и классификационные комиссии к созданию различных классификационных схем, часто оказывающихся взаимоисключающими.

Чтобы исправить положение, в 1966 г. на международном микробиологическом конгрессе в Москве был учрежден Международный комитет по номенклатуре вирусов (МКНВ) К тому времени у вирусологов уже появилась уверенность в возможности создания в ближайшее время единой универсальной таксономической схемы вирусов. Практически никто не сомневался, что сотни разных вирусов, выделенных от людей и животных, а также от растений, насекомых и бактерий, следует классифицировать как единую группу организмов, споры вызывал лишь выбор конкретной иерархической схемы.

Так как МКНВ занимался и классификацией вирусов, то в 1973 г. его реорганизовали в Международный комитет по таксономии вирусов (МКТВ). В настоящее время используют современную классификацию и номенклатуру вирусов позвоночных по материалам седьмого доклада МКТВ (2000), в подготовке которого участвовало более 500 вирусологов.

Номенклатура вирусов является международной и универсальной. Всем вирусам присвоены латинские названия. В настоящее время систем; использует иерархические уровни (таксоны), соответствующие порядку семейству, подсемейству, роду и виду.

В основу классификации положены следующие основные свойства вирусов:

1. Тип нуклеиновой кислоты. В соответствии с этим все вирусы позвоночных подразделяют на два подтипа - ДНК- и РНК содержащие.

2. Количество нитей в ДНК и РНК.

3. Наличие второй липопротеидной оболочки.

4. Чувствительность вирионов к органическим растворителям (эфиру, хлороформу).

5. Тип укладки (симметрии) капсомеров в белковой оболочке вирионов.

6. Количество капсомеров в вирионах.

7. Диаметр (размер) вирионов в нанометрах.

8. Место репродукции вирионов.

9. Способность агглютинировать эритроциты.

В настоящее время насчитывается более 3600 вирусов позвоночных, беспозвоночных, простейших, растений, грибов, водорослей и бактерий, из которых 1550 классифицированы и входят в 3 порядка, 56 семейств, 9 подсемейств и 233 рода. С учетом штаммов и серотипов насчитывают свыше 30 тысяч разновидностей вирусов. Патогенные вирусы позвоночных (человека и животных) в соответствии с современной системой классификации вирусов объединены в 2 (Mononegavirales и Nidovirales) порядка и 28 семейств, из которых 10 являются ДНК- вирусами и 18 РНК-вирусами.

ДНК- содержащие семейства вирусов:Poxviridae, Asfarviridae, Iridoviridae, Herpesviridae, Adenoviridae, Parvoviridae, Poliomaviridae, Hepadnaviridae, Papillomaviridae, Circoviridae.

РНК- содержащие семейства вирусов:Retroviridae, Orthomyxoviridae, Birnaviridae, Paramyxoviridae, Rhabdoviridae, Picornaviridae, Caliceviridae, Coronaviridae, Flaviviridae, Reoviridae, Filoviridae, Bunyaviridae, Arenaviridae, Astroviridae, Arteriviridae, Togaviridae, Bornaviridae, Nodaviridae.

В составе семейств вирусы подразделены на подсемейства (покс-, герпес-, парво- и парамиксовирусы) ироды.

Вид вируса- класс вирусов, характеризующийся большим числом критериев, образующий реплицирующуюся линию и занимающий особую экологическую нишу. Этот уровень иерархии таксонов эквивалентен современному обиходному значению слова «вирус». Например, выражения «вирус свинки» и «полиовирус типа 1» полностью соответствуют смыслу слова «вирус» и должны считаются видовыми названиями.

Род- это группа видов с определёнными общими характеристиками, отличающимися от вирусов других родов. Критерии для выделения родов включают в себя: феномены генетических взаимодействий, круг восприимчивых хозяев, патогениость, географическое распространение способ передачи, антигенные свойства. Названия родов вирусов оканчиваются на -virus.

Семейство- это группа родов с общими характеристиками, отличающимися от вирусов других семейств. Критерии, используемые для деления на семейства, включают в себя фундаментальные свойства вирионов: тип и структуру нуклеиновой кислоты, наличие липопротеиновой оболочки, стратегию вирусного генома, размер и морфологию вирионов. Семейства вирусов обозначают словами, оканчивающимися па -viridae.

В зависимости от того, кого они поражают, все вирусы подразделяют на:

• вирусы позвоночных (человека, животных и птиц);

• вирусы растений;

• вирусы простейших (микроорганизмов);

• вирусы беспозвоночных (насекомых).

Современная классификация вирусов позвоночных охватывает более 4/5 (80%) известных вирусов.