Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

Микробиология. Ч.3. Мир прокариот. Учебное пособие

.pdf
Скачиваний:
0
Добавлен:
07.09.2026
Размер:
1 Мб
Скачать
☆
2.3. ролЬ микроорганизмов в современных экосистемах
выделения обогащают почву органическими веществами; бес­позвоночные животные рыхлят и аэрируют почву, выделяют слизь, которая склеивает минеральные частицы. Немалую роль в формировании почвенных агрегатов играют бакте­рии, обрастающие твёрдые поверхности за счёт гидрофобных взаимодействий. У прокариот выработался целый комплекс адгезивных приспособлений в виде прикрепительных дисков, стебельков, ворса, косм и т. д. Выделяемая бактериями слизь также способствует склеиванию почвенных частиц в комочки. Поровые пространства в рыхлой почве занимают 50–60 % её объёма. Агрегатная структура почвы создаёт условия для су­ществования как аэробных (на поверхности комочков), так и анаэробных организмов (внутри комочков).
Таксономическая структура микробиоценозов и законо­мерности её смены выявлены для большинства типов зональ­ных почв. Так, доля представителей рода Bacillus и актино­бактерий в южных регионах увеличивается, а также в целом усиливается роль бактерий в деструкции целлюлозы по срав­нению с грибами. Но специфичность микробиоценозов разных почв отражается не столько таксономическим составом и чи­сленностью микроорганизмов, сколько особенностями струк­туры и динамикой физиологических и эколого-трофических групп.
Наиболее распространёнными в почве физиологическими группами микроорганизмов являются аммонифицирующие, азотофиксирующие, разлагающие клетчатку и пектин, нитри­фицирующие, денитрифицирующие, серобактерии. Микроорга­низмы одного вида в зависимости от условий могут осуществ­лять противоположные физиолого-биохимические процессы, например, азотофиксацию и денитрификацию. В тоже время каждый процесс способны осуществлять несколько различных групп микроорганизмов («принцип дублирования»). В микро­биоценоз входят четыре трофические группы микроорганиз­мов, тесно связанные и последовательно сменяющие друг друга в ходе разложения органических веществ, внесённых в почву. Процессы разложения органического опада, посту­пающего в почву, начинает зимогенные микроорганизмы, ведущие процессы минерализации растворимых и/или легко­доступных органических веществ. Это бактерии-гидролитики родов Pseudomonas, Proteus, Arthrobacter, Bacillus, различные
51
52
2. бактериалЬные сообщества и распространение прокариот
миксобактерии и цитофаги. Зимогенная группа доминиру­ет при внесении в почву органических удобрений. Частично продукты растительного и животного опада, а также бакте­риальные метаболиты превращаются в перегной. Гумус мед­ленно разлагают автохтонные микроорганизмы — специа­лизированные, обладающие более мощным ферментативным аппаратом, способным окислят сложные органические соеди­нения (липиды, воска, лигнин и др.). К этой группе отно­сятся актинобактерии и проактинобактерии (род Nocardia — N. rubra, N. coralline и др.), доминирующие в необработанной почве. Активен в этом отношении и род Pseudomonas, высту­пающий пионером деструкции органики. Представители этого рода распространены преимущественно в северных почвах, где минерализация идет медленно, в южных районах их числен­ность кратковременно увеличивается лишь при внесении ор­ганики. Виды Arthrobacter характерны для более поздних стадий преобразования органических веществ и представлены большей частью в южных почвах. Род Enterobacter характерен для лесных почв средней полосы, Spirillum для южных почв. В тундровых почвах разложение целлюлозы в первую очередь связано с медленно растущими грибами (видами Demalium, Penicillium), в таежных почвах к ним добавляются микобак­терии и представители рода Cellvibrio. В южных почвах зна­чение грибов снижается, и в деструкции целлюлозы начинают ведущую роль играть бактерии.
Минерализацию остаточных продуктов распада в мини­мальных концентрациях ведут олиготрофные микроорганиз­мы. Среди олиготрофов описан ряд морфологически необыч­ных форм. Это почкующиеся бактерии, образующие простеки (Prostecomicrobium, Ancalomicrobium), стебельковые бактерии (Caulobacter), колонии из спирально закрученных клеток (Seliberia), изогнутые палочки (Microcyclus), почковидные (Renobacter), спиральные (Spirosoma). Стебельки и выросты увеличивают периплазматическое пространство клетки, где расположены транспортные системы для субстратов с низкой концентрацией. Олиготрофная микрофлора более характерна для южных районов, что можно объяснить более высокой ско­ростью минерализации органики.
Неорганические соединения (аммиак, сероводород, водо­род и др.), образующиеся при минерализации, преобразуются
2.3. ролЬ микроорганизмов в современных экосистемах
в процессе жизнедеятельности хемолитотрофов — трансфор­маторов минеральных соединений почвы. Нитрификаторы, окисляющие аммиак, лучше чувствуют себя в теплых юж­ных районах, бактерии, окисляющие водород, серу и желе­зо, особенно хорошо функционируют в условиях затопления. После истощения источника пищи деятельность микроорга­низмов затухает и они переходят в состояние длительного покоя, близкого к анабиозу, вплоть до нового притока пищи. Значительная часть биомассы, ранее бурно развивавшейся популяции, лизируется. Соотношение перечисленных тро­фических и функциональных групп определяет характерную структуру микробиоценоза как зонального типа почв, так и отдельных микролокусов на определенный сезон года.
Значение почвенных микроорганизмов определяется их участием в следующих процессах (См. 1.4. Участие прокариот в почвообразовании и деструкции органики):
– разложение растительного опада и животных остатков;
– образование гумуса. Прокариоты осуществляют фер­ментативную активацию ароматических и алифатических ра­дикалов, вызывающую их спонтанную полимеризацию в вы­сокомолекулярные соединения;
– разложение гумуса;
– деструкция минералов почвенной породы. Микроорга­низмы являются участниками преобразования горных пород в почву характерного строения;
– новообразование минералов и осуществление циклов биоэлементов (C, N, P, S, Fe и др.), что позволяет многократ­но использовать отграниченные локальные ресурсы;
– участие в структурировании почвы и формировании стабильных почвенных агрегатов;
– накопление и временное консервирование (иммобили­зация) минеральных веществ. Связывание бактериями сое­динений предотвращает их вынос из почвы поверхностными и грунтовыми водами;
– формирование качества почвы (почвенного «здоровья»).
53
3.   БИОТИЧЕСКИЕ  ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ  ПРОКАРИОТ
3.1. Типы биотических отношений прокариот
Благодаря пластичности и разнообразию жизненных стратегий прокариоты вступают в разнообразные взаимодей­ствия практически со всеми группами организмов. Эволюция живых организмов тесно связана с их адаптацией к факторам среды, а успешное выживание зависит от способности занять экологическую нишу с максимально ослабленной конкуренци­ей либо проявлять высокую конкурентоспособность.
Конкуренция бактерий за питательный субстрат привела к выработке у них целого ряда приспособлений для угнетения соперников. Антагонизм (активная конкуренция), как взаим­ное или одностороннее подавление роста конкурентов за счет выделяемых метаболитов, очень широко распространен в мире прокариот. Агрессивными агентами выступают экзофермен­ты (протеазы и лизоцимы), кислоты, токсины, бактериоцины и антибиотики. Насчитывается более 10000 антибиотиков, синтезируемых и используемых микроорганизмами.
Паразитизм и хищничество внутри группы прокариот не имеют широкого распространения. Единственным ярким примером бактерии-хищника является мелкий подвижный вибрион Bdellovibrio, описанный в 1962 году Г. Штольпом и Г. Петцольдом в ходе поиска фагов для уничтожения пато­генных бактерий. Название («вибрион-пиявка») отражает ха­рактер этого микроорганизма. Bdellovibrio обитает в полиса­пробных водоёмах с большой концентрацией потенциальных
3.1. типы биотических отношений прокариот
жертв (10 5–10 6 клеток на мл). Активно двигаясь, хищник сталкивается с жертвой, прикрепляется к ней, просверливая отверстие с помощью лизоцимоподобного фермента мурами­дазы во внешней мембране и проникает в периплазматиче­ское пространство, Вскоре жертва погибает, а хищник, оста­ваясь в периплазматическом пространстве, трансформируется в длинную спиральную форму, которая постепенно выедает со­держимое протопласта клетки и занимает собой весь её объём. Когда пища заканчивается, спиралевидная бактерия дробит­ся на множество подвижных вибрионов, которые выходят во внешнюю среду.
Избегая конкуренции, организмы могут использовать различные стратегии: занимать ниши, где нет конкурентов; формировать взаимовыгодные ассоциации с другими организ­мами или воспользоваться другими организмами для своего комфортного существования. Между микроорганизмами суще­ствуют разные формы мутуализма:
– кооперация, когда образуются консорциумы, представ­ляющие собой структурированные ассоциации бактерий с вы­сокой степенью интеграции;
– метабиоз — комменсализм на уровне пищевой цепи, когда последующий член зависит от предыдущего;
– синтрофия — совместное осуществление метаболиче­ских процессов (обмен субстратом, удаление токсинов, меж­видовой перенос водорода и др.), проведение которых одним видом без взаимодействия с другими невозможно. Синтро­фия — характерный тип отношений для прокариот. Накопле­ние в среде вредных продуктов метаболизма лимитирует жизнедеятельность микроорганизмов даже в большей степе­ни, чем истощение питательных ресурсов. Синтрофия играет важную роль в процессе полной минерализации органическо­го вещества, так как недоокисленные продукты метаболизма одних становятся питательным субстратом для других и про­цесс идёт до полного окисления углерода. Синтрофные взаимо­действия складываются между целлюлозаредукторами и азото­фиксаторами. Азотофиксаторы получают продукты гидролиза клетчатки, а разрушители целлюлозы — органический азот. Кроме того, разрушители целлюлозы понижают парциальное давление кислорода в среде, что способствует азотофикса­ции. Некоторые бактерии могут существовать исключительно
55
56
3. биотические взаимодействиЯ прокариот
в синтрофных культурах. Так, Syntrophomonas окисляет соли жирных кислот до ацетата, а выделяющийся при этом водород изымается из среды сульфатредуцирующими бактериями или метаногенами (Desulfovibrio / Methanospirillum). Двунаправ­ленный перенос серы происходит между Desulfovibrio и Chromatium, осуществляющими взаимное обеспечение вос­становленными иокисленными соединениями серы. Два парал­лельных однонаправленных процесса происходят при раз­ложении пирита (FeS 2), в котором принимают участие
Leptospirillum ferrooxidans, окисляющий железо иThiobacillus organoparus, окисляющий серу. Консорциум Desulfomaculum
и Chlorobium — пример тесного клеточного контакта между синтрофами. Клетки Chlorobium облепляют более крупную клетку Desulfomaculum, снабжая её органикой и окисленной серой и получая необходимый для фотосинтеза сероводород. При этом обе бактерии делятся синхронно.
Со всеми группами эукариот у прокариот складываются разнообразные симбиотические отношения: от комменсализма и мутуализма до паразитизма. Особенность взаимоотношений микроорганизмов с макроорганизмом заключается в том, что с одним организмом-хозяином взаимодействуют не отдель­ные особи, а популяции, и часто не одного, а многих видов. По местоположению микроорганизмов на хозяине различают экзо(экто)симбионтов (на поверхности тела или клеток) и эндо­симбионтов (внутри тела или клеток). Эволюция паразитизма шла в направлении создания устойчивой системы, обеспечи­вающей жизнедеятельность обоих партнёров с формированием носительства (сохранения популяции патогенна в теле хозяи­на без причинения ему видимого вреда). Макроорганизм для бактерий — целая вселенная и, в то же время, изолированная экологическая ниша, которую можно занять, убегая от конку­ренции, но бактерии должны иметь свойства, обеспечивающие проникновение внутрь тела хозяина, подавляя его защитные механизмы. Для сосуществования с эукариотами микроорга­низмы должны обладать большой функциональной и генети­ческой пластичностью. Свойственный прокариотам горизон­тальный перенос генов обеспечивает им высокую адаптивность и способность конкурировать с более организованными эука­риотическими организмами. У бактерий выявлены гены сим­биотрофности, расположенные в хромосоме или в плазмидах.
3.1. типы биотических отношений прокариот
Отмечено, что микроорганизмы, находящиеся в контакте с макроорганизмом, обладают большим полиморфизмом по сравнению с их свободноживущими родичами. Организм­хозяин тоже приобретают специфические свойства. Симбионты развиваются в результате коэволюции, что предполагает ис­пользование общего потока энергии, совместной экспрессии ге­нов, обмен физиологической, клеточной, организменной и со­циальной информацией. Неизбежным последствием прочного симбиоза является ущербность одного партнёра в отсутствии другого, доходящая до полной потери жизнеспособности. Сим­биоз сыграл важную роль в эволюции организмов. Согласно теории симбиогенеза предшественниками митохондрий и пла­стид стали эндосимбиотические прокариоты аэробных орга­ноторфов — α-протеобактерии (предположительно пурпурные несерные) и цианобактерии соответственно. Происхождение других структур и органелл (ядра, жгутиков и др.) эукариоти­ческой клетки также иногда объясняют в рамках эндосимбио­тичесекой гипотезы. В любом случае интеграция симбионтов могла послужить стимулом в развитии генно-регуляторной системы и клеточного ядра, так как для сосуществование раз­личных геномов внутри одной клетки необходима система их регуляции. Таким образом, симбиоз мог стать стимулом к воз­никновению эукариотической клетки в целом. Предполагают, что и плазмиды являются древнейшими молекулярными сим­бионтами. Симбиотические бактерии широко распространены и играют важную роль и в настоящее время. Практически все эукариотические организмы оккупированы прокариота­ми, использующими их как среду обитания, часто отношения строятся на взаимовыгодных условиях. Большинство эукари­отических организмов рассматриваются в настоящее время как «сверхорганизмы» — сложные симбиотические комплек­сы, а симбиоз все чаще определяется как магистральный путь эволюции.
Основные функции, выполняемые бактериями-симбионтами: – симбионты служат источником питательных веществ
для хозяина;
– симбионты участвуют в метаболизме хозяина (синтез факторов роста и различных ферментов, в частности, участву­ющих в переваривании высокомолекулярных веществ, в пер­вую очередь полисахаридов; фиксация молекулярного азота;
57
58
3. биотические взаимодействиЯ прокариот
утилизация продуктов жизнедеятельности и т. д.). У всех жи­вотных с узкоспециализированным питанием полноценное развитие обеспечивается за счет симбиоза с бактериями, так растительноядность можно рассматривать как симбиотический феномен.
– симбионты участвуют в предохранении хозяина от ин­вазии паразитов и патогенов; повышают конкурентоспособ­ность хозяина;
– симбионты участвуют в обеспечении коммуникативных свойств хозяев (биолюминесценция);
– симбионты могут служить источником генетического материала для хозяина.
3.2. Взаимоотношения прокариот с растениями
Растения, как первичные продуценты, могут неограни­ченно обеспечивать контактирующих с ними бактерий орга­ническим субстратом, а бактерии, как редуценты, могут про­водить полную деструкцию органических веществ и, минуя консументов, поставлять растениям элементы минерального питания.
Между растениями и бактериями преобладают взаимовы­годные или нейтральные отношения. Фитопатогенных бакте­рий значительно меньше, чем бактерий патогенных для жи­вотных. Бактерии заселяют у наземных высших растений как филлоплану (филлосферу), так и ризосферу.
Под филлосферой в широком смысле подразумевает про­странство вокруг, а под филлопланой поверхность всех над­земных органов растений. На один грамм зелёной массы при­ходится до 10 8 клеток бактерий, или 10 6 клеток на 1 см 2. Субстратом для микроорганизмов, живущих на поверхности листьев и других органов, служат выделения растений (ами­нокислоты, углеводы, органические кислоты, фитогормоны и др.), а так же органические частицы и растворённые веще­ства, оседающие на поверхности надземных органов. Числен­ность и видовой состав микрофлоры филлопланы зависит от многих факторов: вида растений, климатических условий и др. Особенно много эпифитных бактерий в условиях влаж­ного тропического климата. Род Erwinia, ассоциирующийся
3.2. взаимоотношениЯ прокариот с растениЯми
в своем распространении с растениями, имеет много видов, большинство из которых сапрофитные эпифиты: E. salicis обитает на видах рода ива, E. carotovora — на моркови, E. quercina — на дубе и т. д. До 80 % эпифитной микрофлоры составляет E. herbicola, ассоциированная с разными видами растений. Локализация микроорганизмов по разным частям филлосферы также родо- и видоспецифична. Отличаются сво­им бактериальным населением не только верхняя и нижняя стороны листа, но и клетки устьичного аппарата.
Под ризосферой (Хилтнер, 1904) понимают слой почвы толщиной в несколько миллиметров (в среднем 2–3 мм) вокруг корней растений, где накапливаются корневые выделения и повышена численность микроорганизмов. Корни выделя­ют много различных соединений, как низкомолекулярных — сахаров, аминокислот, спиртов, органических кислот, гормонов, витаминов, так и высокомолекулярных — белков, полисаха­ридов, слизей и др. В ризосфере накапливаются отслаивающи­еся клетки ризодермы, корневых чехликов и отмершие корне­вые волоски. Ризодепозиты могут составлять до 40 % продуктов фотосинтеза и формируют богатую пищевую базу для почвен­ных бактерий. Кроме повышенного содержания питательных веществ в ризосфере на 1–2 % выше влажность, рН ближе к нейтральному значению, повышена растворимость соедине­ний фосфора, железа, марганца и др. Число бактерий в ризос­фере в 10 раз больше, чем в основной почве, особенно много бактерий в ризоплане (собственно на поверхности корней).
Наиболее активно колонизируют ризосферу так называе­мая группа PGPB (Plant Growth-promoting Bacteria) или бак­терии, стимулирующие рост растений. Штаммы PGPB есть среди родов Pseudomonas, Bacillus, Clostridium, Arthrobacter, Azospirillum, Erwinia и др.
Бактерии вырабатывают и выделяют полезные для расте­ний вещества, такие как стимуляторы роста (индолилуксус­ная кислота), витамины, лектины, подавляющие рост пато­генных грибов и улучшающие прорастание семян и др. PGPB выделяют фунгициды, разрушающие гифы фитопатогенных грибов и вызывают у растений индуцированную системную устойчивость. Устойчивость проявляется в повышенной лиг­нификации корней и стимуляции синтеза фитоалексинов — фенольных соединений, участвующих в ответной реакции
59
60
3. биотические взаимодействиЯ прокариот
на проникновение патогенов. Бактерии обогащают почву до­ступными минеральными веществами. В ризосфере протекает ассоциативная азотофиксация, стимулируемая фотосинтезом. Считается, что 75 % почвенных бактерий в той или иной сте­пени способны к азотофиксации, особенно эффективен в этом отношении Azospirillum.
Микрофлора ризосферы имеет пространственную неод­нородность и временную динамику. По всей длине корней зоны с большой плотностью микроорганизмов сменяются зо­нами с меньшей плотностью. Вокруг молодых корней кон­центрируются Pseudomonas (40 %), Mycobacterium (20 %), Chromatobacterium (12 %), Micrococcus (3 %), Bacillus (3 %), количество других представителей не превышает 1–2 %. Этот комплекс микроорганизмов выполняет следующие функции:
– минерализацию органического субстрата и подготовку питательных веществ, доступных растениям;
– выделение кислот, способствующих растворению соеди­нений фосфора и магния, извести и силикатов;
– синтез биологически активных веществ;
– создание барьера для патогенных и паразитических организмов.
Позже начинают преобладать Гр+ бактерии, актинобакте­рии, разрушители целлюлозы и пектина и др. Пик активно­сти бактерий приходится на период роста и цветения расте­ний, затем активность замедляется и сводится к минимуму, когда растения переходят в состояние покоя.
Наиболее тесные отношения складываются между симби­отическими клубеньковыми азотофиксирующими бактериями и растениями из семейства бобовых и некоторых родов издру­гих семейств (миртовых, казуариновых, берёзовых, лоховых). Не смотря на то, что клубеньковые бактерии по способу про­никновения и изменения тканей растения хозяина сходны с патогенными бактериями, выгода, получаемая от них расте­ниями, позволяет считать эти взаимоотношения приближаю­щимся к мутуализму. Корневые волоски бобовых растений выделяют аттрактанты — изофлавоноиды, которые вместе с лектинами способствуют адгезии бактерий рода Rhizobium. Выделяющийся корнями в виде экссудата триптофан бактерии преобразуют в ауксин, который способствует удлинению и за­кручиванию корневых волосков. Прикрепление и проникнове-
Соседние файлы в предмете [НЕСОРТИРОВАННОЕ]