Добавил:
ivanov666
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз:
Предмет:
Файл:Микробиология. Ч.3. Мир прокариот. Учебное пособие
.pdf
2.3. ролЬ микроорганизмов в современных экосистемах
выделения обогащают почву органическими веществами; беспозвоночные животные рыхлят и аэрируют почву, выделяют
слизь, которая склеивает минеральные частицы. Немалую
роль в формировании почвенных агрегатов играют бактерии, обрастающие твёрдые поверхности за счёт гидрофобных
взаимодействий. У прокариот выработался целый комплекс
адгезивных приспособлений в виде прикрепительных дисков,
стебельков, ворса, косм и т. д. Выделяемая бактериями слизь
также способствует склеиванию почвенных частиц в комочки.
Поровые пространства в рыхлой почве занимают 50–60 % её
объёма. Агрегатная структура почвы создаёт условия для существования как аэробных (на поверхности комочков), так
и анаэробных организмов (внутри комочков).
Таксономическая структура микробиоценозов и закономерности её смены выявлены для большинства типов зональных почв. Так, доля представителей рода Bacillus и актинобактерий в южных регионах увеличивается, а также в целом
усиливается роль бактерий в деструкции целлюлозы по сравнению с грибами. Но специфичность микробиоценозов разных
почв отражается не столько таксономическим составом и численностью микроорганизмов, сколько особенностями структуры и динамикой физиологических и эколого-трофических
групп.
Наиболее распространёнными в почве физиологическими
группами микроорганизмов являются аммонифицирующие,
азотофиксирующие, разлагающие клетчатку и пектин, нитрифицирующие, денитрифицирующие, серобактерии. Микроорганизмы одного вида в зависимости от условий могут осуществлять противоположные физиолого-биохимические процессы,
например, азотофиксацию и денитрификацию. В тоже время
каждый процесс способны осуществлять несколько различных
групп микроорганизмов («принцип дублирования»). В микробиоценоз входят четыре трофические группы микроорганизмов, тесно связанные и последовательно сменяющие друг
друга в ходе разложения органических веществ, внесённых
в почву. Процессы разложения органического опада, поступающего в почву, начинает зимогенные микроорганизмы,
ведущие процессы минерализации растворимых и/или легкодоступных органических веществ. Это бактерии-гидролитики
родов Pseudomonas, Proteus, Arthrobacter, Bacillus, различные
51

52
2. бактериалЬные сообщества и распространение прокариот
миксобактерии и цитофаги. Зимогенная группа доминирует при внесении в почву органических удобрений. Частично
продукты растительного и животного опада, а также бактериальные метаболиты превращаются в перегной. Гумус медленно разлагают автохтонные микроорганизмы — специализированные, обладающие более мощным ферментативным
аппаратом, способным окислят сложные органические соединения (липиды, воска, лигнин и др.). К этой группе относятся актинобактерии и проактинобактерии (род Nocardia —
N. rubra, N. coralline и др.), доминирующие в необработанной
почве. Активен в этом отношении и род Pseudomonas, выступающий пионером деструкции органики. Представители этого
рода распространены преимущественно в северных почвах, где
минерализация идет медленно, в южных районах их численность кратковременно увеличивается лишь при внесении органики. Виды Arthrobacter характерны для более поздних
стадий преобразования органических веществ и представлены
большей частью в южных почвах. Род Enterobacter характерен
для лесных почв средней полосы, Spirillum для южных почв.
В тундровых почвах разложение целлюлозы в первую очередь
связано с медленно растущими грибами (видами Demalium,
Penicillium), в таежных почвах к ним добавляются микобактерии и представители рода Cellvibrio. В южных почвах значение грибов снижается, и в деструкции целлюлозы начинают
ведущую роль играть бактерии.
Минерализацию остаточных продуктов распада в минимальных концентрациях ведут олиготрофные микроорганизмы. Среди олиготрофов описан ряд морфологически необычных форм. Это почкующиеся бактерии, образующие простеки
(Prostecomicrobium, Ancalomicrobium), стебельковые бактерии
(Caulobacter), колонии из спирально закрученных клеток
(Seliberia), изогнутые палочки (Microcyclus), почковидные
(Renobacter), спиральные (Spirosoma). Стебельки и выросты
увеличивают периплазматическое пространство клетки, где
расположены транспортные системы для субстратов с низкой
концентрацией. Олиготрофная микрофлора более характерна
для южных районов, что можно объяснить более высокой скоростью минерализации органики.
Неорганические соединения (аммиак, сероводород, водород и др.), образующиеся при минерализации, преобразуются

2.3. ролЬ микроорганизмов в современных экосистемах
в процессе жизнедеятельности хемолитотрофов — трансформаторов минеральных соединений почвы. Нитрификаторы,
окисляющие аммиак, лучше чувствуют себя в теплых южных районах, бактерии, окисляющие водород, серу и железо, особенно хорошо функционируют в условиях затопления.
После истощения источника пищи деятельность микроорганизмов затухает и они переходят в состояние длительного
покоя, близкого к анабиозу, вплоть до нового притока пищи.
Значительная часть биомассы, ранее бурно развивавшейся
популяции, лизируется. Соотношение перечисленных трофических и функциональных групп определяет характерную
структуру микробиоценоза как зонального типа почв, так
и отдельных микролокусов на определенный сезон года.
Значение почвенных микроорганизмов определяется их
участием в следующих процессах (См. 1.4. Участие прокариот
в почвообразовании и деструкции органики):
– разложение растительного опада и животных остатков;
– образование гумуса. Прокариоты осуществляют ферментативную активацию ароматических и алифатических радикалов, вызывающую их спонтанную полимеризацию в высокомолекулярные соединения;
– разложение гумуса;
– деструкция минералов почвенной породы. Микроорганизмы являются участниками преобразования горных пород
в почву характерного строения;
– новообразование минералов и осуществление циклов
биоэлементов (C, N, P, S, Fe и др.), что позволяет многократно использовать отграниченные локальные ресурсы;
– участие в структурировании почвы и формировании
стабильных почвенных агрегатов;
– накопление и временное консервирование (иммобилизация) минеральных веществ. Связывание бактериями соединений предотвращает их вынос из почвы поверхностными
и грунтовыми водами;
– формирование качества почвы (почвенного «здоровья»).
53

3. БИОТИЧЕСКИЕ
ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
ПРОКАРИОТ
3.1. Типы биотических отношений прокариот
Благодаря пластичности и разнообразию жизненных
стратегий прокариоты вступают в разнообразные взаимодействия практически со всеми группами организмов. Эволюция
живых организмов тесно связана с их адаптацией к факторам
среды, а успешное выживание зависит от способности занять
экологическую нишу с максимально ослабленной конкуренцией либо проявлять высокую конкурентоспособность.
Конкуренция бактерий за питательный субстрат привела
к выработке у них целого ряда приспособлений для угнетения
соперников. Антагонизм (активная конкуренция), как взаимное или одностороннее подавление роста конкурентов за счет
выделяемых метаболитов, очень широко распространен в мире
прокариот. Агрессивными агентами выступают экзоферменты (протеазы и лизоцимы), кислоты, токсины, бактериоцины
и антибиотики. Насчитывается более 10000 антибиотиков,
синтезируемых и используемых микроорганизмами.
Паразитизм и хищничество внутри группы прокариот
не имеют широкого распространения. Единственным ярким
примером бактерии-хищника является мелкий подвижный
вибрион Bdellovibrio, описанный в 1962 году Г. Штольпом
и Г. Петцольдом в ходе поиска фагов для уничтожения патогенных бактерий. Название («вибрион-пиявка») отражает характер этого микроорганизма. Bdellovibrio обитает в полисапробных водоёмах с большой концентрацией потенциальных

3.1. типы биотических отношений прокариот
жертв (10 5–10 6 клеток на мл). Активно двигаясь, хищник
сталкивается с жертвой, прикрепляется к ней, просверливая
отверстие с помощью лизоцимоподобного фермента мурамидазы во внешней мембране и проникает в периплазматическое пространство, Вскоре жертва погибает, а хищник, оставаясь в периплазматическом пространстве, трансформируется
в длинную спиральную форму, которая постепенно выедает содержимое протопласта клетки и занимает собой весь её объём.
Когда пища заканчивается, спиралевидная бактерия дробится на множество подвижных вибрионов, которые выходят
во внешнюю среду.
Избегая конкуренции, организмы могут использовать
различные стратегии: занимать ниши, где нет конкурентов;
формировать взаимовыгодные ассоциации с другими организмами или воспользоваться другими организмами для своего
комфортного существования. Между микроорганизмами существуют разные формы мутуализма:
– кооперация, когда образуются консорциумы, представляющие собой структурированные ассоциации бактерий с высокой степенью интеграции;
– метабиоз — комменсализм на уровне пищевой цепи,
когда последующий член зависит от предыдущего;
– синтрофия — совместное осуществление метаболических процессов (обмен субстратом, удаление токсинов, межвидовой перенос водорода и др.), проведение которых одним
видом без взаимодействия с другими невозможно. Синтрофия — характерный тип отношений для прокариот. Накопление в среде вредных продуктов метаболизма лимитирует
жизнедеятельность микроорганизмов даже в большей степени, чем истощение питательных ресурсов. Синтрофия играет
важную роль в процессе полной минерализации органического вещества, так как недоокисленные продукты метаболизма
одних становятся питательным субстратом для других и процесс идёт до полного окисления углерода. Синтрофные взаимодействия складываются между целлюлозаредукторами и азотофиксаторами. Азотофиксаторы получают продукты гидролиза
клетчатки, а разрушители целлюлозы — органический азот.
Кроме того, разрушители целлюлозы понижают парциальное
давление кислорода в среде, что способствует азотофиксации. Некоторые бактерии могут существовать исключительно
55

56
3. биотические взаимодействиЯ прокариот
в синтрофных культурах. Так, Syntrophomonas окисляет соли
жирных кислот до ацетата, а выделяющийся при этом водород
изымается из среды сульфатредуцирующими бактериями или
метаногенами (Desulfovibrio / Methanospirillum). Двунаправленный перенос серы происходит между Desulfovibrio
и Chromatium, осуществляющими взаимное обеспечение восстановленными иокисленными соединениями серы. Два параллельных однонаправленных процесса происходят при разложении пирита (FeS 2), в котором принимают участие
Leptospirillum ferrooxidans, окисляющий железо иThiobacillus
organoparus, окисляющий серу. Консорциум Desulfomaculum
и Chlorobium — пример тесного клеточного контакта между
синтрофами. Клетки Chlorobium облепляют более крупную
клетку Desulfomaculum, снабжая её органикой и окисленной
серой и получая необходимый для фотосинтеза сероводород.
При этом обе бактерии делятся синхронно.
Со всеми группами эукариот у прокариот складываются
разнообразные симбиотические отношения: от комменсализма
и мутуализма до паразитизма. Особенность взаимоотношений
микроорганизмов с макроорганизмом заключается в том, что
с одним организмом-хозяином взаимодействуют не отдельные особи, а популяции, и часто не одного, а многих видов.
По местоположению микроорганизмов на хозяине различают
экзо(экто)симбионтов (на поверхности тела или клеток) и эндосимбионтов (внутри тела или клеток). Эволюция паразитизма
шла в направлении создания устойчивой системы, обеспечивающей жизнедеятельность обоих партнёров с формированием
носительства (сохранения популяции патогенна в теле хозяина без причинения ему видимого вреда). Макроорганизм для
бактерий — целая вселенная и, в то же время, изолированная
экологическая ниша, которую можно занять, убегая от конкуренции, но бактерии должны иметь свойства, обеспечивающие
проникновение внутрь тела хозяина, подавляя его защитные
механизмы. Для сосуществования с эукариотами микроорганизмы должны обладать большой функциональной и генетической пластичностью. Свойственный прокариотам горизонтальный перенос генов обеспечивает им высокую адаптивность
и способность конкурировать с более организованными эукариотическими организмами. У бактерий выявлены гены симбиотрофности, расположенные в хромосоме или в плазмидах.

3.1. типы биотических отношений прокариот
Отмечено, что микроорганизмы, находящиеся в контакте
с макроорганизмом, обладают большим полиморфизмом
по сравнению с их свободноживущими родичами. Организмхозяин тоже приобретают специфические свойства. Симбионты
развиваются в результате коэволюции, что предполагает использование общего потока энергии, совместной экспрессии генов, обмен физиологической, клеточной, организменной и социальной информацией. Неизбежным последствием прочного
симбиоза является ущербность одного партнёра в отсутствии
другого, доходящая до полной потери жизнеспособности. Симбиоз сыграл важную роль в эволюции организмов. Согласно
теории симбиогенеза предшественниками митохондрий и пластид стали эндосимбиотические прокариоты аэробных органоторфов — α-протеобактерии (предположительно пурпурные
несерные) и цианобактерии соответственно. Происхождение
других структур и органелл (ядра, жгутиков и др.) эукариотической клетки также иногда объясняют в рамках эндосимбиотичесекой гипотезы. В любом случае интеграция симбионтов
могла послужить стимулом в развитии генно-регуляторной
системы и клеточного ядра, так как для сосуществование различных геномов внутри одной клетки необходима система их
регуляции. Таким образом, симбиоз мог стать стимулом к возникновению эукариотической клетки в целом. Предполагают,
что и плазмиды являются древнейшими молекулярными симбионтами. Симбиотические бактерии широко распространены
и играют важную роль и в настоящее время. Практически
все эукариотические организмы оккупированы прокариотами, использующими их как среду обитания, часто отношения
строятся на взаимовыгодных условиях. Большинство эукариотических организмов рассматриваются в настоящее время
как «сверхорганизмы» — сложные симбиотические комплексы, а симбиоз все чаще определяется как магистральный путь
эволюции.
Основные функции, выполняемые бактериями-симбионтами:
– симбионты служат источником питательных веществ
для хозяина;
– симбионты участвуют в метаболизме хозяина (синтез
факторов роста и различных ферментов, в частности, участвующих в переваривании высокомолекулярных веществ, в первую очередь полисахаридов; фиксация молекулярного азота;
57

58
3. биотические взаимодействиЯ прокариот
утилизация продуктов жизнедеятельности и т. д.). У всех животных с узкоспециализированным питанием полноценное
развитие обеспечивается за счет симбиоза с бактериями, так
растительноядность можно рассматривать как симбиотический
феномен.
– симбионты участвуют в предохранении хозяина от инвазии паразитов и патогенов; повышают конкурентоспособность хозяина;
– симбионты участвуют в обеспечении коммуникативных
свойств хозяев (биолюминесценция);
– симбионты могут служить источником генетического
материала для хозяина.
3.2. Взаимоотношения прокариот с растениями
Растения, как первичные продуценты, могут неограниченно обеспечивать контактирующих с ними бактерий органическим субстратом, а бактерии, как редуценты, могут проводить полную деструкцию органических веществ и, минуя
консументов, поставлять растениям элементы минерального
питания.
Между растениями и бактериями преобладают взаимовыгодные или нейтральные отношения. Фитопатогенных бактерий значительно меньше, чем бактерий патогенных для животных. Бактерии заселяют у наземных высших растений как
филлоплану (филлосферу), так и ризосферу.
Под филлосферой в широком смысле подразумевает пространство вокруг, а под филлопланой поверхность всех надземных органов растений. На один грамм зелёной массы приходится до 10 8 клеток бактерий, или 10 6 клеток на 1 см 2.
Субстратом для микроорганизмов, живущих на поверхности
листьев и других органов, служат выделения растений (аминокислоты, углеводы, органические кислоты, фитогормоны
и др.), а так же органические частицы и растворённые вещества, оседающие на поверхности надземных органов. Численность и видовой состав микрофлоры филлопланы зависит
от многих факторов: вида растений, климатических условий
и др. Особенно много эпифитных бактерий в условиях влажного тропического климата. Род Erwinia, ассоциирующийся

3.2. взаимоотношениЯ прокариот с растениЯми
в своем распространении с растениями, имеет много видов,
большинство из которых сапрофитные эпифиты: E. salicis
обитает на видах рода ива, E. carotovora — на моркови,
E. quercina — на дубе и т. д. До 80 % эпифитной микрофлоры
составляет E. herbicola, ассоциированная с разными видами
растений. Локализация микроорганизмов по разным частям
филлосферы также родо- и видоспецифична. Отличаются своим бактериальным населением не только верхняя и нижняя
стороны листа, но и клетки устьичного аппарата.
Под ризосферой (Хилтнер, 1904) понимают слой почвы
толщиной в несколько миллиметров (в среднем 2–3 мм) вокруг
корней растений, где накапливаются корневые выделения
и повышена численность микроорганизмов. Корни выделяют много различных соединений, как низкомолекулярных —
сахаров, аминокислот, спиртов, органических кислот, гормонов,
витаминов, так и высокомолекулярных — белков, полисахаридов, слизей и др. В ризосфере накапливаются отслаивающиеся клетки ризодермы, корневых чехликов и отмершие корневые волоски. Ризодепозиты могут составлять до 40 % продуктов
фотосинтеза и формируют богатую пищевую базу для почвенных бактерий. Кроме повышенного содержания питательных
веществ в ризосфере на 1–2 % выше влажность, рН ближе
к нейтральному значению, повышена растворимость соединений фосфора, железа, марганца и др. Число бактерий в ризосфере в 10 раз больше, чем в основной почве, особенно много
бактерий в ризоплане (собственно на поверхности корней).
Наиболее активно колонизируют ризосферу так называемая группа PGPB (Plant Growth-promoting Bacteria) или бактерии, стимулирующие рост растений. Штаммы PGPB есть
среди родов Pseudomonas, Bacillus, Clostridium, Arthrobacter,
Azospirillum, Erwinia и др.
Бактерии вырабатывают и выделяют полезные для растений вещества, такие как стимуляторы роста (индолилуксусная кислота), витамины, лектины, подавляющие рост патогенных грибов и улучшающие прорастание семян и др. PGPB
выделяют фунгициды, разрушающие гифы фитопатогенных
грибов и вызывают у растений индуцированную системную
устойчивость. Устойчивость проявляется в повышенной лигнификации корней и стимуляции синтеза фитоалексинов —
фенольных соединений, участвующих в ответной реакции
59

60
3. биотические взаимодействиЯ прокариот
на проникновение патогенов. Бактерии обогащают почву доступными минеральными веществами. В ризосфере протекает
ассоциативная азотофиксация, стимулируемая фотосинтезом.
Считается, что 75 % почвенных бактерий в той или иной степени способны к азотофиксации, особенно эффективен в этом
отношении Azospirillum.
Микрофлора ризосферы имеет пространственную неоднородность и временную динамику. По всей длине корней
зоны с большой плотностью микроорганизмов сменяются зонами с меньшей плотностью. Вокруг молодых корней концентрируются Pseudomonas (40 %), Mycobacterium (20 %),
Chromatobacterium (12 %), Micrococcus (3 %), Bacillus (3 %),
количество других представителей не превышает 1–2 %. Этот
комплекс микроорганизмов выполняет следующие функции:
– минерализацию органического субстрата и подготовку
питательных веществ, доступных растениям;
– выделение кислот, способствующих растворению соединений фосфора и магния, извести и силикатов;
– синтез биологически активных веществ;
– создание барьера для патогенных и паразитических
организмов.
Позже начинают преобладать Гр+ бактерии, актинобактерии, разрушители целлюлозы и пектина и др. Пик активности бактерий приходится на период роста и цветения растений, затем активность замедляется и сводится к минимуму,
когда растения переходят в состояние покоя.
Наиболее тесные отношения складываются между симбиотическими клубеньковыми азотофиксирующими бактериями
и растениями из семейства бобовых и некоторых родов издругих семейств (миртовых, казуариновых, берёзовых, лоховых).
Не смотря на то, что клубеньковые бактерии по способу проникновения и изменения тканей растения хозяина сходны
с патогенными бактериями, выгода, получаемая от них растениями, позволяет считать эти взаимоотношения приближающимся к мутуализму. Корневые волоски бобовых растений
выделяют аттрактанты — изофлавоноиды, которые вместе
с лектинами способствуют адгезии бактерий рода Rhizobium.
Выделяющийся корнями в виде экссудата триптофан бактерии
преобразуют в ауксин, который способствует удлинению и закручиванию корневых волосков. Прикрепление и проникнове-
Соседние файлы в предмете [НЕСОРТИРОВАННОЕ]
