Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

Микробиология. Ч.3. Мир прокариот. Учебное пособие

.pdf
Скачиваний:
0
Добавлен:
07.09.2026
Размер:
1 Мб
Скачать
☆
1.4. ролЬ прокариот в почвообразовании и дестрУкции опада
1.4. Роль прокариот в почвообразовании и деструкции опада
В формировании почвы микроорганизмы принимают не­посредственное участие. Материнская порода почвы — это подвергшиеся выветриванию осадочные, метаморфические и изверженные породы, на 60 % состоящие из алюмосиликатов разных металлов с обобщающей формулой R 2Al2Si2O8. Они по­степенно разрушаются организмами, вследствие чего накапли­ваются ионы металлов и SiO2. Первопоселенцами выходящих на поверхность земли пород, по существу голого субстрата, выступают листовые и накипные лишайники, бактерии и диа­томовые водоросли. Они способствуют образованию мелкозема, обогащённого органическими веществами, железом, кальцием, магнием и фосфором. Цианобактерии обогащают субстрат азо­том за счет процесса азотофиксации. Продуцируемые микро­организмами кислоты разрушают горные породы, а амины, сахара, уроновые кислоты образуют с минералами хелатные соединения. Слизи, выделяемые микроорганизмами, образуют с минералами комплексные соединения, что способствует бо­лее тесному контакту между частицами субстрата и бактери­ями. Микроорганизмы разлагают одни минералы и накапли­вают другие. Выделяемая ими гидроокись железа, теряя воду, кристаллизуется, и формируются такие минералы, как гетит и лимонит. Бактерия Metallogenium участвует в образовании вторичных окисленных минералов марганца.
В процессе формирования почва постепенно обогаща­ется органикой из отмерших частей организмов, которую не успевают перерабатывать (минерализовать) деструкторы. В настоящее время 85–95 % органики почв составляет гумус, сложный, с непостоянным количественным и качественным составом комплекс соединений. В состав гумуса входят гуми­новые кислоты, гумины, фульвокислоты и гематомелановые кислоты. Гумусовые вещества различаются по степени поли­меризации, дисперсности, растворимости и т. д. В 1914 году А. Г. Трусов предположил, что в образовании гумуса большую роль играет лигнин, а американский почвенный микробиолог З. Ваксман сформулировал теорию лигно-протеинового проис­хождения гумуса с участием микроорганизмов. В раститель­ных остатках помимо лигнина содержатся и другие аромати-
21
22
1. биосфернаЯ ролЬ микроорганизмов
ческие соединения (полифенолы), атакже дубильные вещества. Кроме того ароматические вещества продуцируются микроор­ганизмами в процессе метаболизма. Перечисленные вещества формируют основу гумуса, вступая в реакции вторичной спон­танной полимеризации. Кроме того, белковая фракция мине­рализуется только на 50 %, остальная часть входит в гетеро­циклическое ядро гумуса. Конденсационные процессы лишь частично контролируются ферментами, большей частью моно­меры соединяются спонтанно. Тем не менее микроорганизмы принимают активное участие в образование гумуса. Разлагая органические остатки, они поставляют структурные компо­ненты для вторичной конденсации, а также вырабатывают фенолоксидазы, которые переводят полифенолы в хиноны, подвергающиеся полимеризации. Гумус — очень устойчивый и длительно существующий компонент почвы, который сохра­няются неизменными в течение многих сотен лет, но и он по­степенно минерализуется грибами и бактериями в аэробных условиях. В утилизации гумусовых веществ принимают учас­тие представители автохтонной микрофлоры почвы (псевдомо­нады и проактинобактерии), которые синтезируют оксигеназы, обеспечивающие разрыв связей ароматического кольца вблизи гидроксильной группы. В результате образуются ненасыщен­ные органические кислоты. В анаэробных условиях аромати­ческие соединения подвергаются восстановлению с образова­нием метана. В этом процессе принимают участие метаногены в кооперации с другими анаэробными бактериями.
При разложении перегноя выделяются гидроокиси же­леза и алюминия, вступающие в реакции с фульвокислотами и выпадающие в осадок в аллювиальном горизонте. Анаэробы восстанавливают железо и вызывают оглеение почв.
Гумусовые вещества непосредственно недоступны расте­ниям, тем не менее, значение гумуса в повышении плодо­родия почв велико. Оно заключается в аккумуляции и удер­жании питательных веществ, улучшении структуры почв, тепло-влагоемкости, наличии биологически активных веществ, стимулирующих рост и развитие растений.
Разложение и преобразование органических веществ по­чвы — одна из важнейших функций прокариот. Большая часть органики поступает в почву с растительным опадом. Скорость минерализации разных соединений не одинакова.
1.4. ролЬ прокариот в почвообразовании и дестрУкции опада
Большая часть отмершей растительной и животной биомассы разлагается сравнительно легко комплексом «микроорганиз­мов компостирования». Лигнин, углеводороды, воска, хитин разлагаются очень медленно. Одревесневшие растительные остатки, представленные лигноцеллюлозой, начали накапли­ваться с фанерозоя (350 млн лет). Лигнин (полимер фенил­пропана) почти не доступен бактериям, за исключением ми­крофлоры пищеварительного тракта термитов. Разложение лигнина до исходных ароматических соединений проводят грибы из родов Polyporus, Pleurotus, Phaenorohaete и др., после чего деструкцию продолжают бактерии. Для гидролиза хитина необходим фермент хитиназа. Этот фермент выраба­тывает довольно большая группа грибов и аэробных прокари­от. В первую очередь это актиномицеты, а так же такие бак­терии из родов Pseudomonas, Flavobacterium, Arthrobacter, Clostridium и некоторые др.
Большую долю опада составляет целлюлоза. Она пере­рабатывается как аэробными, так и анаэробными микроор­ганизмами, к последним относятся Clostridium thermocellum,
Acetovibrio cellulolyticus, а также виды родов Rhuminicoccus, Bacteroides сellulosolvens и др. В тундровых почвах разложе-
ние целлюлозы в первую очередь связано с медленно расту­щими грибами (видами Demalium, Penicillium), в таежных почвах к ним добавляются микобактерии и представители рода Cellvibrio. В южных почвах значение грибов снижается, и в деструкции целлюлозы начинают ведущую роль играть бактерии.
Гидролиз полимеров осуществляется бактериями за счет экзоферментов, которые выделяются во внешнюю среду, или находятся в клеточной стенке, что подразумевает тесный кон­такт клеток с субстратом. Гены, отвечающие за образование гидролитических ферментов, быстро распространились среди бактерий врезультате латерального переноса, поэтому функци­ональная группа бактерий, разрушающих целлюлозу, состоит из представителей разных таксонов. Гены, кодирующие эти ферменты, видимо, появились в то время, когда растения вышли на сушу и начали в больших объёмах синтезировать целлюлозу для толстостенных элементов проводящих и меха­нических тканей. Однако нужно отметить, что в разрушении древесины в первую очередь участвуют грибы, а бактерии
23
24
1. биосфернаЯ ролЬ микроорганизмов
подключаются на последующих этапах. Преимущество грибов заключается в том, что гифы могут проникать внутрь дре­весины и их слизистые чехлы удерживают гидролазы рядом с гифами и препятствуют рассеянию продуктов гидролиза. Ксилотрофные грибы представлены разными группами — базидиомицетами, сумчатыми, несовершенными и даже хитри­диевыми. На разных этапах разложения участвуют разные группы грибов. На упавших стволах в результате деятельнос­ти грибных ферментов сначала образуется бурая гниль, затем набуром фоне появляются белые пятна— мраморная гниль, да­лее подключаются многочисленные бактерии. Процесс деструк­ции древесины до полной гумификации длится несколько лет. Оставшийся после разложения других компонентов лигнин участвует в образовании гумуса. Часть лигнина минерализу­ется. В присутствии закисного железа окисление олигосаха­ридов приводит к образованию ОН-радикалов, мощных окис­лителей, которые воздействует на алифатические связи (С–С) между фенилпропановыми частями лигнина. В результате образуются лигнолы, доступные для бактерий, разлагающих их до ароматических кислот, фенолов и катехинов, впоследст­вии полностью минерализующиеся.
В общей сложности в деструкции растительных остатков участвуют десятки тысяч видов грибов и бактерий. Это — грибы-гидролитики; аэробные бактерии, использующие про­дукты гидролиза лигнина; аэробы и анаэробы, использующие продукты деметилирования лигнина и пектина; аэробы и ана­эробы, разрушающие целлюлозу и пектин; хитинолитические бактерии, питающиеся отмершими остатками грибов; бакте­рии, использующие глюкозамин — продукт деполимериза­ции хитина и муреина; анаэробы с «хиноновым» дыханием, использующие в качестве акцепторов электронов окисленные ароматические соединения.
1.5. Роль прокариот в поддержании
баланса биосферы
Современное состояние биосферы во многом зависит от микроорганизмов, которые не только создали ее задол­го до появления эукариот, но и продолжают поддерживать
1.5. ролЬ прокариот в поддержании баланса биосферы
баланс окисленных и восстановленных состояний ее элемен­тов. Равновесное состояние биосферы зависит от процессов, обеспечиваемых энергетическими солнечными потоками. Малый круговорот веществ, связанный с превращениями внутри биосферы находится в прямой зависимости и взаи­модействии с круговоротом в планетарном масштабе. В био­логический круговорот вовлечены все химические элементы, участвующие в построение тел живых организмов и их мета­болизме. Фотоавтотрофы аккумулируют солнечную энергию, а хемолитоавтотрофы — энергию окисления минеральных соединений, переводя ее в энергию, заключенную в сложных органических соединениях. Исходные для фото- и хемосинте­за минеральные компоненты очень бедны энергией.
Построение органических соединений, вовлекаемых в круговорот веществ биосферы, связано с использованием минеральных ресурсов планеты. На фотосинтез ежегодно ис­пользуется 1/50 часть атмосферного углекислого газа. Одна­ко его содержание в атмосфере сохраняется на уровне 0,03 % благодаря процессу минерализации. Несмотря на фиксацию около 180 млн т азота в год, содержание молекулярного азота в атмосфере сохраняется на уровне 78 % благодаря процессу денитрификации.
Переработка органики в неорганические соединения — необходимое условие поддержание жизни на планете. Она осуществляется организмами деструкторами (редуцентами) — грибами и прокариотами, которые в отличие от животных (консументов) способны полностью извлекать энергию, ак­кумулированную в химических связях органических соеди­нений, переводя находящиеся в них элементы на базовый неорганический уровень. Микроорганизмы представляют собой конвейер по переработке органики, где каждая группа выпол­няет свою собственную работу и передаёт последующей груп­пе продукты своей жизнедеятельности в качестве субстрата. Это явление получило название «метабиоз».
В результате работы деструкторов создается возможность снова вовлекать минеральные соединения в сферу жизнедея­тельности, которая осуществляется в условиях большой энер­гоемкости ее компонентов.
25
2.  БАКТЕРИАЛЬНЫЕ  СООБЩЕСТВА  И РАСПРОСТРАНЕНИЕ  ПРОКАРИОТ
2.1. Бактериальные сообщества:
особенности структурной организации и взаимодействия
Трофические связи
Основные связи, организующие прокариотические сообще­ства — трофические. Микробные сообщества различных местоо­битаний сильно различаются, нотрофические отношения между функциональными группами принципиально сходны. Особен­ность трофических взаимоотношений прокариот — осуществле­ние поэтапного совместного полного окисления субстрата микроб­ным сообществом. Продукты жизнедеятельности одних групп микроорганизмов используются другими в качестве источника пищи и так далее, до полного извлечения энергии из соеди­нений, участвующих в метаболизме. Наглядным примером со­гласованной работы служат трофические связи, складывающи­еся в анаэробном метаногенном сообществе (Рис. 4). На первом этапе процесс разложения органики осуществляют первичные деструкторы. Доступные растворимые вещества отмершей биомас­сы сбраживаются, а нерастворимые биополимеры подвергаются воздействию ферментов, выделяемых гидролитиками. По типу используемых биополимеров гидролитики делятся надве группы: утилизирующие легкоразлагающиеся биополимеры, к которым
2.1. бактериалЬные сообщества: особенности стрУктУрной организации
относятся в первую очередь аммонификаторы, и разлагаю­щие устойчивые соединения, к которым относятся большей частью целлюлозоразрушители. Образующиеся в результате гидролиза мономеры усваиваются как самими гидролитика­ми, так и бактериями других групп. Гидролитические фер­менты выделяются прокариотами во внешнюю среду. Эффек­тивность внеклеточного гидролиза усиливается при агрегации бактерий, с чем отчасти связано тяготение к формированию микроколоний и других скоплений. Благодаря тесному кон­такту бактерий с субстратом потеря продуктов сведена к ми­нимуму, однако некоторая часть продуктов гидролиза всё же уходит из сферы досягаемости гидролитиков и достаётся «микрофлоре рассеяния» (диссипотрофам), не имеющим соб­ственных гидролаз и использующих мономеры, поступаю­щие в том числе и в результате рассеивания при гидроли­зе. Примечательно, что большинство гидролитиков относятся к грамположительным микроорганизмам, а большинство дис­сипотрофов преимущественно грамотрицательные. Некоторые диссипотрофы относятся к олиготрофам, то есть довольству­ются низкими концентрациями питательных веществ в среде. Диссипотрофы выполняют свою важную роль в работе сооб­щества, снижая концентрацию продуктов гидролиза ниже по­рогового уровня, останавливающего синтез гидролаз. В сооб­ществах, включающих группы гидролитиков и диссипотрофов, разложение биополимеров проходит гораздо эффективнее. Про­дуктами жизнедеятельности первичных деструкторов (летучими жирными кислотами, спиртами и т. д.) пользуются вторичные деструкторы, которые переводят углерод в максимально окис­ленное состояние (СО2), и ацетогенные бактерии. Последние реакции термодинамически возможны при условии активного удаления из среды водорода, тормозящего прямую реакцию. Водород удаляется гидрогенотрофными бактериями (водород­ными бактериями, метаногенами). При разложении ацетата, например, проходит ацетокластический метаногенез, осуществ­ляемый археями Methanosarcina и Methanothrix. В результате деятельности первичных и вторичных деструкторов отмершая биомасса полностью минерализуется, и образующиеся неорга­нические вещества могут использоваться автотрофами. Таким образом, микробное сообщество представляет собой хорошо согласованную систему по утилизации субстрата.
27
28
2. бактериалЬные сообщества и распространение прокариот
Рис. 4. Схема трофических связей
ванаэробном метаногенном сообществе
В результате изучения межвидового переноса водорода было открыто явление синтрофии (совместного питания), по­дразумевающее осуществление реакции только в результате совместного участия организмов. Синтрофия показывает су­ществование энергетического единства не только в пределах организма, но и сообщества в целом. Примеры синтрофии — это рассмотренная выше кооперация окисляющих жирные кислоты бактерий с метаногенами, зелёных серных бактерий с сульфатредукторами. Межвидовой перенос водорода, иду­щий от первичных к вторичным деструкторам, явление до­вольно распространённое. Сульфатредукторы поглощают водо­род даже эффективнее, чем метаногены.
Кооперация, как жизненная стратегия, характерна для высокоспециализированных видов, в то время как неспециа­лизированные микроорганизмы, способные усваивать разно-
2.1. бактериалЬные сообщества: особенности стрУктУрной организации
образные вещества, находятся между собой в конкурентных отношениях. Для синтрофов характерно образование агре­гатов с очень тесным расположением клеток вплоть до со­прикосновения мембранами, что обеспечивает эффективный обмен веществами между взаимозависимыми организмами. Агрегаты могут достигать больших размеров и иметь упорядо­ченную внутреннюю структуру. Используемые в метанотенках бактерии формируют гранулы размером с гречневое зерно. Бактерия Methanosarcina образует пористую рыхлую «парен­химатозную ткань», в свободных пространствах которой рас­полагаются другие микроорганизмы. Организмы, конкуриру­ющие за субстрат, напротив, должны иметь довольно большое диффузное пространство. В качестве разделителя часто ис­пользуется слизь. Расположенные внутри слизистой капсулы клетки резервируют за собой пространство в границах своего слизистого образования. Слизистые чехлы и капсулы порой во много раз превышают объём погружённых в них бактерий.
В пространстве сообщества трофические связи обеспечи­ваются наличием транспортных потоков. По способу питания бактерии относятся к осмотрофам, поэтому питание, а также обмен продуктами между микроорганизмами осуществляет­ся путём молекулярной диффузии в пределах минимального диффузного расстояния между клетками. В трёхмерном про­странстве обмен протекает по всем трём направлениям, поэ­тому именно объёмные агрегации обеспечивают транспортные потоки наилучшим образом, в них также создаются условия для анаэробов. Если внутри гранулы находится питательный субстрат, потребляемый анаэробами, то потоки метаболитов распространяются во все стороны от центра. Приближаясь к поверхности гранулы, они перехватываются скопившими­ся здесь аэробными бактериями, использующими продукты неполного окисления анаэробов в качестве питательного суб­страта. Поглощая кислород, аэробы отсекают поток кислорода и создают анаэробные условия внутри агрегата.
Бентосные организмы получают питательный субстрат, попадающий к ним сверху в результате седиментации. Транс­портные потоки, в этом случае, идут параллельно противото­ком в вертикальном направлении. На дне микроорганизмы располагаются слоями. Вкаждом слое находятся определённые группы микроорганизмов, обеспечивающие последовательную
29
30
2. бактериалЬные сообщества и распространение прокариот
переработку оседающий из толщи воды отмершей биомассы. Планктонные микроорганизмы используют конвекционные потоки для транспортировки питательного субстрата и про­дуктов метаболизма. В нейстоне транспорт веществ осуществ­ляется в горизонтальном направлении с использованием по­верхностного натяжения. Математическое моделирование показало, что жизнь ценоза часто лимитируется не недостат­ком питания, а неэффективным транспортом веществ. В этом отношении прокариоты представляют собой идеально слажен­ную систему перераспределения потоков вещества и энергии внутри консорциумов, в которых сосуществуют и взаимодей­ствуют филогенетически далекие группы микроорганизмов с противоположными жизненными стратегиями.
Взаимодействие бактерий ссубстратом
В природе каждый вид стремится занять максималь­ное пространство с комплексом условий, пригодных для его жизни. У очень мелких существ — бактерий на первый план выходит колонизация питательного субстрата на всей его про­тяжённости. Для этого они выработали ряд приспособлений, обеспечивающих хемотаксис и адгезию.
Хемотаксис — это одна из реакций, направляющая дви­жение бактерии в сторону увеличения или уменьшения кон­центрации определённого вещества. В отсутствии градиента концентрации веществ, клетки двигаются активно, но бес­порядочно, чередуя кувырки и прямолинейное движение. При появлении градиента концентрации, дистанция пробега в нужном направлении увеличивается, а количество кувыр­ков уменьшается. Движение в сторону источника пищи обес­печивается с помощью хеморецепторов — специфических бел­ков, способных присоединять к себе определённые вещества. Под воздействием эффектора конфигурация рецептора изме­няется, и образуется комплекс атрактант–рецептор, который связывается с метилакцепторным белком, расположенным в мембране. Происходит метилирование рецептора, активи­рующее прямолинейное движение, когда процесс метилиро­вание прекращается, движения бактерии становятся хаотич­ными. Для разных бактерий атрактантами выступают разные вещества. Бактерия Vibrio alginolyticus, живущая на морских водорослях, привлекается гликолевой и акриловой кислотами,
Соседние файлы в предмете [НЕСОРТИРОВАННОЕ]