Добавил:
ivanov666
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз:
Предмет:
Файл:Микробиология. Ч.3. Мир прокариот. Учебное пособие
.pdf
1.4. ролЬ прокариот в почвообразовании и дестрУкции опада
1.4. Роль прокариот в почвообразовании
и деструкции опада
В формировании почвы микроорганизмы принимают непосредственное участие. Материнская порода почвы — это
подвергшиеся выветриванию осадочные, метаморфические
и изверженные породы, на 60 % состоящие из алюмосиликатов
разных металлов с обобщающей формулой R 2Al2Si2O8. Они постепенно разрушаются организмами, вследствие чего накапливаются ионы металлов и SiO2. Первопоселенцами выходящих
на поверхность земли пород, по существу голого субстрата,
выступают листовые и накипные лишайники, бактерии и диатомовые водоросли. Они способствуют образованию мелкозема,
обогащённого органическими веществами, железом, кальцием,
магнием и фосфором. Цианобактерии обогащают субстрат азотом за счет процесса азотофиксации. Продуцируемые микроорганизмами кислоты разрушают горные породы, а амины,
сахара, уроновые кислоты образуют с минералами хелатные
соединения. Слизи, выделяемые микроорганизмами, образуют
с минералами комплексные соединения, что способствует более тесному контакту между частицами субстрата и бактериями. Микроорганизмы разлагают одни минералы и накапливают другие. Выделяемая ими гидроокись железа, теряя воду,
кристаллизуется, и формируются такие минералы, как гетит
и лимонит. Бактерия Metallogenium участвует в образовании
вторичных окисленных минералов марганца.
В процессе формирования почва постепенно обогащается органикой из отмерших частей организмов, которую
не успевают перерабатывать (минерализовать) деструкторы.
В настоящее время 85–95 % органики почв составляет гумус,
сложный, с непостоянным количественным и качественным
составом комплекс соединений. В состав гумуса входят гуминовые кислоты, гумины, фульвокислоты и гематомелановые
кислоты. Гумусовые вещества различаются по степени полимеризации, дисперсности, растворимости и т. д. В 1914 году
А. Г. Трусов предположил, что в образовании гумуса большую
роль играет лигнин, а американский почвенный микробиолог
З. Ваксман сформулировал теорию лигно-протеинового происхождения гумуса с участием микроорганизмов. В растительных остатках помимо лигнина содержатся и другие аромати-
21

22
1. биосфернаЯ ролЬ микроорганизмов
ческие соединения (полифенолы), атакже дубильные вещества.
Кроме того ароматические вещества продуцируются микроорганизмами в процессе метаболизма. Перечисленные вещества
формируют основу гумуса, вступая в реакции вторичной спонтанной полимеризации. Кроме того, белковая фракция минерализуется только на 50 %, остальная часть входит в гетероциклическое ядро гумуса. Конденсационные процессы лишь
частично контролируются ферментами, большей частью мономеры соединяются спонтанно. Тем не менее микроорганизмы
принимают активное участие в образование гумуса. Разлагая
органические остатки, они поставляют структурные компоненты для вторичной конденсации, а также вырабатывают
фенолоксидазы, которые переводят полифенолы в хиноны,
подвергающиеся полимеризации. Гумус — очень устойчивый
и длительно существующий компонент почвы, который сохраняются неизменными в течение многих сотен лет, но и он постепенно минерализуется грибами и бактериями в аэробных
условиях. В утилизации гумусовых веществ принимают участие представители автохтонной микрофлоры почвы (псевдомонады и проактинобактерии), которые синтезируют оксигеназы,
обеспечивающие разрыв связей ароматического кольца вблизи
гидроксильной группы. В результате образуются ненасыщенные органические кислоты. В анаэробных условиях ароматические соединения подвергаются восстановлению с образованием метана. В этом процессе принимают участие метаногены
в кооперации с другими анаэробными бактериями.
При разложении перегноя выделяются гидроокиси железа и алюминия, вступающие в реакции с фульвокислотами
и выпадающие в осадок в аллювиальном горизонте. Анаэробы
восстанавливают железо и вызывают оглеение почв.
Гумусовые вещества непосредственно недоступны растениям, тем не менее, значение гумуса в повышении плодородия почв велико. Оно заключается в аккумуляции и удержании питательных веществ, улучшении структуры почв,
тепло-влагоемкости, наличии биологически активных веществ,
стимулирующих рост и развитие растений.
Разложение и преобразование органических веществ почвы — одна из важнейших функций прокариот. Большая
часть органики поступает в почву с растительным опадом.
Скорость минерализации разных соединений не одинакова.

1.4. ролЬ прокариот в почвообразовании и дестрУкции опада
Большая часть отмершей растительной и животной биомассы
разлагается сравнительно легко комплексом «микроорганизмов компостирования». Лигнин, углеводороды, воска, хитин
разлагаются очень медленно. Одревесневшие растительные
остатки, представленные лигноцеллюлозой, начали накапливаться с фанерозоя (350 млн лет). Лигнин (полимер фенилпропана) почти не доступен бактериям, за исключением микрофлоры пищеварительного тракта термитов. Разложение
лигнина до исходных ароматических соединений проводят
грибы из родов Polyporus, Pleurotus, Phaenorohaete и др.,
после чего деструкцию продолжают бактерии. Для гидролиза
хитина необходим фермент хитиназа. Этот фермент вырабатывает довольно большая группа грибов и аэробных прокариот. В первую очередь это актиномицеты, а так же такие бактерии из родов Pseudomonas, Flavobacterium, Arthrobacter,
Clostridium и некоторые др.
Большую долю опада составляет целлюлоза. Она перерабатывается как аэробными, так и анаэробными микроорганизмами, к последним относятся Clostridium thermocellum,
Acetovibrio cellulolyticus, а также виды родов Rhuminicoccus,
Bacteroides сellulosolvens и др. В тундровых почвах разложе-
ние целлюлозы в первую очередь связано с медленно растущими грибами (видами Demalium, Penicillium), в таежных
почвах к ним добавляются микобактерии и представители
рода Cellvibrio. В южных почвах значение грибов снижается,
и в деструкции целлюлозы начинают ведущую роль играть
бактерии.
Гидролиз полимеров осуществляется бактериями за счет
экзоферментов, которые выделяются во внешнюю среду, или
находятся в клеточной стенке, что подразумевает тесный контакт клеток с субстратом. Гены, отвечающие за образование
гидролитических ферментов, быстро распространились среди
бактерий врезультате латерального переноса, поэтому функциональная группа бактерий, разрушающих целлюлозу, состоит
из представителей разных таксонов. Гены, кодирующие эти
ферменты, видимо, появились в то время, когда растения
вышли на сушу и начали в больших объёмах синтезировать
целлюлозу для толстостенных элементов проводящих и механических тканей. Однако нужно отметить, что в разрушении
древесины в первую очередь участвуют грибы, а бактерии
23

24
1. биосфернаЯ ролЬ микроорганизмов
подключаются на последующих этапах. Преимущество грибов
заключается в том, что гифы могут проникать внутрь древесины и их слизистые чехлы удерживают гидролазы рядом
с гифами и препятствуют рассеянию продуктов гидролиза.
Ксилотрофные грибы представлены разными группами —
базидиомицетами, сумчатыми, несовершенными и даже хитридиевыми. На разных этапах разложения участвуют разные
группы грибов. На упавших стволах в результате деятельности грибных ферментов сначала образуется бурая гниль, затем
набуром фоне появляются белые пятна— мраморная гниль, далее подключаются многочисленные бактерии. Процесс деструкции древесины до полной гумификации длится несколько лет.
Оставшийся после разложения других компонентов лигнин
участвует в образовании гумуса. Часть лигнина минерализуется. В присутствии закисного железа окисление олигосахаридов приводит к образованию ОН-радикалов, мощных окислителей, которые воздействует на алифатические связи (С–С)
между фенилпропановыми частями лигнина. В результате
образуются лигнолы, доступные для бактерий, разлагающих
их до ароматических кислот, фенолов и катехинов, впоследствии полностью минерализующиеся.
В общей сложности в деструкции растительных остатков
участвуют десятки тысяч видов грибов и бактерий. Это —
грибы-гидролитики; аэробные бактерии, использующие продукты гидролиза лигнина; аэробы и анаэробы, использующие
продукты деметилирования лигнина и пектина; аэробы и анаэробы, разрушающие целлюлозу и пектин; хитинолитические
бактерии, питающиеся отмершими остатками грибов; бактерии, использующие глюкозамин — продукт деполимеризации хитина и муреина; анаэробы с «хиноновым» дыханием,
использующие в качестве акцепторов электронов окисленные
ароматические соединения.
1.5. Роль прокариот в поддержании
баланса биосферы
Современное состояние биосферы во многом зависит
от микроорганизмов, которые не только создали ее задолго до появления эукариот, но и продолжают поддерживать

1.5. ролЬ прокариот в поддержании баланса биосферы
баланс окисленных и восстановленных состояний ее элементов. Равновесное состояние биосферы зависит от процессов,
обеспечиваемых энергетическими солнечными потоками.
Малый круговорот веществ, связанный с превращениями
внутри биосферы находится в прямой зависимости и взаимодействии с круговоротом в планетарном масштабе. В биологический круговорот вовлечены все химические элементы,
участвующие в построение тел живых организмов и их метаболизме. Фотоавтотрофы аккумулируют солнечную энергию,
а хемолитоавтотрофы — энергию окисления минеральных
соединений, переводя ее в энергию, заключенную в сложных
органических соединениях. Исходные для фото- и хемосинтеза минеральные компоненты очень бедны энергией.
Построение органических соединений, вовлекаемых
в круговорот веществ биосферы, связано с использованием
минеральных ресурсов планеты. На фотосинтез ежегодно используется 1/50 часть атмосферного углекислого газа. Однако его содержание в атмосфере сохраняется на уровне 0,03 %
благодаря процессу минерализации. Несмотря на фиксацию
около 180 млн т азота в год, содержание молекулярного азота
в атмосфере сохраняется на уровне 78 % благодаря процессу
денитрификации.
Переработка органики в неорганические соединения —
необходимое условие поддержание жизни на планете. Она
осуществляется организмами деструкторами (редуцентами) —
грибами и прокариотами, которые в отличие от животных
(консументов) способны полностью извлекать энергию, аккумулированную в химических связях органических соединений, переводя находящиеся в них элементы на базовый
неорганический уровень. Микроорганизмы представляют собой
конвейер по переработке органики, где каждая группа выполняет свою собственную работу и передаёт последующей группе продукты своей жизнедеятельности в качестве субстрата.
Это явление получило название «метабиоз».
В результате работы деструкторов создается возможность
снова вовлекать минеральные соединения в сферу жизнедеятельности, которая осуществляется в условиях большой энергоемкости ее компонентов.
25

2. БАКТЕРИАЛЬНЫЕ
СООБЩЕСТВА
И РАСПРОСТРАНЕНИЕ
ПРОКАРИОТ
2.1. Бактериальные сообщества:
особенности структурной организации
и взаимодействия
Трофические связи
Основные связи, организующие прокариотические сообщества — трофические. Микробные сообщества различных местообитаний сильно различаются, нотрофические отношения между
функциональными группами принципиально сходны. Особенность трофических взаимоотношений прокариот — осуществление поэтапного совместного полного окисления субстрата микробным сообществом. Продукты жизнедеятельности одних групп
микроорганизмов используются другими в качестве источника
пищи и так далее, до полного извлечения энергии из соединений, участвующих в метаболизме. Наглядным примером согласованной работы служат трофические связи, складывающиеся в анаэробном метаногенном сообществе (Рис. 4). На первом
этапе процесс разложения органики осуществляют первичные
деструкторы. Доступные растворимые вещества отмершей биомассы сбраживаются, а нерастворимые биополимеры подвергаются
воздействию ферментов, выделяемых гидролитиками. По типу
используемых биополимеров гидролитики делятся надве группы:
утилизирующие легкоразлагающиеся биополимеры, к которым

2.1. бактериалЬные сообщества: особенности стрУктУрной организации
относятся в первую очередь аммонификаторы, и разлагающие устойчивые соединения, к которым относятся большей
частью целлюлозоразрушители. Образующиеся в результате
гидролиза мономеры усваиваются как самими гидролитиками, так и бактериями других групп. Гидролитические ферменты выделяются прокариотами во внешнюю среду. Эффективность внеклеточного гидролиза усиливается при агрегации
бактерий, с чем отчасти связано тяготение к формированию
микроколоний и других скоплений. Благодаря тесному контакту бактерий с субстратом потеря продуктов сведена к минимуму, однако некоторая часть продуктов гидролиза всё же
уходит из сферы досягаемости гидролитиков и достаётся
«микрофлоре рассеяния» (диссипотрофам), не имеющим собственных гидролаз и использующих мономеры, поступающие в том числе и в результате рассеивания при гидролизе. Примечательно, что большинство гидролитиков относятся
к грамположительным микроорганизмам, а большинство диссипотрофов преимущественно грамотрицательные. Некоторые
диссипотрофы относятся к олиготрофам, то есть довольствуются низкими концентрациями питательных веществ в среде.
Диссипотрофы выполняют свою важную роль в работе сообщества, снижая концентрацию продуктов гидролиза ниже порогового уровня, останавливающего синтез гидролаз. В сообществах, включающих группы гидролитиков и диссипотрофов,
разложение биополимеров проходит гораздо эффективнее. Продуктами жизнедеятельности первичных деструкторов (летучими
жирными кислотами, спиртами и т. д.) пользуются вторичные
деструкторы, которые переводят углерод в максимально окисленное состояние (СО2), и ацетогенные бактерии. Последние
реакции термодинамически возможны при условии активного
удаления из среды водорода, тормозящего прямую реакцию.
Водород удаляется гидрогенотрофными бактериями (водородными бактериями, метаногенами). При разложении ацетата,
например, проходит ацетокластический метаногенез, осуществляемый археями Methanosarcina и Methanothrix. В результате
деятельности первичных и вторичных деструкторов отмершая
биомасса полностью минерализуется, и образующиеся неорганические вещества могут использоваться автотрофами. Таким
образом, микробное сообщество представляет собой хорошо
согласованную систему по утилизации субстрата.
27

28
2. бактериалЬные сообщества и распространение прокариот
Рис. 4. Схема трофических связей
ванаэробном метаногенном сообществе
В результате изучения межвидового переноса водорода
было открыто явление синтрофии (совместного питания), подразумевающее осуществление реакции только в результате
совместного участия организмов. Синтрофия показывает существование энергетического единства не только в пределах
организма, но и сообщества в целом. Примеры синтрофии —
это рассмотренная выше кооперация окисляющих жирные
кислоты бактерий с метаногенами, зелёных серных бактерий
с сульфатредукторами. Межвидовой перенос водорода, идущий от первичных к вторичным деструкторам, явление довольно распространённое. Сульфатредукторы поглощают водород даже эффективнее, чем метаногены.
Кооперация, как жизненная стратегия, характерна для
высокоспециализированных видов, в то время как неспециализированные микроорганизмы, способные усваивать разно-

2.1. бактериалЬные сообщества: особенности стрУктУрной организации
образные вещества, находятся между собой в конкурентных
отношениях. Для синтрофов характерно образование агрегатов с очень тесным расположением клеток вплоть до соприкосновения мембранами, что обеспечивает эффективный
обмен веществами между взаимозависимыми организмами.
Агрегаты могут достигать больших размеров и иметь упорядоченную внутреннюю структуру. Используемые в метанотенках
бактерии формируют гранулы размером с гречневое зерно.
Бактерия Methanosarcina образует пористую рыхлую «паренхиматозную ткань», в свободных пространствах которой располагаются другие микроорганизмы. Организмы, конкурирующие за субстрат, напротив, должны иметь довольно большое
диффузное пространство. В качестве разделителя часто используется слизь. Расположенные внутри слизистой капсулы
клетки резервируют за собой пространство в границах своего
слизистого образования. Слизистые чехлы и капсулы порой
во много раз превышают объём погружённых в них бактерий.
В пространстве сообщества трофические связи обеспечиваются наличием транспортных потоков. По способу питания
бактерии относятся к осмотрофам, поэтому питание, а также
обмен продуктами между микроорганизмами осуществляется путём молекулярной диффузии в пределах минимального
диффузного расстояния между клетками. В трёхмерном пространстве обмен протекает по всем трём направлениям, поэтому именно объёмные агрегации обеспечивают транспортные
потоки наилучшим образом, в них также создаются условия
для анаэробов. Если внутри гранулы находится питательный
субстрат, потребляемый анаэробами, то потоки метаболитов
распространяются во все стороны от центра. Приближаясь
к поверхности гранулы, они перехватываются скопившимися здесь аэробными бактериями, использующими продукты
неполного окисления анаэробов в качестве питательного субстрата. Поглощая кислород, аэробы отсекают поток кислорода
и создают анаэробные условия внутри агрегата.
Бентосные организмы получают питательный субстрат,
попадающий к ним сверху в результате седиментации. Транспортные потоки, в этом случае, идут параллельно противотоком в вертикальном направлении. На дне микроорганизмы
располагаются слоями. Вкаждом слое находятся определённые
группы микроорганизмов, обеспечивающие последовательную
29

30
2. бактериалЬные сообщества и распространение прокариот
переработку оседающий из толщи воды отмершей биомассы.
Планктонные микроорганизмы используют конвекционные
потоки для транспортировки питательного субстрата и продуктов метаболизма. В нейстоне транспорт веществ осуществляется в горизонтальном направлении с использованием поверхностного натяжения. Математическое моделирование
показало, что жизнь ценоза часто лимитируется не недостатком питания, а неэффективным транспортом веществ. В этом
отношении прокариоты представляют собой идеально слаженную систему перераспределения потоков вещества и энергии
внутри консорциумов, в которых сосуществуют и взаимодействуют филогенетически далекие группы микроорганизмов
с противоположными жизненными стратегиями.
Взаимодействие бактерий ссубстратом
В природе каждый вид стремится занять максимальное пространство с комплексом условий, пригодных для его
жизни. У очень мелких существ — бактерий на первый план
выходит колонизация питательного субстрата на всей его протяжённости. Для этого они выработали ряд приспособлений,
обеспечивающих хемотаксис и адгезию.
Хемотаксис — это одна из реакций, направляющая движение бактерии в сторону увеличения или уменьшения концентрации определённого вещества. В отсутствии градиента
концентрации веществ, клетки двигаются активно, но беспорядочно, чередуя кувырки и прямолинейное движение.
При появлении градиента концентрации, дистанция пробега
в нужном направлении увеличивается, а количество кувырков уменьшается. Движение в сторону источника пищи обеспечивается с помощью хеморецепторов — специфических белков, способных присоединять к себе определённые вещества.
Под воздействием эффектора конфигурация рецептора изменяется, и образуется комплекс атрактант–рецептор, который
связывается с метилакцепторным белком, расположенным
в мембране. Происходит метилирование рецептора, активирующее прямолинейное движение, когда процесс метилирование прекращается, движения бактерии становятся хаотичными. Для разных бактерий атрактантами выступают разные
вещества. Бактерия Vibrio alginolyticus, живущая на морских
водорослях, привлекается гликолевой и акриловой кислотами,
Соседние файлы в предмете [НЕСОРТИРОВАННОЕ]
