Добавил:
Upload Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:
статья Смирнова.doc
Скачиваний:
11
Добавлен:
23.02.2015
Размер:
826.88 Кб
Скачать

Литература

1 Берг Л.С. // Труды по теории эволюции. Л. Наука, 1977.

2 Берг Л.С. // Номогенез, или эволюция на основе закономерностей. Тр. географ. ин-та, Гос. изд.-во Петроград 1, 1922.

3 Любищев А.А. // Проблемы формы систематики и эволюции организмов. Москва. Наука, 1982.

4 Смирнов Г.Б. // ВНИИМИ, Медицина и здравоохранение, сер. Эпидемиология, вирусология и инфекционные заболевания, Выпуск 3. Москва, 1988, с.1.

5 Соболев Д.Н. // Начала исторической биогенетики. Киев. Гос.издат. Украины, 1924.

6 Филипченко Ю.А. // Эволюционная идея в биологии. Москва, Наука, 1977, с.205.

7 Achaz G., Rocha E. P. C., Netter P., and Coissac E.//Nucleic Acids Research, 2002, V. 30, P. 2987.

8 Akman L.A., Yamashita H., Watanabe K., Oshima T., Shiba M., and Aksoy S. // Nat. Genet. 2002, V. 32, P. 402.

9 Alsmark C.M., Frank A.C., Karlberg E.O., Legault B.A., Ardel D.H. Canback l, B., Eriksson A.S., Naslund A.K. , Handley S.A., Huvet M., La Scola B., Holmberg M., and Andersson S.G. // Proc Natl Acad Sci U S A. 2004 V. 101(26), P. 9716.

10 Andersson J.O. and Andersson S. G. // Mol. Biol. Evol. 1999, V. 16, P.1178.

11 Andersson J.O. and Andersson S.G.E. // Mol. Biol. Evol. 2001, V.18, P. 829.

12 Andersson S.G.E. and Kurland C.G. // APMIS 1998, Suppl. 84, P.5.

13 Andersson, J.O. and Andersson, S.G. E. // Curr. Op. Gen. Dev.1999, V. 9, P. 664.

14 Andersson, J.O., Sarchfield S.W., and Roger A.J. // Molecular Biology and Evolution 2005, V. 22, №1, P. 85.

15 Aras R.A., Kang J., Tschumi A I., Harasaki Y., and Blaser M.J. // Proc Natl Acad Sci USA 2003, V. 100, P.13579.

16 Arber W. //Ann N Y Acad Sci. 1999, V. 18, № 870, P. 36.

17 Baldo L., Bordenstein S., Wernegreen J.J., and Werren J.H. // Molecular Biology and Evolution 2006, V. 23, №2, P. 437.

18 Barbour A.G. and Restrepo B.I. // Emerging Infectious Diseases 2000, V. 6, P. 5.

19 Barke A and Manning P.A. // Microbiology 1997, V. 143, P. 1805.

20 Bennetzen J., Ma J., and Devos K.M. // Annals of Botany 2005, V. 95, P.127.

21 Berg O.G. and Kurland C.G. // Molecular Biology and Evolution 2002, V. 19, P. 2265.

22 Bi X. and Liu L.F. // Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol.1996, V. 54, P. 253.

23 Bitter W., Gerrits H., Kieft R., and Borst P. // Nature 1998, V. 391, P. 499.

24 Bozeman F.M., Masiello S.A., Williams M.S., Elisberg B.L. // Nature 1975, V. 255, P. 545.

25 Bringaud F., Biteau N., Zuiderwijk E., Berriman M., El-Sayed N.M., Ghedin E., Melville S.E., Hall N., and Baltz T. // Mol. Biol. Evol. 2004, V. 21, №3, P. 520.

26 Brinig M.M., Cummings C.A., Sanden G.N., Stefanelli P., Lawrence A., and Relman D.A. // J. Bacteriol. 2006, V. 188, P. 2375.

27 Brockmeier S.L., Register K.B., Magyar T., Lax A.J., Pullinger G.D., Kunkle R.A. // Infect Immun 2002, V. 70, P. 481.

28 Brubaker R.R. // J. Bacteriol. 1969, V. 98, P. 1404.

29 Caporale L.H. // Evolution of Efficient strategies for evolution: Chance Favors the Prepared Genome. Presented at NECSI's second International Conference on Complexity Studies Nashua, New Hampshire, 1998.

30 Caporale L.H. // Annual Review of Microbiology. 2003, V. 57, P. 467.

31 Chain P.S.G., Carniel E., Larimer F. W. , Lamerdin J., Stoutland P. O., Regala W.M., Georgescu A.M., Vergez L. M., Land M. L., Motin V. L. , Brubaker R. R., Fowler J., Hinnebusch J., Marceau M., Medigue C., Simonet M., Chenal-Francisque V., B. Souza , Dacheux D., Elliott J.M., Derbise A., Hauser L.J., and Garcia E. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2004,V. 101, №38, P. 13826.

32 Chedin F., Dervyn E., Dervyn R., Ehrlich S.D., and Noirot P. // Mol. Microbiol. 1994, V. 12, P. 561.

33 Clark M.A., Baumann L., Thao M.L., Moran N.A., and Baumann P. // J. Bacteriol. 2001, V. 183, P. 1853.

34 Cole S.T., Eiglmeier K., Parkhill J., James K.D., Thomson N.R., Wheeler P.R., Honore N., Garnier T., Churcher C., Harris D., Mungall K., Basham D., Brown D., Chillingworth T., Connor R., Davies R.M., Devlin K., Duthoy S., Feltwell T., Fraser A., Hamlin N., Holroyd S., Hornsby T., Jagels K., Lacroix C., Maclean J., Moule S., Murphy L., Oliver K., Quail M.A., Rajandream M.A., Rutherford K.M., Rutter S., Seeger K., Simon S., Simmonds M., Skelton J., Squares R., Squares S., Stevens K., Taylor K., Whitehead S., Woodward J.R., Barrell B.G. // Nature 2001, V.409, P. 1007.

35 Dale C., Wang B., Moran N., and Ochman H. // Mol. Biol. Evol., 2003, V. 20, №8, P.1188.

36 Dawkins R. // The Selfish Gene. New York and Oxford: Oxford University Press.1976, P. 47.

37 DeShazer D. // J. Bacteriol. 2004, V. 186, №12, P. 3938.

38 Diavatopoulos D.A., Cummings C. A., Schouls L. M., Brinig M.M., Relman D.A., Mooi F. R. // PLOS Pathogens 2005, V.1, P. 4.

39 Dollo L. // Bull. Soc. Belg. Geol. 1893, P. 7.

40 Doolittle W.F. and Sapienza C. // Nature 1980, V. 284, P. 601.

41 Dufresne A., Garczarek L., and Partensky F. // Genome Biology 2005, V. 6, №2, R14.

42 Dufresne A., Salanoubat M., Partensky F., Artiguenave F., Axmann I.M.B.V., Duprat S., Galperin M.Y., Koonin E.V., Le Gall F. // Proc Natl Acad Sci USA 2003, V. 100, P.10020.

43 Fetherson J.D., Schuetze P., and Perry R.D. // Molec. Microbiol. 1992, V. 6, P. 2693.

44 Fuchslocher B., Millar L.L., and Cotter P.A. // Infect Immun. 2003, V. 71, №6, P. 3043.

45 Gil R., Sabater-Muñoz B., Latorre A., Silva F.J., and Moya A. // Proc Natl Acad Sci U S A. 2002, V. 99, №7, P. 4454.

46 Gil R., Sabater-Munoz B., . Perez-Brocal V, Silva F.J., and Latorre A. // Gene 2006, V. 370, P. 17.

47 Goldshmidt R. // The material basis of evolution (Introd. St.J. Gould). Yale Univ. (1982). (Originally publ.: New Haven:Yale Univ. Press. 1940).

48 Gómez-Valero L., Latorre A., Silva F.J. // Mol. Biol. Evol.2004, V. 21, P. 2172.

49 Gregory T.R. // Gene 2004, V.324, P.15.

50 Hare J.M. and McDonough K.A. // J. Bacteriol. 1999, V. 181, № 16б, P. 4896.

51 Hess W.R. // Curr Opin Biotechnol 2004, V. 15, P. 191.

52 Itoh T., Martin W., and Nei M. // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 2002 V. 99, P. 12944.

53 Julien B. // J Bacteriol. 2003, V. 185, №21, P. 6325.

54 Keeling P.J. and Fast N.M. // Annu. Rev. Microbiol. 2002, V. 56, P. 93.

55 Kim H S., Schell M.A., Yu Y., Ulrich R.L., Sarria S.H., Nierman W.C., and DeShazer D. // BMC Genomics 2005, V. 6, P. 174.

56 Knight C.A., Molinari N.A., and Petrov D.A. // Annals of Botany 2005, V.95 №1, P.177.

57 Komaki K., and Ishikawa H. // J. Mol. Evol. 1999, V. 48, P. 717.

58 Kroger M.and Hobom G. // Nature 1982, V. 297, P.159.

59 Lesic B. and Carniel E. // Journal of Bacteriology, 2005, V. 187, P. 3352.

60 Lips S., Revelard P., and Pays E. // Mol. Biochem. Parasitol. 1993, V. 62, P. 135.

61 Lovett S.T., Gluckman J., Simon P.J., Sutera V.J., and Drapkin P.T.// Mol. Gen. Genet. 1994, V. 245, P. 294.

62 Mahillon J. and Chandler M. // Microbiology and Molecular Biology Reviews 1998, V. 62, №3, P. 3725.

63 McGrath L.C. and Katz L.A. // Trends in Ecology & Evolution, 2004, V. 19, P. 32.

64 Melano R., Petroni A., Garutti A.,. Saka A.H., Mange L., Pasteran F., Rapoport M., RossiA., and Galas M. // Antimicrob. Agents Chemother. 2002, V. 46, P. 2162.

65 Mira A., Ochman H., and Moran N.A. // Trends in Genetics 2001, V. 17, P. 589.

66 Mira A., Klasson L., and Andersson S.G. // Curr Opin Microbiol. 2002, V. 5, № 5, P. 506.

67 Moran N.A. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1996, V. 93, P. 2873.

68 Moran N.A. // Cell 2002, V. 108, P.583.

69 Moran N.A. and Mira A. // Genome Biology 2001, V. 2, P. 12.

70 Moran N.A. and Wernegreen J. J. // Trends in Ecology and Evolution 2000, V. 15, P. 321.

71 Nakabachi A., Yamashita A., Toh H., Ishikawa H., Dunbar H.E., Moran N.A., Hattori M. // Science 2006, V. 314, №5797, P. 267.

72 Natsuko K., Nikoh N., Ijichi N., Shimada M., and Fukatsu T. // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 2002, V. 99, P. 14280.

73 Nierman W.C., DeShazer D., Kim H.S., Tettelin H., Nelson K.E., Feldblyum T., Ulrich R.L., Ronning C.M., Brinkac L.M., Daugherty S.C. // Proc Natl Acad Sci USA. 2004, V.101, P.14246.

74 Ogawa A. and Takeda T. // Microbiol. Immunol.1993, V. 37, P. 607.

75 Orgel L.E. and Crick F.H.C. // Nature 1980, V. 284, P. 604.

76 Parkhill J., Sebaihia M., Preston A., Murphy L.D., Thomson N., Harris D.E. // Nat. Genet. 2003, V. 35, P. 32.

77 Pays E., Tebabi P., Pays A., Coquelet H., Revelard P., and Salmon D. // Cell 1989, V. 57, P. 835.

78 Peeters B.P., de Boer J.H., Bron S., and Venema G. // Mol. Gen. Genet 1988, V. 212, P. 450.

79 Petrov D.A. // Theoretical Population Biology 2002, V. 61, P. 531.

80 Petrov D.A., Lozovskaya E.R., and Hartl D.L. // Nature 1996, V. 384, P. 346.

81 Plague G. R., Dale C., and Moran N.A. // Mol. Ecol. 2003, V. 12, P. 1095.

82 Reiter W.D., Palm P., and Yeats S. // Nucleic Acids Res. 1989, V. 17, №5, P. 1907.

83 Reuter M. and Keller L. // Mol. Biol. Evol. 2003, V. 20, №5, P. 748.

84 Rio R.V.M., LefevreC., Heddi A., and Aksoy S. // Appl. Envir. Microbiol., 2003, V. 69, №11, P. 6825.

85 Rocap G., Larimer F.W., Lamerdin J., Malfatti S., Chain P., Ahlgren N.A., Arellano A., Coleman M., Hauser L., Hess W.R. // Nature 2003, V. 424, P. 1042.

86 Rocha E.P.C. and Blanchard A. // Nucleic Acids Research. 2002, V. 30, P. 2031.

87 Romero D. and Palacios R. // Annu. Rev. Genet. 1997, V. 31, P. 91.

88 Rosas-Magallanes V., P. Deschavanne, L. Quintana-Murci, R. Brosch, B. Gicquel, and O. Neyrolles // Molecular Biology and Evolution 2006, V. 23, №6, P.1129.

89 Roth J.R., Benson N., Galitski T., Haack K., Lawrence J. G. // in Escherichia coli and Salmonella: Cellular and Molecular Biology, edited by R. C. H. Neinhardt, J. L. Ingraham, E. C. C. Lin, B. Low, B. Magasanik et al. ASM Press, Washington, DC. 1996, P. 2256.

90 Rowe-Magnus D.A., Guerout A.-M., and Mazel D. // Mol. Microbiol. 2002, V. 43, P. 1657.

91 Rowe-Magnus D.A., Guerout A.-M., Ploncard P., Dychinco B., Davies J., and Mazel D. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2001, V. 98, P. 652.

92 Rowe-Magnus D.A., Guerout A-M., Biskri L., Bouige P., and Mazel D. // Genome Research 2003, V. 13, P. 428.

93 Rowe-Magnus D.A., Davies J., and Mazel D. // Curr. Top Microbiol. Immunol. 2002, V. 264, P.167.

94 Sabater-Muñoz B., Gómez-Valero L., van Ham R.C.H.J., Silva F.J., and Latorre A. // Applied and Environmental Microbiology, 2002, V. 68, P. 2572.

95 Sabater-Muñoz B., van Ham R. C. H. J., Moya A., Silva F.J., and Latorre A. // Journal of Bacteriology 2004, V. 186, P. 2646.

96 Schultz J.E. and Matin A. // J. Mol. Biol. 1991, V. 218, P. 129.

97 Silva F.J., Latorre A., and Moya A.S. // Trends Genet. 2001, V.11, P. 615.

98 Silwa P. and Korona R. // Proc Natl Acad Sci USA 2005, V. 102, P.17670.

99 Smith G.R. // Microbiol. Rev.1988, V. 52, P.1.

100 Tamas I., Klasson L., Canback B., Naslund A.K., Eriksson A.S., Wernegreen J.J., Sandstrom J.P., Moran N.A., Andersson S.G. // Science 2002, V. 296, №5577, P. 2376.

101 Tobes R. and Pareja E. // BMC Genomics 2006, V. 7, P. 62.

102 Turner C.M. // FEMS Microbiol Lett. 1997, V.153, №1, P. 227.

103 Vaisvila R., Morgan R.D., Posfai J., and Raleigh E.A. // Mol. Microbiol. 2001, V. 42, P. 587.

104 van Belkum A., Scherer S., van Alphen L., and Verbrugh H. // Microbiol Mol Biol Rev 1998, V. 62, № 2, P. 275.

105 van der Woude M.W. and Bäumler A. J. // Clinical Microbiology Reviews 2004, V. 17, P. 581.

106 van Dongen W.M.A.M., van Vlerken M.M.A, and De Graaf F.K. // Mol. Gen. (Life Sci. Adv.)1987, V. 6, P. 85.

107 van Ham R.C.H.J., Martínez-Torres D., Moya A., and Latorre A. // Applied and Environmental Microbiology, 1999, V. 65, P. 117.

108 van Ham R.C.H.J., González-Candelas F., Silva F.J., Sabater B., Moya A., and Latorre A. // Proc. Natl.Acad. Sci. U S A. 2000, V. 97, P. 10855.

109 Waters E.,M.J., Hohn I., Ahel D.E., Graham M.D., Adams M., Barnstead K.Y., Beeson L., Bibbs R., Bolanos M., Keller K., Kretz X.Y., Lin E., Mathur J.W., Ni M., Podar T., Richardson G.G., Sutton M., Simon D., Soll K.O., Stetter J. M., Short M.,

110 Weber M. // Biology and Philosophy 1996, V. 11, P. 67.

111 Wernegreen J.J., Degnan P.H., Lazarus A.B., Palacios C., and Bordenstein S. R. // Biol. Bull. 2003, V.204, P. 221.

112 Werren J.H. and Bartos J.D. // Curr. Biol. 2001, V. 11, №6, P. 431.

113 Werren J.H., Zhang W., and Guo L.R. // Proc. Biol. Sci. 1995, V. 261, № 1360, P. 55.

114 Wildschutte H., Wolfe D. M., Tamewitz A., and Lawrence J.G. // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 2004, V. 101, №29, P.10644.

115 Williams K.P. // Nucleic Acids Res. 2002, V. 30, №4, P. 866.

116 Woolfit M. and Bromham L. // Mol. Biol. Evol. 2003, V. 20, №9, P. 1545.

117 Wren B.W. // Nature Genetics 2002, V. 32, P. 335.

118 Zhang J.R., Hardham J. M., Barbour A.G., and Norris S.J. // Сell 1997, V. 89, № 2 , P. 275.

119 Zhao S. and Williams K. P. // J. Bacteriol. 2002, V. 184, №3, P. 859.

120 Zinser E.R. and Kolter R. // J. Bacteriol. 1999, V. 181, P. 5800.

121 Zinser E.R., Schneider D., Blot M., and Kolter R. // Genetics 2003, V. 164, P. 1271.