- •Определение предмета молекулярная биология
- •Основные этапы развития молекулярной биологии
- •Основные открытия
- •Доказательства генетической роли нуклеиновых кислот
- •1. 1928Г. Опыты Фредерика Гриффита.
- •2. 1952Г. Эксперимент Альфреда Херши и Марты Чейз.
- •3. 1957Г. Опыты Френкеля - Конрата
- •Принципы строения днк
- •Формы двойной спирали днк
- •Отличия между днк и рнк
- •Виды рнк
- •Функции днк
- •1. Днк является носителем генетической информации. Функция обеспечивается фактом существования генетического кода.
- •2. Воспроизведение и передача генетической информации в поколениях клеток и организмов. Функция обеспечивается процессом репликации.
- •3. Реализация генетической информации в виде белков, а также любых других соединений, образующихся с помощью белков-ферментов. Функция обеспечивается процессами транскрипции и трансляции.
- •Аминокислоты
- •Классификация аминокислот, входящих в состав белков, по принципу полярности (неполярности) радикала
- •Первичная структура белка
- •Третичная структура белка
- •Четвертичная структура белка
- •Серповидно-клеточная анемия, как пример влияния первичной структуры на третичную и четвертичную.
- •Глобулярные и фибриллярные белки.
- •95% Белков имеют гидрофобное ядро.
- •5% Фибриллярные белки.
- •Функции белков
- •Свойства генетического кода
- •1. Триплетность
- •2. Вырожденность.
- •3. Наличие межгенных знаков препинания.
- •4. Однозначность.
- •5. Компактность, или отсутствие внутригенных знаков препинания.
- •6. Универсальность.
- •Принципы транскрипции:
- •Субъединичный состав рнк-полимеразы е.Coli
- •Особенности структуры промотора
- •Этапы транскрипции
- •1. Узнавание и прочное связывание
- •2. Инициация заключается в образовании первой фосфодиэфирной связи между пурин-трифосфатом (атф или гтф) и следующим нуклеотидом. После инициации - фактор покидает фермент.
- •3. Элонгация - последовательное наращивание цепи рнк (или продолжение транскрипции).
- •4. Терминация.
- •Позитивный контроль работы lac-оперона
- •Структура транспортной рнк
- •Рекогниция
- •1. Активирование аминокислоты.
- •2. Присоединение аминокислоты к tРнк - аминоацилирование.
- •Структура рибосом
- •Каталитические центры рибосом
- •Синтез полипептидов на рибосоме
- •Регуляция образования рибосомных рнк и белков рибосом e.Сoli
- •73 Гена должны работать координированно, чтобы не было избытка белков или rРнк.
- •Транскрипция у эукариот
- •Как образуются рибосомы у эукариот
- •Особенности транскрипции эукариот
- •1. Кепирование 100% mРнк
- •4.Редактирование Показано лишь для нескольких mРнк.
- •Кепирование
- •Назначение "Сар"
- •1. Защита 5'-конца mРнк от действия экзонуклеаз.
- •2. За счет узнавания "Сар"-связывающими белками происходит правильная установка mРнк на рибосоме.
- •Полиаденилирование
- •Сплайсинг
- •Альтернативный сплайсинг mРнк кальцитонинового гена у млекопитающих (крыса)
- •Автосплайсинг
- •Малые рнк
- •Репликация днк
- •Принципы репликации
- •Доказательство полуконсервативного характера репликации
- •Понятие о матрице и затравке
- •1960Г. Гипотетическая модель.
- •Сравнительные характеристики днк-полимераз e. Сoli
- •1974 Г. Оказаки.
- •Топологические проблемы репликации днк
- •Геликазы
- •Топоизомеразы
- •Проблема репликации концов линейных молекул
- •Причины ошибок при синтезе днк
- •In vitro происходит 1 ошибка на 100 тыс. Нукл. Для средней днк-полимеразы.
- •In vitro можно уменьшить вероятность ошибки до 1 на 1млн. Нукл., если добавить ssb, геликазу и лигазу.
- •Этапы проверки
- •Вероятность ошибок для ферментов вирусов, про- и эукариот
- •Основные репарабельные повреждения в днк и принципы их устранения
- •1. Апуринизация.
- •2. Дезаминирование.
- •3. Тиминовые димеры.
- •Размер генома
- •"Избыточность" эукариотического генома
- •1. Большой размер генов (за счет наличия интронов).
- •2. Присутствие повторенных последовательностей. Повторяются и гены, и некодирующие участки. У эукариот некоторые последовательности повторены сотни и тысячи раз.
- •Общая характеристика гистонов
- •Четыре уровня компактизации днк
- •1. Нуклеосомный.
- •2. Супербидный, или соленоидный.
- •3. Петлевой уровень.
- •4. Метафазная хромосома.
- •Основы метода ренатурации днк
- •Быстрые повторы
- •3. Сателлитная днк всегда располагается тандемно по 100-200 единиц в блоке. Образуются длинные последовательности в геноме.
- •4. У недавно образовавшихся на одной территории близких видов сателлитная днк заведомо разная.
- •Умеренные повторы
- •Уникальные гены
- •Другая классификация генов
- •Умеренные фаги
- •Эффекты, вызываемые мобильными элементами
- •Молекулярные основы канцерогенеза
- •Теории рака
- •Обратная транскрипция
- •Гипотезы возникновения жизни
- •Теория биопоэза
- •1. Образование биомономеров.
- •2. Образование биополимеров и их эволюция. Образование систем с обратной связью.
- •3. Образование мембранных структур и пробионтов (первых клеток).
- •2 Стадия биопоэза.
- •Стадия 3.
- •Эволюция пробиотов
1. Кепирование 100% mРнк
2. Полиаденилирование ~95% mРНК
3.Сплайсинг ~95% mРНК. Сплайсингу подвергаются только полиаденилированные mРНК.
4.Редактирование Показано лишь для нескольких mРнк.
Все стадии процессинга mРНК происходят в РНП-частицах (рибонуклеопротеидных комплексах.
По мере синтеза про-mРНК, она тут же образует комплексы с ядерными белками - информоферами. И в ядерные, и в цитоплазматические комплексы mРНК с белками (информосомы) входят sРНК.
![]()
Таким образом, mРНК не бывает свободной от белков.
![]()
На всем пути следования до завершения трансляции mРНК защищена от нуклеаз. Кроме того, белки придают ей необходимую конформацию.
![]()
Определение: полисома - комплекс mРНК с несколькими или многими рибосомами.
![]()
В составе информосом mРНК может жить от нескольких минут до нескольких дней, не подвергаясь действию нуклеаз. (Так, mРНК живут неделями в ооцитах, предшественниках яйцеклеток).
![]()
Кепирование
Кепирование - надевание "шапочки".
|
|
"Сар" представляет собой метилированный ГТФ, присоединенный в необычной позиции 5'-5' и две метилированные рибозы в первых двух нуклеотидах mРНК. По мере образования про-mРНК (еще до 30-ого нуклеотида), к 5'-концу, несущему пуринтрифосфат, присоединяется гуанин, после чего происходит метилирование.
ГТФ + гуанинтрансфераза
(Е)
Е~фГ + ф-ф
5'ф-ф-ф-Пур-ф-Х-ф-Y-ф-Z-...+E~фГ
Г5'-ф-ф-ф-5'-Пур-ф-Х-ф-Y-ф-Z...![]()
(метилирование)
Гm-ф-ф-ф-Пурm-ф-Хm-ф-Y-ф-Z-...
Назначение "Сар"
1. Защита 5'-конца mРнк от действия экзонуклеаз.
2. За счет узнавания "Сар"-связывающими белками происходит правильная установка mРнк на рибосоме.
![]()
Полиаденилирование
|
|
Когда синтез про-mРНК завершен, то на расстоянии примерно 20 нуклеотидов в направлении к 3' - концу от последовательности 5'-AAУAA-3' происходит разрезание специфической эндонуклеазой и к новому 3'-концу присоединяется от 30 до 300 остатков АМФ (безматричный синтез).
Каждый вид mРНК имеет "поли-А хвост" определенной длины. Он защищает 3'-конец от гидролиза, т.к. покрыт полиА-связывающими белками.
В значительной степени время жизни mРНК коррелирует с длиной полиА-хвоста.
![]()
mРНК ряда генов не полиаденилируется (например гистоновых генов).
Полиаденилированные про-mРНК подвергаются сплайсингу.
![]()
Сплайсинг
В 1978г. Филипп Шарп (Массачусетский технологический институт) открыл явление сплайсинга РНК (от англ. to splace - сшивать без узлов).
![]()
Определение: экзоны - кодирующие участки генов.
Определение: интроны - некодирующие участки генов.
![]()
На долю интронов приходится в 5-7 раз больше нуклеотидных пар, чем на долю экзонов. Количество экзонов в гене больше, чем интронов.
![]()
|
|
Определение: сплайсинг - вырезание копий интронов из про-mРНК и сшивание копий экзонов с образованием mРНК.
![]()
Копии интронов гидролизуются до нуклеотидов.
Сплайсинг показан для большинства mРНК и некоторых tРНК. У простейших найден автосплайсинг rРНК. Сплайсинг показан даже для археобактерий.
Не существует единого механизма сплайсинга. Описано по крайней мере 5 разных механизмов.
В ряде случаев сплайсинг осуществляют ферменты-матюразы.
В некоторых случаях в процессе сплайсинга участвуют sРНК.
В случае автосплайсинга процесс происходит благодаря третичной структуре про-РНК.
Для mРНК высших организмов существуют обязательные правила сплайсинга:
![]()
Правило 1. 5' и 3' концы интрона очень консервативны: 5'(ГT-интрон-AГ)3' .
|
|
Правило 2. При сшивании копий экзонов соблюдается порядок их расположения в гене, но могут быть выброшены некоторые из них.
|
|
![]()
Представление об интроне, как пустой, ничего не кодирующей последовательности, неверно. Некоторые интроны кодируют ферменты-матюразы, вырезающие копии этих интронов. На вопрос, зачем эукариотическим геномам экзон - интронная структура, можно ответить только в единичных случаях. Почему эукариотические гены "разорваны", будет рассмотрено в конце курса.
![]()





