- •2. Характеристика процесса репликации
- •3. Гипотетические механизмы репликации.
- •4. Ферменты и белки, принимающие участие в репликации
- •Головні білки реплікації
- •5. Стадии репликации: инициация, элонгация, терминация (на примере e.Coli).
- •6.Отличия репликации у эукариот и прокариот
- •Типы репликации
- •8. Проблема репликации линейных концов днк. Теломераза.
- •Тема 2. Геномы организмов
- •Геном прокариот
- •Уcтройство генов прокариотов
- •Обозначения к схеме и пояснения
- •Тема 3: геномы эукариот
- •Тема 4: Репарация
- •Классификация систем репарации
- •Типы рестриктаз
- •Іі. Репликационная система репарации
- •1. Репарация по ходу репликации
- •2. Репликационная репарация после метилирования дочерней цепи
- •3. Прямая репарация
- •4. Эксцизионная репарация
- •Индуцированная sos-репарация
- •III. Пострепликативная репарация (рекомбинационная)
- •Тема 5: мобильные генетические элементы (мгэ)
- •Плазмиды
- •Свойства плазмид
- •Характеристика некоторых видов плазмид
- •Транспозоны
- •Мобильные генетические элементы прокариот
- •Мобильные генетические элементы эукариот
- •Тема 6: регуляция метаболизма
- •Регуляция на уровне транскрипции
- •Регуляция экспрессии генов на уровне трансляции
- •Тема 7. Конструирование рекомбинантных днк (основы генной инженерии)
- •I этап. Получение генов или фрагментов днк для последующего встраивания в хромосому реципиента
- •Синтез гена химическим путем
- •Использование обратной транскриптазы
- •Метод дробовика (дробового ружья)
- •Іі этап. Конструирование рекомбинантных молекул с помощью векторов. Векторы и принципы их конструирования
- •III этап. Введение рекомбинантного вектора в клетку реципиента
- •IV этап. Клонирование рек-днк и идентификация рекомбинантных клеток
Характеристика некоторых видов плазмид
Наиболее изучены у бактерий F-фактор, плазмиды антибиотикорезистентности – R и r, плазмиды бактериоциногении и токсинообразования.
F-факторы – это крупные плазмиды фертильности (1-2 копии на клетку), которые имеют tra-оперон и, следовательно, трансмиссивны, интегрируются в хромосому, обладают поверхностным исключением, несовместимостью, участвуют в парасексуальном процессе коньюгации, могут существовать в 3-х формах: 1) автономной ССС-форме – в виде классического F-фактора, 2) в виде интегрированного в хромосому Hfr-фактора (от англ. High frequency of recombination -высокая частота рекомбинаци), 3) в виде F/-факторов, захвативших участки бактериальной хромосомы при освобождении из интегрированного состояния. F-фактор является видоспецифичным и в основном передается между клетками в пределах вида или рода.
R-плазмиды несут гены, обеспечивающие устойчивость к антибиотикам. Они могут осуществлять переходы между клетками отдалённых групп бактерий, перенося гены устойчивости к антибиоткам. Так, возможны переходы R-плазмид между всеми грамотрицательными бактериями - эшерихиями, сальмонеллами, псевдомонадами, цитробактерами, холерными вибрионами и др. Это ведет к распространению антибиотикоустойчивых штаммов бактерий.
Плазмиды бактериоциногении содержат гены, кодирующие синтез бактериоцинов - бактерицидных веществ, вырабатываемых одним штаммом и убивающих клетки близкородственных штаммов.
Плазмиды токсинообразования несут гены, кодирующие токсины бактерий. Так, у E. coli обнаружены плазмиды Ent (кодирует синтез энтеротоксина), Hly (кодирует синтез гемолизина), плазмиды К88 и К99, кодиующие синтез адгезинов. Все они обуславливают патогенные свойства бактерий.
Транспозоны
Транспозоны – это группа МГЭ, которые способны перемещаться из одного участка генома в другой путём специфического механизма транспозиции. Впервые транспозоны были открыты в 40-х годах ХХ столетия Барбарой Мак-Клинтон в зёрнах индейского зерна (красной кукурузы). К 1970 году они были обнаружены почти у всех живых организмов – от бактерий до червей и плодовых мушек дрозофилл. До 70-х годов считалось, что геномы организмов достаточно стабильны и гены, кодирующие структурные и биохимические признаки, расположены на хромосомах в ряд в строгой последовательности. Однако, открытие транспозонов полностью изменило это догматическое представление. Стало понятно, что отдельные участки генома (и даже гены) с помощью транспозонов и других МГЭ могут «совершать прогулки по хромосомам», т.е. стабильность геномов весьма относительна. Этот вид генетических перестроек наряду с мутациями дает значительный материал для естественного отбора и эволюции живых организмов. Кстати, частота транспозиций сопоставима с частотой спонтанных мутаций и колеблется в интервале 10-4 - 10-11 (на поколение). В 1983 г. Мак-Клинток за открытие транспозонов получила Нобелевскую премию и транспозоны начали широко изучаться.
Рекомбинации, связанные с перемещением транспозонов, получили название «транспозиций». Транспозиции, осуществляемые МГЭ могут быть направленными и ненаправленными. При направленной транспозиции перемещение МГЭ может происходить в строго определенный сайт, а при ненаправленной транспозиции – в любой участок генома. Роль МГЭ могут выполнять не только транспозоны и плазмиды, но и некоторые вирусы, причем их перемещение может происходить как в пределах одной клетки, так и между клетками. Кроме того, транспозиции могут осуществляться за счет встраивания в хромосомы продуктов обратной транскрипции. Таким путем, очевидно, сформировались ретропозоны и ретротранспозоны у эукариот.
Перемещение транспозонов называют «незаконной рекомбинацией», так как оно практически не зависит от системы генов Rec ABC. Последняя обычно обеспечивает рекомбинации в клетке. Еще одной отличительной чертой «незаконной транспозиции» является то, что она происходит при участии особого фермента транспозазы. Хотя по сути механизма транспозиции являются рекомбинациями, они сопровождаются также и различными мутациями, среди которых наиболее часто происходят выпадения участков хромосом (делеции), вставки (инсерции), повороты фрагментов ДНК (инверсии), и даже крупные генетические перестройки (транслокации).