Приклад розв’язування задач для визначення будови білків.

Для розв’язування цього типу задач необхідно знати лінійні розміри амінокислот і їх середньої молекулярної маси.

l – лінійні розміри амінокислоти.

l_{амінокислоти} – 0,35 нм 1нм = 10^-6 мм.

М – молекулярна маса

М _{середня 1 амінокислоти} = 110 дальтон, 1 дальтон = в.а.о.

Задача 1. Молекулярна маса каталази 224000 дальтон. Скільки амінокислотних ланок у цій молекулі?

Дано:

М_{(каталази)}=224000 дальтон Розв’язання:

М_{(сер.а-т)}=110 дальтон n=М_(білку)/М_{(сер.а-т)}

n_{(амінокислотних ланок)} - ? n=224000 дальтон/110 дальтон = 2036

Відповідь. У цій молекулі 2036 амінокислотних ланок

Задача 2. Молекулярна маса пепсину 35500 дальтон. Яка довжина первинної структури цього білка?

Дано: Розв’язання:

М_{(пепсину)}=35500 дальтон 1. Визначаємо кількість амінокислотних ланок

М_{(сер.а-т)}=110 дальтон n = 35500 дальтон/110 дальтон = 323 ланок.

l_а=0,35нм 2. Визначаємо довжину первинної структури

l_{(первинної структури білка пепсину)} - ? білка.

l=n * l_а, де n – кількість амінокислот

l=328*0,35 нм = 113,05 нм.

Відповідь. Довжина первинної структури цього білка становить 113,05 нм.

Задача 3. У молекулі ДНК аденілові нуклеотиди складають 15% від загальної кількості. Визначте процентний вміст інших видів нуклеотидів.

Дано: Розв’язання:

А=15% 1. За правилом Чаргаффа А=Т, Г=Ц, то Т=15%

Т(%) - ? 2. Т+А=15%+15%=30%

Г(%) - ? 3. (А+Т)+(Г+Ц)=100%

Ц(%) - ? (Г+Ц)=100% - (А+Т)

(Г+Ц)=100% - 30%=70%

4. Г=Ц=70%/2=35%

Відповідь. Т=15%, Г=35%, Ц=35%.

Задача 4. Яка довжина фрагменту ДНК, що складається з 30 нуклеотидів?

Дано: Розв’язання:

n_{(нуклеотидів)}=30 1. 30 нуклеотидів – відповідає 15 парам нуклеотидів (або

l_{(фраг.ДНК)} - ? це 15 нуклеотидів однієї з ниток ДНК).

2. Оскільки розмірність одного нуклеотиду 0,34 нм, то

довжина фрагменту ДНК становитиме l_{(фраг.ДНК)}=15*0,34 нм=5,1 нм.

Відповідь. Довжина фрагменту ДНК, що складається із 30 нуклеотидів становить 5,1 нм.

Задача 5. Одна із спіралей фрагменту ДНК має такий склад нуклеотидів:

- Г – Г – Г – Ц – А – Т – А – А – Ц – Г – Ц – Т.

1. Визначте порядок чергування нуклеотидів у другій спіралі фрагменту ДНК.

2. Обчисліть, яка довжина даного фрагменту молекули ДНК?

3. визначте процентний вміст кожного нуклеотиду у даному фрагменті.

Розв’язання:

1. … - Г – Г – Г – Ц – А – Т – А – А – Ц – Г – Ц – Т - …

… - Ц – Ц – Ц – Г – Т – А – Т – Т – Г – Ц – Г – А - …

12 пар нуклеотидів – 24 нуклеотиди.

2. l_{(фраг.ДНК)}=12*0,34 нм=4,08 нм.

3. Встановлюємо процентний вміст кожного нуклеотиду у фрагменті ДНК.

А=5, Т=5, Т=А=(5*100%)/24=20,8%

Г=7, Ц=7, Г=Ц=(7*100%)/24=29,2%

Відповідь. 1. - Ц – Ц – Ц – Г – Т – А – Т – Т – Г – Ц – Г – А - , 2. l_{(фраг.ДНК)}=4,08 нм, 3. А=20,8%, Т=20,8%, Г=29,2%, Ц=29,2%.