- •Качановский е.А., Ушаков в.Л.
- •Выделение днк.
- •В в е д е н и е
- •Исходный материал
- •Ткани животных
- •Эритроциты
- •Мягкие растительные ткани
- •Бактерии
- •Процедура выделения днк.
- •Контрольные вопросы.
- •Йодные часы.
- •Реакция Белоусова – Жаботинского.
- •Ртутное сердце (амеба).
- •Оптическая активность биомолекул.
- •R-аланин
- •Техника измерения.
- •1. Поляриметр круговой см-2.
- •2. Автоматический поляриметр фотоэлектронный а1-епо.
- •Нуклеозиды
- •Свойства нуклеозидов
- •Минорные нуклеозиды
- •1Ыйуровень упаковки в 6,7 раз 2ойуровень упаковки в 40 раз 3ийуровень упаковки (петельный) в 680 раз
Ртутное сердце (амеба).
В емкости с полукруглым дном (часовое стекло) смешать 2 мл конц. азотной кислоты с 12 мл воды (разбавление 1:6), добавить каплю металлической ртути, а рядом поместить кристалл или кусочек бихромата калия. Будут наблюдаться периодические подергивания капли металла.
Лабораторная работа №10
Оптическая активность биомолекул.
Цель: ознакомиться с явлением оптической активности биомолекул и поляризационным методом ее определения.
Введение.
Подавляющее большинство сложных молекул, содержащих более трех атомов, не имеют плоскости и центра симметрии. Такие молекулы дисимметричны, хиральны ("хиральность"- несовпадение некоторой структуры с ее зеркальным отражением). Хиральные вещества могут фигурировать в двух формах – правой и левой. Эти две конфигурации нельзя совместить друг с другом никаким поворотом системы как целого в пространстве, они относятся друг к другу, как правая и левая рука.
Хиральность – свойство объекта быть несовместимым со своим отображением в идеальном плоском зеркале. В химии рассматривается хиральность индивидуальных молекул и их агрегатов. Хиральные молекулы существуют в виде пар энантиомеров, различающихся только знаком оптического вращения, которое связано с конфигурацией.
В мире биологических молекул чаще всего приходится встречаться с хиральностью, определяемой так называемым асимметричным атомом углерода, обычно отмечаемым звездочкой. В насыщенных органических соединениях четыре валентных связи углерода расположены под тетраэдрическими углами друг к другу. Если две валентности из четырех связывают одинаковые группы, как, например, в молекуле СХ2YZ, то плоскость СYZ является плоскостью симметрии и хиральность отсутствует. Атом углерода асимметричен, если все четыре группы, с которыми он связан, различаются - СXYZV (например, приведенная ниже на рисунке молекулаCHClBrI). Такая молекула не имеет ни плоскости, ни центра симметрии. Поэтому большинство аминокислот обладают хиральностью. В обычном химическом синтезе из исходных симметричных молекул синтезируемое вещество всегда получается в виде рацемической смеси, содержащей по 50 % правого и левого антипода. Это следует из второго начала термодинамики, поскольку рацемат отвечает максимальной энтропии.
Удельное вращение вещества [] – это вращение раствора вещества, выраженное в градусах при его концентрации, равной 1 г/мл, и при толщине слоя раствора, равнойLдм. Практически обычно пользуются более разбавленными растворами (концентрацией С) и более короткими трубками (длинойL). Правое вращение обозначают знаком «+», а левое – знаком «-». Наблюдаемое вращениепересчитывают на удельное по формуле:
[]·С·L=
Для обозначения пространственной структуры химических соединений применяется специальная стереохимическая номенклатура. (Правила ИЮПАК, раздел Е)
Наиболее общий подход к обозначению конфигурации энантиомеров – использование R,S–системы. В основе этой системы лежит правило последовательности, которое однозначно устанавливает старшинство заместителей (старшинство численно равно заряду ядра). Старшими считаются те из них, у которых с рассматриваемым хиральным элементом (например, асимметричным атомом углерода, двойной связью, циклом) непосредственно связан атом с бóльшим атомным номером. Если эти атомы одинаковы по старшинству, то рассматривают “второй слой”, в который входят атомы, связанные с атомами “первого слоя”, и т.д., до появления первого различия; номера атомов, связанных двойной связью, при определении старшинства удваивают. Перечень заместителей в порядке возрастания старшинства для 75 радикалов приведен ниже:
H;CH3;C2H5;C3H7;C4H9;C5H11;C6H13; (CH2)2CH(CH3)2;CH2CH(CH3)2;CH2CH=CH2;CH2C(CH3)3;CH2CCH;CH2C6H5;CH(CH3)2;CH=CH2;CH(CH3)C2H5;C6H11;CH=CHCH3;C(CH3)3;C(CH3)=CH2;CCH;C6H5; п-C6H4CH3; п-C6H4NO2; м-C6H4CH3; 3,5 -C6H3(CH3)2; м-C6H4NO2; 3,5 -C6H3(NO2)2; СCСH3; о-C6H4CH3; 2,6 -C6H3(CH3)2;C(C6H5)3; о-C6H4NO2; 2,4 -C6H3(NO2)2; С(О)Н; С(О)CH3; С(О)C6H5; СООН; СООСН3; СООС2Н5; СООСН2C6H5; трет- СООС(СН3)3;NH2;NH3+;NHСН3;NHС2Н5;NHС6Н5;NHC(O)СН3;NHC(O)С6Н5;NHC(O)OCH2С6Н5;N(СН3)2;N(С2Н5)2;N(СН3)3+;N=NС6Н5;NO;NO2;OH;OСН3;OС2Н5;OCH2С6Н5;OС6Н5;OC(O)H;OC(O)CH3;OC(O)С6Н5;OS(O)CH3;OS(O2)CH3;F;SH;SCH3;S(O)CH3;S(O2)CH3;S(O2)OH;Cl;Br;I.
Для углеводов, -гидроксикислот,-аминокислот, широко используют также D,L – систему, основанную на сравнении конфигурации рассматриваемого асимметричного центра с конфигурацией соответствующего энантиомера глицеринового альдегида.
Исторически сложилось, что исходным для L и D-ряда органических соединений служит глицериновый альдегид (альдотриоза).
СНО СНО
Н СОН НОСН
СН2О СН2О
D-(+)-глицериновый альдегид L-(-)-глицериновый альдегид
(правовращающий) (левовращающий)
R-глицериновый альдегид S-глицериновый альдегид
СОО-СОО-
Н СNН3++Н3NСН
СН3СН3