MOLEKULJARNO-GENETICHESKII_UROVEN
.pdfдочерние молекулы ДНК. Каждая дочерняя молекула содержит одну материнскую и одну вновь синтезированную цепь
(полуконсервативный способ удвоения). Репликация в клетке происходит перед каждым еѐ делением в синтетический период интерфазы (S-период).
Единицей репликации является репликон – участок ДНК,
способный к самостоятельной репликации. У бактерий и вирусов имеется обычно один репликон на клетку, тогда как у эукариот их содержится много. Репликация начинается в сайте инициации.
Двойная спираль ДНК расплетается в точках инициации репликации и образуются репликационные глазки, состоящие из двух репликационных вилок, ведущих синтез в противоположных направлениях (двунаправленная репликация), как показано схематически на рис. 2.
Рис. 2. Схема репликационных единиц в ДНК эукариот.
О – точка начала репликации
10
В синтезе полинуклеотидных цепей ДНК участвует фермент ДНК-полимераза, которая наращивает новую цепь в направлении
5' → 3'. Однако синтез дочерних цепей ДНК осуществляется неодинаково. Одна из них создается непрерывно и называется лидирующей. Другая называется отстающей, так как она собирается из отдельных коротких участков (фрагментов Оказаки), которые потом соединяются вместе ДНК-лигазами. Такой феномен наблюдается из-за антипараллельности материнских цепей ДНК.
ФЕРМЕНТЫ и другие БЕЛКИ, обеспечивающие репликацию ДНК:
Геликаза – расплетает двойную спираль ДНК, разрушая водородные связи между комплементарными азотистыми
основаниями.
РНК-полимераза (или ДНК-праймаза) – инициирует синтез ДНК, образуя РНК-затравки (праймеры).
ДНК-полимераза – синтезирует полинуклеотидную цепь ДНК в направлении 5' → 3'.
ДНК-лигаза – сшивает вместе фрагменты Оказаки после удаления РНК-праймера и его замещения на нуклеотиды ДНК.
ДНК-топоизомераза – помогает раскручиванию ДНК и работе геликазы, снимая напряжение на спирали материнской молекулы.
Дестабилизирующие белки – негистоновые ядерные белки,
связываются с разъединенными цепями ДНК, поддерживают
репликационную вилку открытой.
11
Задание 6. Полуконсервативная репликация ДНК в
репликационной вилке
Изучите (рис. 3) особенности синтеза дочерних полинуклеотидных цепей ДНК в репликационной вилке.
Рис. 3. Схема репликационой вилки ДНК
Р е ш и т е з а д а ч и :
Задача 1. В одной из цепей фрагмента ДНК нуклеотиды
расположены в следующей последовательности: 5'
...ЦЦЦГЦЦАЦЦТГЦГГА... 3'. Напишите последовательность нуклеотидов в комплементарной цепи ДНК. Укажите направление синтеза новой цепи.
Задача 2. Участок ДНК имеет следующий состав нуклеотидов:
12
Напишите нуклеотидный состав дочерних ДНК, отметьте старую и новую полинуклеотидные цепи, их 5'- и 3'-концы. Какие химические группы стоят на 5'- и 3'-концах ДНК?
Задание 7. Генетический код
Генетический код – это система кодирования информации о последовательности аминокислот в белке с помощью последовательности нуклеотидов ДНК (РНК) (таблица 4). Единицей генетического кода является кодон (триплет) – последовательность из трех нуклеотидов. В составе генетического кода 64 кодона, из них кодирующих аминокислоты – 61, а некодирующих (стоп-кодоны) – 3.
Кодон АУГ, кодирующий аминокислоту метионин, выполняет функцию кодона-инициатора (старт-кодона) – с него начинается считывание генетической информации с иРНК. Первой к месту синтеза белка – рибосоме подходит тРНК с аминокислотой метионин.
У эукариот только один старт-кодон, тогда как у прокариот их может быть несколько.
Свойства генетического кода: триплетность – каждая аминокислота кодируется сочетанием из трех нуклеотидов;
специфичность – каждый кодон кодирует одну определенную аминокислоту; вырожденность (избыточность) – почти каждая аминокислота (кроме метионина и триптофана) может быть закодирована двумя или более разными кодонами; универсальность – принцип кодирования аминокислот у всех видов одинаков.
13
Таблица 4
Генетический код (в кодонах ДНК и иРНК)
Первый |
|
Второй нуклеотид |
|
Третий |
||||
нуклеотид |
|
|
|
|
нуклеотид |
|||
ДНК |
|
А |
Г |
Т |
Ц |
|
ДНК |
|
|
РНК |
У |
Ц |
А |
Г |
РНК |
|
|
|
|
Фен |
Сер |
Тир |
Цис |
У |
А |
|
А |
У |
Фен |
Сер |
Тир |
Цис |
Ц |
Г |
|
Лей |
Сер |
стоп-кодон |
стоп-кодон |
А |
Т |
|||
|
|
|||||||
|
|
Лей |
Сер |
стоп-кодон |
Три |
Г |
Ц |
|
|
|
Лей |
Про |
Гис |
Apг |
У |
А |
|
Г |
Ц |
Лей |
Про |
Гис |
Apг |
Ц |
Г |
|
Лей |
Про |
Глн |
Apг |
А |
Т |
|||
|
|
|||||||
|
|
Лей |
Про |
Глн |
Apг |
Г |
Ц |
|
|
|
Иле |
Тре |
Асн |
Сер |
У |
А |
|
Т |
А |
Иле |
Тре |
Асн |
Сер |
Ц |
Г |
|
Иле |
Тре |
Лиз |
Apг |
А |
Т |
|||
|
|
|||||||
|
|
Мет |
Тре |
Лиз |
Apг |
Г |
Ц |
|
|
|
Вал |
Ала |
Асп |
Гли |
У |
А |
|
Ц |
Г |
Вал |
Ала |
Асп |
Гли |
Ц |
Г |
|
Вал |
Ала |
Глу |
Гли |
А |
Т |
|||
|
|
|||||||
|
|
Вал |
Ала |
Глу |
Гли |
Г |
Ц |
Правила пользования таблицей Первый нуклеотид в кодоне берется из левого вертикального
ряда, второй – из верхнего горизонтального ряда и третий – из правого вертикального. Там, где пересекутся линии, идущие от всех трех нуклеотидов, и находится сокращенное название искомой аминокислоты.
О т в е т ь т е н а в о п р о с ы :
Сколько в генетическом коде кодонов? Сколько из них кодируют аминокислоты? Сколько кодонов не кодируют аминокислоты, как они называются?
14
Напишите аминокислоты, закодированные: а) одним; б) двумя;
в) тремя; г) четырьмя; д) шестью кодонами.
Какие из кодонов не кодируют аминокислоты, а выполняют функцию стоп-сигнала (терминации) трансляции? Напишите их нуклеотидный состав в кодонах ДНК и РНК.
Какой кодон у эукариот не только кодирует аминокислоту, но и является стартовым кодоном (инициатором) трансляции?
Р е ш и т е з а д а ч у :
Одна из цепей фрагмента ДНК имеет следующий состав нуклеотидов:
3' ...ААААГААТАГГГГТТАТААТГАЦА... 5'.
Сколько аминокислот закодировано в данном фрагменте ДНК?
Напишите их последовательность в молекуле полипептида. Как изменится аминокислотный состав полипептида, если в трех последних кодонах третий нуклеотид заменить на тимидиловый?
Задание 8. Геном
Раздел генетики, изучающий геномы организмов, называется
геномика. Геном – это генетическая система клетки, включающая ДНК ядра и митохондрий (у растений – пластид). В ядерном геноме человека (данные 2011 г.) более 3,2 млрд. нyклeoтидoв на гаплоидный набор. Определение порядка расположения последовательности нуклеотидов в ДНК проводится путем секвенирования генома.
Ознакомьтесь по таблице 5 с областями применения знаний о геноме человека.
15
Таблица 5
Применение знаний о геноме человека
Секвенирование генома человека
|
Идентификация всех генов |
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
Генетическое |
|
|
«Социоэкономическая |
|
«Функциональная |
|
«разнообразие |
|
|
геномика» |
|
|
геномика» |
человека» |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Молекулярная медицина |
|
|
|
Геномная |
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
Генная терапия |
|
|
|
|
|
|
||
дактилоскопия |
|
|
|
|||
|
|
|
||||
|
|
|
|
|
|
|
Молекулярная |
|
диагностика |
Превентивная медицина |
|
ДосимтоматиФармакогенетика ческая
диагостика
|
Генетическое тестирование |
|
|
|||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Гены |
|
|
|
|
|
|
Гены |
|
|
|
Гены-триггеры |
|
|
|
|
||
«внешней |
|
|
|
|
|
мембранных |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
||
среды» |
|
|
|
|
|
|
рецепторов |
|
|
|
|
Базы ДНК-данных |
|
|
|||
|
|
|
|
|
||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Популяционные |
|
|
Семейные |
|
|
Индивидуальные |
|
|
Этнические |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Генетический |
|
|
|
|
|
|
|
|
«паспорт» |
|
|
16 |
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
Задание 9. Организация генома прокариот
Наследственный материал прокариотической клетки содержится в единственной молекуле ДНК, которая располагается в цитоплазме и не ограничена мембраной (цитологическая структура – нуклеоид).
Кроме хромосомной ДНК, в геноме прокариот присутствуют генетические элементы (плазмиды), определяющие разные функции и процессы, происходящие в бактериальной клетке.
Ознакомьтесь по таблице 6 с организацией генома прокариот.
Таблица 6
Генетический материал бактериальной клетки
Компоненты |
|
Особенности и функции |
|
|
|
|
|||
Хромосомная |
Одна (n) кольцевая двухцепочечная молекула ДНК. В |
|||
ДНК |
нескольких местах контактирует с плазматической |
|||
|
мембраной, что обеспечивает расхождение дочерних |
|||
|
ДНК после репликации. Хранит генетическую |
|||
|
информацию |
и |
регулирует |
процессы |
|
жизнедеятельности клетки. |
|
|
|
|
|
|||
Плазмиды |
Внехромосомные кольцевые двухцепочечные короткие |
|||
|
молекулы ДНК. Ряд плазмид являются факторами |
|||
|
устойчивости к условиям среды. Примеры: F-фактор, |
|||
|
Соlфактор, R-фактор. Обладают способностью |
|||
|
встраиваться в чужеродную ДНК и используются в |
|||
|
генной инженерии в качестве переносчиков ДНК. |
|||
|
|
|||
Мигрирующие |
Сегменты ДНК, способные к перемещению в пределах |
|||
генетические |
одного генома или из одного генома в другой. |
|
||
элементы |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
17
Задание 10. Ядерный и митохондриальный геномы человека
Изучите по таблице 7 особенности организации и
функционирования ядерного и митохондриального геномов человека.
|
|
Таблица 7 |
Генетический материал клетки человека |
||
|
|
|
|
Ядерный |
Митохондриальный |
|
|
|
Структура ДНК |
Двухцепочечная |
Двухцепочечная |
|
линейная |
кольцевая |
|
|
|
Количество молекул |
46 |
4-6 в одной |
ДНК |
(2n2с) |
митохондрии |
|
|
|
Количество пар |
~ 3,2 млрд. в |
16569 в одной молекуле |
нуклеотидов |
гаплоидном наборе |
|
|
|
|
Связь с белками |
40% ДНК+60% белков |
Только ДНК |
|
(гистоны и |
|
|
негистоновые) → ДНП |
|
|
|
|
Гены, их продукты |
>20 тыс. генов. |
2 гена рРНК, 22 гена |
|
Кодируют все белки |
тРНК, 13 генов |
|
цитоплазмы, 90% |
ферментов тканевого |
|
белков митохондрий и |
дыхания, 10% |
|
все виды РНК |
строительных белков |
|
|
митохондрии |
|
|
|
Структура генов |
Экзон-интронная |
Интронов мало или их |
|
|
нет |
|
|
|
Репликация |
Много вилок |
Две вилки репликации |
|
репликации |
|
|
|
|
Транскрипция |
Как правило, идет с |
С одной цепи, часто – с |
|
одной (кодогенной) |
двух (встречная |
|
цепи ДНК |
транскрипция) |
|
|
|
|
18 |
|
О т в е т ь т е н а в о п р о с ы :
По материнской или отцовской линии передается митохондриальная ДНК?
Как называют всю совокупность генетического материала,
заключенного в гаплоидном наборе хромосом клеток данного вида организма (генотип, геном, кариотип)?
Задание 11. Проверка усвоения материала
Проверьте усвоение материала занятия по тестовым заданиям с выбором одного или нескольких правильных ответов (стр. 78).
А у д и т о р н а я р а б о т а
Задание 12. Генетическое кодирование
Р е ш и т е з а д а ч и :
Задача 1. Одна из цепей фрагмента ДНК имеет следующую последовательность нуклеотидов:
ЦАЦГТАААТТГАГГЦТТЦЦТЦАТТ.
Сколько аминокислот может быть закодировано в данной цепи ДНК? Какие аминокислоты кодируют 1-й, 5-й, 6-й кодоны?
Напишите кодоны синонимы иРНК, кодирующие аминокислоту валин (Вал).
Задача 2. Фрагмент белка Д имеет следующий состав аминокислот:
...мет-фен-тир-асп-гис-цис...
Напишите нуклеотидный состав иРНК и ДНК (используя один из кодонов-синонимов), в которых закодирован данный белковый
19