Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

Метод функционала плотности. Ab initio молекулярная динамика. Методические указания к лабораторным работам

.pdf
Скачиваний:
0
Добавлен:
15.08.2026
Размер:
994 Кб
Скачать

Министерство образования и науки Российской Федерации

Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования

«Оренбургский государственный университет»

Кафедра радиофизики и электроники

Н.Ю. Кручинин

МЕТОД ФУНКЦИОНАЛА ПЛОТНОСТИ. AB INITIO МОЛЕКУЛЯРНАЯ ДИНАМИКА

Рекомендовано к изданию Редакционно-издательским советом федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Оренбургский государственный университет» в качестве методических указаний для студентов, обучающихся по программам высшего профессионального образования по направлению подготовки 011800.62 Радиофизика

Оренбург

2014

УДК 538(9) ББК 22.37

К 84

Рецензент – кандидат физико-математических наук Д.А. Кислов

Кручинин, Н.Ю.

К 84 Метод функционала плотности. Ab initio молекулярная динамика: методические указания к лабораторным работам / Н.Ю. Кручинин. – Оренбургский гос. ун-т. – Оренбург: ОГУ, 2014. – 67 с.

Методические указания содержат 5 лабораторных работ и методические указания к ним. В методическом указании представлено описание метода функционала плотности и ab initio молекулярной динамики, постановка задачи и порядок выполнения для лабораторных работ.

Методические указания предназначены для студентов направления 011800.62 «Радиофизика» для изучения дисциплины «Математическое моделирование физических процессов».

УДК 538(9) ББК 22.37

© Кручинин Н.Ю., 2014

© ОГУ, 2014

2

 

Содержание

 

 

Введение..................................................................................................

4

1

Метод функционала плотности …………………………..…………

5

1.1

Аппроксимация Томаса-Ферми-Дирака ……………………………

5

1.2

Теоремы Хоэнберга — Кона ……………………………..…………

6

1.3Метод Кона-Шама ……………………………………….………….. 10

1.4 Нестационарная теория функционала плотности (TDDFT)……….. 18

1.5 Функционалы для обмена и корреляции …………………………... 20

1.6Решение уравнений Кона-Шама …………………………………..... 28

1.7Псевдопотенциалы…………………………………………………... 32

1.8 Плоские волны и сетки……………………………………………… 37

1.9Расчет спектра поглощения…………………………………………. 44

2 Ab initio молекулярная динамика…………………………………… 46

2.1Ehrenfest молекулярная динамика…………………………………... 52

2.2Born-Oppenheimer молекулярная динамика………………………... 54

2.3

Car-Parrinello молекулярная динамика………………………………

55

3

Лабораторные работы…………………………………………………

58

3.1Лабораторная работа №1. Исследование физических свойств отдельных молекул………………………………………………….. 58

3.2Лабораторная работа №2. Исследование физических свойств

кристаллических веществ…………………………………………… 60

3.3Лабораторная работа №3. Исследование оптических свойств молекул и металлических кластеров………………………………. 61

3.4Лабораторная работа №4. Исследование динамики молекул методом ab initio молекулярной динамики………………………... 62

Список использованных источников .................................................

65

3

Введение

Методические указания содержат 4 лабораторные работы и методические указания к ним. Произведено теоретическое изложение материала. Каждая работа постановку задачи, порядок выполнения,

контрольные вопросы. Методические указания предназначены для студентов направления 011800.62 «Радиофизика».

Методические указания содержат описание метода функционала плотности и ab initio молекулярной динамики, а также задания к ним.

Методические указания предназначены для студентов направления 011800.62

«Радиофизика».

Данные указания направлены на изучение метода функционала плотности и ab initio молекулярной динамики, использовании данных методов при изучении свойств молекул, кластеров, кристаллов.

В лабораторных работах предполагается исследовать методом функционала плотности свойства различных молекул (водорода, кислорода,

азота, метана, этана, родамина 6G, эритрозина), кристаллов (кремния,

алюминия), кластеров (золота, серебра).

4

1. Метод функционала плотности

1.1Аппроксимация Томаса-Ферми-Дирака

Воригинальном методе Томаса-Ферми кинетическая энергия системы электронов аппроксимирована как явный функционал плотности невзаимодействующих электронов в однородном газе. Обменными взаимодействиями и корреляцией электронов пренебрегают. Дирак расширил метод, сформулировав локальную аппроксимацию для обменных взаимодействий. Это приводит к функционалу энергии для электронов во

внешнем потенциале Vext (r)

:

 

E [n] C

 

3

rn(r)

5/ 3

 

 

3

rV

(r)

d

 

 

d

TF

 

1

 

 

 

 

 

 

 

 

 

ext

 

где C1

 

3

(3

2

)

2 / 3

2.871, C2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

10

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

n(r) C2 d

3

rn(r)

4 / 3

 

1

d

3

3

r

'

 

 

2

 

rd

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

3 ( 3 )1 / 3

4

 

 

'

)

n(r)n(r

| r r

'

|

 

 

 

,

(1.1)

Первый терм - локальное приближение кинетической энергии, второй терм – потенциальная энергия электронов, третий терм - обменная энергия, и

последний – классическая электростатическая энергия Хартри.

Плотность и энергия основного состояния могут быть найдены,

минимизируя функционал энергии (1.1) по всем возможным плотностям при ограничении на общее число электронов:

3

rn(r) N

d

(1.2)

Используя метод множителей Лагранжа, решение может быть найдено минимизацией данного функционала:

 

d

rn(r) N},

 

(1.3)

TF [n] ETF [n] {

 

 

3

 

 

 

где множитель

Лагранжа

 

это энергия Ферми (эквивалентно

химическому потенциалу в основном состоянии). Для малой вариации плотности n(r) условие для стационарной точки:

d 3r{ TF [n(r) n(r)] TF [n(r)]},

5

 

r{

5

C1n(r)

2 / 3

V (r) }n(r) 0 ,

 

 

 

 

 

 

(1.4)

 

 

 

 

 

 

 

d

 

 

 

 

 

 

 

3

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

3

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

где

V (r) Vext (r) VH (r) VX (r)

-

 

это

полный

потенциал.

Это должно

выполняться

для

любой функции

n(r)

,

следовательно,

функционал

 

 

стационарен

тогда

и только,когда

 

плотность

и

потенциал удовлетворяют

соотношению:

1

(3

2

)

2 / 3

n(r)

2 / 3

V (r) 0

 

 

 

 

 

 

2

 

 

 

 

 

 

 

(1.5)

Привлекательность теории функционала плотности в том, что уравнение для плотности значительно проще, чем полное уравнение Шредингера многих тел, которое включает 3N степеней свободы для электронов N. Тем не менее, приближения в методе Томаса-Ферми слишком грубые, на практике метод не дает точных результатов. Основные ошибки этого метода в определении кинетической и обменной энергии, не учитывалась электронная корреляция [2, 16].

1.2. Теоремы Хоэнберга — Кона

Подход П. Хоэнберга и У. Кона заключается в формулировке теории функционала плотности, как точной теории системы многих тел.

Формулировка относится к любой системе взаимодействующих частиц во

внешнем потенциале Vext (r) , где гамильтониан может быть записан:

 

 

2

i

Vext (ri )

1

 

 

e

2

 

H

 

 

 

(1.6)

ˆ

 

 

2

 

 

 

| r r

 

 

2m

i

i

2

i j

|

 

 

e

 

i

 

j

 

Теория функционала плотности базируется на двух теоремах,

доказанных Хоэнбергом и Коном.

Теорема 1.

Для любой системы взаимодействующих частиц, находящихся во внешнем потенциале Vext (r) , плотность определяется однозначно (внешний потенциал является уникальным функционалом плотности).

Следствие:

6

Так как гамильтониан полностью определен, кроме постоянного сдвига энергии, следовательно, могут быть определены волновые функции системы многих тел для всех состояний (основного и возбужденного). Поэтому все свойства системы полностью определяются с учетом только плотности

основного состояния n0 (r) .

 

Теорема 2.

 

Универсальный функционал для энергии

E[n] может быть определен в

терминах плотности. Точное значение энергии основного состояния системы является глобальным минимальным значением этого функционала,

плотность, минимизирующая этот функционал, является точной плотностью основного состояния.

Следствие:

 

 

Достаточно одного функционала

E[n]

для того, чтобы точно

определить энергию и плотность основного состояния.

Поскольку все свойства, такие как кинетической энергии и т.д.,

однозначно определяются, если известна плотность электронов n(r) , то каждое такое свойство можно рассматривать как функционал n(r) , в том числе функционал полной энергии:

E

 

[n] T[n] E

[n]

 

3

rV

(r)n(r) E

 

HK

d

II

 

int

 

 

ext

 

F

[n]

 

3

rV

(r)n(r) E

 

d

II

HK

 

 

ext

 

,

(1.7)

где EII в себя

- энергия взаимодействия между ядрами. Функционал FHK [n] включает всю внутреннюю энергию взаимодействующей электронной системы:

FHK [n] T[n] Eint[n]

(1.8)

Этот функционал должен быть универсальным по построению, так как кинетическая энергия и энергия взаимодействия частиц являются функционалами только плотности. Он определяет только свойства основного состояния и не дает никакой информации относительно возбужденных состояний.

7

Альтернативное определение функционала Леви и Либа.

Идея Леви и Либа (LL) заключается в определение двухступенчатого порядка минимизации, начиная с обычного общего выражения для энергии с точки зрения волновой функции многих тел:

 

| H |

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

E

ˆ

 

ˆ

ˆ

ˆ

 

 

3

 

(r)n(r) E

 

 

rV

 

 

H

T

V

d

II

 

|

 

 

 

int

 

 

ext

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

(1.9)

Основное состояние можно найти, в принципе, путем минимизации энергии по всем переменным . Будем считать энергию для класса волновых функций многих тел, которые имеют одинаковую плотность n(r) .

Для любой волновой функция, полная энергия может быть записана:

ˆ

ˆ

|

 

3

rV

(r)n(r)

E | T

| | V

d

 

int

 

 

ext

 

(1.10)

Минимизируя энергию по классу волновых функций с одинаковой плотностью, можно однозначно определить низшую энергию для этой плотности:

E

 

 

 

 

 

 

ˆ

 

ˆ

| ]

 

d

3

rV

(r)n(r) E

 

 

 

LL

min

[ | T

| |V

 

II

 

 

 

 

 

 

 

 

int

 

 

 

ext

 

 

 

 

 

 

 

n(r)

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

,

(1.11)

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

F

[n]

d

3

rV

(r)n(r) E

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

II

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

LL

 

 

 

 

ext

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

где функционал Леви-Либа (LL) Kплотности определяется как:

F

[n]

 

ˆ

ˆ

|

min

[ | T

V

LL

 

 

int

 

 

 

n(r)

 

 

 

(1.12)

Формулировка Леви-Либа (1.12) проясняет смысл функционала:

минимум суммы кинетической энергии и энергии взаимодействий для всех

возможных волновых функций с данной плотностью

n(r) . Данная

формулировка имеет важные формальные отличия от формулировки Хоэнберга-Кона. В формулировке Леви-Либа функционал (1.12)

определяется любой плотностью n(r) , полученной из волновой функции N

для N электронов. Это называется N-представление: существует такая волновая функция N при любой плотности, удовлетворяющая простым

8

условиям. Хоэнберга-Кона функционал определен только для плотностей,

которые могут генерироваться каким-то внешним потенциалом (V-

представление), условия для таких плотностей неизвестны. При минимальной полной энергии в данном внешнем потенциале, LL-

функционал должен быть равен функционалу Хоэнберга-Кона, так как минимальной является плотность, которая может быть порождена внешним потенциалом. Кроме того, форма LL исключает ограничение Хоэнберга-Кона в невырожденных основных состояниях; теперь можно делать поиск в пространстве по любому из набора вырожденных состояний.

Теория функционала спиновой плотности

Теоремы Хоэнберга-Кона можно обобщить на несколько типов частиц.

Рассмотрим два вида плотности: плотность частиц n(r) n(r, ) n(r, ) и

спиновую плотность s(r) s(r, ) s(r, ) . Это приводит к функционалу энергии:

E

E

HK

[n, s]

 

 

E

'

HK

 

[n]

,

(1.13)

где в

последней форме предполагается, что [n] обозначает функционал

плотности,

который зависит и от положения в пространстве r и от спина s.

Теория функционала плотности не обеспечивает способ понять свойства материала просто, глядя на форму плотности. Нет способа извлечь непосредственно из плотности любой общий набор свойств, например,

является ли материал металлом или диэлектриком.

Рассмотрим случай, когда может быть найдено точное решение для N

невзаимодействующих электронов во внешнем потенциале. В этом случае точный Хоэнберга-Кона функционал дает кинетическую энергию. Для того чтобы оценить кинетическую энергию точно, единственный способ -

вернуться к обычным выражением с точки зрения набора N волновых функций. Кинетическая энергия выражается в термах волновых функций и

меняется как функция от числа электронов. Все части точного функционала

9

(кинетическая и потенциальная) будут варьироваться неаналитическим образом в зависимости от число электронов.

В случае твердых тел, плотность похожа на сумму перекрытия атомных плотностей. Ковалентную связь трудно отличить в общей плотности. Ионный кристалл часто рассматривается как сумма ионов, но он также хорошо представляется в виде суммы нейтральных атомов. Это возможно потому,

что отрицательный анион настолько велик, что его плотность проходит вокруг положительный катион, в результате чего плотность, аналогичную нейтральных атомов. Таким образом, даже для известных ионных кристаллов, не очевидно, как извлечь необходимую информацию из электронной плотности. Еще труднее отличить металлы от диэлектриков.

Это приводит методу Кона-Шама, успех которого основан на том факте, что он включает в себя кинетическую энергию невзаимодействующих электронов с точки зрения независимых волновых функций частиц, в

дополнение к взаимодействиям, явно смоделированных как функционалы плотности. Поскольку кинетическую энергию рассматривают в термах орбиталей - не как явный функционал плотности - он строится с квантовыми свойствами, которые не имеют простого соотношения плотности. Пока решение задачи многих тел достаточно близко к формулировке независимых частиц, метод Кона-Шама является мощным методом для теории электронной структуры [11, 13, 16].

1.3 Метод Кона-Шама

Теория функционала плотности является сегодня наиболее широко используемым методом для расчетов электронной структуры из-за метода,

предложенного Коном и Шамом: заменить оригинальную задачу многих тел на задачу вспомогательной системы независимых частиц. Этот подход приводит к точным расчетам свойств системы многих тел с использованием методов независимых частиц.

10

Соседние файлы в предмете [НЕСОРТИРОВАННОЕ]