 
        
        книги из ГПНТБ / Титаев А.А. Эволюция органических соединений на Земле. От углерода до биополимеров
.pdfЛактатдегидрогеиеза в организме животных и человека при сутствует в пяти формах — нзоферментах, которые различаются по электрофоретической подвижности и обозначают сокращенно ЛДГ-1, ЛДГ-2, ЛДГ-3, ЛДГ-4, ЛДГ-5. Наибольшей электриче ской подвижностью и отрицательным зарядом обладает ЛДГ-1. Этот изофермент наряду с ЛДГ-2 составляет преобладающую по активности фракцию изоферментов ЛДГ в сердце, эритроцитах, почках. Наименее подвижная катодная фракция ЛДГ-5 вместе с ЛДГ-4 характерна для печени и скелетной мышцы. Лактатдегид-
| рогеназа представляет | собой тетрамер с молекулярным весом | |||||||||
| 135 ООО. Этот | тетрамер | состоит из двух типов мономеров А | 
 | ж В | ||||||
| с молекулярным | весом | 35 ООО. Изоферменты ЛДГ | представляют | |||||||
| собой комбинации мономеров А и В: ЛДГ-1 | состоит из | 4 | В, | |||||||
| ЛДГ-2 — и з | 3 | В + | 1А, | ЛДГ-3 — из 2/3 | + | 2,4, | ЛДГ-4 - | из | ||
| ЗА + 1В и ЛДГ-5 - | из | 44 [177—179]. | 
 | 
 | 
 | 
 | 
 | |||
| Наибольшей активностью обладают тетрамеры ЛДГ. По не | ||||||||||
| которым данным, | ее не лишены и мономеры и тем более димеры | |||||||||
| с молекулярным | весом | 70 ООО [178, 179]. | 
 | 
 | 
 | 
 | 
 | |||
| Физико-химические | 
 | различия между | изоферментами | ЛДГ | ||||||
объясняются некоторым различием в их аминокислотном составе:
| преобладанием | аспарагиновой кислоты | в | ЛДГ-1 | и лизина | в | 
| ЛДГ-5 [177, | 178]. | 
 | 
 | 
 | 
 | 
| Изоферменты ЛДГ отличаются один | от | другого | также по | ве | |
личине константы Михаэлиса-Ментена, по иммунохимическим свойствам, по действию на них ингибиторов.
Фосфорилаза представляет собой своеобразный фермент. Она содержится в значительных количествах в печени и мышцах. Ее функция состоит в переносе остатков глюкозы от глюкозо-1- фосфата к гликогену или крахмалу. Оиа катализирует также обратную реакцию.
Известны две формы мышечиой^фосфорилазы [109]: активная а и неактивная Ь, которые могут взаимопревращаться. Фосфори лаза а содержит восемь молей фосфата, из них четыре присоеди
| нены к остаткам серпна, | а четыре содержатся в форме кофермен- | 
| та — пиридоксальфосфата | [180]. В фосфорилазе Ъ содержатся | 
два моля пиридоксальфосфата и две фосфатные группы, соеди ненные с серином.
| Очевидно, | фосфорилаза | а | представляет | собой комплекс из | |
| двух частнц | фосфорилазы | Ъ, которая образуется путем расщеп | |||
| ления формы а на две равные части. | 
 | 
 | |||
| Молекулярный вес фосфорилазы а составляет 500 000, | фос | ||||
| форилазы b — 250 000 или, по | другим данным, 185 000. В | орга | |||
| низме превращение формы | b | в форму а | осуществляется | при | |
участии, адениловой кислоты (адеиозии-З-5-монофосфата) и ионов магния под влиянием фермента кииазы, которая в свою очередь активируется адреналином и глюкагоном [180].
По данным советских ученых [181, 182], фосфорилазу можно разложить на мономеры с молекулярным весом 60 0000. Димер
71
ее имеет молекулярный вес 125 ООО и становится активным в при сутствии аденнловой кислоты.
Не исключена возможность, что и субъеддшицы фермента — мономеры — обладают активностью в известной степени [182].
MeinodunecKue указания. В работе использованы следующие методы: 1) определение общей и удельной активности ЛДГ по Вроблевскому и Дэйдыо [183]; 2) микроэлектрофоретическое разделение изоферментов ЛДГ; 3) определение фосфорилазной активности по Иллингворс и Кори [184]; 4) микроэлектрофорез
| фосфорилазы по Такеуши с окраской 0,01 н. 1а [185]. | из амино | ||||
| Инкубационная смесь для синтеза | была | составлена | |||
| кислот, АТФ и смолы | Дауэкс. Исходный | состав аминокислот | |||
| соответствовал | составу | имитируемого | фермента — ЛДГ [109] и | ||
| фосфорилазы | [109]. | 
 | 
 | 
 | 
 | 
| Очистка продукта спнтеза лактатдегидрогипазиого | действия | ||||
(ПЛ) и продукта синтеза фосфорилазного действия (ПФ) произ водилась путем осаждения и переосаждепия двойным объемом
| ацетона и | сернокислым аммонием до 0,5 (для | ПЛ) или 0,41 | ||
| (для ПФ) | насыщения, | многодневным диализом | при 0 + | 2°. В | 
| процессе очистки к | растворам добавляли соль цинка | (для | ||
| ЛДГ), АМФ и пирпдоксаль-5-фосфат (для ПФ). | 
 | 
 | ||
В работе были использованы аминокислоты, адеипловая кис лота (АМФ), аденозиитрифосфат (АТФ), пирпдоксаль-5-фосфат и глготатион восстановленный чехословацкой марки, Na-P-глицеро- фосфат фирмы Schuchardt (Мюнхен).
Результаты исследовании. В фильтратах от смолы, получен ных после инкубации, ферментной активности не обнаруживается или она слаба.
По-видимому, ПЛ и ПФ обладают в слабой степени полпферментативной активностью, однако в каждом из них резко пре обладает специфическая ферментативная активность. Последняя, однако, значительно ниже активности природных чистых фер
| ментов — ЛДГ и фосфорилазы [183, 184]. | 
 | 
 | |
| Активность, ед/ыг белка | ПЛ | 
 | ПФ | 
| ЛДГ | 607 (67—1553) | 2,2(0,3-3,3) | |
| фосфорилазная | 43,3 (19-83,3) | 458 | (225-880) | 
| амилазпая | 0,66 (051—0,70) | 2,4(1,0-30) | |
| Выход белка, % | 5,8(3,6-9) | 6,72 | (4,0-12,0) | 
| Другие параметры, | характеризующие ПЛ и ПФ, также свое | |
| образны для каждого | из них: | 
 | 
| Номер | Молекуляр- | N-концевые | 
| препарата | иый вес | аминокислоты | 
| Параметры, характеризующие ГШ | ||
| 2 | И 295 | Глутамиповая кислота | 
| 5 | 23 443 | То же, аллшги | 
| 7 | 33 687 | То же | 
72
| Номер | Молен уляр- | N-копцевые | 
| препарата | iibiii вес | аминокислоты | 
| 
 | Параметры, характеризующие ПФ | |
И8 013 Лизни, аспарапшо-
| 
 | 
 | вая кислота | 
| 12 | 41 420 | То же | 
| 13 | 46 ООО | » | 
| 14 | 145 900 | » | 
| 15 | 55100 | То же, валпн | 
Приведенные значения молекулярного веса, полученные осмо тическим методом, не соответствуют, вероятно, истинному моле кулярному весу активных частиц, содержащихся в ПЛ и ПФ, и являются лишь среднечислеииыми. Однако максимальные зна чения молекулярного веса характерны для каждого препарата и близки к молекулярному весу субъедишщ природных фермен тов (ЛДГ - 35 000 [181] и фосфорилазы — 125 000 [182] или меньше).
Закономерное повторение одних и тех же N-концевых амино кислот во всех исследованных препаратах ПЛ и ПФ оказалось для нас неожиданным и притом своеобразным для каждого из этих двух продуктов синтеза: глутаминовая кислота для ПЛ, лизин для ПФ. Идентификация N-концевых аминокислот была подтверждена гидролизом ДНФ-производных ПЛ и ПФ в кон центрированном аммиаке с последующей хроматографией иа бу маге в смеси бутаиол, уксусная кислота, вода ( 4 : 1 : 5). Здесь можно указать, что N-концевой группой в пептиде, полученном из фосфорилазы, является тоже лизин [186]. Доказательство существования пептидных связей в ПЛ и ПФ было получено
| путем определения N — N H 2 после гидролиза очищенных | продук | ||
| тов синтеза (20 час. при 105°) в 6 н. ЫС1: | 
 | 
 | |
| 
 | п л | ПФ | 
 | 
| Количество белка, мг/мл | 0,167 (0,080—0,285) | 0,178(0,085—0,240) | |
| N—NFL>, % иа белок | 8,78 + 3,04 | 13,9 + 6,15 | 
 | 
| Характерные отличия | ПЛ и ПФ были | обнаружены | и при | 
| микроэлектрофоретическом | разделении их | препаратов. | В трех | 
препаратах ПЛ были выявлены по две фракции, мигрировавшие к аноду. Первая медленная фракция соответствует по скорости миграции природному изофермепту ЛДГ2 , вторая — быстрая фракция не имеет аналога в природных пяти изоферментах ЛДГ и присутствует в ПЛ в меньшей концентрации, чем первая. Быть может, она в какой-то степени соответствует дополнительным фракциям, •существующим только в эмбриональной печени [187]. В двух препаратах ПЛ была найдена лишь одна фракция, а имен но первая — медленная (рис. 6). Относительное содержание обеих фракций составляло 65—75% для быстрой и 25—35% для мед ленной.
73
 
жание крахмала в смеси определяли йодной реакцией. Синтети
| ческая способность была найдена только в четырех | препаратах | ||
| ПФ из 26 исследованных и составляла | в среднем | 3,29 (1,82— | |
| 5,66) | мг крахмала на 1 мг белка. Как | указано в первой части | |
| этого | раздела, аминокислотный состав | продуктов | синтеза иа | 
смоле близок к составу исходной смеси аминокислот, что пока
| зано на примере | аминокислотного состава ПФ | (в % ) : | |
| 
 | Аминокислоты | ПФ | Исходный | 
| 
 | раствор | ||
| 
 | 
 | 
 | |
| Аргнинн | 
 | 15,0 | 13,5 | 
| Аспарагиповая кислота | 17,0 | 14,6 | |
| Алании | 
 | 5,8 | 5,4 | 
| Валии -|- метнотган | 10,7 | 8,65 | |
| Глутаминовая кислота-f-треоиин | 17,3 | 14,35 | |
| Глицин + | серии | 8,5 | 10,8 | 
| Лейцины | 
 | 7,3 | 6,7 | 
З а к л ю ч е н и е . Описанные эксперименты позволяют утвер ждать, что в условиях гетерогенного катализа возможен синтез белка с ферментными свойствами.
В качестве адсорбента были применены каолин и ионообмен ные смолы. Инкубационная смесь содержала все аминокислоты в количественном соотношении, характерном для синтезируемого фермента. Ее обязательными ингредиентами были АТФ и свой ственный моделируемому ферменту кофактор.
Синтезированные вещества имели более низкую активность, чем природные ферменты, и не обладали строгой специфичностью. Молекулярный вес некоторых из них был достаточно высоким. Однако в составе продукта синтеза содержались и мономеры, и дробные доли субъедишщ наряду с активными частицами пол ного молекулярного веса.
| Такая неоднородность состава продуктов синтеза | находит | 
| себе объяснение в ступенчатом характере синтеза на | адсорбен | 
тах. По аминокислотному составу, по кинетике активности, отношению к рН среды и к активаторам, по N-концевым амино кислотам синтезированные вещества были близки к копируемым природным ферментам.
Синтезированная лактатдегидрогеназа посредством электрофо реза на агар-агаре была разделена на два изофёрмента. Амилаза оказалась близкой к а-амилазе.
Необходимо подчеркнуть своеобразие каждого из трех син тезированных веществ, отличие их одно от другого и сходство в свойствах и строении с иоделируемыми ферментами. Отличи тельные особенности синтезированных фермеитоподобных ве ществ могли быть обусловлены лишь различным и характерным для каждого из них аминокислотным составом, так как все дру гие условия синтеза были одинаковыми.
75
Можно утверждать в соответствии с данными Стейнмана [1481, что в условиях гетерогенного катализа происходит синтез полипептидов не хаотической, а какой-то упорядоченной структуры, зависящей от количественного соотношения отдельных амино кислот в исходном растворе и обладающей соответствующей моде лируемому ферменту активностью.
Представленные здесь данные в значительной мере подкреп ляют представление о вероятном синтезе нативного белка с при митивными ферментными свойствами (или без них) в предбиоло гический период: в мягких условиях, в мутной воде прибреж ных зон, в присутствии мелкораздробленных адсорбентов — час тиц глины, апатита и др.
6
Нуклеиновые кислоты и их структурные элементы
П р е д в а р и т е л ь н ы е з а м е ч а н и я . В природе суще ствуют два типа нуклеиновых кислот — дезоксирибонуклеииовые (ДНК) и рибонуклеиновые (РНК). Первые локализованы преиму щественно в клеточных ядрах, вторые — в плазме, в рибосомах, а также в ядре. Оба типа нуклеиновых кислот построены по еди ному плану. Молекула каждой из них представляет собой весьма длинную цепь из соединенных друг с другом в определенной по вторяющейся последовательности четырех иуклеотидов. Каждый нуклеотид построен из углевода, трех остатков фосфата и пуринового или пиримидииового основания.
Нуклеотиды в молекуле нуклеиновых кислот соединены один с другим остатками сахара и фосфорной кислоты, основания же прикреплены к молекуле сахара и остаются в остальном свободными и способными образовывать водородные связи. В ДНК углеводом, является дезоксприбоза, в РНК — рибоза. Пуриновые основания в ДНК и РНК одинаковые — аденин и гуанин. Пиримпдиновые 'Основания в ДНК представлены цитозином и тимином, в РНК — цитозииом и урацилом.
Путем гидролиза ферментами из ДНК можно получить четы
| ре нуклеотпда — дезоксиаденозинтрифосфат, | дезоксигуанозинтрп- | ||||||
| фосфат, | дезоксицитидинтрифосфат, | 
 | дезокситимидинтрифосфат | ||||
| или | нуклеозиды — дезоксиаденозин | и | т. д. | Из | рибонуклеино | ||
| вой | кислоты таким же путем | или | гидролизом | щелочью полу | |||
| чают | нуклеотиды — адеиозинтрифосфат | и т. д. и нуклеозиды — | |||||
| аденозин, | гуанозин, уридин, | цитидин | [189]. | 
 | 
 | ||
Структурную основу ДНК и РНК составляют пуриновые и тгиримидиновые основания, от характера и последовательности расположения которых в молекулах ДНК и РНК и зависят ин дивидуальные свойства нуклеиновых кислот.
Представление о строении нуклеиновых кислот, о внутрен ней связи элементов их молекул — фосфатов, сахара и оснований— дает прилагаемая схема (см. стр. 78).
77
| фосфат | 
 | 
 | 
 | 
| I | сахар | А | ::::: | 
| фосфат | 1 | 
 | 
 | 
| | | сахар | Г | ::::: | 
| фосфат | 1 | 
 | 
 | 
| I | сахар | Ц | ::::: | 
| фосфат | 1 | 
 | 
 | 
| | | сахар | У (Г) | ::::: | 
| фосфат | 1 | 
 | 
 | 
Синтез нуклеиновых кислот и начинается с синтеза оснований. П у р и н о в ы е и п и р и м и д п н о в ы е о с н о в а н и я .
Возможность их синтеза в предбпологическую эпоху на Земле сомнений не вызывает. В ряде лабораторий выполнены модельные
| синтезы оснований в условиях, имитирующих земные | условия | 
| той эпохи. | 
 | 
| Исходными веществами для этих синтезов послужплп | прежде | 
всего метан, аммиак, цианистый водород, водород. Имитируя
| возможное действие 1 0 К иа первобытной Земле, указанную | выше | 
| смесь с добавлением радиоактивного 1 '1 С-метаиа, 4 н.раствора | хло | 
ристого аммония и водорода помещали в цилиндрический стеклян ный прибор и подвергали действпю пучка электронов мощностью 4,5 мэв. Йод этим воздействием жидкость кипела, количество поглощенной энергии за время опыта составило 7-101 0 эрг/г. Хроматографическим методом в этом опыте было установлено образо вание радиоактивного адеппна [190].
При этом выяснплось, что присутствие водорода замедляло синтетическую реакцию, а в отсутствие его ода значительно ус корялась.
В связи с этим наблюдением авторы приходят к выводу, что после удаления всего водорода из земной атмосферы количество органического вещества иа Земле увеличилось [145, 190].
Одновременно с аденином в реагирующей смеси были открыты гуанин и пентозы — рибоза и дезоксирибоза [190]. Прибавление формальдегида к смеси увеличивало выход углеводов. Очевидно, формальдегид был промежуточным веществом в этой реакции при образовании углеводов из метана.
Кроме метана исходным веществом для модельного синтеза пуринов послужила и синильная кислота. Радикал CN обнару жен, как известно, на Солнце, в кометах, и его присутствие на Земле предполагается еще в очень ранний период ее существова ния [191, 192].
В избрании HCN для^интеза пуринов руководствовались так же сходством строения этих двух веществ. В самом деле, валовую' формулу адеиина C6 I-I5 N5 можно рассматривать как полимер из пяти молекул HCN [138, 193].
78
Надежды синтезировать адении из HCN оправдались, но ме ханизм этого синтеза оказался сложнее, чем просто полимериза ция HCN.
В качестве источников энергии в этом синтезе были использо ваны ультрафиолетовая радиация и тепловая энергия. Так, Понамперума [138] облучал коротковолновыми ультрафиолетовыми лу чами в течение семи дпей раствор 10~3 моль/л цианистого натрпя, меченного иС в эвакуированных и запаянных кварцевых пробир ках. По окончании опыта содержимое пробирок выпаривали и разделяли двухмерной хроматографией па бумаге в системах растворителей: пропаиол, аммиак, вода и бутаиол, проппоновая кислота и вода. Хроматограммы радиоавтографировалп на рент геновскую пленку. В качестве продуктов реакции в этом опыте
| был получен | ряд | органических веществ — рибоза и дезоксирибо- | |
| за, мочевина | и | др. Среди ипх, применив нерадпоактивные но | |
| сители, | идентифицировали н пурииовые основания — 1 % аденииа | ||
| и 0,5% | гуанина | [138]. | |
Образование адепи'па можно наблюдать и в простых условиях термического синтеза. Если нагревать водный раствор, содержа щий синильную кислоту и аммиак, прп температуре 70—90° в те чение нескольких дпей, то в пем образз^ется около 1 % (от количе ства исходных веществ) аденппа и немного гппоксантина [193, 194].
Адении был получен также при нагревании раствора цианида аммония [128], а гуаппн — путем нагревания до 125° смеси 4-аминонмпдазол-5-карбоксамида и мочевины [195, 196].
Исходными веществами в модельных опытах по синтезу пуриновых оснований служили также аминокислоты. Так, прп нагре
| вании глицина до температуры | около | 500° К наблюдали образо | |
| вание | аденппа, ксаитпна, | мочевой | кислоты, гппоксантина | 
| [194]. | 
 | 
 | 
 | 
Здесь необходимо кратко коснуться вопроса о механизме син теза пуринов из метана и синильной кислоты. Метан в присутствии аммиака и воды под влиянием облучения подвергается окислению возникающими в растворе радикалами ОН и N H 2 с образованием формальдегида п его производных. В присутствии водорода эти радикалы восстанавливаются с образованием N H 3 и Н 2 0 .
Далее в реакции образуется предположительно цианистый водород [132, 138]. В указанных условиях из HCN образуется сна чала димер моноцианкарбен H.2N — С — CN, а затем имидазольные соединения (4-амино-имидазол-карбоксамид и др.), которые конденсируются с присутствующими в смеси производными фор мальдегида с образованием аденина [192, 198]. Согласно Клисс и Мэттыос, из HCN образуется в данных условиях сначала имидазольпое кольцо, а с присоединением к нему еще одной молекулы HCN — адении [196].
Синтез пйримидиновых оснований-в-модельных опытах изученслабо. Здесь можно назвать две-три работы.
79
Оро и сотрудники действием электрического разряда на смесь примитивных газов получали С3 -соедииеиия — 8-алапии, акрилонптрил, 6-аминопроппопптрил. Затем путем конденсации этих соединений с мочевиной в присутствии аммиака при 135° С им удалось синтезировать урацил с небольшим выходом [128]. Фоксу удалось получить урацил путем конденсации яблочной кислоты и мочевины в присутствии полифосфорной кислоты при 650° С [197]. Цптозин был получен при нагревании водного раствора KCNO + -г CJICN при 100° в течение C V T O K в присутствии водорода [1981.
По сравнению с модельными экспериментами по синтезу пури нов эксперименты с синтезом урацила не обладают большой силой убедительности: прямого синтеза пиримидинов из простейших газов не удалось осуществить.
Как видно, пути абиогенного синтеза ппримидИнов в перво бытных условиях не вполне ясны. Возможно, что причиной этого является нестойкость пиримидинов и разрушение их в присутствии гидразина, который образуется в большом количестве при дей ствии электрических разрядов на NIL, или NH4 OH [199].
Образование второго компонента нуклеиновых кислот — рибозы в РНК и дезокснрибозы в ДНК — совершалось, вероятно, легко в предбпологнческнх условиях на Земле. Наиболее вероят
| ный | путь этого синтеза | — из метана через | формальдегид: | 
| СН4 | —>НСНО —>С=,Н10О5 | —>Св Н1 2 Ов . Механизм | этого синтеза— | 
бутлеровская конденсация формальдегида. Действительно, синтез рибозы и дезокснрибозы установлен в опытах по синтезу адеиина из метана [138]. Он отмечен также и при других сходных опытах с применением ультрафиолетовой или ионизирующей (0 0 Со) ра диации [190]. Оро и Кокс синтезировали 2-дезоксирибозу и 2-де-
| зоксиксилозу | из смеси формальдегида и | ацетальдегида | [200]. | |
| Подробнее этот вопрос освещен в разделе V I I . | 
 | |||
| Н у к л е о з и д ы, | н у к л е о т и д ы, п о л и п у к л е о - | |||
| т и д ы. Эти | синтезы | надо рассматривать | как вторую | ступень | 
химической эволюции. В самом деле, для их осуществления требо вались уже готовые синтезированные исходные вещества — ну клеиновые основания — пурины, пиримидииы и сахара. Возмож ность образования нуклеозидов из готовых нуклеиновых оснований и углевода с очевидностью показана в опытах Понамперумы [201, 202]. Смесь 1 4 С-аденииа с дезоксирибозой в присутствии циани стого натрия в концентрации по 10~3 молей каждого ингредиента помещали в ампулы, замораживали, откачивали воздух и запаи вали. После облучения ампул ультрафиолетом с длиной волны 2537 А в течение 27 час. был получен дезоксиаденозин с выходом 7,1% [201].
Далее этим же исследователем было установлено, что в водных растворах смеси адеиина и рибозы под влиянием ультрафиолетовой радиации аденозин образуется лишь в присутствии фосфата, а при воздействии ионизирующего облучения на такой же раствор
80
