Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

книги из ГПНТБ / Титаев А.А. Эволюция органических соединений на Земле. От углерода до биополимеров

.pdf
Скачиваний:
11
Добавлен:
25.10.2023
Размер:
15.04 Mб
Скачать

В отсутствие РЫК и присутствии

АТФ и всех

других

ингреди­

ентов

системы скорость синтеза

замедлена (табл. 4,

 

ПА-0).

О. ступенчатом образовании продуктов

синтеза.

В

экспери­

ментах

с кратковременной

инкубацией

описанных

систем, от

15 мни. до 2 час , в элюатах смолы были

обнаружены

пептиды,

состоявшие из небольшого

числа

аминокислот.

Вследствие их

малой концентрации в элюатах по сравнению с концентрацией свободных аминокислот осуществить их изолирование и очистку

было трудно. Путем высоковольтного электрофореза

по Михль

с последующей хроматографией

электрофоретпческих

фракций

по методу пальцевых отпечатков или одномерной

хромато­

графии на бумаге с окраской по

Ридон — Смит [167] удалось

получить сведения о составе этих пептидов. Число электрофо­

ретпческих фракций,

выделенных из элгоатов смолы после 30—

60 мин. инкубации,

составляло

обычно

4—5, каждая фракция

делилась при хроматографии па

бумаге

на два — четыре пеп­

тида, состав которых

распознавался путем гидролиза в 6 п. НС1

и хроматографии на бумаге, а также путем дииитрофенилироваипя.

В контрольных пробах, содержащих- все ингредиенты,

кроме

АТФ. пептиды не

обнаружены. В

табл.

5

приведены

данные

 

 

 

Т а б л и ц а

5

 

 

 

 

 

Образование

пептидов при инкубации в течение 30 мин.

 

Источник

Исходный Общее чис­

 

 

 

 

 

N-конце-

 

раствор

ло пепти­

 

 

 

 

 

Rf

ГНК

аминокис­ дов в опы­

Состав некоторых пептидов вые амино­

 

лот

те

 

 

 

 

 

кислоты

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Печень

А

8

Асп,

глц

 

 

 

 

Асп

0,18

 

 

 

Асп,

глу, вал

 

 

 

Асп

0,30

 

 

 

Лиз,

асп,

глу,

ала

 

 

Асп

0,04

 

 

 

Глу,

про,

ала,

лей

 

 

Лей

0,44

Дрожжи

А

10

Лиз,

глн,

глу, вал

 

 

Глу

0,26

 

 

 

Лиз,

гпл, глу, ала,

лей

Ала

0,40

 

 

 

Лиз,

глу, вал, лей

 

 

Вал

0,28

Без РНК

А

9

Сер,

глу, ала

 

 

 

Ала

0,11

 

 

 

Асп,

глу,

вал

 

 

 

Асп

0,34

 

 

 

Глн,

вал

 

 

 

 

Вал

0,45

Дрожжи

Ж

12

Гли,

глу,

про

 

 

 

Про

0,23

 

 

 

Асп,

про,

опро

 

 

 

Про

0,29

 

 

 

Лиз,

глу,

про,

лей

 

 

Про

0,27

П р и м е ч а н и е . А. — смесь аминокислот,

соответствующая

составу

альбумина, Ж —

то же, желатины.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

61

числа аминокислотных остатков в молекуле, получения пептидов при ферментативном переваривании продуктов синтеза трип­ сином.

Процесс синтеза в наших условиях совершается ступенчато: в первые часы инкубации смеси аминокислот образуются олпгопептиды, а затем, с течением времени, они превращаются в высоко­ молекулярные нолипептиды. Молекулярный вес продуктов син­ теза в среднем составлял 57 450—90 ООО.

Адсорбированная на ионообменной смоле РЫК стимулирует синтез пептидов в присутствии АТФ (см. рис. 4). При этом ка­ чественные различия РНК в зависимости от происхождения отражаются иа составе аминоконцевых групп синтезированных продуктов и начальных пептидов при кратковременных экспе­ риментах.

Следует отметить, что N-концевые аминокислоты в некоторых препаратах ПА, где применялась рРНК из печени, оказались идентичными с N - и С-копцевыми группами природного сыво­

роточного альбумина [171], но эта

идентичность

могла быть

просто случайной.

 

 

Необходимо подчеркнуть, что в

зависимости

от заданного

исходного состава аминокислот инкубационной смеси, имитирую­ щего тот или другой белок, получены и различные продукты синтеза, соответствующие по своим качественным и количест­ венным показателям имитируемому белку.

Это обстоятельство, если будет подтверждено, откроет воз­ можность осуществления в предложенной системе целенаправ­ ленного синтеза белка.

Внаших экспериментах была использована в качестве адсор­ бента и катализатора ионообменная смола. Проверочные допол­ нительные опыты доказали, что с таким же успехом для синтеза полипептидов из аминокислот может быть использована и белая глина.

Вприродных условиях предбиологического периода иа Земле

могли существовать вещества, близкие

по составу

и свойствам

к синтетическим

ионообменным

смолам.

 

Значительно

позже нашей

работы

Крамппц и

сотр. [172]

в качестве модели абиогенного синтеза белка предложили метод воздействия аденозиимоиофосфата иа 18 аминокислот при обя­ зательном присутствии глутамина, аспарагина, N-формпл-метио- нина и N-ацетилвалина. В этой модели сначала образуется смесь амииоациладепнлатов, которые затем конденсируются иеэпзиматическим путем в карбонатном буфере при 25°. После трехднев­

ного диализа и очистки гельфпльтрацией на Сефадексе

G-50

авторы получили, видимо,

полипептид с

молекулярным

весом

100 ООО. Если синтез ведется

в отсутствие

дополнительных

четы­

рех веществ, то получается вещество малого молекулярного веса.

Полипептид подвергается

действию протеолитических ферментов

с образованием пептидов

[172],

63

Адсорбцию иа взвешенных частицах признают важным факто­ ром в синтезе полнпептидов из аминокислот н полпнуклеотидов из нуклеиновых оснований также Неймап и сотр. 1173]. Они считают, что эти синтезы происходили иа местах прилива и отли­ ва в условиях испарения и повышения концентрации реагирую­ щих веществ и адсорбции их на кристаллах апатпта при участии процессов дегидратации и фосфорилпрованпя.

Итак, в первой серии экспериментов в предложенных нами условиях были синтезированы белковоподобные Вещества типа простых белков, аналогичные в какой-то степени сывороточному альбумину и желатине.

Вторая серия экспериментов была посвящена вопросу о возможности синтеза белков с ферментными свойствами амилазы, лактатдегндрогеиазы, фосфорилазы.

5

Вещества с ферментными свойствами

А ы и л а з о п о д о б н о е в е щ е с т в о . Белковые вещества, синтезированные в предбиологический период, могли обладать ферментными свойствами. Нет ничего невероятного в том, что первичные белки могли образовывать комплексы и с металлами (Fe, Zii, Мп), и органическими веществами — предшественниками коферментов, тем более что возможность синтеза таких веществ в тот же период была вполне вероятной и показана в ряде модель­ ных экспериментов (см. стр. 35). Фоксу удалось выявить фосфатазные, адепозиптрифосфатазные и трансаминазиые свойства

своих

протеппоидов [155,

1561.

В

своих

исследованиях

мы исходили из позиции, изложенной

в разделе 4.

Не рассчитывая на случайную комбинацию амино­

кислот, мы закладывали с самого начала в исходную смесь именно

те

аминокислоты

и в том соотношении, в каком

они содержатся

в

естественном ферменте.

В

этом

случае, как и в разделе 4,

мы руководствовались

мыслью, что

количественные

соотноше­

ния

аминокислот

и их

свойства

могут определить в

известной

степени и их последовательность

в

синтезируемом

полимере

[148].

 

 

 

 

 

 

 

 

 

В

инкубационную

смесь

кроме

аминокислот

вносили соот­

ветствующие коферменты, соли металлов, специфические для фермента, и аденозинтрифосфорную кислоту.

Синтез проводили в условиях гетерогенного катализа с при­

менением ионообменных смол и глины (каолина).

 

Амилаза в природе

существует в двух формах — а-

и (3-ами-

лазы.

а-Амилаза,

или

а-1,4-глюкан-4-глюканогидрола-

за (3.2.1.1), расщепляет гликозидные связи гликогена

и крах­

мала

беспорядочно, с

образованием декстринов, олигосахаридов

и, наконец, мальтозы. Йодная проба при этом быстро становится отрицательной. Вторая форма амилазы — [3-амилаза, или 1,4- глюкан-мальтогидролаза (3.2.1.2), действует иа те же полисаха­ риды планомерно, последовательно отщепляя от них молекулы дисахарида мальтозы до полного разложения. Йодная реакция при этом сохраняется долго. Нагреванием разрушается преиму­ щественно (3-амилаза, слабой кислотой — а-амилаза. Этими воз­ действиями можно различать и отделять формы одну от другой.

3 А. А. Титаев

65

Имеются данные, что (3-амилаза содержит два активных центра с рН 4,3 н 7,1 с карбоксильной] и имидазолыюй (гистидии) груп­ пами. Молекула амилазы по своей структуре представляет со­

вокупность

трех

полипептидных

цепей, детали строения

кото­

рых

неизвестны.

Этот фермент

не содержит

кофакторов

[109,

174].

Его

синтез

в абиогеиных

условиях

оказался осущест­

вимым.

 

 

 

 

 

Ход эксперимента в его двух модификациях для синтеза амилазы был аналогичен изложенному в разделе IV . Единственное различие состояло в том, что соотношение аминокислот в инку­ бационном растворе соответствовало известному в литературе количественному соотношению их в природном ферменте [109]. Инкубация растворов длилась одни — пять суток при 37°, причем стерильность растворов была полностью обеспечена и сохранялась

до

конца

опыта.

 

 

 

 

 

 

 

Отсутствие бактериального загрязнения в наших эксперимен­

тах

доказывается

еще тем, что ферментная

активность в

филь­

тратах, где

мог

происходить

рост бактерий,

всегда

отсутство­

вала (см. табл.

5). Она отсутствовала также в

фильтратах

и элюатах

контрольных проб, не содержавших

АТФ, тема и т. п.

Отсутствием

бактериального

загрязнения

объясняются

инди­

видуальные свойства продуктов синтеза, полученных при инкуба­ ции аминокислотных смесей разного состава (каталаза, карбо-

ксипептпдаза

н т. д.).

 

Для смывания продуктов

синтеза с адсорбента применяли

0,9% NaCl,

фосфатный буфер

с различными значениями рН,

раствор 0,5—2н. NH4 OH. Элюаты со смолы подвергали диализу, сгущали в вакууме (40°) или теплым воздухом. Для очистки продукта синтеза амплазного действия (именуемого далее ПАм) использовали осаждение элюатов со смолы смесью спирта и ацетона (1 : 3), адсорбцию на крахмале (в 40%-иом спирте) с последующим смыванием фосфатным буфером рН 7,2—7,4 или 0,5н. NH4 OH в присутствии СаС12 и CaS04, а затем диализом,

электрофорезом на

бумаге.

Для очистки продукта

синтеза кар-

боксипептндазного

действия

(ПК) к сгущенным

элюатам

со смо­

лы добавляли NaOH до 0,1

и. и затем осаждали их добавле­

нием 1 н. уксусной

кислоты

в присутствии

микроколичеств

ZnS04 . Осадок после соответствующего промывания

взвеши­

вали в 2 М NaCl

и добавляли

0,1 н.

NaOH

до

растворения

осадка.

 

 

 

 

 

 

 

 

Элюироваиные

со смолы

продукты

синтеза

каталазиого дей­

ствия очистке не

подвергались.

 

 

 

 

 

Продукты синтеза подвергали структурному анализу. Опре­ деляли молекулярный вес, аминокислотный состав, N-концевые аминокислоты, аминоазот по вышеуказанным методам (см. раз­ дел 4).

Ферментативную активность ПАм измеряли в 1/15 М фосфат­ ном' буфере рН 7,2 по Смит и Роу [175] и по Хагедорн — Иенсен,

66

и по содержанию мальтозы хроматографией на

бумаге. Количе­

ство белка

определяли по Лоури [164]..

' !

Другие

подробности эксперимента описаны

в предыдущей!

разделе.

 

 

В целях синтеза продукта, обладающего амилолитическим1 действием, была использована, как сказано выше, смесь амино­

кислот, точно соответствующая

составу амилазы слюны чело­

века или поджелудочной железы свиньи [109].

Одновременно с инкубацией

этой смеси в качестве контроля

в точно одинаковых условиях инкубировали с таким же адсор­ бентом различные другие смеси аминокислот, взятые в том же количестве: 1) смесь, соответствующую составу сывороточного альбумина; 2) смесь, соответствующую составу а-амилазы, но! не содержащую аминокислот активного центра (гистидина, серипа, глицина); 3) смесь аминокислот активного центра амилазы (в количестве 10 мг) в таком соотношении, в каком они нахо­ дятся в природном продукте [109].

Фильтраты, фосфатные и аммиачные элюаты со смолы во всех этих экспериментах, после удаления аммиака в строго одинако­ вых количественных условиях, были использованы для опреде­

ления амилолитической активности по Смит

и Роу.

Результаты

этих исследований представлены в

табл.

6,

расчет

активности

сделан на весь

фильтрат

или элюат

с 1 г

смолы.

 

 

 

Т а б л и ц а

6

 

 

 

 

Амилолнтнчеекая активность

ээпоатов

смолы

 

(в 1 мг крахмала,

расщепленного

в течение 2 час.)

 

 

Элюаты

 

 

Число иссле­

Смесь аминокислот

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

дований

 

 

фосфатные

 

аммиачные

 

 

 

 

Амилазыая

0,022 (0-0,0S0)

 

2,63(1,1-6,0)

10-14

Амилазная без

активного

0

 

0,49 (0-0,72)

7

центра

 

 

 

 

 

 

 

Активный центр амилазы

Альбуминовая (сывороточ­ ный альбумин)

0,12(0-0,6)

7

1,4(0-3,5).

5

II р и м е ч а и й е. В фильтратах активность не обнаружена.

Из представленных данных видно, что элюаты смолы обла­ дают амилолитической активностью, в фильтратах же она отсут­ ствует. Наибольшая активность присуща аммиачным элюатам адсорбента, инкубированного в присутствии смеси аминокислот, соответствующей составу амилазы. Активность элюатов резко уменьшается при отсутствии в смеси аминокислот активного цен-

67

3*

тра амилазы или при инкубации других смесей. Активный про­ дукт синтеза, очевидно, локализуется на частицах адсорбента и лучше элюируется раствором аммиака, чем фосфатным буфе­

ром. Адсорбент

с адсорбированным на нем продуктом

синтеза

обладает весьма

слабой активностью

(10 контрольных

экспери­

ментов). В отсутствие АТФ синтез белка

не был ощутим.

Характеристика

продукта синтеза

с

амилазным

действием

{ПАм).

Очищенные препараты ПАм при электрофорезе иа бумаге

давали

одну полосу с амилолитической

активностью

в

области

•у-фракции. Амилолитическую активность фракций электрофореграмм устанавливали путем инкубации их при 37° в течение 2 час. после пропитывания 0,1%-иым раствором крахмала в фос­ фатном буфере рН 7,2 с последующим высушиванием и окраской йодом. Для характеристики нескольких очнщениых ПАм были определены: удельная амилолитическая активность (УАА), со­

держание

белка,

молекулярный вес, аминокислотный

состав,

N-концевые аминокислоты, N-NH2 ,

зависимость

активности ПАм

от рП и

температуры.

 

 

 

Как следует

из

данных, представленных

ниже, удельная

амилолитическая активность (в мг крахмала па 1 мг белка)

наших

ПАм была ниже активности природной кристаллической

а-ами-

лазы в 80 и более раз.

 

 

 

 

Инкубация,

Выход белка, %

Удельная амшюлитн-

 

 

час

 

ческая активность

 

 

48

 

3,74(2,05-7,70)

17,17 (1,82—37,5)

 

 

96

 

5,63(2,50—9,04)

45,37 (4,2")—83,0)

 

Дело в том, что наши

препараты не могли быть получены в кри­

сталлическом виде вследствие недостаточного количественного со­ держания в них белка.

Два препарата ПАм были

подвергнуты дополнительной

очист­

ке, и их удельная активность

увеличилась до 125,0 и 152,6.

Моле­

кулярный

вес наших

препаратов,

измеренный осмотическим

методом,

варьировал от 8280 до 20 000 (табл. 7).

 

 

Т а б л и ц а

7

 

 

Молекулярный

вес и амилолитическая

активность

 

очищенных препаратов

 

(на 1 мг белка)

 

Номер

 

Молекуляр­

Удельная ак­

 

с

тивность, мг

 

препарата

 

ный вес

крахмала на

 

 

 

 

 

 

i мг белка

 

16

30,0

 

 

8 280

31,250

 

18

16,0

 

15 530

61,728

 

18а

12,7

 

19 530

17,200

 

19

12,3

 

20 000

6,0

68

При хроматографпческом анализе гидролизатов аминокислот­ ный состав синтезированного препарата оказался в значительной степени сходным но количественному содержанию с составом исходной смеси аминокислот (в %) :

Аминокислоты

Исходный

Синтезированный

раствор

препарат^ПАм

Лизин + цнстелн

8,6

9,8

Гистндин + аргинин

11,9

15,0

Аспарагиновая кислота

19,3

16,0

Глицин + серии

14,6

15,6

Треошш

4,5

4,4

Глутаминовая кислота

9,6

6,0

Алании + пролин

8,6

8,0

Тирозин

5,5

6,2

Валин, мзтиошш

6,9

8,6

Фепилалашш

 

 

Лейцин

18,8

9,2

Изолсйции

J

 

Отличие в содержании аминокислот между исходным раство­ ром и ПАм сказалось главным образом в отношении лейцина, изолейцина, фенилаланииа, глутамииовой кислоты. В шести пре­ паратах ПАм были определены N-концевые аминокислоты по методу Сэиджера:

Номер препарата

N-кбнцевые аминокислоты

5-1

Алании,

глутаминовая кислота

5-2

Феннлаланнн, аспарагиновая кислота

6-1

Глицин,

фепилалашш, глутаминовая

6-2

кислота

 

 

Глицин,

алашш,

фепилалашш, глу­

14

таминовая кислота

Глицин,

алашш,

лейцин

18Глицин, аланшг, лейцшг

Вприродной амилазе содержатся три полипетидные цепи с N-концевыми аминокислотами — фенилаланином, аланииом и

глицином [176]. В наших препаратах

присутствовало,

вероят­

но, от двух до четырех полипетидных

цепей, связанных

или не

связанных

одна с другой.

 

 

 

 

Доказательство полипептидной структуры ПАм можно видеть

из данных

по изменению

содержания

NH2 -rpynn после

гидро­

лиза ПАм:

 

 

 

 

 

 

Количество ПАм, мг

 

5,65

 

 

N—ГМШ, мг

 

 

 

 

 

первичный.

 

0,070+0,031

 

 

после гидролиза

0,663+0,117

 

 

увеличение,

%

 

10 21

 

69

Ниже показано изменение амилолптической удельной активности ПАм в зависимости от рЫ при 37° (опыты проводили в Vis М фосфатном буфере):

пТ-т пгш 47°

Активность

, ? 0

Активность

рН при и

П А М | %

 

рН при

И

ПАм_ %

 

5,0

1,0-1,5

8,8

 

2,2-2,5

5,6-6,6

1,6-2,2

10-12

 

0

6,8-7,4

2,2-15,0

 

 

 

Как видно,

оптимальная

зона

рН для ПАм лежит в пределах

6,8-7,4.

 

 

 

 

 

 

Удельная

активность

ПАм

при постоянной рН (7,2), но при

различной температуре

меняется значительно: при 55° остается

еще достаточно высокой,

с повышением температуры активность

падает и при 100°

исчезает.

 

 

 

Температура,

Активность

Температура,

Активность

°С

ПАм, %

°С

 

ПАМ, %

37

100

80

,10

 

55

62

 

100

0-8,8

 

В целях получения белковоподобиого продукта с заданными

ферментными свойствами

мы использовали

систему из адсорбен­

та, АТФ и смеси аминокислот,

точно соответствующей качествен­

ному и количественному

составу фермента — амилазы. В этих

условиях полученный продукт синтеза обладал ожидаемым амилолитпческим действием, но с пониженной активностью. По своим свойствам — отношению к нагреванию, к рН — наш препарат стоит ближе к а-, чем к (3-форме амилазы. Путем хроматографии на бумаге в продуктах гпдролиза крахмала под действием на­ шего препарата была обнаружена только мальтоза, глюкоза же отсутствовала. О полном соответствии нашего препарата с при­

родной сс-амилазой вряд ли можно говорить, но все же

вероятно,

что последовательность аминокислот в нем была близка

к после­

довательности ее в копируемом природном ферменте и конструи­ ровалась по закономерностям, указанным Стейиманом [148]. Активность синтезированного амилазоподобного вещества опре­ делялась, вероятно, констелляцией аминокислот активного цен­ тра, которая была близка к структуре активного центра ами­ лазы. Может быть, наш препарат заслуживает названия «преамилаза».

 

В е щ е с т в а с о с в о й с т в а м и

л а к т а т д е г и д р о -

г е н а з ы

и

ф о с ф о р и л а з ы .

 

Лактатдегидрогеназа (ЛДГ)

катализирует

конечную,

обратимую,

реакцию

гликолиза —

восстановление

пировиноградной

кислоты в

молочную при

участии

никотинамиддинуклеотида

(НАД). Этот фермент рас­

пространен среди животных,

где он содержится в виде L-формы,

а

также

среди

некоторых

бактерий

(Lactobacillus,

Clostridium

и

др.), где содержится в виде L- или

D-формы

[109].

70

Соседние файлы в папке книги из ГПНТБ