книги из ГПНТБ / Титаев А.А. Эволюция органических соединений на Земле. От углерода до биополимеров
.pdfВ отсутствие РЫК и присутствии |
АТФ и всех |
других |
ингреди |
||||
ентов |
системы скорость синтеза |
замедлена (табл. 4, |
|
ПА-0). |
|||
О. ступенчатом образовании продуктов |
синтеза. |
В |
экспери |
||||
ментах |
с кратковременной |
инкубацией |
описанных |
систем, от |
|||
15 мни. до 2 час , в элюатах смолы были |
обнаружены |
пептиды, |
|||||
состоявшие из небольшого |
числа |
аминокислот. |
Вследствие их |
малой концентрации в элюатах по сравнению с концентрацией свободных аминокислот осуществить их изолирование и очистку
было трудно. Путем высоковольтного электрофореза |
по Михль |
|
с последующей хроматографией |
электрофоретпческих |
фракций |
по методу пальцевых отпечатков или одномерной |
хромато |
|
графии на бумаге с окраской по |
Ридон — Смит [167] удалось |
получить сведения о составе этих пептидов. Число электрофо
ретпческих фракций, |
выделенных из элгоатов смолы после 30— |
||
60 мин. инкубации, |
составляло |
обычно |
4—5, каждая фракция |
делилась при хроматографии па |
бумаге |
на два — четыре пеп |
|
тида, состав которых |
распознавался путем гидролиза в 6 п. НС1 |
и хроматографии на бумаге, а также путем дииитрофенилироваипя.
В контрольных пробах, содержащих- все ингредиенты, |
кроме |
|||||||||
АТФ. пептиды не |
обнаружены. В |
табл. |
5 |
приведены |
данные |
|||||
|
|
|
Т а б л и ц а |
5 |
|
|
|
|
|
|
Образование |
пептидов при инкубации в течение 30 мин. |
|
||||||||
Источник |
Исходный Общее чис |
|
|
|
|
|
N-конце- |
|
||
раствор |
ло пепти |
|
|
|
|
|
Rf |
|||
ГНК |
аминокис дов в опы |
Состав некоторых пептидов вые амино |
||||||||
|
лот |
те |
|
|
|
|
|
кислоты |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
Печень |
А |
8 |
Асп, |
глц |
|
|
|
|
Асп |
0,18 |
|
|
|
Асп, |
глу, вал |
|
|
|
Асп |
0,30 |
|
|
|
|
Лиз, |
асп, |
глу, |
ала |
|
|
Асп |
0,04 |
|
|
|
Глу, |
про, |
ала, |
лей |
|
|
Лей |
0,44 |
Дрожжи |
А |
10 |
Лиз, |
глн, |
глу, вал |
|
|
Глу |
0,26 |
|
|
|
|
Лиз, |
гпл, глу, ала, |
лей |
Ала |
0,40 |
|||
|
|
|
Лиз, |
глу, вал, лей |
|
|
Вал |
0,28 |
||
Без РНК |
А |
9 |
Сер, |
глу, ала |
|
|
|
Ала |
0,11 |
|
|
|
|
Асп, |
глу, |
вал |
|
|
|
Асп |
0,34 |
|
|
|
Глн, |
вал |
|
|
|
|
Вал |
0,45 |
Дрожжи |
Ж |
12 |
Гли, |
глу, |
про |
|
|
|
Про |
0,23 |
|
|
|
Асп, |
про, |
опро |
|
|
|
Про |
0,29 |
|
|
|
Лиз, |
глу, |
про, |
лей |
|
|
Про |
0,27 |
П р и м е ч а н и е . А. — смесь аминокислот, |
соответствующая |
составу |
альбумина, Ж — |
|||||||
то же, желатины. |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
61
числа аминокислотных остатков в молекуле, получения пептидов при ферментативном переваривании продуктов синтеза трип сином.
Процесс синтеза в наших условиях совершается ступенчато: в первые часы инкубации смеси аминокислот образуются олпгопептиды, а затем, с течением времени, они превращаются в высоко молекулярные нолипептиды. Молекулярный вес продуктов син теза в среднем составлял 57 450—90 ООО.
Адсорбированная на ионообменной смоле РЫК стимулирует синтез пептидов в присутствии АТФ (см. рис. 4). При этом ка чественные различия РНК в зависимости от происхождения отражаются иа составе аминоконцевых групп синтезированных продуктов и начальных пептидов при кратковременных экспе риментах.
Следует отметить, что N-концевые аминокислоты в некоторых препаратах ПА, где применялась рРНК из печени, оказались идентичными с N - и С-копцевыми группами природного сыво
роточного альбумина [171], но эта |
идентичность |
могла быть |
просто случайной. |
|
|
Необходимо подчеркнуть, что в |
зависимости |
от заданного |
исходного состава аминокислот инкубационной смеси, имитирую щего тот или другой белок, получены и различные продукты синтеза, соответствующие по своим качественным и количест венным показателям имитируемому белку.
Это обстоятельство, если будет подтверждено, откроет воз можность осуществления в предложенной системе целенаправ ленного синтеза белка.
Внаших экспериментах была использована в качестве адсор бента и катализатора ионообменная смола. Проверочные допол нительные опыты доказали, что с таким же успехом для синтеза полипептидов из аминокислот может быть использована и белая глина.
Вприродных условиях предбиологического периода иа Земле
могли существовать вещества, близкие |
по составу |
и свойствам |
||
к синтетическим |
ионообменным |
смолам. |
|
|
Значительно |
позже нашей |
работы |
Крамппц и |
сотр. [172] |
в качестве модели абиогенного синтеза белка предложили метод воздействия аденозиимоиофосфата иа 18 аминокислот при обя зательном присутствии глутамина, аспарагина, N-формпл-метио- нина и N-ацетилвалина. В этой модели сначала образуется смесь амииоациладепнлатов, которые затем конденсируются иеэпзиматическим путем в карбонатном буфере при 25°. После трехднев
ного диализа и очистки гельфпльтрацией на Сефадексе |
G-50 |
||
авторы получили, видимо, |
полипептид с |
молекулярным |
весом |
100 ООО. Если синтез ведется |
в отсутствие |
дополнительных |
четы |
рех веществ, то получается вещество малого молекулярного веса.
Полипептид подвергается |
действию протеолитических ферментов |
с образованием пептидов |
[172], |
63
Адсорбцию иа взвешенных частицах признают важным факто ром в синтезе полнпептидов из аминокислот н полпнуклеотидов из нуклеиновых оснований также Неймап и сотр. 1173]. Они считают, что эти синтезы происходили иа местах прилива и отли ва в условиях испарения и повышения концентрации реагирую щих веществ и адсорбции их на кристаллах апатпта при участии процессов дегидратации и фосфорилпрованпя.
Итак, в первой серии экспериментов в предложенных нами условиях были синтезированы белковоподобные Вещества типа простых белков, аналогичные в какой-то степени сывороточному альбумину и желатине.
Вторая серия экспериментов была посвящена вопросу о возможности синтеза белков с ферментными свойствами амилазы, лактатдегндрогеиазы, фосфорилазы.
5
Вещества с ферментными свойствами
А ы и л а з о п о д о б н о е в е щ е с т в о . Белковые вещества, синтезированные в предбиологический период, могли обладать ферментными свойствами. Нет ничего невероятного в том, что первичные белки могли образовывать комплексы и с металлами (Fe, Zii, Мп), и органическими веществами — предшественниками коферментов, тем более что возможность синтеза таких веществ в тот же период была вполне вероятной и показана в ряде модель ных экспериментов (см. стр. 35). Фоксу удалось выявить фосфатазные, адепозиптрифосфатазные и трансаминазиые свойства
своих |
протеппоидов [155, |
1561. |
|
В |
своих |
исследованиях |
мы исходили из позиции, изложенной |
в разделе 4. |
Не рассчитывая на случайную комбинацию амино |
кислот, мы закладывали с самого начала в исходную смесь именно
те |
аминокислоты |
и в том соотношении, в каком |
они содержатся |
|||||||
в |
естественном ферменте. |
В |
этом |
случае, как и в разделе 4, |
||||||
мы руководствовались |
мыслью, что |
количественные |
соотноше |
|||||||
ния |
аминокислот |
и их |
свойства |
могут определить в |
известной |
|||||
степени и их последовательность |
в |
синтезируемом |
полимере |
|||||||
[148]. |
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
В |
инкубационную |
смесь |
кроме |
аминокислот |
вносили соот |
ветствующие коферменты, соли металлов, специфические для фермента, и аденозинтрифосфорную кислоту.
Синтез проводили в условиях гетерогенного катализа с при
менением ионообменных смол и глины (каолина). |
|
|||
Амилаза в природе |
существует в двух формах — а- |
и (3-ами- |
||
лазы. |
а-Амилаза, |
или |
а-1,4-глюкан-4-глюканогидрола- |
|
за (3.2.1.1), расщепляет гликозидные связи гликогена |
и крах |
|||
мала |
беспорядочно, с |
образованием декстринов, олигосахаридов |
и, наконец, мальтозы. Йодная проба при этом быстро становится отрицательной. Вторая форма амилазы — [3-амилаза, или 1,4- глюкан-мальтогидролаза (3.2.1.2), действует иа те же полисаха риды планомерно, последовательно отщепляя от них молекулы дисахарида мальтозы до полного разложения. Йодная реакция при этом сохраняется долго. Нагреванием разрушается преиму щественно (3-амилаза, слабой кислотой — а-амилаза. Этими воз действиями можно различать и отделять формы одну от другой.
3 А. А. Титаев |
65 |
Имеются данные, что (3-амилаза содержит два активных центра с рН 4,3 н 7,1 с карбоксильной] и имидазолыюй (гистидии) груп пами. Молекула амилазы по своей структуре представляет со
вокупность |
трех |
полипептидных |
цепей, детали строения |
кото |
||
рых |
неизвестны. |
Этот фермент |
не содержит |
кофакторов |
[109, |
|
174]. |
Его |
синтез |
в абиогеиных |
условиях |
оказался осущест |
|
вимым. |
|
|
|
|
|
Ход эксперимента в его двух модификациях для синтеза амилазы был аналогичен изложенному в разделе IV . Единственное различие состояло в том, что соотношение аминокислот в инку бационном растворе соответствовало известному в литературе количественному соотношению их в природном ферменте [109]. Инкубация растворов длилась одни — пять суток при 37°, причем стерильность растворов была полностью обеспечена и сохранялась
до |
конца |
опыта. |
|
|
|
|
|
|
|
|
Отсутствие бактериального загрязнения в наших эксперимен |
||||||||
тах |
доказывается |
еще тем, что ферментная |
активность в |
филь |
|||||
тратах, где |
мог |
происходить |
рост бактерий, |
всегда |
отсутство |
||||
вала (см. табл. |
5). Она отсутствовала также в |
фильтратах |
|||||||
и элюатах |
контрольных проб, не содержавших |
АТФ, тема и т. п. |
|||||||
Отсутствием |
бактериального |
загрязнения |
объясняются |
инди |
видуальные свойства продуктов синтеза, полученных при инкуба ции аминокислотных смесей разного состава (каталаза, карбо-
ксипептпдаза |
н т. д.). |
|
Для смывания продуктов |
синтеза с адсорбента применяли |
|
0,9% NaCl, |
фосфатный буфер |
с различными значениями рН, |
раствор 0,5—2н. NH4 OH. Элюаты со смолы подвергали диализу, сгущали в вакууме (40°) или теплым воздухом. Для очистки продукта синтеза амплазного действия (именуемого далее ПАм) использовали осаждение элюатов со смолы смесью спирта и ацетона (1 : 3), адсорбцию на крахмале (в 40%-иом спирте) с последующим смыванием фосфатным буфером рН 7,2—7,4 или 0,5н. NH4 OH в присутствии СаС12 и CaS04, а затем диализом,
электрофорезом на |
бумаге. |
Для очистки продукта |
синтеза кар- |
|||||
боксипептндазного |
действия |
(ПК) к сгущенным |
элюатам |
со смо |
||||
лы добавляли NaOH до 0,1 |
и. и затем осаждали их добавле |
|||||||
нием 1 н. уксусной |
кислоты |
в присутствии |
микроколичеств |
|||||
ZnS04 . Осадок после соответствующего промывания |
взвеши |
|||||||
вали в 2 М NaCl |
и добавляли |
0,1 н. |
NaOH |
до |
растворения |
|||
осадка. |
|
|
|
|
|
|
|
|
Элюироваиные |
со смолы |
продукты |
синтеза |
каталазиого дей |
||||
ствия очистке не |
подвергались. |
|
|
|
|
|
Продукты синтеза подвергали структурному анализу. Опре деляли молекулярный вес, аминокислотный состав, N-концевые аминокислоты, аминоазот по вышеуказанным методам (см. раз дел 4).
Ферментативную активность ПАм измеряли в 1/15 М фосфат ном' буфере рН 7,2 по Смит и Роу [175] и по Хагедорн — Иенсен,
66
и по содержанию мальтозы хроматографией на |
бумаге. Количе |
|
ство белка |
определяли по Лоури [164].. |
' ! |
Другие |
подробности эксперимента описаны |
в предыдущей! |
разделе. |
|
|
В целях синтеза продукта, обладающего амилолитическим1 действием, была использована, как сказано выше, смесь амино
кислот, точно соответствующая |
составу амилазы слюны чело |
века или поджелудочной железы свиньи [109]. |
|
Одновременно с инкубацией |
этой смеси в качестве контроля |
в точно одинаковых условиях инкубировали с таким же адсор бентом различные другие смеси аминокислот, взятые в том же количестве: 1) смесь, соответствующую составу сывороточного альбумина; 2) смесь, соответствующую составу а-амилазы, но! не содержащую аминокислот активного центра (гистидина, серипа, глицина); 3) смесь аминокислот активного центра амилазы (в количестве 10 мг) в таком соотношении, в каком они нахо дятся в природном продукте [109].
Фильтраты, фосфатные и аммиачные элюаты со смолы во всех этих экспериментах, после удаления аммиака в строго одинако вых количественных условиях, были использованы для опреде
ления амилолитической активности по Смит |
и Роу. |
Результаты |
|||||
этих исследований представлены в |
табл. |
6, |
расчет |
активности |
|||
сделан на весь |
фильтрат |
или элюат |
с 1 г |
смолы. |
|
||
|
|
Т а б л и ц а |
6 |
|
|
|
|
Амилолнтнчеекая активность |
ээпоатов |
смолы |
|
||||
(в 1 мг крахмала, |
расщепленного |
в течение 2 час.) |
|||||
|
|
Элюаты |
|
|
Число иссле |
||
Смесь аминокислот |
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
дований |
||
|
|
фосфатные |
|
аммиачные |
|||
|
|
|
|
||||
Амилазыая |
0,022 (0-0,0S0) |
|
2,63(1,1-6,0) |
10-14 |
|||
Амилазная без |
активного |
0 |
|
0,49 (0-0,72) |
7 |
||
центра |
|
|
|
|
|
|
|
Активный центр амилазы
Альбуминовая (сывороточ ный альбумин)
—
—
0,12(0-0,6) |
7 |
1,4(0-3,5). |
5 |
II р и м е ч а и й е. В фильтратах активность не обнаружена.
Из представленных данных видно, что элюаты смолы обла дают амилолитической активностью, в фильтратах же она отсут ствует. Наибольшая активность присуща аммиачным элюатам адсорбента, инкубированного в присутствии смеси аминокислот, соответствующей составу амилазы. Активность элюатов резко уменьшается при отсутствии в смеси аминокислот активного цен-
67 |
3* |
тра амилазы или при инкубации других смесей. Активный про дукт синтеза, очевидно, локализуется на частицах адсорбента и лучше элюируется раствором аммиака, чем фосфатным буфе
ром. Адсорбент |
с адсорбированным на нем продуктом |
синтеза |
||||
обладает весьма |
слабой активностью |
(10 контрольных |
экспери |
|||
ментов). В отсутствие АТФ синтез белка |
не был ощутим. |
|||||
Характеристика |
продукта синтеза |
с |
амилазным |
действием |
||
{ПАм). |
Очищенные препараты ПАм при электрофорезе иа бумаге |
|||||
давали |
одну полосу с амилолитической |
активностью |
в |
области |
•у-фракции. Амилолитическую активность фракций электрофореграмм устанавливали путем инкубации их при 37° в течение 2 час. после пропитывания 0,1%-иым раствором крахмала в фос фатном буфере рН 7,2 с последующим высушиванием и окраской йодом. Для характеристики нескольких очнщениых ПАм были определены: удельная амилолитическая активность (УАА), со
держание |
белка, |
молекулярный вес, аминокислотный |
состав, |
|||
N-концевые аминокислоты, N-NH2 , |
зависимость |
активности ПАм |
||||
от рП и |
температуры. |
|
|
|
||
Как следует |
из |
данных, представленных |
ниже, удельная |
|||
амилолитическая активность (в мг крахмала па 1 мг белка) |
наших |
|||||
ПАм была ниже активности природной кристаллической |
а-ами- |
|||||
лазы в 80 и более раз. |
|
|
|
|||
|
Инкубация, |
Выход белка, % |
Удельная амшюлитн- |
|
||
|
час |
|
ческая активность |
|
||
|
48 |
|
3,74(2,05-7,70) |
17,17 (1,82—37,5) |
|
|
|
96 |
|
5,63(2,50—9,04) |
45,37 (4,2")—83,0) |
|
|
Дело в том, что наши |
препараты не могли быть получены в кри |
сталлическом виде вследствие недостаточного количественного со держания в них белка.
Два препарата ПАм были |
подвергнуты дополнительной |
очист |
ке, и их удельная активность |
увеличилась до 125,0 и 152,6. |
Моле |
кулярный |
вес наших |
препаратов, |
измеренный осмотическим |
|||
методом, |
варьировал от 8280 до 20 000 (табл. 7). |
|||||
|
|
Т а б л и ц а |
7 |
|
||
|
Молекулярный |
вес и амилолитическая |
активность |
|||
|
очищенных препаратов |
|
(на 1 мг белка) |
|||
|
Номер |
|
Молекуляр |
Удельная ак |
||
|
с |
тивность, мг |
||||
|
препарата |
|
ный вес |
крахмала на |
||
|
|
|
|
|
|
i мг белка |
|
16 |
30,0 |
|
|
8 280 |
31,250 |
|
18 |
16,0 |
|
15 530 |
61,728 |
|
|
18а |
12,7 |
|
19 530 |
17,200 |
|
|
19 |
12,3 |
|
20 000 |
6,0 |
68
При хроматографпческом анализе гидролизатов аминокислот ный состав синтезированного препарата оказался в значительной степени сходным но количественному содержанию с составом исходной смеси аминокислот (в %) :
Аминокислоты |
Исходный |
Синтезированный |
|
раствор |
препарат^ПАм |
||
Лизин + цнстелн |
|||
8,6 |
9,8 |
||
Гистндин + аргинин |
11,9 |
15,0 |
|
Аспарагиновая кислота |
19,3 |
16,0 |
|
Глицин + серии |
14,6 |
15,6 |
|
Треошш |
4,5 |
4,4 |
|
Глутаминовая кислота |
9,6 |
6,0 |
|
Алании + пролин |
8,6 |
8,0 |
|
Тирозин |
5,5 |
6,2 |
|
Валин, мзтиошш |
6,9 |
8,6 |
|
Фепилалашш |
|
|
|
Лейцин |
18,8 |
9,2 |
|
Изолсйции |
J |
|
Отличие в содержании аминокислот между исходным раство ром и ПАм сказалось главным образом в отношении лейцина, изолейцина, фенилаланииа, глутамииовой кислоты. В шести пре паратах ПАм были определены N-концевые аминокислоты по методу Сэиджера:
Номер препарата |
N-кбнцевые аминокислоты |
||
5-1 |
Алании, |
глутаминовая кислота |
|
5-2 |
Феннлаланнн, аспарагиновая кислота |
||
6-1 |
Глицин, |
фепилалашш, глутаминовая |
|
6-2 |
кислота |
|
|
Глицин, |
алашш, |
фепилалашш, глу |
|
14 |
таминовая кислота |
||
Глицин, |
алашш, |
лейцин |
18Глицин, аланшг, лейцшг
Вприродной амилазе содержатся три полипетидные цепи с N-концевыми аминокислотами — фенилаланином, аланииом и
глицином [176]. В наших препаратах |
присутствовало, |
вероят |
|||
но, от двух до четырех полипетидных |
цепей, связанных |
или не |
|||
связанных |
одна с другой. |
|
|
|
|
Доказательство полипептидной структуры ПАм можно видеть |
|||||
из данных |
по изменению |
содержания |
NH2 -rpynn после |
гидро |
|
лиза ПАм: |
|
|
|
|
|
|
Количество ПАм, мг |
|
5,65 |
|
|
|
N—ГМШ, мг |
|
|
|
|
|
первичный. |
|
0,070+0,031 |
|
|
|
после гидролиза |
0,663+0,117 |
|
||
|
увеличение, |
% |
|
10 21 |
|
69
Ниже показано изменение амилолптической удельной активности ПАм в зависимости от рЫ при 37° (опыты проводили в Vis М фосфатном буфере):
пТ-т пгш 47° |
Активность |
„ |
, ? 0 |
Активность |
||
рН при и |
П А М | % |
|
рН при |
И |
ПАм_ % |
|
|
5,0 |
1,0-1,5 |
8,8 |
|
2,2-2,5 |
|
5,6-6,6 |
1,6-2,2 |
10-12 |
|
0 |
||
6,8-7,4 |
2,2-15,0 |
|
|
|
||
Как видно, |
оптимальная |
зона |
рН для ПАм лежит в пределах |
|||
6,8-7,4. |
|
|
|
|
|
|
Удельная |
активность |
ПАм |
при постоянной рН (7,2), но при |
различной температуре |
меняется значительно: при 55° остается |
||||
еще достаточно высокой, |
с повышением температуры активность |
||||
падает и при 100° |
исчезает. |
|
|
|
|
Температура, |
Активность |
Температура, |
Активность |
||
°С |
ПАм, % |
°С |
|
ПАМ, % |
|
37 |
100 |
80 |
,10 |
|
|
55 |
62 |
|
100 |
0-8,8 |
|
В целях получения белковоподобиого продукта с заданными |
|||||
ферментными свойствами |
мы использовали |
систему из адсорбен |
|||
та, АТФ и смеси аминокислот, |
точно соответствующей качествен |
||||
ному и количественному |
составу фермента — амилазы. В этих |
условиях полученный продукт синтеза обладал ожидаемым амилолитпческим действием, но с пониженной активностью. По своим свойствам — отношению к нагреванию, к рН — наш препарат стоит ближе к а-, чем к (3-форме амилазы. Путем хроматографии на бумаге в продуктах гпдролиза крахмала под действием на шего препарата была обнаружена только мальтоза, глюкоза же отсутствовала. О полном соответствии нашего препарата с при
родной сс-амилазой вряд ли можно говорить, но все же |
вероятно, |
что последовательность аминокислот в нем была близка |
к после |
довательности ее в копируемом природном ферменте и конструи ровалась по закономерностям, указанным Стейиманом [148]. Активность синтезированного амилазоподобного вещества опре делялась, вероятно, констелляцией аминокислот активного цен тра, которая была близка к структуре активного центра ами лазы. Может быть, наш препарат заслуживает названия «преамилаза».
|
В е щ е с т в а с о с в о й с т в а м и |
л а к т а т д е г и д р о - |
|||||||
г е н а з ы |
и |
ф о с ф о р и л а з ы . |
|
Лактатдегидрогеназа (ЛДГ) |
|||||
катализирует |
конечную, |
обратимую, |
реакцию |
гликолиза — |
|||||
восстановление |
пировиноградной |
кислоты в |
молочную при |
||||||
участии |
никотинамиддинуклеотида |
(НАД). Этот фермент рас |
|||||||
пространен среди животных, |
где он содержится в виде L-формы, |
||||||||
а |
также |
среди |
некоторых |
бактерий |
(Lactobacillus, |
Clostridium |
|||
и |
др.), где содержится в виде L- или |
D-формы |
[109]. |
70