Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

книги из ГПНТБ / Титаев А.А. Эволюция органических соединений на Земле. От углерода до биополимеров

.pdf
Скачиваний:
6
Добавлен:
25.10.2023
Размер:
15.04 Mб
Скачать

для

синтеза адеиозпна

присутствие

фосфата но

обязательно

[202].

 

 

 

 

 

Дальнейшим шагом вперед было получение в примитивных

условиях

нуклеотидов

путем фосфорилировання

нуклеозпдов.

В

этом

модельном синтезе встретились

трудности: в водном рас­

творе в присутствии фосфорной - кислоты нуклеотиды не синтези­ ровались. Синтез удалось осуществить, когда взамен фосфорной кислоты был применен этилметафосфат, который обладает способ­ ностью активировать карбонильные, гпдроксильпые и аминные

группы [138, 152].

 

 

 

 

 

Растворы с концентрацией адеиозипа 10~3

моль/л

в

присут­

ствии

стехиометрических

количеств

этилметафосфата

в

запаян­

ных

пробирках из стекла

«Викор»

облучали

четырьмя

бактери­

цидными лампами (максимумом излучения 2537 А) при 40 + 2° С. По окончании облучения продукты реакции были изучены и иден­ тифицированы путем хроматографии — двухмерной на бумаге, тонкослойной и ионообменной. Было установлено образование аденозинмоиофосфата пз адеиозипа, адепозпндпфосфата из аденпловой кислоты и аденозиптрифосфата из аденозиндифосфата в при­

сутствии

этилметафосфата

во всех

случаях [138, 152].

В этом же направлении Шраммом

[71, 203] была проведена об­

ширная

работа по синтезу

нуклеозпдов, нуклеотидов и полииу-

клеотпдов с применением метаморфных эфпров — этплполпметафосфата и др. Метафосфориый эфир можно синтезировать из обыч­ ного диэтилового эфира и пятиокиси фосфора по обычным прави­ лам этер1гфикации, но в мягких условиях (при -f- 60°, при отсут­ ствии воды, в растворителе типа хлороформа).

Синтез адеиозипа из адешпта и рибозы, дезоксиаденозина из адеинпа и дезоксирибозы ведут в присутствии избытка метафосфорного эфира при рН 1,15. Конденсация завершается в течение одного часа, но затем реакция идет в обратном направлении. В реакции используется только 20—40% прибавленного в смесь сахара. В присутствии рибозы получают |3-аденозин, в присутствии дезоксирибозы — (3-дезокспадеиозин.

Метафосфориый эфир способствует также фосфорилированию

нуклеозпдов

и образованию нуклеотидов в неводиых

растворах

при избытке

реактива и нагревании смеси. Реакция завершается

в одну стадию [203]. Применение метафосфорного эфира

оказалось

эффективным и в процессе полимеризации нуклеотидов. В реакции применялись готовые препараты рибоиуклеотидов, например 2', З'-уридиловая кислота. Полученный синтетический продукт представлял собой, как пишет Шрамм, смесь компонентов различ­ ного молекулярного веса, которую можно было разделить на ко­ лонках из сефадекса или ДЭАЭ-целлюлозы. Высокомолекулярные полинуклеотиды, полученные после диализа в остатке, составили

10% исходного вещества,

имели константы седиментации от 1,4

до 2,4S, молекулярный

вес около 10 000, Такие же результаты

в основном получены и Н. К. Кочетковым [204]. Однако синтези-

4 Л. Л. Тптаев

81

ронянные препараты были в значительной степени резистентны к действию рибонуклеазы. Следовательно, фосфатные группы в син­

тетических препаратах

полинуклеотидов

образовали

связь не ме­

жду 3' и 5'-атомами

углерода,

характерную

для

естественных

нуклеотндов, а иные,

вероятно,

2', 2'

или 3',

З'-связи. Все же

Шрамму удалось показать, применяя фосфодиэстеразу змеиного яда, что в его препаратах имеются полннуклеотпды и с нормальным положением фосфатных групп. Синтезированная этим автором полиуридиловая кислота обладала кодирующей активностью по отношению к фенилалашшу в бесклеточиой системе Esherichia coli. Автор показал также, что добавление комплементарной полнадениловой кислоты в качестве матрицы приводит к ускорению реакции образования полпурндиловой кислоты в 10 раз. При этом

оказалось, что реакция резко

замедляется

к тому времени, когда

в нее вступило всего 20—30%

уридпловой

кислоты [711.

Следует заметить, что в этой реакции добавление полиуридиловой кислоты не оказало влияния на скорость полимеризации урпдиловой кислоты.

Все же, видимо, некоторые нуклеотиды могут ускорять обра­ зование комплементарных нуклеотпдных цепей, и в этом Шрамм усматривает элементарный, зачаточный матричный процесс.

Конденсация цитидиловой кислоты в полимер была легко осу­ ществлена в простых экспериментальных условиях [86J: смешивали мононуклеотид — цнтндиловую кислоту — с полифосфориой кис­ лотой и нагревали смесь при 65° в течение 1—2 час. при ограни­

чении доступа воздуха. Полученный продукт

фракционировали

на ионообменной смоле

Дауэкс-1, элюировали раствором 4 н. му­

равьиной

кислоты

в 0,5 н. муравьшшкислом

аммонии.

Выход

продукта

составил

1 %.

 

 

 

Полученный в этих

условиях искусственный

полимер

цитиди­

ловой кислоты (цитидинмоиофосфат) по спектральной характерис­ тике и гиперхромному эффекту был сходен с натуральными полинуклеотидами. Однако по результатам действия на него фосфатазы и рибонуклеазы он был охарактеризован как смесь ди- и тринуклеотидов цитидпна [86]. Таким же методом был получен полиаденилат.

Как видно из сказанного, с помощью метафосфорного эфира в модельных опытах из предшественников довольно успешно были синтезированы нуклеозиды, нуклеотиды и полинуклеотиды. Пред­ полагается, что таким способом могли синтезироваться и нуклеи­ новые кислоты. Механизм конденсации в двухкомпоиентной систе­ ме при участии метафосфорного эфира заключается в замещении фосфатом гидроксильной группы одного из двух компонентов

споследующим отщеплением активирующей группы одновременно

сотщеплением протона от второго компонента. По этой схеме, например, активированная ОН-группа рибозы реагирует с активи­

рованным азотом адеиина, в результате чего образуется адеиозин [71].

82

Слабым звеном в теории образования нуклеиновых кислот при участии метафосфорного эфира является непременное требование отсутствия воды для успешного осуществления реакций полиме­ ризации. Если в самом деле такие условия существовали на перво­ бытной Земле и на ней были области, лишенные воды, то для об­

разования

предшественников для синтеза

нуклеиновых

кислот—

пуринов,

пиримидииов,

углеводов — необходима

была вода

[192]. Трудно также сказать,

были ли

в этих сухих

областях

залежи метафосфориых

эфиров.

Согласно

теории А. И.

Опарина,

химическая эволюция протекала в «первичном бульоне», т. е. в водном растворе.

Шрамм предполагает, что свободная от воды область могла находиться внутри коацерватов А. И. Опарина пли подобных им

структур, имеющих

водонепроницаемую

мембрану [71]. В таком

случае,

вероятно,

внутри коацерватов должны были находиться

Р2 Од и

дпэтиловый

эфир, необходимые

для синтеза метафосфор­

ного эфира. Сомнительно также, мог ли существовать на первич­ ной Земле в сухих местах при 60° (температура реакции) дпэтило­

вый эфир и

Р 2 0 5 ?

Очевидно,

мнение об образовании метафосфорного эфира в

коацерватных каплях недостаточно убедительно. Коацерваты могли образоваться лишь в водной среде. Следовательно, вопрос в отношении участия метафосфорного эфира в синтезе нуклеино­ вых кислот на первичной Земле остается неясным или же на пего следует ответить отрицательно [143].

Термический синтез полинуклеотидов, осуществленный Фок­ сом и сотрудниками, заслуживает, несомненно, внимания, как со­ ответствующий реальным условиям предбиологической эры на Земле.

С о б с т в е н н ы е

и с с л е д о в а н и я .

В

наших экспе­

риментах

мы пытались

создать

такие мягкие

условия,

которые

были

бы возможно близкими к

атмосферно-почвенным

условиям

эры

биохемогенеза.

 

 

 

 

 

Синтез

проводили

в водной

среде в условиях

гетерогенного

катализа с применением белой глины в качестве адсорбента. На­

гревание реакционной смеси не превышало 100°, время

реакции

2 часа. В других случаях — при синтезе нуклеиновых

кислот и

белка — применяли температуру 37°, продолжительность опыта в этих случаях составляла 24—72 часа. Кроме белой глины обя­ зательным участником реакции были восстановители — обычно глютатион восстановленный. В некоторых случаях последний за­ меняли на гидросульфит натрия (Na2 S2 04 ), иногда пользовались водородом in statu nasceudi (цинковая пыль и НО) .

В основном в этих условиях с применением соответствующих модификаций инкубационной смеси были синтезированы нуклеи­ новые кислоты, их предшественники, белковоподобные вещества, белки с ферментными свойствами, ди- и полисахариды, высшие жирные кислоты, глицериды.

83

4*

Синтез аденина. Инкубационная смесь для синтеза адеиина содержала наряду с белой глиной 10 мг KCN, 20 мг глютатиопа восстановленного, 1 н. NH4 OH или НС1 по 0,5 мл. Опыт проводили при 70° в течение 2—20 час. в герметически закрытых пробирках. Определение продукта реакции было выполнено методом хрома­ тографии на бумаге с разделительной смесью бутаиол, уксусная ледяная кислота, вода ( 4 : 1 : 5). Экстракцию пятен, обнаружен­ ных на хроматограмме в ультрафиолете, вели в 0,01 н. НС1 в те­ чение ночи в холодильнике при 0°. Светопоглощение элюатов из­ меряли иа спектрофотометре при 260 им. Ниже даны сведения о результатах синтеза аденина из HCN при различном составе инкубационной смесп:

Состав смеси

мг

0/

 

 

Полная + НС1

0,5

5,0

То же, без глггаы

0,2

2,0

То же. без глютатиопа

0,0

0,0

Полная + NI-I.,OH

0-0,01

0-0,1

Полная -j- НС1 + Na3Sa0.i

0,0

0,0

(взамен

глютатиопа)

 

 

Образование

адеппиа можно

было наблюдать уже через 1 час

инкубации с наибольшим выходом в полной кислой смесп. В отсут­ ствие глютатпона выход был значительно снижен, как и в отсут­ ствие глины пли обоих этих ингредиентов.

Кроме пятиа аденппа с Rf 0,5 на хроматограммах присутство­ вало еще пятно с Rf 0,3, соответствующее положению свидетеля урацпла. Других оснований не было обнаружено (рпс. 8). При хроматографии продукта реакции в некоторых смесях иа хромато­ граммах выявилось пятно с красной флуоресценцией RC 0,1—0,2, относившееся, по-видимому, к производным порфирина.

Итак, в условиях нашего эксперимента возможен синтез аде­ нина из тех же исходных веществ, какие применялись другими исследователями для той же цели [190, 191, 193, 205].

Синтез нуклеотидов. В первой части этого исследования выясняли возможность образования нуклеотидов из нуклеозидов и фосфатов. Методика проведения эксперимента в основном не отличалась от вышеописанной и состояла в инкубации смеси реа­ гирующих веществ в присутствии белой глины и восстановленного глютатиопа при 37 и 80° в течение 20 н 2 час. соответственно. В ин­ кубационную смесь, содержащую 200 мг глины и 1 мл воды, до­ бавляли какой-либо из нуклеозидов — аденозин, цитидин, уридин

или гуанозин в

количестве 50—100 мкмолей, кислый фосфат —

5 ммолей и глютатион восстановленный — 5—10 ммолей на 1 мл.

После инкубации

смесь центрифугировали, фильтрат исследовали

без обработки, осадок элюировали 1 и. NH 4 OIi . Элюат сгущали теплым воздухом до известного объема. Эквивалентные порции

84

п смесях различного состава в процентах от взятого в опыт аденозпна (50—100 мкмоль):

UI

свидетелей

Rf продуктов

Выход

АМФ

 

синтеза

0,27

0,25-0,3

2

-10

АДФ

0,1В

0,15-0,2

0,1

- 5

АТФ

0,11

0,05-0,12

20-80

Представленные данные с очевидностью указывают, что в при­ мененных нами условиях совершается, и подчас весьма интенсив­ но, фосфорплпроваипе пуклеозида аденозина с образованием моно-,

дн- п трифосфатов.

Все ли ингредиенты смеси необходимы? Для

выяснения этого

были проведены эксперименты

с выключением

из инкубационной

смеси

того или иного вещества

или с заменой

его другим. Выяснялось,

что все указанные ингредиенты необхо­

димы и достаточны

для исследуемого синтеза.

 

Замена К Н 2 Р 0 4

на NaJiPOj снижала выход синтезированных

фосфатов более чем вдвое. В отсутствие глютатиоиа выход снижал­ ся до 0—5 п 10—15 % при замене глютатиоиа на гидросульфит

натрия в

эквнмолярном

соотношении.

Синтез

рибонуклеиновой

кислоты. Синтез полинуклеотидов (по-

лиурпдиловой н полнцптпдиловой кислот) уже осуществлен в абио­ генных условиях в бесфермептпой среде, имитирующей, по мнению авторов [86, 2091, предбнологические условия на Земле. Этот син­ тез был проведен в отсутствие воды с применением в качестве ка­ тализатора метафосфорпого эфира.

Нами также сделана попытка синтезировать нуклеиновые кис­ лоты в модельной системе в абиогенных условиях без применения ферментов. Наши условия отличаются от условий, избранных в цитированной выше работе ТПрамма и сотрудников, тем, что син­ тез проводится в водном растворе, в мягких условиях с примене­ нием простых и распространенных веществ, которые, без сомне­ ния, присутствовали на Земле в предбиологический период ее существования.

В качестве исходного материала для этих синтезов были исполь­ зованы гидролизаты нуклеиновых кислот. Гидролиз дрожжевой нуклеиновой кислоты (венгерской марки Реанал) был проведен в 0,3 и. NaOH (50 мл на 1 г кислоты) в течение 18 час. при 37°. Гпдролизат был нейтрализован 0,3 п. НС1.

В этих условиях щелочного гидролиза рибонуклеиновая кис­ лота распадается до рибопуклеотидов [2081.

Опытная полная инкубационная смесь содержала нейтральный гпдролизат РНК — 2,5—5 мл, АТФ — 1—10 мг, восстановленный глютатион — 1—10 мг. Ипкубация при 37° продолжалась от 2 до 48 час.

После инкубации и центрифугирования

производили смывание

с глины продукта синтеза 0,14 молярным

раствором NaCl 2—3

раза с центрифугированием. Соединенные

элюаты осаждали двой-

86

ньш объемом этанола, осадки переосаждали дважды этанолом, промывали 1—2% НСЮ4 при охлаждении для удаления пуклеотидов и подвергали длительному диализу против растворителя при 0 - | - 1 0 , после чего снова осаждали спиртом, промывали спиртом и эфиром, сушили. Часть препаратов подвергали очистке иа ко­ лонке с ДЭАЭ-сефадексом [207, 209].

Полученные препараты для выяснения однородности были подвергнуты хроматографии на бумаге последовательно в двух растворителях: бутанол, уксусная ледяная кислота, вода (4 : 1 : 5) или бутанол, этанол, ацетат аммония (4 : 1 : 2) в течение суток

и

затем в смеси метанол, бутанол, вода (80 : 5 : 15) в течение

4

час.

 

Далее, в растворах препаратов было измерено светопоглощение

при 260, 280 и 290 нм и его изменения при 60° [208, 210]. Приго­ товленные по известным прописям гидролиза™ препаратов в 0,3 и. NaOH, в 6 н. НС1, в 98%-ной муравьиной кислоте пли в хлор­ ной кислоте хроматографировали иа бумаге в указанных разде­ лительных смесях, определяли содержание оснований, вычисляли коэффициенты специфичности [206—210]. Кроме того, в препаратах определяли содержание рибозы 1148], фосфора по Фиске — Субарроу, азота по Кьельдалю и молекулярный вес [209, 211].

При вычислении содержания пурииовых и пиримндииовых оснований в препаратах были использованы известные расчетные коэффициенты [202].

Исходное количество нуклеотпдов в объеме щелочного гидролпзата РЫК, взятого для опыта, составляло 18 мг. Выход синтези­ рованного продукта, измеряемый по сухому весу очищенного продукта, совпадал с определением содержания РЫК по фосфату или рибозе.

 

Выход очищенного продукта синтеза в зависпмостп от состава

инкубационной

смеси

показан

в табл.

8.

 

 

 

 

В контрольных смесях (2, 3, 4, 5 , 6) после инкубации при осаж­

дении

спиртом

осадка

ие было

или он был незначительным, его

вес не

превышал 1 мг. Сухой

вес очищенного спиртового

осадка

 

 

 

 

Т а б л и ц а 8

 

 

 

 

Выход продукта, синтезированного

из щелочного

гидролизата

РНК (в мг)

 

 

 

 

 

 

Опыт

 

 

Состав инкубационной смеси

1-й

2-й

3-й

4-й

5-й

6-й

 

 

 

 

1.

Полная

 

8,0

2,5

7,28

8,0

8,7

10,8

2.

Без

АТФ

 

0

0

0

0

0

0

3.

Без

глютатиона

 

0,5

0,2

0,4

0

0

'0

4. Без АТФ и глютатиона

Следы

Следы

 

Следы

—.

 

 

 

5.

Без

глины

 

0

0

0

0

0

0

G.

Без гидролизата

РНК

0

0

0

87

опытной смеси в среднем составил 7,55 мг, или 42% от исходи ого количества нуклеотидов (18 мг). В одном из опытов исходный гпдролпзат РЫК содержал 0,5 г пуклеотндоп. В результате ин­ кубации было получено 225 мг очищенного продукта, в 50 мкг ко­ торого содержалось 5,2 мкг фосфора.

Выход синтезированного продукта в зпачптелыюй степени изменялся в зависимости от взятого количества основных ин­ гредиентов инкубационной смеси при одном п том же количестве гпдролизата (18 мг на сухой вес) (табл. 9).

 

 

 

 

 

 

Т а б л и ц а

9

 

 

Выход

продукта синтеза

в

зависимости

от содержания

ингредиентов

 

 

 

 

 

 

в смеси

 

 

 

Ппгредцент

 

 

 

 

Количество в пробе, мг

 

 

АТФ

 

 

1,0

 

5,0

5,0

5,0

10,0

Глготатпон

 

10,0

 

1,0

5,0

10,0

10,0

Выход, мг

 

1,3

 

1,0

8,5

12,5

7,5

 

 

 

 

 

 

Т а б л и ц а

10

 

 

Оптическая

плотность

(им) растворов

синтезированных

препаратов

 

 

 

и

концентрация в них РИК (в мкг/мл)

 

Номер препарата

Концентрация

Оно

 

 

Ds*0. 280

РЫК

 

РНК в пробе

 

 

 

1

 

 

6,0

 

0,155

0,070

2,2

 

2

 

 

13,5

 

0,325

0,195

U

 

3

 

 

17,5

 

0,433

0,235

1,9

Натпвпая

 

 

17,0

 

0,430

0,210

2,04

 

 

 

 

 

 

Т а б л и ц а

11

 

 

 

 

 

 

Содержание РНК в

препаратах

 

 

Номер

пре­

 

 

 

РНК, мг/мл

РНК, %

Сухой оста­

Фосфор, %

 

 

 

 

парата РНК

 

 

по фосфору

 

ток , мг/мл

 

 

 

 

по фосфору по рнбозе

по рибозу

1

 

9,5

3,0

3,2

100

100

3,0

2

 

 

9,5

1,50

1,48

100

100

1,5

3

 

 

7,75

3,25

2,2

81,2

55

4,0

4

 

9,75

14,10

103,05

14,5

Нативная

 

9,5

 

 

88

п осле нейтрализации и соответствующей обработки были исследо­ ваны хроматографией па бумаге в вышеуказанных растворителях. Пятна нуклеотндов (рис. 10) пли оснований, как и пятна соответ­ ствующих свидетелей, обнаруженные в ультрафиолете, вырезали, элюпровали 0,01 н. ЫС1 в течение 20 час. прпО + 1°, подвергали анализу, как указано выше.

Результаты испытаний трех препаратов представлены в табл.

12.

 

 

 

Т а б л и ц а 12

 

 

 

Содержание пуринов и пиримидинов

в синтезированных препаратах

 

 

 

(в моль

%)

 

 

 

Номер

 

 

 

 

Молярное

 

 

 

 

 

 

отношение

Г + У

Г + Ц

препарата

А

Ц

г

У

пурины/

А + Ц

А + У

РНК

 

 

 

 

ппрнмндн-

 

 

 

 

 

ны

 

 

1

23,7

11,8

34,3

30,2

1,80

1,42

0,84

2

23, В

26,2

31,4

IS,8

1,20

1,0

1,33

з

44,8

15,4

10,0

30,8

1,15

0,67

0,34

Натпваая

25,4

21,9

29,0

24,4

1,13

0,11

1,01

Из данных следует, что во всех препаратах содержались все че­ тыре, присущие РНК основания. Количественные отношения осно­ ваний в разных препаратах оказались различными. По мо­ лярному соотношению оснований синтезированные препараты

можно было

отнести к

разным типам РНК — Г +

У, Г + Ц,

А 4- Ц.

 

 

 

Молярное

отношение

пуриновых и пиримидиновых

оснований

в препаратах

№ 2 и 3 соответствовало их отношению в исходной

дрожжевой РНК, в препарате № 1 оно сильно отличалось от ис­ ходного.

По составу оснований препарат № 2 был близок к составу рас­ творимой -РНК дрожжей, печени. Другие препараты соответство­

вали

скорее составу вирусных РНК, например

вируса раковой

опухоли [189].

 

 

 

Причины этих различий многообразны. Они могут заключать­

ся

и

в неучитываемой разнице экспериментальных условий,

и

в

вариациях нуклеотидного состава исходных гидролизатов,

и

в

отсутствие

матрицы.

 

 

Полученные

препараты обладали в растворах

гиперхромным

эффектом как при нагревании до температуры «плавления» 60°, так и после щелочного гидролиза. Как известно, светопоглощение

раствора нативной

рРНК при 260 нм и при иагревании до 60°

увеличивается на

22—34%, а после щелочного гидролиза —

на 24-25% [189].

 

1 Часть измерений выполнена под руководством докт. мед. наук Р. П. Нарцисова, которому приносим здесь искреннюю благодарность.

90

Соседние файлы в папке книги из ГПНТБ