![](/user_photo/_userpic.png)
книги из ГПНТБ / Титаев А.А. Эволюция органических соединений на Земле. От углерода до биополимеров
.pdfдля |
синтеза адеиозпна |
присутствие |
фосфата но |
обязательно |
|
[202]. |
|
|
|
|
|
|
Дальнейшим шагом вперед было получение в примитивных |
||||
условиях |
нуклеотидов |
путем фосфорилировання |
нуклеозпдов. |
||
В |
этом |
модельном синтезе встретились |
трудности: в водном рас |
творе в присутствии фосфорной - кислоты нуклеотиды не синтези ровались. Синтез удалось осуществить, когда взамен фосфорной кислоты был применен этилметафосфат, который обладает способ ностью активировать карбонильные, гпдроксильпые и аминные
группы [138, 152]. |
|
|
|
|
|
|
Растворы с концентрацией адеиозипа 10~3 |
моль/л |
в |
присут |
|||
ствии |
стехиометрических |
количеств |
этилметафосфата |
в |
запаян |
|
ных |
пробирках из стекла |
«Викор» |
облучали |
четырьмя |
бактери |
цидными лампами (максимумом излучения 2537 А) при 40 + 2° С. По окончании облучения продукты реакции были изучены и иден тифицированы путем хроматографии — двухмерной на бумаге, тонкослойной и ионообменной. Было установлено образование аденозинмоиофосфата пз адеиозипа, адепозпндпфосфата из аденпловой кислоты и аденозиптрифосфата из аденозиндифосфата в при
сутствии |
этилметафосфата |
во всех |
случаях [138, 152]. |
В этом же направлении Шраммом |
[71, 203] была проведена об |
||
ширная |
работа по синтезу |
нуклеозпдов, нуклеотидов и полииу- |
клеотпдов с применением метаморфных эфпров — этплполпметафосфата и др. Метафосфориый эфир можно синтезировать из обыч ного диэтилового эфира и пятиокиси фосфора по обычным прави лам этер1гфикации, но в мягких условиях (при -f- 60°, при отсут ствии воды, в растворителе типа хлороформа).
Синтез адеиозипа из адешпта и рибозы, дезоксиаденозина из адеинпа и дезоксирибозы ведут в присутствии избытка метафосфорного эфира при рН 1,15. Конденсация завершается в течение одного часа, но затем реакция идет в обратном направлении. В реакции используется только 20—40% прибавленного в смесь сахара. В присутствии рибозы получают |3-аденозин, в присутствии дезоксирибозы — (3-дезокспадеиозин.
Метафосфориый эфир способствует также фосфорилированию
нуклеозпдов |
и образованию нуклеотидов в неводиых |
растворах |
при избытке |
реактива и нагревании смеси. Реакция завершается |
|
в одну стадию [203]. Применение метафосфорного эфира |
оказалось |
эффективным и в процессе полимеризации нуклеотидов. В реакции применялись готовые препараты рибоиуклеотидов, например 2', З'-уридиловая кислота. Полученный синтетический продукт представлял собой, как пишет Шрамм, смесь компонентов различ ного молекулярного веса, которую можно было разделить на ко лонках из сефадекса или ДЭАЭ-целлюлозы. Высокомолекулярные полинуклеотиды, полученные после диализа в остатке, составили
10% исходного вещества, |
имели константы седиментации от 1,4 |
до 2,4S, молекулярный |
вес около 10 000, Такие же результаты |
в основном получены и Н. К. Кочетковым [204]. Однако синтези-
4 Л. Л. Тптаев |
81 |
ронянные препараты были в значительной степени резистентны к действию рибонуклеазы. Следовательно, фосфатные группы в син
тетических препаратах |
полинуклеотидов |
образовали |
связь не ме |
||
жду 3' и 5'-атомами |
углерода, |
характерную |
для |
естественных |
|
нуклеотндов, а иные, |
вероятно, |
2', 2' |
или 3', |
З'-связи. Все же |
Шрамму удалось показать, применяя фосфодиэстеразу змеиного яда, что в его препаратах имеются полннуклеотпды и с нормальным положением фосфатных групп. Синтезированная этим автором полиуридиловая кислота обладала кодирующей активностью по отношению к фенилалашшу в бесклеточиой системе Esherichia coli. Автор показал также, что добавление комплементарной полнадениловой кислоты в качестве матрицы приводит к ускорению реакции образования полпурндиловой кислоты в 10 раз. При этом
оказалось, что реакция резко |
замедляется |
к тому времени, когда |
в нее вступило всего 20—30% |
уридпловой |
кислоты [711. |
Следует заметить, что в этой реакции добавление полиуридиловой кислоты не оказало влияния на скорость полимеризации урпдиловой кислоты.
Все же, видимо, некоторые нуклеотиды могут ускорять обра зование комплементарных нуклеотпдных цепей, и в этом Шрамм усматривает элементарный, зачаточный матричный процесс.
Конденсация цитидиловой кислоты в полимер была легко осу ществлена в простых экспериментальных условиях [86J: смешивали мононуклеотид — цнтндиловую кислоту — с полифосфориой кис лотой и нагревали смесь при 65° в течение 1—2 час. при ограни
чении доступа воздуха. Полученный продукт |
фракционировали |
||||
на ионообменной смоле |
Дауэкс-1, элюировали раствором 4 н. му |
||||
равьиной |
кислоты |
в 0,5 н. муравьшшкислом |
аммонии. |
Выход |
|
продукта |
составил |
1 %. |
|
|
|
Полученный в этих |
условиях искусственный |
полимер |
цитиди |
ловой кислоты (цитидинмоиофосфат) по спектральной характерис тике и гиперхромному эффекту был сходен с натуральными полинуклеотидами. Однако по результатам действия на него фосфатазы и рибонуклеазы он был охарактеризован как смесь ди- и тринуклеотидов цитидпна [86]. Таким же методом был получен полиаденилат.
Как видно из сказанного, с помощью метафосфорного эфира в модельных опытах из предшественников довольно успешно были синтезированы нуклеозиды, нуклеотиды и полинуклеотиды. Пред полагается, что таким способом могли синтезироваться и нуклеи новые кислоты. Механизм конденсации в двухкомпоиентной систе ме при участии метафосфорного эфира заключается в замещении фосфатом гидроксильной группы одного из двух компонентов
споследующим отщеплением активирующей группы одновременно
сотщеплением протона от второго компонента. По этой схеме, например, активированная ОН-группа рибозы реагирует с активи
рованным азотом адеиина, в результате чего образуется адеиозин [71].
82
Слабым звеном в теории образования нуклеиновых кислот при участии метафосфорного эфира является непременное требование отсутствия воды для успешного осуществления реакций полиме ризации. Если в самом деле такие условия существовали на перво бытной Земле и на ней были области, лишенные воды, то для об
разования |
предшественников для синтеза |
нуклеиновых |
кислот— |
|||
пуринов, |
пиримидииов, |
углеводов — необходима |
была вода |
|||
[192]. Трудно также сказать, |
были ли |
в этих сухих |
областях |
|||
залежи метафосфориых |
эфиров. |
Согласно |
теории А. И. |
Опарина, |
химическая эволюция протекала в «первичном бульоне», т. е. в водном растворе.
Шрамм предполагает, что свободная от воды область могла находиться внутри коацерватов А. И. Опарина пли подобных им
структур, имеющих |
водонепроницаемую |
мембрану [71]. В таком |
|
случае, |
вероятно, |
внутри коацерватов должны были находиться |
|
Р2 Од и |
дпэтиловый |
эфир, необходимые |
для синтеза метафосфор |
ного эфира. Сомнительно также, мог ли существовать на первич ной Земле в сухих местах при 60° (температура реакции) дпэтило
вый эфир и |
Р 2 0 5 ? |
Очевидно, |
мнение об образовании метафосфорного эфира в |
коацерватных каплях недостаточно убедительно. Коацерваты могли образоваться лишь в водной среде. Следовательно, вопрос в отношении участия метафосфорного эфира в синтезе нуклеино вых кислот на первичной Земле остается неясным или же на пего следует ответить отрицательно [143].
Термический синтез полинуклеотидов, осуществленный Фок сом и сотрудниками, заслуживает, несомненно, внимания, как со ответствующий реальным условиям предбиологической эры на Земле.
С о б с т в е н н ы е |
и с с л е д о в а н и я . |
В |
наших экспе |
||||
риментах |
мы пытались |
создать |
такие мягкие |
условия, |
которые |
||
были |
бы возможно близкими к |
атмосферно-почвенным |
условиям |
||||
эры |
биохемогенеза. |
|
|
|
|
|
|
Синтез |
проводили |
в водной |
среде в условиях |
гетерогенного |
катализа с применением белой глины в качестве адсорбента. На
гревание реакционной смеси не превышало 100°, время |
реакции |
2 часа. В других случаях — при синтезе нуклеиновых |
кислот и |
белка — применяли температуру 37°, продолжительность опыта в этих случаях составляла 24—72 часа. Кроме белой глины обя зательным участником реакции были восстановители — обычно глютатион восстановленный. В некоторых случаях последний за меняли на гидросульфит натрия (Na2 S2 04 ), иногда пользовались водородом in statu nasceudi (цинковая пыль и НО) .
В основном в этих условиях с применением соответствующих модификаций инкубационной смеси были синтезированы нуклеи новые кислоты, их предшественники, белковоподобные вещества, белки с ферментными свойствами, ди- и полисахариды, высшие жирные кислоты, глицериды.
83 |
4* |
Синтез аденина. Инкубационная смесь для синтеза адеиина содержала наряду с белой глиной 10 мг KCN, 20 мг глютатиопа восстановленного, 1 н. NH4 OH или НС1 по 0,5 мл. Опыт проводили при 70° в течение 2—20 час. в герметически закрытых пробирках. Определение продукта реакции было выполнено методом хрома тографии на бумаге с разделительной смесью бутаиол, уксусная ледяная кислота, вода ( 4 : 1 : 5). Экстракцию пятен, обнаружен ных на хроматограмме в ультрафиолете, вели в 0,01 н. НС1 в те чение ночи в холодильнике при 0°. Светопоглощение элюатов из меряли иа спектрофотометре при 260 им. Ниже даны сведения о результатах синтеза аденина из HCN при различном составе инкубационной смесп:
Состав смеси |
мг |
0/ |
|
|
Полная + НС1 |
0,5 |
,О |
|
5,0 |
|||
То же, без глггаы |
0,2 |
2,0 |
|
То же. без глютатиопа |
0,0 |
0,0 |
|
Полная + NI-I.,OH |
0-0,01 |
0-0,1 |
|
Полная -j- НС1 + Na3Sa0.i |
0,0 |
0,0 |
|
(взамен |
глютатиопа) |
|
|
Образование |
адеппиа можно |
было наблюдать уже через 1 час |
инкубации с наибольшим выходом в полной кислой смесп. В отсут ствие глютатпона выход был значительно снижен, как и в отсут ствие глины пли обоих этих ингредиентов.
Кроме пятиа аденппа с Rf 0,5 на хроматограммах присутство вало еще пятно с Rf 0,3, соответствующее положению свидетеля урацпла. Других оснований не было обнаружено (рпс. 8). При хроматографии продукта реакции в некоторых смесях иа хромато граммах выявилось пятно с красной флуоресценцией RC 0,1—0,2, относившееся, по-видимому, к производным порфирина.
Итак, в условиях нашего эксперимента возможен синтез аде нина из тех же исходных веществ, какие применялись другими исследователями для той же цели [190, 191, 193, 205].
Синтез нуклеотидов. В первой части этого исследования выясняли возможность образования нуклеотидов из нуклеозидов и фосфатов. Методика проведения эксперимента в основном не отличалась от вышеописанной и состояла в инкубации смеси реа гирующих веществ в присутствии белой глины и восстановленного глютатиопа при 37 и 80° в течение 20 н 2 час. соответственно. В ин кубационную смесь, содержащую 200 мг глины и 1 мл воды, до бавляли какой-либо из нуклеозидов — аденозин, цитидин, уридин
или гуанозин в |
количестве 50—100 мкмолей, кислый фосфат — |
5 ммолей и глютатион восстановленный — 5—10 ммолей на 1 мл. |
|
После инкубации |
смесь центрифугировали, фильтрат исследовали |
без обработки, осадок элюировали 1 и. NH 4 OIi . Элюат сгущали теплым воздухом до известного объема. Эквивалентные порции
84
![](/html/65386/283/html_YB3CQnYhbe.hWcZ/htmlconvd-aaTI7185x1.jpg)
п смесях различного состава в процентах от взятого в опыт аденозпна (50—100 мкмоль):
UI |
свидетелей |
Rf продуктов |
Выход |
|
АМФ |
|
синтеза |
||
0,27 |
0,25-0,3 |
2 |
-10 |
|
АДФ |
0,1В |
0,15-0,2 |
0,1 |
- 5 |
АТФ |
0,11 |
0,05-0,12 |
20-80 |
Представленные данные с очевидностью указывают, что в при мененных нами условиях совершается, и подчас весьма интенсив но, фосфорплпроваипе пуклеозида аденозина с образованием моно-,
дн- п трифосфатов. |
Все ли ингредиенты смеси необходимы? Для |
|||
выяснения этого |
были проведены эксперименты |
с выключением |
||
из инкубационной |
смеси |
того или иного вещества |
или с заменой |
|
его другим. Выяснялось, |
что все указанные ингредиенты необхо |
|||
димы и достаточны |
для исследуемого синтеза. |
|
||
Замена К Н 2 Р 0 4 |
на NaJiPOj снижала выход синтезированных |
фосфатов более чем вдвое. В отсутствие глютатиоиа выход снижал ся до 0—5 п 10—15 % при замене глютатиоиа на гидросульфит
натрия в |
эквнмолярном |
соотношении. |
Синтез |
рибонуклеиновой |
кислоты. Синтез полинуклеотидов (по- |
лиурпдиловой н полнцптпдиловой кислот) уже осуществлен в абио генных условиях в бесфермептпой среде, имитирующей, по мнению авторов [86, 2091, предбнологические условия на Земле. Этот син тез был проведен в отсутствие воды с применением в качестве ка тализатора метафосфорпого эфира.
Нами также сделана попытка синтезировать нуклеиновые кис лоты в модельной системе в абиогенных условиях без применения ферментов. Наши условия отличаются от условий, избранных в цитированной выше работе ТПрамма и сотрудников, тем, что син тез проводится в водном растворе, в мягких условиях с примене нием простых и распространенных веществ, которые, без сомне ния, присутствовали на Земле в предбиологический период ее существования.
В качестве исходного материала для этих синтезов были исполь зованы гидролизаты нуклеиновых кислот. Гидролиз дрожжевой нуклеиновой кислоты (венгерской марки Реанал) был проведен в 0,3 и. NaOH (50 мл на 1 г кислоты) в течение 18 час. при 37°. Гпдролизат был нейтрализован 0,3 п. НС1.
В этих условиях щелочного гидролиза рибонуклеиновая кис лота распадается до рибопуклеотидов [2081.
Опытная полная инкубационная смесь содержала нейтральный гпдролизат РНК — 2,5—5 мл, АТФ — 1—10 мг, восстановленный глютатион — 1—10 мг. Ипкубация при 37° продолжалась от 2 до 48 час.
После инкубации и центрифугирования |
производили смывание |
с глины продукта синтеза 0,14 молярным |
раствором NaCl 2—3 |
раза с центрифугированием. Соединенные |
элюаты осаждали двой- |
86
ньш объемом этанола, осадки переосаждали дважды этанолом, промывали 1—2% НСЮ4 при охлаждении для удаления пуклеотидов и подвергали длительному диализу против растворителя при 0 - | - 1 0 , после чего снова осаждали спиртом, промывали спиртом и эфиром, сушили. Часть препаратов подвергали очистке иа ко лонке с ДЭАЭ-сефадексом [207, 209].
Полученные препараты для выяснения однородности были подвергнуты хроматографии на бумаге последовательно в двух растворителях: бутанол, уксусная ледяная кислота, вода (4 : 1 : 5) или бутанол, этанол, ацетат аммония (4 : 1 : 2) в течение суток
и |
затем в смеси метанол, бутанол, вода (80 : 5 : 15) в течение |
4 |
час. |
|
Далее, в растворах препаратов было измерено светопоглощение |
при 260, 280 и 290 нм и его изменения при 60° [208, 210]. Приго товленные по известным прописям гидролиза™ препаратов в 0,3 и. NaOH, в 6 н. НС1, в 98%-ной муравьиной кислоте пли в хлор ной кислоте хроматографировали иа бумаге в указанных разде лительных смесях, определяли содержание оснований, вычисляли коэффициенты специфичности [206—210]. Кроме того, в препаратах определяли содержание рибозы 1148], фосфора по Фиске — Субарроу, азота по Кьельдалю и молекулярный вес [209, 211].
При вычислении содержания пурииовых и пиримндииовых оснований в препаратах были использованы известные расчетные коэффициенты [202].
Исходное количество нуклеотпдов в объеме щелочного гидролпзата РЫК, взятого для опыта, составляло 18 мг. Выход синтези рованного продукта, измеряемый по сухому весу очищенного продукта, совпадал с определением содержания РЫК по фосфату или рибозе.
|
Выход очищенного продукта синтеза в зависпмостп от состава |
||||||||
инкубационной |
смеси |
показан |
в табл. |
8. |
|
|
|
||
|
В контрольных смесях (2, 3, 4, 5 , 6) после инкубации при осаж |
||||||||
дении |
спиртом |
осадка |
ие было |
или он был незначительным, его |
|||||
вес не |
превышал 1 мг. Сухой |
вес очищенного спиртового |
осадка |
||||||
|
|
|
|
Т а б л и ц а 8 |
|
|
|
|
|
Выход продукта, синтезированного |
из щелочного |
гидролизата |
РНК (в мг) |
||||||
|
|
|
|
|
|
Опыт |
|
|
|
Состав инкубационной смеси |
1-й |
2-й |
3-й |
4-й |
5-й |
6-й |
|||
|
|
|
|
||||||
1. |
Полная |
|
8,0 |
2,5 |
7,28 |
8,0 |
8,7 |
10,8 |
|
2. |
Без |
АТФ |
|
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
3. |
Без |
глютатиона |
|
0,5 |
0,2 |
0,4 |
0 |
0 |
'0 |
4. Без АТФ и глютатиона |
Следы |
Следы |
|
Следы |
—. |
— |
|||
|
|
|
|||||||
5. |
Без |
глины |
|
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
G. |
Без гидролизата |
РНК |
0 |
0 |
0 |
— |
— |
— |
87
опытной смеси в среднем составил 7,55 мг, или 42% от исходи ого количества нуклеотидов (18 мг). В одном из опытов исходный гпдролпзат РЫК содержал 0,5 г пуклеотндоп. В результате ин кубации было получено 225 мг очищенного продукта, в 50 мкг ко торого содержалось 5,2 мкг фосфора.
Выход синтезированного продукта в зпачптелыюй степени изменялся в зависимости от взятого количества основных ин гредиентов инкубационной смеси при одном п том же количестве гпдролизата (18 мг на сухой вес) (табл. 9).
|
|
|
|
|
|
Т а б л и ц а |
9 |
|
|
Выход |
продукта синтеза |
в |
зависимости |
от содержания |
ингредиентов |
||||
|
|
|
|
|
|
в смеси |
|
|
|
Ппгредцент |
|
|
|
|
Количество в пробе, мг |
|
|
||
АТФ |
|
|
1,0 |
|
5,0 |
5,0 |
5,0 |
10,0 |
|
Глготатпон |
|
10,0 |
|
1,0 |
5,0 |
10,0 |
10,0 |
||
Выход, мг |
|
1,3 |
|
1,0 |
8,5 |
12,5 |
7,5 |
||
|
|
|
|
|
|
Т а б л и ц а |
10 |
|
|
Оптическая |
плотность |
(им) растворов |
синтезированных |
препаратов |
|||||
|
|
|
и |
концентрация в них РИК (в мкг/мл) |
|
||||
Номер препарата |
Концентрация |
Оно |
|
|
Ds*0. 280 |
||||
РЫК |
|
РНК в пробе |
|
|
|||||
|
1 |
|
|
6,0 |
|
0,155 |
0,070 |
2,2 |
|
|
2 |
|
|
13,5 |
|
0,325 |
0,195 |
U |
|
|
3 |
|
|
17,5 |
|
0,433 |
0,235 |
1,9 |
|
Натпвпая |
|
|
17,0 |
|
0,430 |
0,210 |
2,04 |
||
|
|
|
|
|
|
Т а б л и ц а |
11 |
|
|
|
|
|
|
Содержание РНК в |
препаратах |
|
|
||
Номер |
пре |
|
|
|
РНК, мг/мл |
РНК, % |
Сухой оста |
||
Фосфор, % |
|
|
|
|
|||||
парата РНК |
|
|
по фосфору |
|
ток , мг/мл |
||||
|
|
|
|
по фосфору по рнбозе |
по рибозу |
||||
1 |
|
9,5 |
3,0 |
3,2 |
100 |
100 |
3,0 |
||
2 |
|
|
9,5 |
1,50 |
1,48 |
100 |
100 |
1,5 |
|
3 |
|
|
7,75 |
3,25 |
2,2 |
81,2 |
55 |
4,0 |
|
4 |
|
9,75 |
14,10 |
— |
103,05 |
— |
14,5 |
||
Нативная |
|
9,5 |
|
— |
— |
|
— |
— |
88
![](/html/65386/283/html_YB3CQnYhbe.hWcZ/htmlconvd-aaTI7189x1.jpg)
п осле нейтрализации и соответствующей обработки были исследо ваны хроматографией па бумаге в вышеуказанных растворителях. Пятна нуклеотндов (рис. 10) пли оснований, как и пятна соответ ствующих свидетелей, обнаруженные в ультрафиолете, вырезали, элюпровали 0,01 н. ЫС1 в течение 20 час. прпО + 1°, подвергали анализу, как указано выше.
Результаты испытаний трех препаратов представлены в табл.
12.
|
|
|
Т а б л и ц а 12 |
|
|
|
||
Содержание пуринов и пиримидинов |
в синтезированных препаратах |
|||||||
|
|
|
(в моль |
%) |
|
|
|
|
Номер |
|
|
|
|
Молярное |
|
|
|
|
|
|
|
отношение |
Г + У |
Г + Ц |
||
препарата |
А |
Ц |
г |
У |
пурины/ |
|||
А + Ц |
А + У |
|||||||
РНК |
|
|
|
|
ппрнмндн- |
|||
|
|
|
|
|
ны |
|
|
|
1 |
23,7 |
11,8 |
34,3 |
30,2 |
1,80 |
1,42 |
0,84 |
|
2 |
23, В |
26,2 |
31,4 |
IS,8 |
1,20 |
1,0 |
1,33 |
|
з |
44,8 |
15,4 |
10,0 |
30,8 |
1,15 |
0,67 |
0,34 |
|
Натпваая |
25,4 |
21,9 |
29,0 |
24,4 |
1,13 |
0,11 |
1,01 |
Из данных следует, что во всех препаратах содержались все че тыре, присущие РНК основания. Количественные отношения осно ваний в разных препаратах оказались различными. По мо лярному соотношению оснований синтезированные препараты
можно было |
отнести к |
разным типам РНК — Г + |
У, Г + Ц, |
А 4- Ц. |
|
|
|
Молярное |
отношение |
пуриновых и пиримидиновых |
оснований |
в препаратах |
№ 2 и 3 соответствовало их отношению в исходной |
дрожжевой РНК, в препарате № 1 оно сильно отличалось от ис ходного.
По составу оснований препарат № 2 был близок к составу рас творимой -РНК дрожжей, печени. Другие препараты соответство
вали |
скорее составу вирусных РНК, например |
вируса раковой |
||
опухоли [189]. |
|
|
||
|
Причины этих различий многообразны. Они могут заключать |
|||
ся |
и |
в неучитываемой разнице экспериментальных условий, |
||
и |
в |
вариациях нуклеотидного состава исходных гидролизатов, |
||
и |
в |
отсутствие |
матрицы. |
|
|
Полученные |
препараты обладали в растворах |
гиперхромным |
эффектом как при нагревании до температуры «плавления» — 60°, так и после щелочного гидролиза. Как известно, светопоглощение
раствора нативной |
рРНК при 260 нм и при иагревании до 60° |
увеличивается на |
22—34%, а после щелочного гидролиза — |
на 24-25% [189]. |
|
1 Часть измерений выполнена под руководством докт. мед. наук Р. П. Нарцисова, которому приносим здесь искреннюю благодарность.
90