Биохимия пособие Коновалова 2012
.pdfТ.е. по этой модели гомотропное взаимодействие может быть пожительиым и отрицательным.
Л дллостерическая регуляция может приводить к активации или ин гибированию фермента.
На базе симметричной модели: если эффектор сдвигает конформадионное равновесие R <=> Т в сторону R, то субстрат будет иметь уве личенное сродство к ферменту —положительный кооперативный эф фект. Следовательно, эффектор - активатор. Если эффектор сдвинул равновесие в сторону конформации Т, имеет место уменьшение сродст ва к ферменту - отрицательный кооперативный эффект; т.е. эффектор - ингибитор.
5. Регуляция по типу обратной связи. Характерна для последова тельных реакций, при этом каждая реакция катализируется своим фер ментом. Различают ретроингибирование и форактивацию:
а) Ретроингибирование —ингибирование по типу отрицательной об ратной связи.
|
(-) |
|
|
E ji |
е 2 |
Е3 Е„ |
1 |
А —► В |
-+ С |
—► |
Z |
| |
(+) |
! |
|
|
|
Конечный продукт Z обычно не влияет на активность промежу точных ферментов системы, а ингибирует ее первый фермент Ei. Этим обеспечивается целенаправленность регуляции, т.к. цель системы со стоит в образовании именно конечного продукта, а не промежуточных соединений.
б) Форактивация — активация предшественником. Накопление субстрата А стимулирует его распад до продукта Z через активацию фермента более поздних стадий превращения.
4. Медицинская энзимология
Включает энзимодиагностику, энзимопатологию, энзимотерапию. Энзимодиагностика —исследование ферментов в биологических средах организма с диагностической целью. Условно выделяют 4 груп
пы ферментов:
1. Ферменты, широко представленные в различных органах и тканях. Это ферменты основных метаболических процессов, без кото рых жизнь клетки невозможна (обмен белков, жиров, углеводов). При повреждении мембран клеток эти ферменты появляются в крови. Опре деление повышенного количества этих ферментов в крови не позволяет локализовать патологический процесс.
61
2.Органоспецифические ферменты преимущественно локализо ваны в определенных органах. Эти ферменты катализируют обычно ре акции, обеспечивающие специфическую функцию данного органа. В клетках других органов этих ферментов нет или очень мало. Выход ор ганоспецифических ферментов в кровь сигнализирует о поражении оп ределенного органа, т.е. позволяет диагностировать место поражения. Например, АлАТ —появляется в крови преимущественно при пораже ниях печени, АсАТ - сердца.
3.Изоферменты.
4.Ферменты, локализованные в органеллах клеток (окисли тельно-восстановительные в митохондриях, кислые гидролазы в лизосомах и др.). Выходя в кровь, сигнализируют о глубоком поражении клетки.
Изоферменты - это молекулярные формы фермента, которые ка тализируют одну и ту же реакцию, но различаются по некоторым свой ствам: аминокислотной последовательности, молекулярной массе, ами нокислотному составу, субстратной специфичности, элетрофоретической подвижности и др.
Изоферменты являются продуктами экспрессии разных генов: ге ны могут быть в разных хромосомах (например, для амилазы слюны и амилазы панкреатической) или в одной хромосоме (например, для ци топлазматической и митохондриальной малатдегидрогеназы).
Существуют различия в распределении изоферментов в разных тканях, в разных внутриклеточных компартментах, что отражает разли чия в метаболизме, например, изоферменты могут иметь разное сродст во к субстрату (глюкокиназа печени имеет более низкое сродство к глюкозе, чем гексокиназа - изофермент, ускоряющий фофорилйрование глюкозы в других тканях).
Один из основных механизмов образования изоферментов вклю чает объединение разных субъединиц в разной комбинации при образо вании активного олигомерного фермента
Пример. Креатинкиназа (КК) катализирует обратимую реакцию образования и распада креагинфосфата —вещества, которое участвует в запасании энергии.
КК
Креатин + АТФ «-+ Креатинфосфат + АДФ
Фермент креатинкиназа (КК) является димером, состоящим из 2 субъединиц. Субъединицы В (мозговая) и М (мышечная) закодированы в разных генах.
Фермент КК представлен 3 изоферментами, которые различаются по электрофоретической подвижности:
— ВВ (КК-1) —мозговой, максимальное продвижение к аноду.
62
|
JY03 (KK-2) —сердечный, средняя подвижность. |
|
" |
(КК-З) —мышечный, самый медленный. |
|
|
Изоформы креатинкиназы. |
|
|
Набор изоформ КК в разных тканях неодинаков: |
|
|
КК-1 присутствует в значительных количествах в мозге, простате, |
|
елудке, легких, плаценте, щитовидной железе. |
||
ж J |
кк-2 находится в основном в сердечной мышце (25-46% от об |
|
щей активности фермента), в скелетной мышце (5%). |
||
__ |
КК-З присутствует в основном в клетках скелетных и сердечной |
|
мыши- |
|
|
|
Примеры органоспецифических ферментов |
|
|
|
(изоферментов) |
|
Фермент |
Орган, при повреждении которого |
|
содержание фермента в крови |
|
|
(изофермент) |
|
|
увеличивается |
|
|
ЛДГ1,2 |
|
|
Миокард |
|
|
ЛДГЗ |
Легкие |
|
ЛДГ4.5 |
Печень, мышцы |
|
Амилаза |
Поджелудочная железа |
|
АлАТ |
Печень |
|
АсАТ |
Миокард |
|
Кислая фосфатаза |
Простата |
|
Щелочная фосфатаза |
Кости |
Q Энзимопатология
J
Наследственные энзимопатии - заболевания, связанные с на следственными дефектами ферментов. Изменения при этом могут быть двух типов:
1) Связанные с образованием избытка субстрата реакции или его предшественников. Например, накопление и выделение галактозы при
дефекте фермента, превращающего галактозу в фруктозу - галактоземия.
2) Связанные с недостаточностью образования продуктов изменен ной химической реакции. Этот тип сопровождается клиническими про явлениями. В этой фазе обычно уже бывает поздно применять дейст венные терапевтические меры.
Энзимотерапия
- это использование ферментов и регуляторов их активности в ка честве лекарственных средств.
63
Препарат |
Характеристика |
Показания к |
Цель применения |
|
|
применению |
|
Пепсин |
Протеолитический |
Недостаточность желу |
Заместительная тера |
|
фермент желудка |
дочного пищеварения |
пия |
|
|
(гипоацидные гастриты и |
|
Трипсин |
Протеолитический |
др.) |
|
а) Гнойные раны |
Расщепление некроти |
||
|
фермент поджелу |
б) Воспалительные забо |
зированных тканей и |
|
дочной железы |
левания верхних дыха |
сгустков крови |
Трасилол |
Ингибитор ряда |
тельных путей |
|
Панкреатиты |
Предупреждение само- |
||
|
протеолитических |
|
переваривания подже |
|
ферментов (трип |
|
лудочной железы трип |
|
сина, химотрип- |
|
сином, который при |
|
сина и др.) |
|
панкреатитах активи |
|
|
|
руется уже в протоках |
Фибринолизин |
Протеиназа, раз |
Тромбоз сосудов |
железы |
Рассасывание уже об |
|||
|
рушающая фиб |
|
разовавшихся тромбов |
|
рин |
|
|
Ипразид |
Ингибитор моно- |
Депрессивные состояния |
Накопление в мозгу ка |
|
аминооксидазы |
|
техоламинов, усиление |
|
(МАО), инактиви |
|
процессов возбуждения |
|
рующей катехо |
|
|
|
ламин |
|
|
Гиапуронидаза |
Гликозидаза, раз |
Рубцы после ожогов и |
Разрушение избыточ |
(лидаза) |
рушающая гиалу- |
операций, спайки и др. |
ной соединительной |
|
роновую кислоту |
|
ткани |
Пенициллин, |
Ингибиторы фер |
Различные бактериальные |
Бактериостатическое и |
циклосерин |
ментов синтеза |
инфекции |
бактерицидное дейст |
|
компонентов кле |
|
вие |
|
точной оболочки у |
|
|
|
бактерий |
|
|
Иммобилизованные ферменты — это ферменты, связанные с твердым носителем или спрятанные в полимерную капсулу. Чаще ис пользуют капсулу из липидов —липосомы —они легко проходят через мембрану и оказывают действие внутри клетки.
Иммобилизованные ферменты часто используются в технологиче ских процессах. Преимущества иммобилизованных ферментов:
1.Легко отделяются от реакционной среды, можно использовать повторно, продукт не загрязнен ферментом.
2.Ферментативный процесс можно вести непрерывно.
3.Повышается стабильность фермента, инактивация фермента за медляется в сотни, тысячи и даже млн. раз.
64
Исдользованне ферментов в качестве аналитических реагентов
^Тупксидаза Определение концентрации глюкозы в крови
Определение концентрации холестерина в крови
'Хояестерол'
ОксЩЙЗ—
|
Определение концентрации триацил-глицеринов в крови |
jrgeaajL- |
Определение концентрации мочевины в крови |
|
Лекция 5
БИОЛОГИЧЕСКИЕ МЕМБРАНЫ. ТРАНСМЕМБРАННЫЙ ТРАНСПОРТ
Общая характеристика и функции мембран
Термин «мембрана» используется вот уже более 100 лет для обо значения клеточной границы, служащей, с одной стороны, барьером между содержимым клетки и внешней средой, а с другой —полупрони цаемой перегородкой, через которую могут проходить вода и некоторые из растворенных в ней веществ. Тем самым, мембрана играет активную роль в поддержании жизнедеятельности клетки, обеспечивая внутри нее необходимый «микроклимат».
Мембраны —важная составная часть и клеточных компонентов — ядра, митохондрий, лизосом, хлоропластов и т. п. Таким образом, клет ка весьма насыщена разнообразными мембранными структурами, обра зующими в сущности разветвленную, четко организованную сеть. От сюда понятна ключевая роль мембран в жизни клетки, которая по мере развития биологических наук становится все более очевидной.
^ и о ^ оги'^кие.мембршш —это сложные, высокоорганизованные надмолекулярные динамичные структуры, построенные главным обра зом из липидов и белков. Весовое соотношение между ними колеблется от 1:4 во внутренней мембране митохондрий до 4:1 в миелине нервных волокон. Кроме того, в состав мембран в заметных количествах входят углеводы и вода. Количество связанной (неспособной растворять вно симые вещества) воды может достигать 30 % общего веса мембраны.
Химический состав некоторых мембран (G.Zubay, Third Edition.)
Мембрана |
% общего сухого веса мембраны |
|||
Белки |
Липиды |
Углеводы |
||
Миелин |
||||
18 |
79 |
3 |
||
Плазматическая (эритроциты) |
49 |
43 |
8 |
65
Мембраны не являются пассивными полупроницаемыми оболоц. ками. Они принимают прямое и очень важное участие в жизнедеятель, ности клетки, определяя особенности ее функционирования.
Функции мембран:
1.Наиболее очевидной является отделение клетки как целого от окружающей спелы (плазматическая мембрша). С другой с ^ роны, внутриклеточные мембраны ограничивают органеллы и формируют обособленные отсеки - компартменты. Наличие последних обеспечивает функциональную специализацию клетки, тонкую регуляцию процессов, протекающих в ней.
2.Мембраны осуществляют высокоизбирательньгй транспорт ве ществ. Перемещение многих соединений происходит против градиента концентрации, то есть совершается осмотическая работа. Наличие транспортных систем регулирует молекулярный и ионный состав внутриклеточной среды.
3.В мембранах локализованы основные^биоэнергетические про цессы - окислительное фосфорилирование (внутренняя мем брана митохондрий) и фотосинтез (мембрана тилакоидов хлоропластов растений) - обеспечивающие клетки энергией.
4.Мембраны играют центральную роль в системе межклеточных взаимоотношений, участвуют в восприятии и преобразовании поступающих внешних сигналов. Результатом чего могут быть такие ответы как деление клетки, ее направленное движение (хемотаксис бактерий, лейкоцитов), восприятие света, измене ние направления протекания биохимических процессов в клет ке в ответ на действие гормона и т. д. В свою очередь некото рые мембраны сами способны генерировать сигнал —химиче ский или электрический.
Липиды мембран
Основу всех мембран клетки составляет липидный матрикс в виде бимолекулярного слоя. В его образовании участвуют молекулы липидов трех основных классов: фосфолипиды, гликолипиды и стероиды. К
числу минорных липидных компонентов мембран, которые, тем не ме нее, выполняют важные биологические функции, относятся токоферолы (витамин Е), ретиналь (витамин А), убихинон (кофермент Q) и ряд дрУ' гих жирорастворимых соединений.
Мембраны различного происхождения сильно отличаются друг от друга по содержанию в них липидов разного типа.
6 6
Липидный состав некоторых мембран (Д.Мецлер, 1980)
|
% общего сухого веса мембраны |
|||
Соединение |
Миелин |
Плазматическая |
мембраны |
|
|
|
мембрана |
митохондрий |
|
|
|
(эритроцит) |
||
•урпйпл (общее количество) |
78 |
|
||
40 |
24 |
|||
Ж ^мшдилхолин |
7,5 |
6,9 |
8,8 |
|
■ЗС^^нлилэтаноламин |
11,7 |
6,5 |
8,4 |
|
-^^фятидилсерин |
7,1 |
3,1 |
- |
|
■аКсЛагадияинозиг |
0,6 |
0,3 |
0,75 |
|
Т^фяягомиелин |
6,4 |
6,5 |
- |
|
ГярпИОЛИПИН |
- |
- |
4,3 |
|
Фосфолипиды |
33 |
24 |
22,5 |
|
Собшее количество) |
||||
|
|
|
||
Фосфолипиды |
42 |
* 60 |
94 |
|
общего количества липидов) |
||||
|
|
|
||
Гликолипиды |
22 |
Следы |
Следы |
|
Холестерин |
17 |
9,2 |
0,24 |
Фосфолипиды практически во всех мембранах составляют ос новную часть липидной фракции (от 40 до 90% общего количества ли пидов). Мембранные фосфолипиды делятся на глщ ерофосфолипиды (производные фосфатидной кислоты) и сфингофдсфолипиды (прои> водные церамида). Из первой группы в мембранах доминируют фосфатидилхолин и фосфатидшэтаноламин, в меньших количествах содер жатся фосфатидилсерин и фосфатидилинозит.
Р 3
R f-C -O -C H ,
Я21
Ri-C -O -CH 0
1' II
Ч М а-О -р -О"
о
Фосфатидная кислота
О
и
игс6о ш 2 // 1
% С О С Н
я
v
1^-С -О -р 0
C ^ - O -P O C H 2- CH -NH3
о |
1 |
u |
схю |
Фосфатидилсерин |
|
о
I и +
СН2О Р - 0 - С Н 2 CHr NH3 6"
Фосфатидилэтаноламин
67
т, р
I^ - C O C H ,
Я !
R 2- C O C H |
о |
|
СНз |
|
|
|
+ / |
С ^ -О -Р -О Щ г CE^-I^ C H J |
|||
|
О |
|
СИ , |
Фосфатиднлхолин (лецитин) |
|||
R I'C -O C H 2 |
|
н |
|
р |
I |
0 |
|
R 2- C - O - C H |
он |
||
|
|
|
с н 2 о р
О- он
Фосфатидил инозит
Сфингофосфолипиды в основном представлены сфингомиелином.
НОСНCB=CH -(CI 12),у с н 3
I |
|
р |
|
C E M S H -C — R |
|
||
носн2 |
|
|
|
|
Церамид |
|
|
|
НОСН-С№СН-(СН2>12 сн3 |
||
„ ^ |
о |
I |
р |
СН—NH |
С—R |
||
НзС\ + |
Y |
I |
|
Н3С— N - C H 2-C H 2о -р - о с н 2 |
|
||
Н3С |
i - |
|
|
|
Сфингомиелин |
|
Фосфолипиды играют основную (структурную) роль в мембран ном бислое - их молекулы построены по единому плану и стерически хорошо «соответствуют» друг другу. В то же время, структурное едино образие не исключает наличия огромного числа различных фосфолипи дов, что обеспечивается разнообразием жирных кислот, входящих в их состав. Преобладающими являются: —С,6 (пальмитиновая), С,8 (стеари новая), Сц:2 (линолевая), С18:3 (линоленовая), СМ:4(арахидоновая).
6 8
В молекулах глицерофосфолипидов цепи жирных кислот, связан ные с С) и С2 атомами глицерина, неравнозначны. Обычно из двух це пей лишь принадлежащая С2-углеродному атому имеет двойные связи. Степень насыщенности жирных кислот влияет на плотность упаковки "молекул в мембранах: фосфолипиды, имеющие в своем составе полиненасьнценную жирную кислоту образуют более рыхлый бислой благода ря менее упорядоченной пространственной конфигурации.
Гликолипиды в основном принадлежат к группе гликосфинголипидов, которые также являются производивши церамида, однако, в от личие от сфингофосфолипидов, не содержат фосфата, который заменен на один или несколько остатков углевода.
Из гликолипидов наиболее распространены:
1. Цереброзиды —углеводная часть представлена гексозой (гала тоза, реже глюкоза). В наибольших количествах цереброзиды присутст вуют в миелиновых оболочках нервов.
|
Н О С Н - сн=€1ь (СН2) й сн3 |
|
» |
I |
р |
6 |
||
|
С 1 Ь - М Ь С ^ К |
Галактоцереброзид
2.Сульфатиды (сульфатные эфиры цереброзидов) - отличаются от цереброзидов наличием остатка серной кислоты, присоединенного сложноэфирной связью к С3 -атому углевода. Сульфатиды встречаются
взаметных количествах в белом веществе мозга.
3.Ганглиозиды —в структурном отношении сходны с цереброзидами, отличаются тем, что вместо моносахарида содержат сложный, часто разветвленный, олигосахарид, имеющий в своем составе, помимо других углеводов, по крайней мере один остаток N-ацетил- нейраминовой кислоты. Ганглиозидов много в сером веществе мозга на внешней поверхности плазматических мембран нервных и глиальных клеток.
69
о
N-ацетил-нейрамнновая кислота
За счет углеводного компонента, гликосфинголипиды (особенно ганглиозиды) вовлечены в процесс приема сигналов, поступающих в клетки из окружающей среды. Они активно участвуют в контроле и ре гуляции межклеточных контактов; рецепции пептидных гормонов, бак териальных токсинов. Структура ганглиозидов и их состав генетически контролируются ферментами гликозилтрансферазами, поэтому ганглио зиды обладают высокой тканевой специфичностью и могут выступать в роли антигенов клеточной поверхности.
Стероиды - группа соединений, содержащих углеродный скелет циклопентанпергидрофенантрена. Главньм представителем стероидов, который присутствует в большинстве мембран животных клеток, явля ется холестерин. Исключение составляет внутренняя мембрана мито хондрий, где его уровень очень низок.
Циклопентанлергидрофенантрен
21
70