Добавил:
Upload Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:
Лекция-ОКС-СКС-00-1.doc
Скачиваний:
31
Добавлен:
21.04.2019
Размер:
678 Кб
Скачать
☆

Ели Шренка

№

Источники варьирования

Степени свободы

Сумма квадратов,

S

Средний квадрат,

М

Теоретически ожидаемое для среднего квадрата по модели 1

1.

ОКС

Разница между семьями полусибсов

Sg

Mg

2.

СКС

Разница между семьями сибсов

Ss

Ms

3.

Остаток (ошибка)

=

a×b×(c–1)

Se

Me

Вычисление компонентов проводят по следующим формулам:

Сумма квадратов, обусловленная общей комбинационной способностью (ОКС):

Сума квадратов, обусловленная специфической комбинационной способностью (СКС):

Достоверность эффектов общей и специфической комбинационной способности определяют с помощью F-критерия Фишера.

Для эффектов общей комбинационной способности:

В соответствии с таблицей 3, число степеней свободы равно:

  • для значения Mg kg= p – 1;

  • для значения Me’ ke= m

Для эффектов специфической комбинационной способности:

В соответствии с таблицей 3, число степеней свободы равно:

- для значений Ms ks= p(p – 3)/2

  • для значения Me’ ke= m

Общую комбинационную способность любой родительской формы (i) определяют по формуле:

Варианса ОКС определенной родительской формы равна:

Специфическая комбинационная способность пары родительских компонентов (ij) определяют по формуле:

Варианса специфической комбинационной способности определенной родительской формы составляет:

ВЫЧИСЛЕНИЯ

В рассматриваемом нами примере проводилось одностороннее прямое диаллельное скрещивание 6 родительских форм, в результате которого было получено 15 полусибсовых семей гибридного потомства F1. Количество гибридных семей (15) соответствует расчетному числу Гриффинга (1/2 × р × (р – 1)) по варианту «4». Варианты самоопыления исключались из схемы опыта. Характеристики родителей (плюсовых деревьев) также не учитывались. Испытание проводилось в шести повторностях (на 6 разных учетных участках испытательных культур или питомника) по 12 гибридных растений в каждой повторности. Анализировалась высота сеянцев в возрасте 20 лет. Средние значения анализируемого признака, представляющие собой средние арифметические значения по каждой полусибсовой семье из 6 повторностей с 12 гибридными сеянцами в каждой сведены в таблице 4.

Таблица 4.

Средняя для полусибсовой семьи высота ствола (см) у гибридов f1 ели Шренка и исходные значения для определения комбинационной способности

♀

♂

Р-1

Р-2

Р-3

Р-4

Р-5

Р-6

xi=Σxij

xi2

Р-1

81,1

83,1

82,2

81,1

82,0

409,5

167690,25

Р-2

81,1

85,1

85,0

82,0

85,0

418,2

174891,24

Р-3

83,1

85,1

85,9

85,2

88,0

427,3

182585,29

Р-4

82,2

85,0

85,9

87,4

88,2

428,7

183783,69

Р-5

81,1

82,0

85,2

87,4

93,0

428,7

183783,69

Р-6

82,0

85,0

88,0

88,2

93,0

436,2

190270,44

Σ

2548,6

1083004,60

Помимо экспериментально полученных данных, средних значений высоты ствола для каждой из 6 родительских форм (xij.), приведенных в верхней правой части матрицы, (для каждого из 6 плюсовых деревьев) вычисляют сумму значений признака (в данном примере по средним значениям для каждой комбинации скрещиваний) у F1 (F1ij = Рi × Рj) соответствующей полусибсовой семьи: всех потомков-полусибсов каждого одного из испытываемых плюсовых деревьев (Рi) в его сочетаниях со всеми другими (Рj) – (xi = Σ xij):

х1 = 81,1+83,1+82,2+81,1+82,0 = 409,5

х2 = 81,1+85,1+85,0+82,0+85,0 = 418,2

х3 = 83,1+85,1+85,9+85,2+88,0 = 427,3

х4 = 82,2+85,0+85,9+87,4+88,2 = 428,7

х5 = 81,1+82,0+85,2+87,4+93,0 = 428,7

х6 = 82,0+85,0+88,0+88,2+93,0 = 436,2

и соответствующие квадраты этих сумм (xi2 = [Σ xij]2):

х12 = (81,1+83,1+82,2+81,1+82,0)2 = 409,52 = 167690,25

х22 = (81,1+85,1+85,0+82,0+85,0)2 = 418,22 = 174891,24

х32 = (83,1+85,1+85,9+85,2+88,0)2 = 427,32 = 182585,29

х42 = (82,2+85,0+85,9+87,4+88,2)2 = 428,72 = 183783,69

х52 = (81,1+82,0+85,2+87,4+93,0)2 = 428,72 = 183783,69

х62 = (82,0+85,0+88,0+88,2+93,0)2 = 436,22 = 190270,44

а также общую сумму этих квадратов сумм значений полусибсовых семей по каждому полному набору комбинаций скрещиваний каждого ПД (Σ xi2); Σ xi2 = Σ (Σ xij)2 = 1083004,60 (см. табл. 4, итоговая строка).

На следующем этапе рассчитывают:

- сумму всех значений признака полученных в данной схеме испытаний полусибсовых семей (в рассматриваемом примере только прямые односторонние скрещивания): вычисляется как сумма полученных в данном испытании средних (xij.) по комбинациям (только прямые скрещивания, см. табл. 4) значений признака (x.. = [Σ Σ xij.]):

x.. = 81,1+83,1+82,2+81,1+82,0 +

+ 85,1+85,0+82,0+85,0 +

+ 85,9+85,2+88,0 +

+ 87,4+88,2 +

+ 93,0 =

= 1274,3

- квадрат этой суммы (x..2 = [Σ Σ xij.]2), x..2 = (1274,3)2 = 1623840,49;

- общую сумму квадратов значений признака всех гибридов F1 (F1ij = Рi × Рj) – в нашем случае одностороннего скрещивания (только прямые скрещивания, без вариантов самоопыления), (Σ Σ x2ij.), Σ Σ x2ij. = 108405,73.

Σ Σ x2ij. = 81,12+83,12+82,22+81,12+82,02 + …

+ 85,12+85,02+82,02+85,02 + …

+ 95,92+85,22+88,02 + …

+ 87,42+88,22 + …

+ 93,02 =

= 108405,73

Кроме того, вычисляют полную сумму сумм значений признака (в данном примере по приведенным средним значениям для каждой комбинации скрещиваний) у F1 (F1ij = Рi × Рj) соответствующей полной полусибсовой семьи: всех потомков-полусибсов каждого одного из испытываемых плюсовых деревьев (Рi) в его сочетаниях со всеми другими (Рj) – (Σxi = Σ Σ xij , если xi = Σ xij); показатель используется в расчетах оценок ОКС:

Σ Σ xij = 81,1+83,1+82,2+81,1+82,0 + Σ xi = 409,5 +

+ 81,1+85,1+85,0+82,0+85,0 + + 418,2 +

+ 83,1+85,1+85,9+85,2+88,0 + + 427,3 +

+ 82,2+85,0+85,9+87,4+88,2 + или + 428,7 +

+ 81,1+82,0+85,2+87,4+93,0 + + 428,7 +

+ 82,0+85,0+88,0+88,2+93,0 = + 436,2 =

= 2548,6 = 2548,6

полученная величина в формулах дальнейших расчетов ОКС обозначена как «2 × х..». Она соответствует общей сумме всех значений признака полусибсовых групп для полной реципрокной схемы диаллельных скрещиваний получим (Σxi = Σ Σ xij) Σxi = 2548,6 (см. табл. 4 итоговая строка).

Вычисление компонентов дисперсии проводят по следующим формулам, используя полученные на предыдущем этапе значения.

1. Сумма квадратов, обусловленная общей комбинационной способностью (ОКС) - Sg:

=

= 1/(6 – 2) × 1083004,6 – 4/6 × (6 – 2) × 162384,49 = 270751,15 – 270640,08 = 111,07.

2. Сума квадратов, обусловленная специфической комбинационной способностью (СКС) - Ss:

=

= 108405,73 – 1/(6 – 2) × 1083004,6 + 2/[(6 – 1) × (6 – 2)] ×1623840,49 = 108405,73 – 270751,15 + + 162384,05 = 38,63.

На следующем этапе составляют таблицу варианс (табл. 5).

Таблица 5.

Таблица варианс для определения комбинационной способности

Источники

варьирования

Степень свободы, k

Сумма квадратов, S

Средний квадрат М

ОКС

kg = = 6 – 1 = 5

Sg = 111,07

Мg = Sg /kg = 22,21

СКС

ks=

Ss = 38,63

Мs = Ss /ks = 4,29

Остаток

ke =a×b×(c–1)×b×c = 71280

Sе = 5782,00

М'е=Sе/kе= 0,08

Достоверность эффектов общей и специфической комбинационной способности определяют с помощью F-критерия Фишера.

Для эффектов общей комбинационной способности:

= 22,21 / 0,08 = 277,6 (табличное значение 4,37).

В соответствии с таблицей 3, число степеней свободы равно:

  • для значения Mg kg = p – 1 = 5;

  • для значения Me’ ke = m = 990.

Для эффектов специфической комбинационной способности:

= 4,29 / 0,08 = 53,6 (табличное значение 2,71).

В соответствии с таблицей 3, число степеней свободы равно:

  • для значения Ms ks = p(p – 3)/2 = 9;

  • для значения Me’ ke = m = 990

Из представленных расчетов и сравнений видно, что и фактическое (опытное, эмпирическое) значение дисперсионного отношения (критерия Фишера) общей комбинационной способности и фактическое (опытное, эмпирическое) значение дисперсионного отношения (критерия Фишера) специфической комбинационной способности превышают соответствующие табличные значения. Это свидетельствует о том, что значения общей и специфической комбинационной способности достоверны. Полученный результат обусловливает возможность и целесообразность (создает основания, предпосылки для) продолжения генетического анализа, который будет состоять в определении общей комбинационной способности для каждой родительской формы (плюсового дерева) и специфической комбинационной способности для каждой их пары в прямых односторонних скрещиваниях.

При диаллельном скрещивании для каждого родительского компонента (i) – любой родительской формы – общую комбинационную способность (gi) определяют по формуле:

Варианса ОКС определенной родительской формы равна:

Тогда для каждой из родительских форм (плюсового дерева) получим следующие значения общей комбинационной способности (gi).

g1 = 1/[6×(6 – 2)] × (6 × 409,5 – 2 × 1274,3) = – 3,82

g2 = 1/[6×(6 – 2)] × (6 × 418,2 – 2 × 1274,3) = – 1,64

g3 = 1/[6×(6 – 2)] × (6 × 427,3 – 2 × 1274,3) = 0,63

g4 = 1/[6×(6 – 2)] × (6 × 428,7 – 2 × 1274,3) = 0,98

g5 = 1/[6×(6 – 2)] × (6 × 428,7 – 2 × 1274,3) = 0,98

g6 = 1/[6×(6 – 2)] × (6 × 439,2 – 2 × 1274,3) = 2,86

Оценки вариансы для ОКС каждой особи получают в результате следующих расчетов.

σgi = – 3,822 – (6 – 1)/[6×(6 – 2)] × 0,08 = 14,58

σgi = – 1,642 – (6 – 1)/[6×(6 – 2)] × 0,08 = 2,67

σgi = 0,632 – (6 – 1)/[6×(6 – 2)] × 0,08 = 0,38

σgi = 0,982 – (6 – 1)/[6×(6 – 2)] × 0,08 = 0,94

σgi = 0,982 – (6 – 1)/[6×(6 – 2)] × 0,08 = 0,94

σgi = 2,862 – (6 – 1)/[6×(6 – 2)] × 0,08 = 8,16

Расчеты для каждой родительской формы сводят в таблицу 6.

Таблица 6.

Соседние файлы в предмете [НЕСОРТИРОВАННОЕ]