- •Биологическое окисление. Понятие о метаболизме.
- •История развития учения о биоокислении.
- •Современная теория биоокисления
- •Митохондриальное окисление (МтО).
- •Главная (полная) цепь
- •Укороченная (сокращенная) цепь
- •Главная дыхательная цепь
- •Митохондриального окисления
- •Синтез атф.
- •Никотинамидные дегидрогеназы (надг)
- •Комплекс I
- •Комплекс III.
- •Комплекс IV.
- •Основные процессы, для которых используется энергия атф:
- •Синтез атф.
- •Специфические ингибиторы тканевого дыхания
- •Вещества-разобщители процессов окисления и фосфорилирования
- •Теория сопряжения окисления и фосфорилирования питера митчелла.
- •Автономная саморегуляция системы митохондриального окисления
- •Варианты дыхательной цепи.
- •1. Полная дыхательная цепь
- •2. Сокращенная (укороченная) дыхательная цепь
- •3. Максимально сокращенная (максимально укороченная) дыхательная цепь.
- •Окислительное декарбоксилирование пировиноградной
- •Окислительное декарбоксилирование пирувата
- •Цикл трикарбоновых кислот
- •Итоговое уравнение цтк
- •Биологическое значение цтк
- •Автономная саморегуляция цтк
- •Энергетический заряд клетки (эзк)
- •Челночные механизмы переноса водорода
- •Биохимия крови.
- •Функции крови.
- •Альбумины
- •Функции альбуминов
- •Глобулины
- •Функции 1-глобулинов
- •Биохимия мышечной ткани
- •1. Специальные реакции субстратного фосфорилирования
- •2. Гликолиз, гликогенолиз.
- •3. Окислительное фосфорилирование.
- •Биохимия почек.
- •1. Ультрафильтрация
- •2. Реабсорбция
- •3. Секреция
- •1. Водно-солевой гомеостаз.
- •2. Участие почек в регуляции кислотно-щелочного равновесия
- •2) Аммониогенез
- •3) Глюконеогенез
- •Биохимия костной ткани, тканей зуба, биохимия слюны.
- •Органический матрикс кости.
- •Дентин.
- •Пульпа.
- •Биохимия нервной ткани
- •2) Пептиды
- •Биохимия питания биохимические основы питания человека.
- •Окислительное декарбоксилирование пирувата
- •Внемитохондриальное окисление
- •I. Окисление оксидазного типа.
- •II. Окисление оксигеназного типа
- •Примеры реакций оксигеназного типа окисления
- •Антиоксидантная система.
- •1. Ферментативная
- •В) пероксидаза.
- •2. Неферментативные компоненты антиоксидантной системы
- •Метаболизм белков Особая роль белков в питании
- •Переваривание и всасывание белков в желудочно-kишечном тракте
- •Механизмы, защищающие белки от действия протеиназ:
- •Ингибиторы сериновых протеиназ.
- •Ингибиторы тиоловых протеиназ
- •Высокоспецифичные протеиназы
- •Катаболизм аминокислот.
- •3. Гистидиндекарбоксилаза
- •Обмен сложных белков обмен нуклеопротеинов
- •Обмен нуклеиновых кислот
- •Различия в катаболизме пуриновых и пиримидиновых азотистых оснований.
- •Функции мочевой кислоты:
- •Синтез нуклеиновых кислот синтез мононуклеотидов
- •Синтез пиримидиновых мононуклеотидов.
- •Синтез нуклеиновых кислот из мононуклеотидов
- •Строение и обмен хромопротеинов
- •Параметаболизм
- •Некоторые параметаболические процессы
- •Строение и свойства белков.
- •Основные различия в строении белковых молекул
- •II. Биологическая классификация.
- •Типы связей между аминокислотами в молекуле белка
- •Слабые типы связей
- •Пространственная организация белковой молекулы
- •Первичная структура
- •Вторичная структура
- •Третичная структура
- •Четвертичная структура
- •Методы определения первичной структуры белка
- •1)Деградация по Эдмону
- •2) Секвенирование днк
- •3) Рентгеноструктурный анализ
- •Электронная микроскопия
- •Конфигурация и конформация белковой молекулы
- •Лиганды
- •Нативность белковой молекулы
- •Денатурация белка
- •Факторы, вызывающие денатурацию белков
- •Физические факторы
- •Химические факторы
- •Обратимость денатурации
- •Белки стресса
- •Физико-химические свойства белков. Растворимость белков в воде.
- •Факторы стабилизации белка в растворе.
- •Свойства воды гидратной оболочки
- •Способы осаждения белков
- •Осаждение нативных белков
- •Осаждение денатурированных белков
- •Строение и свойства ферментов
- •Общие свойства катализаторов
- •Особенности ферментов как биологических катализаторов
- •Строение ферментов
- •I класс - оксидоредуктазы.
- •Кинетика ферментативного катализа
- •Характеристика конкурентных ингибиторов
- •Автономная саморегуляция ферментативных процессов
- •2. Субстрат - аллостерический активатор своего фермента.
- •3. Продукт реакции - аллостерический активатор своего фермента.
- •4. Один субстрат - два фермента и два продукта.
- •5. Один субстрат, два фермента и один продукт
- •Фруктоземия.
- •Химия и обмен липидов.
- •Липопротеины
- •Пищевой жир.
- •Липогенез.
- •Гормональная регуляция синтеза жира
- •Катаболизм жира
- •Пути метаболизма глицерина
- •Распад глицерина по пути к углеводам
- •Пути использования жирных кислот.
- •Катаболизм жирных кислот
- •Реакции синтеза кетоновых тел
- •Утилизация кетоновых тел
- •Биохимия фосфолипидов, гликолипидов и стероидов. Биологические мембраны. Биологические мембраны
- •Фосфолипиды.
- •Роль мембранных белков.
- •Роль углеводных компонентов мембран
- •Функции липоидов
- •Катаболизм липоидов.
- •Строение и обмен хромопротеинов
- •Цикл трикарбоновых кислот
- •Итоговое уравнение цтк
- •Биологическое значение цтк
- •Автономная саморегуляция цтк
- •Энергетический заряд клетки (эзк)
- •Челночные механизмы переноса водорода
3) Рентгеноструктурный анализ
Схема, поясняющая принцип этого метода, представлена на рисунке:
В результате облучения на фотопленке фиксируется карта электронной плотности (похожа на географическую карту). Далее производится компьютерный анализ полученного изображения, в результате чего строится пространственная модель белковой молекулы.
-
Электронная микроскопия
Может быть использована для выяснения структуры белковых молекул с большой молекулярной массой – от 500.000 до 1.000.000 Да (дальтон). Дальтон (Да) и килодальтон (кДа)– единицы измерения массы белков. 1кДа=103 Да. 1 дальтон равен 1/16 массы атома кислорода (кислородная единица массы).
Конфигурация и конформация белковой молекулы
Из всего сказанного можно заключить, что пространственная организация белков очень сложна. В химии существует понятие - пространственная КОНФИГУРАЦИЯ - жестко закрепленное ковалентными связями пространственное взаимное расположение частей молекулы (например: принадлежность к L-ряду стереоизомеров или к D-ряду).
Для белков также используется понятие КОНФОРМАЦИЯ белковой молекулы - определенное, но не застывшее, не неизменное взаимное расположение частей молекулы. Так как конформация белковой молекулы формируется при участии слабых типов связей, то она является подвижной (способной к изменениям), и белок может изменять свою структуру. В зависимости от условий внешней среды молекула может существовать в разных конформационных состояниях, которые легко переходят друг в друга. Энергетически выгодными для реальных условий являются только одно или несколько конформационных состояний, между которыми существует равновесие. Переходы из одного конформационного состояния в другое обеспечивают функционирование белковой молекулы. Это обратимые конформационные изменения (встречаются в организме, например, при проведении нервного импульса, при переносе кислорода гемоглобином). При изменении конформации часть слабых связей разрушается, и образуются новые связи слабого типа.
Лиганды
Взаимодействие белка с каким-нибудь веществом иногда приводит к связыванию молекулы этого вещества молекулой белка. Этот явление известно как «сорбция» (связывание). Обратный же процесс - освобождение другой молекулы от белковой называется «десорбция».
Если для какой-нибудь пары молекул процесс сорбции преобладает над десорбцией, то это уже специфическая сорбция, а вещество, которое сорбируется, называется «лиганд».
Виды лигандов:
1) Лиганд белка-фермента – субстрат.
2) Лиганд траспортного белка – транспортируемое вещество.
3) Лиганд антитела (иммуноглобулина) – антиген.
4) Лиганд рецептора гормона или нейромедиатора – гормон или нейромедиатор.
Белок может изменять свою конформацию не только при взаимодействии с лигандом, но и в результате любого химического взаимодействия. Примером такого взаимодействия может служить присоединение остатка фосфорной кислоты.
В природных условиях белки имеют несколько термодинамически выгодных конформационных состояний. Это нативные состояния (природные). Natura (лат.) – природа.
Нативность белковой молекулы
НАТИВНОСТЬ - это уникальный комплекс физических, физико-химических, химических и биологических свойств белковой молекулы, который принадлежит ей, когда молекула белка находится в естественном, природном (нативном) состоянии.
Например: белок хрусталика глаза - кристаллин - обладает высокой прозрачностью только в нативном состоянии).