- •Биологическое окисление. Понятие о метаболизме.
- •История развития учения о биоокислении.
- •Современная теория биоокисления
- •Митохондриальное окисление (МтО).
- •Главная (полная) цепь
- •Укороченная (сокращенная) цепь
- •Главная дыхательная цепь
- •Митохондриального окисления
- •Синтез атф.
- •Никотинамидные дегидрогеназы (надг)
- •Комплекс I
- •Комплекс III.
- •Комплекс IV.
- •Основные процессы, для которых используется энергия атф:
- •Синтез атф.
- •Специфические ингибиторы тканевого дыхания
- •Вещества-разобщители процессов окисления и фосфорилирования
- •Теория сопряжения окисления и фосфорилирования питера митчелла.
- •Автономная саморегуляция системы митохондриального окисления
- •Варианты дыхательной цепи.
- •1. Полная дыхательная цепь
- •2. Сокращенная (укороченная) дыхательная цепь
- •3. Максимально сокращенная (максимально укороченная) дыхательная цепь.
- •Окислительное декарбоксилирование пировиноградной
- •Окислительное декарбоксилирование пирувата
- •Цикл трикарбоновых кислот
- •Итоговое уравнение цтк
- •Биологическое значение цтк
- •Автономная саморегуляция цтк
- •Энергетический заряд клетки (эзк)
- •Челночные механизмы переноса водорода
- •Биохимия крови.
- •Функции крови.
- •Альбумины
- •Функции альбуминов
- •Глобулины
- •Функции 1-глобулинов
- •Биохимия мышечной ткани
- •1. Специальные реакции субстратного фосфорилирования
- •2. Гликолиз, гликогенолиз.
- •3. Окислительное фосфорилирование.
- •Биохимия почек.
- •1. Ультрафильтрация
- •2. Реабсорбция
- •3. Секреция
- •1. Водно-солевой гомеостаз.
- •2. Участие почек в регуляции кислотно-щелочного равновесия
- •2) Аммониогенез
- •3) Глюконеогенез
- •Биохимия костной ткани, тканей зуба, биохимия слюны.
- •Органический матрикс кости.
- •Дентин.
- •Пульпа.
- •Биохимия нервной ткани
- •2) Пептиды
- •Биохимия питания биохимические основы питания человека.
- •Окислительное декарбоксилирование пирувата
- •Внемитохондриальное окисление
- •I. Окисление оксидазного типа.
- •II. Окисление оксигеназного типа
- •Примеры реакций оксигеназного типа окисления
- •Антиоксидантная система.
- •1. Ферментативная
- •В) пероксидаза.
- •2. Неферментативные компоненты антиоксидантной системы
- •Метаболизм белков Особая роль белков в питании
- •Переваривание и всасывание белков в желудочно-kишечном тракте
- •Механизмы, защищающие белки от действия протеиназ:
- •Ингибиторы сериновых протеиназ.
- •Ингибиторы тиоловых протеиназ
- •Высокоспецифичные протеиназы
- •Катаболизм аминокислот.
- •3. Гистидиндекарбоксилаза
- •Обмен сложных белков обмен нуклеопротеинов
- •Обмен нуклеиновых кислот
- •Различия в катаболизме пуриновых и пиримидиновых азотистых оснований.
- •Функции мочевой кислоты:
- •Синтез нуклеиновых кислот синтез мононуклеотидов
- •Синтез пиримидиновых мононуклеотидов.
- •Синтез нуклеиновых кислот из мононуклеотидов
- •Строение и обмен хромопротеинов
- •Параметаболизм
- •Некоторые параметаболические процессы
- •Строение и свойства белков.
- •Основные различия в строении белковых молекул
- •II. Биологическая классификация.
- •Типы связей между аминокислотами в молекуле белка
- •Слабые типы связей
- •Пространственная организация белковой молекулы
- •Первичная структура
- •Вторичная структура
- •Третичная структура
- •Четвертичная структура
- •Методы определения первичной структуры белка
- •1)Деградация по Эдмону
- •2) Секвенирование днк
- •3) Рентгеноструктурный анализ
- •Электронная микроскопия
- •Конфигурация и конформация белковой молекулы
- •Лиганды
- •Нативность белковой молекулы
- •Денатурация белка
- •Факторы, вызывающие денатурацию белков
- •Физические факторы
- •Химические факторы
- •Обратимость денатурации
- •Белки стресса
- •Физико-химические свойства белков. Растворимость белков в воде.
- •Факторы стабилизации белка в растворе.
- •Свойства воды гидратной оболочки
- •Способы осаждения белков
- •Осаждение нативных белков
- •Осаждение денатурированных белков
- •Строение и свойства ферментов
- •Общие свойства катализаторов
- •Особенности ферментов как биологических катализаторов
- •Строение ферментов
- •I класс - оксидоредуктазы.
- •Кинетика ферментативного катализа
- •Характеристика конкурентных ингибиторов
- •Автономная саморегуляция ферментативных процессов
- •2. Субстрат - аллостерический активатор своего фермента.
- •3. Продукт реакции - аллостерический активатор своего фермента.
- •4. Один субстрат - два фермента и два продукта.
- •5. Один субстрат, два фермента и один продукт
- •Фруктоземия.
- •Химия и обмен липидов.
- •Липопротеины
- •Пищевой жир.
- •Липогенез.
- •Гормональная регуляция синтеза жира
- •Катаболизм жира
- •Пути метаболизма глицерина
- •Распад глицерина по пути к углеводам
- •Пути использования жирных кислот.
- •Катаболизм жирных кислот
- •Реакции синтеза кетоновых тел
- •Утилизация кетоновых тел
- •Биохимия фосфолипидов, гликолипидов и стероидов. Биологические мембраны. Биологические мембраны
- •Фосфолипиды.
- •Роль мембранных белков.
- •Роль углеводных компонентов мембран
- •Функции липоидов
- •Катаболизм липоидов.
- •Строение и обмен хромопротеинов
- •Цикл трикарбоновых кислот
- •Итоговое уравнение цтк
- •Биологическое значение цтк
- •Автономная саморегуляция цтк
- •Энергетический заряд клетки (эзк)
- •Челночные механизмы переноса водорода
Третичная структура
Это трехмерная архитектура полипептидной цепи – особое взаимное расположение в пространстве спиралеобразных, складчатых и нерегулярных участков полипептидной цепи. У разных белков третичной структуры различна. В формировании третичной структуры участвуют дисульфидные связи и все слабые типы связей.
Выделяют два общих типа третичной структуры:
1) В фибриллярных белках (например, коллаген, эластин) молекулы которых имеют вытянутую форму и обычно формируют волокнистые структуры тканей, третичная структура представлена либо тройной альфа-спиралью (например, в коллагене), либо бета-складчатыми структурами.
2) В глобулярных белках, молекулы которых имеют форму шара или эллипса (латинское название: GLOBULA - шар), встречается сочетание всех трех типов структур: всегда есть нерегулярные участки, есть бета-складчатые структуры и альфа-спирали.
Обычно в глобулярных белках гидрофобные участки молекулы находятся в глубине молекулы. Соединяясь между собой, гидрофобные радикалы образуют гидрофобные кластеры (центры). Формирование гидрофобного кластера вынуждает молекулу соответствующим образом изгибаться в пространстве. Обычно в молекуле глобулярного белка бывает несколько гидрофобных кластеров в глубине молекулы. Это является проявлением двойственности свойств белковой молекулы: на поверхности молекулы - гидрофильные группировки, поэтому молекула в целом - гидрофильная, а в глубине молекулы - спрятаны гидрофобные радикалы.
Четвертичная структура
Встречается не у всех белков, а только у тех, которые состоят из двух или более полипептидных цепей. Каждая такая цепь называется СУБЪЕДИНИЦЕЙ данной молекулы (или ПРОТОМЕРОМ). Поэтому белки, обладающие четвертичной структурой, называют ОЛИГОМЕРНЫМИ белками. В состав белковой молекулы могут входить одинаковые или разные субъединицы. Например, молекула гемоглобина «А» состоит из двух субъединиц одного типа и двух субъединиц другого типа, то есть является тетрамером. Фиксируются четвертичные структуры белков всеми типами слабых связей, а иногда еще и дисульфидными связями.
Методы определения первичной структуры белка
1)Деградация по Эдмону
К раствору белка добавляют реактив Эдмона, содержащий фенилизотиоцианат.
Фенилизотиоцианат взаимодействует с альфа-аминогруппой первой (N-концевой) аминокислоты, а затем происходит ее отщепление от полипептидной цепи путем гидролиза:
После этого идентифицируют первую аминокислоту. Затем процесс повторяется.
В настоящее время процесс автоматизирован.
2) Секвенирование днк
Первичная структура любой белковой молекулы напрямую зависит от структуры ДНК-генома. Поэтому сначала выделяют ген, в котором закодирована структура белка. Далее определяют последовательность азотистых оснований в ДНК. Каждая аминокислота в белковой молекуле закодирована сочетанием трех азотистых оснований - триплетом (кодоном) в молекуле ДНК. Например, сочетание трех оснований аденина (ААА) кодирует аминокислоту фенилаланин, а последовательность из трех оснований цитозина – глицин. Это дает возможность получить информацию о первичной структуре белковой молекуле, а, значит, прогнозировать строение всей молекулы в целом, поскольку именно первичная структура определяет строение всех высших уровней организации – и вторичной, и третичной, а, иногда и четвертичной структур.
Для проверки предположений о строении высших структур используется еще один метод: