1. Классификация и номенклатура аминокислот по строению радикалов
По строению углеродного скелета радикалов АК делятся на алифатические, ароматические и гетероциклические. В составе радикалов могут быть функциональные группы, придающие им специфические свойства: карбоксильная, амино-, тиольная, амидная, гидроксильная, гуанидиновая. Названия применяют преимущественно тривиальные (глицин от слова сладкий –glykos, серин от слова serieum – шелковистый, получен из фибрина шелка) , для записи используют их трехбуквенное обозначение. В составе полипептидной цепочки остаток АК, не имеющий карбоксильной группы в стандартном блоке называется с изменением окончания –ИН на –ИЛ. Например глицил вместол глицин и т.д.
Классификация аминокислот по растворимости их радикалов в воде, полярности, наличию или отсутствию заряда
Сами АК все в воде растворимы, но в составе белка их радикал оказывает влияние на растворимость его в воде, поэтому важно выделить АК с гидрофобными неполярными и гидрофильными полярными радикалами. Гидрофобные радикалы это углеводородные структуры, которые способны «склеиваться» друг с другом образуя гидрофобные связи, но не образуют водородные или диполь-дипольные связи с водой и поэтому на растворяются в ней. Гидрофильные – образуют диполь-дипольные или водородные связи водой. Гидрофобные и гидрофильные радикалы АК определяют пространственное строение белка(конформацию) , в который они входят.
Среди полярных радикалов также выделяют с зарядом (положительно и отрицательно заряженные) и без заряда. Радикалы с зарядом лучше растворяются в воде чем без заряда.
1.Ак с алифатическими углеводородными радикалами, гидрофобные, незаряженные
2. АК с ароматическими углеводородными радикалами, гидрофобные, незаряженные
.
3. АК с гидроксильными группами (полярные) гидрофильные не заряженные
А. Спиртовой
7.
8.
Б. Фенольный
9.
4. АК с серосодержашими радикалами (гидрофильные не заряженные)
10.
11.
5. АК с карбоксильной группой в радикале (гидрофильные отрицательно заряженные)
12
13.
6. АК, содержащие амидные группы (гидрофильные не заряженные)
14
15.
7. АК, содержащие аминогруппу в радикале (гидрофильные, положительно заряженные)
16.
8. АК, содержащие гуанидиновую группу (гидрофильные, положительно заряженные)
17.
9. АК с гетероциклическими радикалами, триптофан – гидрофобный незаряженный, гистидин гидрофильный, положительно заряженный, пролин гидрофильный, незаряженный.
18, 19, 20
Таким образом по свойствам и строению радикалов все -АК делятся на :
А.Нейтральные АК
1.Неполярные радикалы (гидрофобные): аланин, валин, изолейцин, лейцин, метионин, пролин, триптофан, фенилаланин
2.Полярные незаряженные радикалы (гидрофильные): аспарагин, глицин, глутамин, серин, тирозин, треонин, цистеин
Б.Кислые АК рН7
Отрицательно заряженные радикалы (гидрофильные): аспарагиновая кислота, глутаминовая кислота
В. Основные АК, рН7
Положительно заряженные радикалы (гидрофильные): аргинин, гистидин, лизин
Химические свойства