- •ТРЕТИЧНАЯ СТРУКТУРА –
- •Водородные связи между радикалами аминокислотных остатков
- •Max Perutz и John Kendrew –
- •Третичная структура миоглобина
- •Типы взаимодействий, стабилизирующие третичную структуру
- •Примеры нековалентных взаимодействий между аминокислотными остатками в третичной структуре
- •Гидрофобные взаимодействия
- •Ленточная модель с боковыми радикалами третичной структуры поверхностного белка вируса гепатита В (HBsAg)
- •относительная гидрофобность
- •Гидрофобный кор лизоцима
- •Электростатические взаимодействия
- •ЧЕТВЕРТИЧНАЯ СТРУКТУРА –
- •Первый олигомерный
- •ЛЕНТОЧНАЯ МОДЕЛЬ ГЕМОГЛОБИНА
- •3-мерная модель гомодимера поверхностного белка вируса гепатита В (HBsAg)
- •Электростатические взаимодействия между субъединицами в гемоглобине
- •Структура гема
- •Изменение конформации гемоглобина при связывании кислорода
- •Некоторые примеры свойств мультимерных белков
- •Надмолекулярные структуры – капсиды вирусов
- •Определение пространственной структуры белков
- •Крио-электронная микроскопия
- •Атомная силовая микроскопия (AFM, SFM)
- •Спектроскопия ЯМР
- •ДЕНАТУРАЦИЯ И
- •Денатурация – нарушение нековалентных взаимодействий в белках и разрушение дисульфидных связей
- •ФАКТОРЫ ДЕНАТУРАЦИИ
- •Рибонуклеаза:
- •Денатурированное
- •Формирование третичной структуры белка
- •Самопроизвольность протекания любого процесса оценивают с помощью изменения свободной энергии Гиббса
- •«спонтанная» реакция
- •Экспериментально рассчитанное изменение свободной энергии для фолдинга 7 анкириновых повторов Notch- рецептора
- •Этапы свертывания полипептидной цепи
- •Структурные домены сворачиваются отдельно
- •Внутри домена можно выделить ядро свертывания
- •Проблемы фолдинга
- •Динамическая флуоресцентная деполяризация – метод исследования фолдинга белков
- •Котрансляционный фолдинг белков
- •УЧАСТИЕ ШАПЕРОНОВ В ФОЛДИНГЕ БЕЛКОВ
- •Участие шаперонов в фолдинге белков
- •ФОЛДИНГ БЕЛКОВ С УЧАСТИЕМ ШАПЕРОНИНОВ
- •Пространственная
- •Возможные причины нарушения процесса сворачивания (фолдинга) белка
- •НАРУШЕНИЯ ФОЛДИНГА: ПРИОННЫЕ БОЛЕЗНИ
- •Модели прионного перехода
Динамическая флуоресцентная деполяризация – метод исследования фолдинга белков
Котрансляционный фолдинг белков
УЧАСТИЕ ШАПЕРОНОВ В ФОЛДИНГЕ БЕЛКОВ
Участие шаперонов в фолдинге белков
ФОЛДИНГ БЕЛКОВ С УЧАСТИЕМ ШАПЕРОНИНОВ
Пространственная
структура GroEL И GroES комплекса
Возможные причины нарушения процесса сворачивания (фолдинга) белка
•а) при избыточной продукции некоторых белков, в результате чего увеличивается их концентрация в клетке и они начинают взаимодействовать друг с другом, нарушая процесс сворачивания
•б) при попадании в клетки или образовании в них белков, способных влиять на сворачивание или пространственное расположение других молекул белка
•в) при усилении расщепления нормальных белков, сопровождающемся образованием нерастворимых, склонных к агрегации (склеиванию) фрагментов
•г) при возникновении точечных мутаций в молекуле ДНК, приводящих к заменам аминокислотных остатков в молекуле кодируемого белка.
НАРУШЕНИЯ ФОЛДИНГА: ПРИОННЫЕ БОЛЕЗНИ
Участок коры головного мозга пациента с болезнью Крейцфельдта – Якоба с участками с вакуолярной дегенерацией (вакуоли в межклеточном пространстве в области синапсов нарушают проведение нервного импульса)
Прионные болезни вызваны накоплением аномальной изоформы прионного белка PrPSc (нормальный прионный белок – PrPC )
Модели прионного перехода
А
гетеродимерная модель
полимеризационная модель
