
- •ИЕРАРХИЯ
- •• Первичная Вторичная
- •Весной 1951 г. Linus Pauling,
- •ТОРСИОННЫЕ УГЛЫ В ПЕПТИДАХ
- •ПАРАМЕТРЫ СПИРАЛИ
- •ВТОРИЧНАЯ СТРУКТУРА –
- •Вторичная структура белка стабилизирована
- •- спираль
- •Характеристики α-спирали
- •Модели вторичных структур
- •Спираль коллагена
- ••Коллаген составляет более 30% общей массы белков тела, причем около 40% его находится
- •Глицин
- •Левозакрученная одиночная спираль
- •Пример первичной последовательности фрагмента коллагена
- •Модель тройной спирали коллагена
- •Структура коллагеновой фибриллы
- •– складчатый слой
- •– складчатый слой
- •Характеристики β-складчатого слоя
- •β-поворот
- •Антипараллельный
- •РОЛЬ АМИНОКИСЛОТНЫХ РАДИКАЛОВ В ФОРМИРОВАНИИ ВТОРИЧНОЙ СТРУКТУРЫ
- •ФИБРИЛЛЯРНЫЕ БЕЛКИ ИМЕЮТ ТОЛЬКО ВТОРИЧНУЮ СТРУКТУРУ
- ••«Памятник» α- спирали перед родным домом Лайнуса Полинга
- •Структурная классификация белков
- •Супервторичные структуры
- •Суперспираль (coiled-coil)
- •Кератин – продукт кератиноцитов
- •Структура кератина
- •Структура кератиновых микрофибрилл
- •СХЕМА ХИМИЧЕСКОЙ ЗАВИВКИ
- •СПИРАЛЬ-ПОВОРОТ-СПИРАЛЬ HELIX-TURN-HELIX
- •EF Hand
- •Β-шпилька (β-hairpin)
- •ГРЕЧЕСКИЙ КЛЮЧ (Greek Key motif)
- •β-α-β Fold
- •УКЛАДКА ЦЕПИ ПО РОССМАНУ
- •СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ БЕЛКА
- •ПРИМЕРЫ СТРУКТУРНЫХ ДОМЕНОВ
- •Лейциновая молния
- •TIM barrel
- •Β-бочонок (порин)
- •Двойной бочонок
- •Beta-propeller
- •DNA clamp
- •Conotoxin
- •• Первичная Вторичная
- •ТРЕТИЧНАЯ СТРУКТУРА –
- •Max Perutz и John Kendrew –
- •Третичная структура миоглобина
- •Ленточная модель с боковыми радикалами третичной структуры поверхностного белка вируса гепатита В (HBsAg)
- •Типы взаимодействий, стабилизирующие третичную структуру
- •Примеры нековалентных взаимодействий между аминокислотными остатками в третичной структуре
- •Значения выше 0.679 – гидрофобные а.к.о. (красные);

• Первичная
Вторичная
• Структурные домены |
|
Супервторичная |
|
•Третичная
•Четверитчная

ТРЕТИЧНАЯ СТРУКТУРА –
УКЛАДКА ВТОРИЧНЫХ СТРУКТУР ОДНОЙ ПОЛИПЕПТИДНОЙ ЦЕПИ В ГЛОБУЛУ
(ПОЛНАЯ ПРОСТРАНСТВЕННАЯ СТРУКТУРА ПОЛИПЕПТИДНОЙ ЦЕПИ)
ТРЕТИЧНАЯ СТРУКТУРА СТАБИЛИЗИРУЕТСЯ
НЕКОВАЛЕНТНЫМИ
СВЯЗЯМИ

Max Perutz и John Kendrew –
рентгеноструктурный анализ миоглобина (1958) и гемоглобина

Третичная структура миоглобина
a – ленточная модель (видны вторичные стр.)
b – сетчатая (поверхность) c – поверхностный контур d – ленточная с боковыми радикалами
e – полная пространственная модель

Ленточная модель с боковыми радикалами третичной структуры поверхностного белка вируса гепатита В (HBsAg)
1: Gly7–Ile28,
2: Phe80–Leu97,
3: Phe170–Trp191
4: Gly202–Trp223
Типы взаимодействий, стабилизирующие третичную структуру
•Гидрофобные взаимодействия между неполярными радикалами
•Водородные связи между полярными радикалами
•Электростатические взаимодействия между противоположно заряженными радикалами

Примеры нековалентных взаимодействий между аминокислотными остатками в третичной структуре
Hydrophobic interaction


Значения выше 0.679 – гидрофобные а.к.о. (красные);
Значения ниже 0.583 - гидрофильные а.к.о. (синие);
Промежуточные – желтые
По 10 а.к.о. На N- и C-концах – вне профиля гидрофобности
(серые)
