
- •ИЕРАРХИЯ
- •• Первичная Вторичная
- •Весной 1951 г. Linus Pauling,
- •ТОРСИОННЫЕ УГЛЫ В ПЕПТИДАХ
- •ПАРАМЕТРЫ СПИРАЛИ
- •ВТОРИЧНАЯ СТРУКТУРА –
- •Вторичная структура белка стабилизирована
- •- спираль
- •Характеристики α-спирали
- •Модели вторичных структур
- •Спираль коллагена
- ••Коллаген составляет более 30% общей массы белков тела, причем около 40% его находится
- •Глицин
- •Левозакрученная одиночная спираль
- •Пример первичной последовательности фрагмента коллагена
- •Модель тройной спирали коллагена
- •Структура коллагеновой фибриллы
- •– складчатый слой
- •– складчатый слой
- •Характеристики β-складчатого слоя
- •β-поворот
- •Антипараллельный
- •РОЛЬ АМИНОКИСЛОТНЫХ РАДИКАЛОВ В ФОРМИРОВАНИИ ВТОРИЧНОЙ СТРУКТУРЫ
- •ФИБРИЛЛЯРНЫЕ БЕЛКИ ИМЕЮТ ТОЛЬКО ВТОРИЧНУЮ СТРУКТУРУ
- ••«Памятник» α- спирали перед родным домом Лайнуса Полинга
- •Структурная классификация белков
- •Супервторичные структуры
- •Суперспираль (coiled-coil)
- •Кератин – продукт кератиноцитов
- •Структура кератина
- •Структура кератиновых микрофибрилл
- •СХЕМА ХИМИЧЕСКОЙ ЗАВИВКИ
- •СПИРАЛЬ-ПОВОРОТ-СПИРАЛЬ HELIX-TURN-HELIX
- •EF Hand
- •Β-шпилька (β-hairpin)
- •ГРЕЧЕСКИЙ КЛЮЧ (Greek Key motif)
- •β-α-β Fold
- •УКЛАДКА ЦЕПИ ПО РОССМАНУ
- •СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ БЕЛКА
- •ПРИМЕРЫ СТРУКТУРНЫХ ДОМЕНОВ
- •Лейциновая молния
- •TIM barrel
- •Β-бочонок (порин)
- •Двойной бочонок
- •Beta-propeller
- •DNA clamp
- •Conotoxin
- •• Первичная Вторичная
- •ТРЕТИЧНАЯ СТРУКТУРА –
- •Max Perutz и John Kendrew –
- •Третичная структура миоглобина
- •Ленточная модель с боковыми радикалами третичной структуры поверхностного белка вируса гепатита В (HBsAg)
- •Типы взаимодействий, стабилизирующие третичную структуру
- •Примеры нековалентных взаимодействий между аминокислотными остатками в третичной структуре
- •Значения выше 0.679 – гидрофобные а.к.о. (красные);

Модель тройной спирали коллагена
Шаг с/с – 8,6 нм

Структура коллагеновой фибриллы
40 нм |
300 нм |

– складчатый слой
|
|
|
|
O |
|
H |
|
|
|
|
O |
|
H |
|
|
|
|
O |
|
H |
|
|
|
|
O |
|
H |
|||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C |
|
|
|
C |
C N |
C |
|
|
|
C |
C N |
C |
|
|
|
C |
C N |
C |
|
|
|
C |
C N |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
N |
|
|
|
|
C |
|
|
N |
|
|
|
|
C |
|
|
N |
|
|
|
|
C |
|
|
N |
|
|
|
|
C |
|
|||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||
|
|
H |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
H |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
H |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
H |
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||
|
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
O |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||
|
O |
|
|
|
H |
|
O |
|
|
|
H |
|
O |
|
|
|
H |
|
O |
|
|
|
H |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
N |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
N |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
N |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
N |
|||||||||||||
|
C N C |
|
|
|
|
C N C |
|
|
|
|
C N C |
|
|
|
|
C N C |
|
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
C |
C |
|
C |
C |
|
C |
C |
|
C |
C |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
H |
O |
|
|
|
|
H |
O |
|
|
|
|
H |
O |
|
|
|
|
H |
O |

– складчатый слой
|
O |
H |
|
O |
H |
|
O |
H |
|
O |
H |
C |
C |
C N |
C |
C |
C N |
C |
C |
C N |
C |
C |
C N |
N |
C |
N |
C |
N |
C |
N |
C |
||||
|
H |
O |
|
H |
O |
|
H |
O |
|
H |
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
||||
|
O |
H |
|
O |
H |
|
O |
H |
|
O |
H |
|
C N C |
N |
|
C N C |
N |
|
C N C |
N |
|
C N C |
N |
|
C |
C |
C |
C |
C |
C |
C C |
||||
|
H |
O |
|
H |
O |
|
H |
O |
|
H |
O |
|
O |
H |
|
O |
H |
|
O |
H |
|
O |
H |
C |
C |
C N |
C |
C |
C N |
C |
C |
C N |
C |
C |
C N |
N |
C |
N |
C |
N |
C |
N |
C |
||||
|
H |
O |
|
H |
O |
|
H |
O |
|
H |
O |
|
|
|
|
|
|
|
|

Характеристики β-складчатого слоя
•Повторяющаяся вторичная структура: 2 а.к.о. на период; шаг - 0.65-0.7 нм, на один а.к.о. приходится 0.32-0.35 nm
•Торсионные углы: φ= -45 до -180 º and ψ=+110 до +180º
•Образуется разными частями последовательности
•Может быть параллельным и антипараллельным
•Водородные связи – межцепочечные
•Боковые радикалы а.к.о., участвующие в образовании водородных связей, находятся на противоположных сторонах цепей и не взаимодействуют друг с другом




β-поворот

Антипараллельный |
Тройная спираль |
||||
β-слой |
|
||||
Параллельный |
коллагена |
β-поворот |
|||
|
β-слой
Левая α-спираль
Правая α-спираль