Ферменты, осуществляющие сайт-специфическую РК: сайт-специфические топоизомеразы типа I
А. Интегразы
Обеспечивают интеграцию/дезинтеграцию (инсерцию/делецию) по прямым повторам участков ДНК у прокариот и низших эукариот.
Создают разрыв-перевоссоединение в одной паре цепей двух дуплексов c образованием 3’-P, который ковалентно прикрепляется к остатку Tyr фермента, и 5’-OH концов, а позднее – разрыв-перевоссоединение во второй паре.
Вгруппу входят гомологичные белки:
•Сre-белок фага P1.
•Интеграза фага λ и других умеренных фагов.
•Белок, катализирующий сайт-специфическую РК в 2- микронной плазмиде дрожжей.
38
Ферменты, осуществляющие сайт-специфическую РК: сайт-специфические топоизомеразы типа I
Б. Инвертазы
•Осуществляют инверсии специальных сегментов хромосом, ограниченных обращенными повторами длиной ок. 30 п.н., меняют ориентацию локализованных в этих сегментах генов относительно их промоторов и переключают гены.
•Создают разрыв-перевоссоединение в обеих парах цепей двух дуплексов одновременно, , т. е. одновременно расщепляют все четыре цепи, образуя 5’-P и 3’-OH-концы.
•Разрывы цепей в каждом дуплексе происходят на расстоянии 2 п.н., так что 3’-конец как бы выступает. 5’-P-концы ковалентно связываются с остатком Ser фермента.
•Входят в систему Din (от DNA inversions) сайт-специфических инверсий ДНК кишечных бактерий и их фагов:
-переключение генов поверхностного антигена (флагеллина) у S. typtimurium - борьба с иммунной системой хозяина. Инвертаза Hin;
-переключение генов, кодирующих белки хвостовых отростков у фагов Mu (инвертаза Gin) и P1 – смена хозяев.
•гомологичны между собой на 60-70%, заменяют друг друга при РК in
vitro. |
39 |
Жизненный цикл ретротранспозонов c LTR
40
Размножение ретротранспозона L1 человека
(без LTR)
Выбор места встраивания и обратная транскрипция сопряжены
41
Функция ретротранспозонов без LTR –
удлинение концов хромосом дрозофилы с участием РНК-интермедиата
42