
- •Пути передачи биологической информации
- •Аминокислоты (АК)
- •Трехбуквенные и однобуквенные обозначения аминокислот
- •Кислотно-основные свойства аминокислот
- •Аминокислотный состав белков
- •Заменимые и незаменимые аминокислоты
- •Редкие аминокислоты, входящие в состав белков
- •Аминокислоты, не встречающиеся в белках
- •Что определило такой набор аминокислот в составе белков?
- •Пространственная организация белковой молекулы
- •Первичная структура белка
- •Анализ первичной структуры белковых молекул
- •Вторичная структура белка
- •Особенности пептидной связи, определяющие формирование регулярной пептидной структуры
- •Стерические ограничения, возникающие при формировании полипептидной цепи
- •Типы вторичной структуры белка
- •Альфа спираль
- •Свойства α-спирали (1)
- •Свойства α-спирали (2)
- •Коллагеновая спираль
- •Бета-структуры
- •Параллельный и антипараллельный β-слои
- •Бета-изгиб
- •Методы, применяемые для анализа вторичной структуры белковых молекул
- •Супервторичная структура (мотив)
- •Супервторичные структуры
- •Супервторичные структуры
- •Супервторичные структуры
- •Супервторичные структуры
- •Типы β-бочонков

Свойства α-спирали (1)
•Длина α-спирали в глобулярных белках – 6-24 аминокислот, в фибриллярных - много больше (α-кератин, тропомиозин).
•Возможности образования водородных связей между пептидными группами в α- спирали использованы сполна.
•Зеркально-симметричная относительно αR-спирали левая α-спираль (αL) встречается в природе крайне редко, хотя энергетически возможна.

Свойства α-спирали (2)
•Формирование гидрофильных и гидрофобных гребней на поверхности а-спирали:
а-спираль может быть чисто гидрофобной, что характерно для трансмембранных белков, или амфифильной (амфипатическойamphipathic), т.е. обладающей гидрофильной и гидрофобной сторонами.
•Трансмембранные части белков в большинстве являются α-спиралями.

Коллагеновая спираль
•Левая спираль;
•Число остатков на виток – 3;
•Структурные повторы
•(Gly-Х-Y), где часто Х=Pro;
•По строению схожа с L- полипролиновой спиралью;
•В отличие от α-спирали образование водородных связей здесь невозможно;
•Структура стабилизирована за счет скручивания трех пептидных цепей в правую тройную суперспираль (тропоколлаген);
•Gly – в центре суперспирали.

• В β-структурах плоскости |
|
Бета-структуры |
|
пептидных связей |
|
||
расположены в |
|
|
|
пространстве подобно |
|
|
|
равномерным складкам |
|
|
|
листа бумаги; |
|
|
|
|
|
|
|
•Стабилизация - за счет образования поперечных межцепочечных водородных связей;
•R-группы направлены почти перпендикулярно средней плоскости листа, попеременно вверх и вниз;
•Жесткие структуры;
•Не обладают дипольным моментом