Анализ первичной структуры белковых молекул

•Доказательства индивидуальности белка;

•Причины возникновения микрогетерогенности белков:

–Внутренние разрывы п/п цепи за счет действия протеаз;

–Неоднозначность посттрансляционной модификации;

–Дезаминирование отдельных ак остатков Asn, реже Gln;

–Функциональная гетерогенность, обусловленная функционированием аллельных генов или альтернативным сплайсингом.

•Определение аминокислотного состава белка

•Определение аминокислотной последовательности белка (пептида) методом Эдмана

-Инсулин – первый «расшифрованный» белок, Фредерик Сенгер (Нобелевская премия по химии 1958г.)

•Методы протеомики –

-двумерный гель-электрофорез (распределение по молекулярной массе и изоэлектрической точке),

-масс-спектрометрия в комбинации с протеолитическим расщеплением и HPLC анализом

Вторичная структура белка

•Вторичной структурой белковой молекулы называется пространственное расположение атомов главной цепи молекулы белка на ее участках.

•Два вида вторичной структуры:

–регулярная,

–нерегулярная.

Пространственное строение полипептидной цепи может быть представлено, как последовательность плоских элементов – пептидных группировок

•Пептидные группировки соединяются через Сαатомы.

•Связи N-Сα и Сα-С являются шарнирными, вокруг которых происходит вращение пептидных группировок .

С-конец

N-конец