Добавил:
Nemo_Nemorino
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз:
Предмет:
Файл:Хроматин презентации / Lecture_5_2019.pptx
X
- •Инактивация генов
- •В клетках многоклеточных организмов большая часть генома неактивна
- •Существует несколько путей инактивации генов, которые не являются взаимоисключающими
- •trxG Pвкл
- •Транскрипционные репрессоры, как и активаторы состоят из ДНК-связывающего и эффекторного доменов
- •Большинство репрессоров работает при посредстве привлекаемых ко-репрессоров
- •Ключевую роль в долговременной репрессии структурных генов играют белки группы Polycomb
- •Polycomb (PcG) proteins:
- •Конститутивный и факультативный гетерохроматин
- •How does heterochromatin spread?
- •ограничение подвижности нуклеосом может быть важнее, чем просто компактизация хроматиновой фибриллы
- •факультативный гетерохроматин
- •У Дрозофилы комплексы Polycomb связываются с особыми регуляторными участками – Polycomb Response Elements,
- •У человека EED-EZH2
- •аналог белка Polycomb Дрозофилы (хромомодомен) компактизация хроматина
- •PRC1 человека
- •модулирует активность метилазы
- •свободный от модификаций H3 (31-42) и H3K27-met3 стимулируют EZH2 метилазу
- •Привлечение комплексов Polycomb к ДНК
- •Посадка PRC1 на H3K27met3
- •Распределение РС белков и потенциальных рекруитирующих факторов в протяженном сегменте хромосомы 3 Дрозофилы
- •Как осуществляется репрессия
- •Во многих случаях гены, инактивированные Polycomb, содержат инициированную Pol II в состоянии паузы.
- •Пространственная организация репрессорных комплексов
- •Воспроизведение профилей репрессии после клеточного деления
- •В клетке нет ничего, что являлось бы абсолютно неизменным. Неактивные домены достаточно стабильны,
- •The nucleus is bounded by double membrane, the Nuclear Envelope, that is continuous
- •Rod domain (coiled coil)
- •Ядерная ламина механически связана как с цитоскелетом, так и с хроматином
- •Связанные с ламиной участки генома можно пометить с использованием Dam метилазы, слитой с
- •Домены, ассоциированные с ядерной ламиной (LAD)
- •Внутри LAD находятся неактивные модификации хроматина. На границах – Сайты связывания CTCF. Рядом
- •Существуют также хроматиновые домены, ассоциированные с ядрышком, (NAD), которые в значительной мере перекрываются
- •ГИСТОНОВЫЙ КОД
- •утверждение о том, что в активном хроматине гистоны ацетилированы, а в неактивном метилированы
- •ацетилирование любых гистонов по любым позициям
- •Set 2 – H4K36 methylation – recruitment of histone deacetylases
- •PTM crosstalk in cis
- •Взаимоисключающие модификации in situ (в той же позиции)
- •взаимное влияние модификаций одного и того же гистона (crosstalk in cis)
- •Как правило, активные и неактивные модификации гистонов сегрегированы в разных геномных областях (эухроматин
- •Цветовая кодировка типов хроматина (Filion et. al., Cell Cell 143, 212–224; в основе
- •красный хроматин: Brahma (BRM), Mediator, GAGA factor, CTCF…
- •Kharchenko, Peter V. et al, 2010, Nature 471.7339: 480–485.
- •state 1, red
- •Chromatin colors in human cells
- •number of domains
утверждение о том, что в активном хроматине гистоны ацетилированы, а в неактивном метилированы не является верным
Метилирование по некоторым позициям (например K4 гистона Н3) является типичным для активного хроматина
P (работающий промотор)
энхансер
H3K4 1/2-meth |
H3K4 3-meth |
|
ацетилирование любых гистонов по любым позициям
метилирование аргинина
метилирование лизина
Н3К4 триметилирование
Н3К4 моно/диметилирование
Н3К9 ди- и триметилирование
Н3К27 триметилирование
АКТИВНЫЙ ХРОМАТИН
АКТИВНЫЙ ХРОМАТИН
ЗАВИСИТ ОТ ПОЗИЦИИ
ПРОМОТОРЫ
ЭНХАНСЕРЫ
ГЕТЕРОХРОМАТИН
(обычно конститутивный)
ГЕТЕРОХРОМАТИН
(обычно факультативный)
Set 2 – H4K36 methylation – recruitment of histone deacetylases
PTM crosstalk in cis
H3K36me3
H3K36me3
Взаимоисключающие модификации in situ (в той же позиции)
метилирование |
метилирование |
ацетилирование |
взаимное влияние модификаций одного и того же гистона (crosstalk in cis)
в то же PRMT1
удаляет
Соседние файлы в папке Хроматин презентации