Метилирование ДНК – самая стабильная эпигенетическа модификация
me |
me |
CpG |
CpG |
Most
me
me |
me |
Интегрированные в клеточный геном метилированные последовательности ДНК (CpG метилирование) остаются метилированными после ряда клеточных делений
Интегрированные в клеточный геном неметилированные последовательности ДНК остаются неметилированными
BISULFIT SEQUENCING
m m m m
e.g. TAGCGGGCCCGTTGTCGGTCG
TAGUGGGUUUGTTGTUGGTUG nonmethylated C are converted to U upon bisulfite treatment
If C was methylated and then bisulfite treated it remains unchanged:TAGCGGGUUCGTTGTCGGTCG
acBio platform позволяет определять позиции метилированных оснований епосредственно по ходу сиквенирования
MBD domain – связывание с метилированными CpG динуклеотидами
MBD1 is involved in directing histone methylation to sites of DNA methylation
MeCP2 has roles in eterochromatin clustering hrough histone methylation nd nucleosome remodeling
eCP2 is also able to oordinate histone methylation nd histone deacetylation at
e same methylated loci via ofactor interactions
uch as to CoREST
BD2 directs transcriptional pression through the uRD/Mi-2 complex binding rtner that enables histone acetylation and nucleosome modeling
MBD3 also interacts with th NuRD/Mi-2 complex and couples this with DNA methylation. MBD3′s DNA interaction at target promoters is mediated through transcription factor recruitment
MBD4 maintains correct DN methylation by repairing spontaneous 5-mC→T transitions to C and interacting with DNMTs t
o guide remethylation
MeCP2 is able to silence select genes by creating chromatin loops via the aid of chromatin remodeler ATRX and CTCF-Cohesin
MBD1 is associated with th fork via CAF1 and ensures correct histone methylation associated with DNA methylation
я метилирование ДНК традиционно рассматривается как репрессивная модификац чение метилирования зависит от контекста.
екоторых случаях метилирование ДНК позитивно коррелирует с транскрипцией
ы связывания транскрипционных факторов, узнаваемые при наличии илирования и при отсутствии метилирования могут различаться по консен едовательности
гены, уровень экспрессии которых позитивно коррелирует с метилированием
гены, уровень экспрессии которых негативно коррелирует с метилированием
