Упаковка генома тесно увязана с функциональной компартментализацией клеточного ядра

Nuclear bodies

Not visible in light microscope without specific staining (except nucleolus)

Some of them contain DNA, and others do not

Highly dynamic and regulated structure, rapid diffusion of the components

Ядрышко – единственный ядерный компартмент, который можно увидеть в световой микроскоп без специальной окраски

Основной функцией ядрышек является синтез рибосомной РНК и сборка рибосом

В последние годы сделан ряд наблюдений, показывающих, что ядрышко выполняет и другие функции:

регуляция клеточного цикла

координация клеточного ответа на различные стрессы

процессинг и экспорт из ядра некоторых мРНК биосинтез (или внесение модификаций в) РНК, входящей в

состав сигнальных частиц (которые ингибируют трансляцию)

биосинтез (или внесение модификаций в) РНК, входящей в состав теломеразы процессинг ряда других РНК, включая некоторые тРНК

Во время митоза ядрышко диспергируется. Компоненты грануллярного слоя остаются связанными с поверхностью конденсированных хромосом. FC и DFC остаются связанными с ядрышковым организатором (NOR). Транскрипция рДНК полностью прекращается только в метафазе. Возобновление работы Pol I инициирует процесс сборки ядрышка

Большинство ядерных компартментов можно увидеть только после окрашивания присутствующих в этих компартментах макромолекул

Nuclear bodies

Speckles, Interchromatin granule clusters (IGCs)

Storage/modification compartment for pre-mRNA splicing factors, including snRNPs and serine/arginine-rich (SR) proteins.

Enriched with MALAT1 lncRNA that influence the dynamics of SR-family splicing factors

Cajal bodies

Maturation of snRNPs and snoRNPs

3’ end processing of snRNAs and some other poly

A-minus transcripts (including histone gene transcripts)

Telomere maintenance