- •Вопросы к экзамену по биофизике, 2017: Дата: 3 июня, суббота!
- •1. Биофизика как наука. Предмет, задачи и объект исследования биофизики. Философские проблемы биофизики.
- •2. История становления биофизики как науки. Методы изучения в биофизике.
- •3. Термодинамические (тд) системы. Параметры состояния.
- •4. Внутренняя энергия, работа и тепло.
- •5. Обратимые и необратимые процессы.
- •6. Понятие термодинамического равновесия. Равновесные и неравновесные системы.
- •7. Первый закон термодинамики. История открытия. Формулировка, физический и биологический смысл.
- •8. Термодинамические функции состояния (термодинамический потенциал). Свободная энергия Гиббса. Примеры использования термодинамических представлений.
- •9. Энтальпия. Закон Гесса. Примеры использования в биологических системах.
- •Виды теплоты, теплопродукция. Удельная теплопродукция. Примеры.
- •11.Второе начало термодинамики. История открытия. Формулировка, физический и биологический смысл.
- •12. Энтропия. Свойства энтропии. Её физический и биологический смысл с позиций термодинамики и молекулярной физики.
- •13. Изменение энтропии в открытых системах. Определение скорости продукции энтропии в открытых системах.
- •Работоспособность биологических систем. Градиенты.
- •Баланс энтропии при росте и развитии организмов.
- •Сравнительная характеристика стационарного состояния и термодинамического равновесия.
- •18. Характеристики устойчивого и неустойчивого стационарного состояния системы. Диссипативная структура.
- •19. Скорость продуцирования энтропии вблизи стационарного состояния системы. Теорема Пригожина.
- •20. Общие свойства систем вблизи от термодинамического равновесия. Общие свойства систем вдали от термодинамического равновесия.
- •Флуктуации в термодинамической системе. Свойства и значения флуктуаций вблизи и вдали от термодинамического равновесия.
- •22. Феномен белка в биофизике. Уникальность строения и свойств белка.
- •23.Фибриллярные белки. Мембранные белки. Глобулярные белки. Характеристика, примеры.
- •24. Элементарные взаимодействия в белках: ковалентные, координационные связи в белках.
- •25. Силы Ван-дер-Ваальса, характеристика, примеры на белковых молекулах.
- •26. Энергия Ван-дер-Ваальсова взаимодействия: взаимодействие сил отталкивания и притяжения в белках, формула Леннард-Джонса.
- •Элементарные взаимодействия в белках: водородные связи, их характеристика.
- •Элементарные взаимодействия в белках: гидрофобные взаимодействия, их характеристика.
- •29. Первичная структура белка. Пептидная связь и её свойства. Пространственная конфигурация полипептидной цепи. Факторы её определяющие.
- •Вторичная структура белка. Типы вторичной структуры, их особенности.
- •31. Третичная структура белка, характеристика. Четвертичная структура белка, характеристика, отличия от агрегатов.
- •32. Общие закономерности, наблюдаемые в структуре белков. Мотивы укладки. Термодинамические характеристики образования структур белковых молекул.
- •33. Физическая теория фазовых переходов. Понятие фазового перехода. Типы фазовых переходов. Образование и разрушение пространственной структуры белка с позиции теории фазовых переходов.
- •34.Денатурация белка. Термодинамическая характеристика денатурации. Этапы денатурации белка. Механизмы денатурации. Способы денатурации. Ренатурация.
- •35. Строение атома, теории Томсона, Резерфорда. Первый и второй постулаты Бора. Атомные спектры.
- •Фотофизические и фотохимические превращения биосистем. Классификация фотобиологических процессов.
- •37. Физические аспекты поглощения света молекулами вещества при протекании фотобиологических процессов. Особенности строения хроматофорных групп, типы электронных переходов.
- •38. Фотофизическая дезактивация электронно-возбужденной молекулы. Типы. Характеристика.
- •39. Люминесценция. Фосфоресценция, флуоресценция. Классификация видов люминесценции в зависимости от вида возбуждения.
- •40. Механизмы люминесценции. Возможные варианты протекания этого процесса. Правило Стокса. Энергетический выход, закон Вавилова.
- •Применение люминесценции в биологии и медицине.
- •Лазеры. Типы лазеров. Определение. Принцип действия лазера. Инверсная нацеленность. Активная среда. Системы возбуждения.
- •43. Особенности лазерного излучения.
- •Первичные механизмы и биологическое действие лазерного излучения.
- •45. Изменения свойств ткани и ее температуры под действием непрерывного мощного лазерного излучения. Фазы.
- •46.Использование лазерного излучения. Лазерная диагностика. Лазерное излучение в биологии, в терапии и хирургии.
- •47.Рентгеновское излучение. Общие понятия, история открытия. Источники рентгеновского излучения.
- •48. Тормозное рентгеновское излучение, характеристика. Спектр тормозного рентгеновского излучения.
- •49. Характеристическое рентгеновское излучение, характеристика. Спектр характеристического рентгеновского излучения. Закон Мозли.
- •50. Взаимодействие рентгеновского излучения с веществом. Закон ослабления. Физические основы использования рентгеновского излучения в биологии и медицине.
- •51. Радиоактивность. История открытия. Основной закон радиоактивного распада. Постоянная распада. Период полураспада. Активность.
- •52. Основные виды радиоактивного распада. Характеристика.
- •53.Количественные характеристики взаимодействия ионизирующего излучения с веществом (линейная тормозная способность вещества, линейная плотность ионизации, средний линейный пробег).
- •54. Биофизические основы действия ионизирующего излучения. Основные стадии. Общие закономерности биологической стадии.
- •55. Естественная и искусственная радиоактивность. Примеры.
- •Биологические эффекты доз облучения, предельные дозы.
13. Изменение энтропии в открытых системах. Определение скорости продукции энтропии в открытых системах.
dS=diS+deS.
diS>=0 (никогда не бывает отрицательной).
deS=0только в изолированной системе(стационарное состояние); в закрытых и открытых системахdeS ≠ 0.
Энтропия возрастает во всех реальных термодинамических процессах.
(Неравенство dS≥ 0 выражает второе начало ТД)
В живых системах S возрастает или уменьшается. Всякое уменьшение энтропии требует участия внешних сил, => энтропия внешней системы (взаимодействующей) будет возрастать. Возрастание энтропии самопроизвольно и необратимо.
*каждой системе свойственна тенденция к самопроизвольному переходу в состояние maxмолекулярного беспорядка, т.е. каждая система стремится к разупорядоченности.
Второе начало ТД для открытых систем:
deS/dt ˃ 0 показывает увеличение энтропии системы в результате того, что в организм постоянно поступает поток вещества и энергии.
deS/dt ˂ 0 означает, что отток энтропии из организма превышает ее приток.
Величина diS/dt , обусловленная процессами происходящими внутри организма и выделением теплоты в окружающую среду,может принимать любое положительное значение.
При условии, что diS/dt ˃ 0 , возможны следующие три случая:
1. dS/dt ˃ 0:
1.1. deS/dt ˃ 0
1.2. deS/dt ˂ 0, но diS/dt ˃ deS/dt: скорость производства энтропии внутри организма будет превышать скорость обмена энтропией с окружающей средой
2. dS/dt ˂ 0
deS/dt ˂ 0
deS/dt ˃ diS/dt
Общее изменение энтропии в системе становится отрицательным, т.е. скорость обмена энтропией с окружающей средой превышает скорость производства энтропии внутри организма.
Отток из организма положительной энтропии или приток из окружающей среды отрицательной энтропии.
Только при ЭТОМ условии обмена энтропией с внешней средой возможно существование и усложнение живых организмов в процессе эволюции.
3. dS/dt = 0
deS/dt ˂ 0
Скорость обмена энтропией с окружающей средой равна скорости производства энтропии за счет внутренних биофизических и биохимических процессов.
Установление в системе стационарного состояния.
Увеличение энтропии системы за счет происходящих в ней необратимых процессов компенсируется притоком отрицательной энтропии при взаимодействии системы с внешней средой.
Баланс S при росте и развитии организмов:рост и развитие – непрерывное снижение скорости продуцирования S, отнесенной к единице массы объекта: dS = diS + deS< 0.Снижается и достигает минимальных значений в конечном стационарном состоянии (при ТД равновесии).
Уменьшение скорости теплопродукции (dβ/dt) = уменьшение скорости продуцирования энтропии (dS/dt).
Благодаря более интенсивным процессам обмена веществ отток энтропии превышает ее продукцию:deS/dt ˃ diS/dt.
Старение сопровождается возрастанием энтропии! dS = diS + deS> 0; diS/dt>deS/dt.
Жизнь – это постоянная борьба против тенденции к возрастанию энтропии.
Работоспособность биологических систем. Градиенты.
Работоспособность биологических систем, обусловленная наличием свободной энергии, определяется градиентами, которые являются результатом неравновесного распределения вещества в биологической системе и непрерывного переноса его молекул из одной части системы в другую.
Работа биологической системы происходит за счет реализации энергии каких-либо градиентов. Поэтому отсутствие градиентов означает смерть организма.
Биологические системы обладают разнообразными градиентами:
концентрационный - возникает при условии наличия значительной разницы в концентрации ионов во внутренней и внешней среде;
осмотический - характеризует разницу в величине осмотического давления в системе растворитель - раствор, разделенных полупроницаемой мембраной, т. е. проницаемой для молекул растворителя, но непроницаемой для растворенного вещества;
электрический - характеризует движение ионов в сторону их противоположного заряда.
Термодинамические потоки
Процесс жизнедеятельности определяют потоки: осмотический, электрический, тепловой, диффузионный…которые характеризуются градиентами соответствующих величин.
Н-р: интенсивность диффузионного потока пропорциональна градиенту концентрации вещества:
В живых организмах градиенты определяют потоки. Градиенты, вызывающие в системе потоки веществ, теплоты, зарядов, называются термодинамическими силами.
