- •Вопросы к экзамену по биофизике, 2017: Дата: 3 июня, суббота!
- •1. Биофизика как наука. Предмет, задачи и объект исследования биофизики. Философские проблемы биофизики.
- •2. История становления биофизики как науки. Методы изучения в биофизике.
- •3. Термодинамические (тд) системы. Параметры состояния.
- •4. Внутренняя энергия, работа и тепло.
- •5. Обратимые и необратимые процессы.
- •6. Понятие термодинамического равновесия. Равновесные и неравновесные системы.
- •7. Первый закон термодинамики. История открытия. Формулировка, физический и биологический смысл.
- •8. Термодинамические функции состояния (термодинамический потенциал). Свободная энергия Гиббса. Примеры использования термодинамических представлений.
- •9. Энтальпия. Закон Гесса. Примеры использования в биологических системах.
- •Виды теплоты, теплопродукция. Удельная теплопродукция. Примеры.
- •11.Второе начало термодинамики. История открытия. Формулировка, физический и биологический смысл.
- •12. Энтропия. Свойства энтропии. Её физический и биологический смысл с позиций термодинамики и молекулярной физики.
- •13. Изменение энтропии в открытых системах. Определение скорости продукции энтропии в открытых системах.
- •Работоспособность биологических систем. Градиенты.
- •Баланс энтропии при росте и развитии организмов.
- •Сравнительная характеристика стационарного состояния и термодинамического равновесия.
- •18. Характеристики устойчивого и неустойчивого стационарного состояния системы. Диссипативная структура.
- •19. Скорость продуцирования энтропии вблизи стационарного состояния системы. Теорема Пригожина.
- •20. Общие свойства систем вблизи от термодинамического равновесия. Общие свойства систем вдали от термодинамического равновесия.
- •Флуктуации в термодинамической системе. Свойства и значения флуктуаций вблизи и вдали от термодинамического равновесия.
- •22. Феномен белка в биофизике. Уникальность строения и свойств белка.
- •23.Фибриллярные белки. Мембранные белки. Глобулярные белки. Характеристика, примеры.
- •24. Элементарные взаимодействия в белках: ковалентные, координационные связи в белках.
- •25. Силы Ван-дер-Ваальса, характеристика, примеры на белковых молекулах.
- •26. Энергия Ван-дер-Ваальсова взаимодействия: взаимодействие сил отталкивания и притяжения в белках, формула Леннард-Джонса.
- •Элементарные взаимодействия в белках: водородные связи, их характеристика.
- •Элементарные взаимодействия в белках: гидрофобные взаимодействия, их характеристика.
- •29. Первичная структура белка. Пептидная связь и её свойства. Пространственная конфигурация полипептидной цепи. Факторы её определяющие.
- •Вторичная структура белка. Типы вторичной структуры, их особенности.
- •31. Третичная структура белка, характеристика. Четвертичная структура белка, характеристика, отличия от агрегатов.
- •32. Общие закономерности, наблюдаемые в структуре белков. Мотивы укладки. Термодинамические характеристики образования структур белковых молекул.
- •33. Физическая теория фазовых переходов. Понятие фазового перехода. Типы фазовых переходов. Образование и разрушение пространственной структуры белка с позиции теории фазовых переходов.
- •34.Денатурация белка. Термодинамическая характеристика денатурации. Этапы денатурации белка. Механизмы денатурации. Способы денатурации. Ренатурация.
- •35. Строение атома, теории Томсона, Резерфорда. Первый и второй постулаты Бора. Атомные спектры.
- •Фотофизические и фотохимические превращения биосистем. Классификация фотобиологических процессов.
- •37. Физические аспекты поглощения света молекулами вещества при протекании фотобиологических процессов. Особенности строения хроматофорных групп, типы электронных переходов.
- •38. Фотофизическая дезактивация электронно-возбужденной молекулы. Типы. Характеристика.
- •39. Люминесценция. Фосфоресценция, флуоресценция. Классификация видов люминесценции в зависимости от вида возбуждения.
- •40. Механизмы люминесценции. Возможные варианты протекания этого процесса. Правило Стокса. Энергетический выход, закон Вавилова.
- •Применение люминесценции в биологии и медицине.
- •Лазеры. Типы лазеров. Определение. Принцип действия лазера. Инверсная нацеленность. Активная среда. Системы возбуждения.
- •43. Особенности лазерного излучения.
- •Первичные механизмы и биологическое действие лазерного излучения.
- •45. Изменения свойств ткани и ее температуры под действием непрерывного мощного лазерного излучения. Фазы.
- •46.Использование лазерного излучения. Лазерная диагностика. Лазерное излучение в биологии, в терапии и хирургии.
- •47.Рентгеновское излучение. Общие понятия, история открытия. Источники рентгеновского излучения.
- •48. Тормозное рентгеновское излучение, характеристика. Спектр тормозного рентгеновского излучения.
- •49. Характеристическое рентгеновское излучение, характеристика. Спектр характеристического рентгеновского излучения. Закон Мозли.
- •50. Взаимодействие рентгеновского излучения с веществом. Закон ослабления. Физические основы использования рентгеновского излучения в биологии и медицине.
- •51. Радиоактивность. История открытия. Основной закон радиоактивного распада. Постоянная распада. Период полураспада. Активность.
- •52. Основные виды радиоактивного распада. Характеристика.
- •53.Количественные характеристики взаимодействия ионизирующего излучения с веществом (линейная тормозная способность вещества, линейная плотность ионизации, средний линейный пробег).
- •54. Биофизические основы действия ионизирующего излучения. Основные стадии. Общие закономерности биологической стадии.
- •55. Естественная и искусственная радиоактивность. Примеры.
- •Биологические эффекты доз облучения, предельные дозы.
35. Строение атома, теории Томсона, Резерфорда. Первый и второй постулаты Бора. Атомные спектры.
Теория Томпсона («Кекс с изюмом») 1903 год: Атом представляет собой электронейтральную сферу, в которой в облаке положительного заряда, равного размеру атома, содержатся маленькие, отрицательно заряженные «корпускулы», суммарный электрический заряд которых равен заряду положительно заряженного облака, обеспечивая электронейтральность атомов.
Теория Резерфорда (Планетарная модель атома): В центре атома находится положительно заряженное ядро с зарядом Z (порядковый номер элемента), по круговым орбитам вращаются отрицательно заряженные электроны.
Недостатки:
Центростремительная, сила, удерживающая электрон на орбите радиусом г, представляет кулоновскую силу притяжения электрона к ядру:
где εо = 8,85 • 10-12 Ф/м — электрическая постоянная; m — масса электрона, кг; v — скорость электрона на орбите, м/с. Энергия электрона должна постепенно убывать, а вместе с ней и скорость вращения электрона вокруг ядра. Электрон в конце концов должен упасть на ядро. Однако атомы — достаточно устойчивые образования и могут существовать миллиарды лет.
Постулаты Бора:
1) Условие стационарности:
электрон в атоме может находится только
в некоторых определенных устойчивых
состояниях, называемых стационарными,
или квантовыми, каждому из которых
соответствует определенная энергия. В
этих состояниях атом не излучает.
Из
всех возможных состояний в атоме
реализуются только те, для которых
момент импульса равен целому числу
постоянных Планка (h=6,63*10-34
Дж/с), деленных на
.
Условие
квантования орбит:
2) При переходе из 1 стационарного
состояния в другое атом излучает и
поглощает энергию электромагнитного
излучения определенными порциями –
квантами или фотонами. Условие частот:
Атомные спектры
– спектры испускания электромагнитных
волн одиночными атомами. Обусловленные
электронными переходами между
стационарными орбитами. При переходе
с одной орбиты на другую излучается или
поглощается квант энергии с определенной
частотой:
При переходе с внешней орбиты на первую – серия Лаймана, частоты в УФ области. При переходе с любой внешней на вторую – серия Бальмера, ближняя УФ и видимая область. При переходе с любой внешней на третью – серия Пашена, инфракрасная область. При переходе с любой внешней орбиты на четвертую – серия Брэкета, далекая инфракрасная область.
Фотофизические и фотохимические превращения биосистем. Классификация фотобиологических процессов.
Фотобиологическими называют процессы, начинающиеся с поглощения света биологическим соединением и заканчивающиеся определенной физиологической реакцией организма. Фотохимические и фотофизические процессы являются ключевыми в жизнедеятельности биосистем. Подавляющее большинство фотобиологических реакций относятся к эндергоническим.
Фотохимическими реакциями называют такие химические реакции, которые протекают только под воздействием света. Начальной стадией любой фотохимической реакции является поглощение фотона, которое переводит молекулу в возбужденное состояние. Энергия фотонного возбуждения составляет несколько электрон-вольт, в то время как энергия теплового возбуждения при обычных температурах не превышает нескольких сотых электронвольта (Ефот >> Етепл). Высокая энергия фотовозбуждения и обусловливает возможность протекания таких реакций, которые в обычных условиях неосуществимы. Фотонное возбуждение молекулы запускает один из двух возможных механизмов изменения ее химических свойств, каждый из которых затем порождает цепочку обычных химических превращений.
В возбужденной молекуле появляется электрон на высоко расположенной свободной орбитали. Такой электрон легко отделяется от молекулы, и она вступает в реакции фотоокисления. В этом случае возбужденная молекула становится донором электрона.
Типичными донорами являются возбужденные молекулы триптофана и тирозина (ароматические аминокислоты).
C другой стороны, после перехода электрона на один из верхних энергетических уровней на основной орбитали S0 образуется вакансия, в результате чего молекула может вступить в восстановительную реакцию с подходящим донором. В этом случае она становится акцептором электрона. Примером такой реакции служит фотовосстановление хлорофилла.
Продукты первичных окислительно-восстановительных реакций являются свободными радикалами (имеют неспаренный электрон) и обладают высокой химической активностью. Они вступают во вторичные реакции, которые и заканчиваются соответствующей физиологической реакцией.
Энергия света необходима для преодоления активационных барьеров и химических превращения.
Функции света в живых системах:
1 Энергетическая – обеспечение живых систем свободной энергией солнца.
2 Информационная – обеспечение взаимодействия живых систем с окружающей средой.
Классификация фотобиологических процессов.
А) с энергетической т.з.
Эндергонические фотобиологические реакции – реакции, в результате которых образуются фотопродукты, обладающие большими запасами свободной энергии. Эти запасы больше, чем у исходных веществ. Смысл: превращение световой энергии в химическую.
Экзергонические фотобиологические реакции – идут с уменьшением или без существенного изменения свободной энергии системы (большинство фотобиологический реакции, например, зрение).
В) с функционально-физиологической т.з (биологической стороны):
Энергетические фотобиологические р-ции (АТФ)
Информационные фотобиологические р-ции – кванты света по средством образования продуктов запускают усиленные механизмы, организм получает информацию. Например, токсины, зрение у животных, тропизмы, периодизмы.
Фотобиосинтетические реакции – отдельные промежуточные стадии последовательных реакций синтеза (например, витамина D, хлорофилла, активация ферментативных систем, синтез пигментов).
Деструктивно – модифицирующие фотобиологические реакции – свет повреждает молекулы объекта, индукция химических процессов приводит к повреждению или гибели клеток (организма). Наряду с этим может быть стимуляция или модификация жизненных процессов. Большинство фотобиологических реакций относятся к деструктивно-модифицирующим. Их разделяют на: летальные, мутационные, патофизиологические.
Общая схема фотобиологических процессов.
Отдельный фотобиологический процесс представляет собой сложную последовательность различных стадий :
1. Поглощение энергии фотона хромофорной группой биомолекулы и образование электронно-возбужденных состояний системы
2. Миграция энергии электронного возбуждения
3. Первичный фотофизический акт и появление первичных фотопродуктов
4. Промежуточные стадии, включающие перенос заряда
5. Образование стабильных химических продуктов
6. Физиолого-биохимические процессы
7. Конечный фотобиологический эффект.
Первичные фотохимические продукты (молекулы в электронно-возбужденном состоянии, свободные радикалы) крайне неустойчивы и быстро переходят либо в исходные вещества, либо в устойчивые фотопродукты.
