- •Вопросы к экзамену по биофизике, 2017: Дата: 3 июня, суббота!
- •1. Биофизика как наука. Предмет, задачи и объект исследования биофизики. Философские проблемы биофизики.
- •2. История становления биофизики как науки. Методы изучения в биофизике.
- •3. Термодинамические (тд) системы. Параметры состояния.
- •4. Внутренняя энергия, работа и тепло.
- •5. Обратимые и необратимые процессы.
- •6. Понятие термодинамического равновесия. Равновесные и неравновесные системы.
- •7. Первый закон термодинамики. История открытия. Формулировка, физический и биологический смысл.
- •8. Термодинамические функции состояния (термодинамический потенциал). Свободная энергия Гиббса. Примеры использования термодинамических представлений.
- •9. Энтальпия. Закон Гесса. Примеры использования в биологических системах.
- •Виды теплоты, теплопродукция. Удельная теплопродукция. Примеры.
- •11.Второе начало термодинамики. История открытия. Формулировка, физический и биологический смысл.
- •12. Энтропия. Свойства энтропии. Её физический и биологический смысл с позиций термодинамики и молекулярной физики.
- •13. Изменение энтропии в открытых системах. Определение скорости продукции энтропии в открытых системах.
- •Работоспособность биологических систем. Градиенты.
- •Баланс энтропии при росте и развитии организмов.
- •Сравнительная характеристика стационарного состояния и термодинамического равновесия.
- •18. Характеристики устойчивого и неустойчивого стационарного состояния системы. Диссипативная структура.
- •19. Скорость продуцирования энтропии вблизи стационарного состояния системы. Теорема Пригожина.
- •20. Общие свойства систем вблизи от термодинамического равновесия. Общие свойства систем вдали от термодинамического равновесия.
- •Флуктуации в термодинамической системе. Свойства и значения флуктуаций вблизи и вдали от термодинамического равновесия.
- •22. Феномен белка в биофизике. Уникальность строения и свойств белка.
- •23.Фибриллярные белки. Мембранные белки. Глобулярные белки. Характеристика, примеры.
- •24. Элементарные взаимодействия в белках: ковалентные, координационные связи в белках.
- •25. Силы Ван-дер-Ваальса, характеристика, примеры на белковых молекулах.
- •26. Энергия Ван-дер-Ваальсова взаимодействия: взаимодействие сил отталкивания и притяжения в белках, формула Леннард-Джонса.
- •Элементарные взаимодействия в белках: водородные связи, их характеристика.
- •Элементарные взаимодействия в белках: гидрофобные взаимодействия, их характеристика.
- •29. Первичная структура белка. Пептидная связь и её свойства. Пространственная конфигурация полипептидной цепи. Факторы её определяющие.
- •Вторичная структура белка. Типы вторичной структуры, их особенности.
- •31. Третичная структура белка, характеристика. Четвертичная структура белка, характеристика, отличия от агрегатов.
- •32. Общие закономерности, наблюдаемые в структуре белков. Мотивы укладки. Термодинамические характеристики образования структур белковых молекул.
- •33. Физическая теория фазовых переходов. Понятие фазового перехода. Типы фазовых переходов. Образование и разрушение пространственной структуры белка с позиции теории фазовых переходов.
- •34.Денатурация белка. Термодинамическая характеристика денатурации. Этапы денатурации белка. Механизмы денатурации. Способы денатурации. Ренатурация.
- •35. Строение атома, теории Томсона, Резерфорда. Первый и второй постулаты Бора. Атомные спектры.
- •Фотофизические и фотохимические превращения биосистем. Классификация фотобиологических процессов.
- •37. Физические аспекты поглощения света молекулами вещества при протекании фотобиологических процессов. Особенности строения хроматофорных групп, типы электронных переходов.
- •38. Фотофизическая дезактивация электронно-возбужденной молекулы. Типы. Характеристика.
- •39. Люминесценция. Фосфоресценция, флуоресценция. Классификация видов люминесценции в зависимости от вида возбуждения.
- •40. Механизмы люминесценции. Возможные варианты протекания этого процесса. Правило Стокса. Энергетический выход, закон Вавилова.
- •Применение люминесценции в биологии и медицине.
- •Лазеры. Типы лазеров. Определение. Принцип действия лазера. Инверсная нацеленность. Активная среда. Системы возбуждения.
- •43. Особенности лазерного излучения.
- •Первичные механизмы и биологическое действие лазерного излучения.
- •45. Изменения свойств ткани и ее температуры под действием непрерывного мощного лазерного излучения. Фазы.
- •46.Использование лазерного излучения. Лазерная диагностика. Лазерное излучение в биологии, в терапии и хирургии.
- •47.Рентгеновское излучение. Общие понятия, история открытия. Источники рентгеновского излучения.
- •48. Тормозное рентгеновское излучение, характеристика. Спектр тормозного рентгеновского излучения.
- •49. Характеристическое рентгеновское излучение, характеристика. Спектр характеристического рентгеновского излучения. Закон Мозли.
- •50. Взаимодействие рентгеновского излучения с веществом. Закон ослабления. Физические основы использования рентгеновского излучения в биологии и медицине.
- •51. Радиоактивность. История открытия. Основной закон радиоактивного распада. Постоянная распада. Период полураспада. Активность.
- •52. Основные виды радиоактивного распада. Характеристика.
- •53.Количественные характеристики взаимодействия ионизирующего излучения с веществом (линейная тормозная способность вещества, линейная плотность ионизации, средний линейный пробег).
- •54. Биофизические основы действия ионизирующего излучения. Основные стадии. Общие закономерности биологической стадии.
- •55. Естественная и искусственная радиоактивность. Примеры.
- •Биологические эффекты доз облучения, предельные дозы.
1. Биофизика как наука. Предмет, задачи и объект исследования биофизики. Философские проблемы биофизики.
Биофизика — наука о наиболее простых и фундаментальных взаимодействиях, лежащих в основе биологических процессов. Теоретическое построение и модели биофизики основаны на физических понятиях энергии, силы, типов взаимодействия, на общих понятиях физической и формальной кинетики, термодинамики, теории информации. Эти понятия отражают природу основных взаимодействий и законов движения материи, что, как известно, составляет предмет физики — фундаментальной естественной науки. В центре внимания биофизики как биологической науки лежат биологические процессы и явления. Основная тенденция современной биофизики — проникновение в самые глубокие, элементарные уровни, составляющие молекулярную основу структурной организации живого.
Общая Б.: Б. сложных систем ( –> кинетика и термодинамика живых систем), молекулярная Б. (–> строение и функционирование биол.макромолекул (белковые молекулы)).
Частная Б.: отдельные процессы, клеточные процессы, б. мышечных тканей, радиационная б.
Предмет Б. – Живые системы.
Объект Б. – Живые системы в сравнении с неживыми объектами природы.
Задача Б. – сведение биологических постулатов к физическим.
Отличия живых и неживых систем:
1. Высокая упорядоченность живых систем: дискретность и целостность (целое – нечто большее, чем ∑ составных частей); многоуровневая организация (на каждом уровне приобретаются новые свойства).
2. Способность к самовоспроизведению.
3. Способность к развитию в направлении усложнения организации и увеличения упорядоченности.
4. Феномен информации (в ЖС) – обменная величина, получение которой приводит к увеличению порядка у получателя; = обратная величина энтропии, то есть является отрицательной энтропией: I= -S. Условия:
1) источником информации м.б. только упорядоченная система
2) информация существует только при наличии получателя; а получатель – только упорядоченная структура
3) получение информации приводит к увеличению упорядоченности у получателя
5. Феномен целесообразности: любые структуры/процессы имеют свое назначение => функциональная упорядоченность.
Философская проблема: О возможности сведения всех законов к законам физики.
1.Редукционизм. Все законы ЖС можно свести к законам физики.
2. Антиредукционизм, Витализм. Законы ЖС принципиально не сводятся к физическим.
3. Дополнительность. В основе лежат физические законы, но существуют процессы и явления пока не объяснимые с точки зрения физики и химии.
2. История становления биофизики как науки. Методы изучения в биофизике.
История становления биофизики как науки.
Большую роль в развитии биофизики сыграла школа Лёба (1906 г). В работе Лёба были выявлены физико-химические основы явлений партеногенеза и оплодотворения. Конкретную физико-химическую интерпретацию получило явление антагонизма ионов.
Позднее появились классические исследования Шаде о роли ионных и коллоидных процессов в патологии воспаления. Эти исследования завершаются фундаментальным трудом «Физическая химия во внутренней медицине», которые издаётся в России в 1911–1912 гг.
Первая мировая война приостановила развитие биофизики как науки.
Но уже в 1922 году в СССР открывается «Институт биофизики», которым руководит П.П. Лазарев. Здесь он разрабатывает ионную теорию возбуждения, которая в это же время разрабатывается и Нернстом. Было установлено, что в явлениях возбуждения и проведения решающая роль принадлежит именно ионам.
С.И. Вавилов занимается вопросами предельной чувствительности глаза. В.Ю. Чаговец разрабатывает ионную теорию возникновения биопотенциалов, Н.К. Кольцов обосновывает роль поверхностного натяжения, ионов и рН в морфогенезе.
Школа Кольцова сыграла видную роль в развитии биофизики в СССР. Его ученики широко разрабатывали вопросы влияния физико-химических факторов внешней среды на клетки и их структуры. Несколько позже (1934) Родионов С.Р. и Франк Г.М. открыли явление фотореактивации, Завойский (1944) метод электронного парамагнитного резонанса.
Методы биофизических исследований:
Рентгеноструктурный анализ – исследование атомной структуры вещества, с помощью дифракции рентгеновских лучей. По дифракционной картине устанавливают распределение электронной плотности вещества, а уже по ней можно определить, какие атомы содержатся в веществе и как они расположены. Исследование кристаллических структур, жидкостей и белковых молекул.
Колоночная хроматография – различное распределение и анализ смесей между 2 фазами – подвижной и неподвижной. Она может быть связана с различной степенью вещества абсорбции или к различной степени ионного обмена. Может быть газовой, либо жидкостной. Распределение веществ используют в капиллярах - капилярная, либо в трубках, заполненных сорбентом – колончатая. Можно проводить на бумаге, пластинках
Спектральный анализ – качественное и количественное определение вещества по оптическим спектрам. Вещество определяют либо по спектру испускания – эмиссионный спектральный анализ или по спектру поглощения – абсорбционный. Содержание вещества определяется по относительной или абсолютной толщине линий в спектре. Также относят радиоспектроскопию – электронный парамагнитный резонанс и ядерно-магнитный резонанс.
Изотопная индикация
Электронная микроскопия
Ультрафиолетовая микроскопия – исследование в УФ лучах биологических объектов повышает контрастность изображения, особенно внутриклеточных структур и она позволяет исследовать иные клетки без предварительной окраски и фиксации препарата.
