
- •Перечень сокращений
- •Раздел I. Организация генетического материала…………………… 12 Глава 1 . Генный уровень организации генетического материала ….12
- •Глава 2. Хромосомный уровень генетического материала…………40
- •Глава 3. Геномный уровень организации
- •Раздел II. Матричный синтез информационных макромолекул……. 97
- •Глава 4. Перенос генетической информации……………………… 97
- •Глава 5. Общий перенос информации……………………………. 101
- •Глава 6. Экспрессия генетического материала……………………. 129
- •Раздел I. Организация генетического материала
- •Глава 1. Генный уровень организации генетического материала
- •1.1. Классификация генов
- •1.2. Основные свойства гена
- •1.4. Структура генов прокариот
- •Транскрипции
- •Лидерная м-рнк uuuuuuuu- он 3′
- •1.5. Гены эукариотических организмов
- •1.5.1. Кластер генов гемоглобина
- •1.5.2. Кластер генов гистонов
- •1.5.3. Кластер рибосомных генов
- •Глава 2. Хромосомный уровень генетического материала
- •2.1. Хромосомы прокариот и вирусов
- •Льтате осмотического шока).
- •2.2. Хромосомы эукариот
- •2.2.1. Нуклесомная нить.
- •(Из: Клаг, 2009)
- •2.2.2. Наднуклеосомная укладка днк
- •Фибрилла – нуклеомер (Из: Жимулев.2007).
- •(Из: Фаллер, 2003)
- •2.2.3. Морфология метафазных хромосом
- •Уровни компактизации хроматина
- •2.2.4. Кариотип
- •Классификация хромосом согласно Денверовской классификации
- •2.2.5. Политенные хромосомы и хромосомы типа ламповых щеток
- •Глава 3. Геномный уровень организации наследственного
- •3.1. Геном вирусов
- •«Ламповых щеток» (Callan, 1941- из:Жимулев, 2007).
- •3.2. Геном прокариот
- •Размеры геномов прокариот
- •Состав сложных геномов бактерии
- •Тремя генами; б-сложный транспозон Тn10 с двумя
- •3.3. Геном эукариот
- •Размер геномов некоторых эукариот
- •7 Хромосомы человека и кукурузы (Из: Клаг,2009).
- •Количество и плотность генов в 5 отсеквенированных эукариотических геномах
- •3.3.1. Простые тандемные повторы (сателлиты).
- •3.3.2Диспергированные повторы
- •Классификация мобильных элементов.
- •Мобильные элементы
- •3.3.3. Геном цитоплазматических днк
- •3.3.4. Геном человека
- •Хромосомы 21 человека (Из: Клаг.2009).
- •Раздел II. Матричный синтез информационных макромолекул.
- •Глава 4. Перенос генетической информации
- •Глава 5. Общий перенос информации
- •5.1. Воспроизведение генетической информации. Репликация днк.
- •Параметры репликации днк у прокариот и эукариот (Из: Жимулев, 2007).
- •Включается в растущую цепь дочерней днк
- •5.1.1. Инициация репликации днк
- •5.1.4. Репликация теломерных отделов днк
- •5.1.5. Метилирование днк
- •Глава 6. Экспрессия генетического материала
- •6.1. Транскрипция днк (синтез рнк)
- •6.1.1.Транскрипция у прокариот
- •6.1.2. Транскрипция у эукариот
- •6.1.3. Процессинг пре-рнк
- •6.2. Принципы кодирования генетической информации Генетический код и его свойства
- •6.3. Трансляция мРнк
- •6.3.1.Структура и функции мРнк
- •6.3.2. Структура и функции тРнк
- •6.3.3. Структура и функции рРнк
- •4 Домена (Из: Коничев, 2003)
- •6.3.4. Рибосомы.
- •6.3.6. Активация аминокислот
- •3.3.7. Инициация трансляции
- •6.3.8. Элонгация трансляции
- •6.3.9. Терминация трансляции
- •Проверочные задания
- •2. Укажите какие из следующих утверждений правильные, а какие - нет. Если утверждение не верно, объясните почему.
- •3. Одна цепь участка днк, выделенной из е.Coli, имеет следующую последовательность оснований: 5′ gтаgсстасссатаgg 3′
- •Раздел II. Организация генетического материала
- •Глава 4. Генный уровень организации генетического материала
- •4.1. Классификация генов
- •4.2. Основные свойства гена
- •4.4. Структура генов прокариот
- •4.5. Гены эукариотических организмов
- •4.5.1. Кластер генов гемоглобина
- •4.5.2. Гены гистонов
- •4.5.3. Кластер рибосомных генов
- •Глава 5. Хромосомный уровень генетического материала
- •5.1. Хромосомы прокариот и вирусов
- •Льтате осмотического шока).
- •5.2. Хромосомы эукариот
- •(Из: Клаг, 2009)
- •5.2.1. Нуклесомная нить.
- •5.2.2. Наднуклеосомная укладка днк
- •Фибрилла – нуклеомер (Из: Жимулев.2007).
- •5.2.3. Морфология метафазных хромосом
- •Из: Жимулев, 2007).
- •Уровни компактизации хроматина
- •5.2.4. Кариотип
- •Классификация хромосом согласно Денверовской классификации
- •5.2.5. Политенные хромосомы и хромосомы типа ламповых щеток
- •Глава 6. Геномный уровень организации наследственного
- •2.3.1. Геном вирусов
- •«Ламповых щеток» (Callan, 1941- из:Жимулев, 2007).
- •2.3.2. Геном прокариот
- •Размеры геномов прокариот
- •Состав сложных геномов бактерии
- •(В тнп) кольцевой днк у е.Соli.
- •Тремя генами; б-сложный транспозон Тn10 с двумя
- •Характеристика некоторых транспозонов (Из: Айяла-Кайгер, 1988)
- •Антибиотикам: tеtr, саmr, kаnr, strr и аmpr; точками обозна- чены гены конъюгации,штриховкой – мобильные элемен-
- •2.3.3. Геном эукариот
- •Размер геномов некоторых эукариот
- •Количество и плотность генов в 5 отсеквенированных эукариотических геномах
- •2.3.3.1. Простые тандемные повторы (сателлиты).
- •2.3.3.2. Тандемно организованные кластеры генов
- •Классификация мобильных элементов.
- •2.3.3.3. Геном цитоплазматических днк.
- •2.3.3.4. Геном человека
- •Хромосомы 21 человека (Из: Клаг.2009).
2.2.2. Наднуклеосомная укладка днк
Дальнейшая спирализация хроматина приводит к образованию плотного тела митотической хромосомы и включает следующие уровни компактизации: хроматиновая фибрилла, хромомерный и хромонемный, хроматидный и метафазную хромосому.
Хроматиновая фибрилла. Этот уровень компактизации обеспечивается гистоном Н1, который будучи связанным с линкерной ДНК, связывается также с соседними нуклеосомами и, изменяя свою конформацию, сближает их (рис.32). При этом образуется глобула, из 6 нуклеосом ( сверхбусина), или соленоид (рис.30,b).
Такая структура называется элементарной хроматиновой фибриллой или нуклеомером; имеет диаметр 30нм и длину 1,2мм. Уровень компактизации составляет 40 раз (рис.34). На один нуклеомер приходится 1600 н.п.
Рис.34. Элементарная хроматиновая
Фибрилла – нуклеомер (Из: Жимулев.2007).
Хромомеры и хромонемы. Следующий уровень структурной компактизации ДНК связан с укладкой хроматиновой фибриллы в петли (рис.35).
Рис.35.
Петлевой
уровень
компак-
тизации хроматина
Соленоидная хроматиновая фибрилла складывается в петли разной длины. В образовании петель участвуют не гистоновые белки ядерного матрикса, которые способны узнавать специфические последовательности ДНК (SAR- последовательности), отдаленные друг от друга на расстоянии в несколько тысяч пар нуклеотидов. Эти белки образуют остов (scaf- fold), который связывается с SAR-последовательностями ДНК (scaffold attachment regions) (рис.36) и, сближая их, образует петли (рис.35). Каждая петля содержит от 20 до 80 тыс. пар нуклеотидов, что может соответс- твовать одному или нескольким генам и называется петлевой домен (рис.30,с). В интерфазном ядре такие петли связаны с сетчатым белковым образованием, расположенным на внутренней стороне ядерной оболочки и называемым сетчатым ядерным матриксом, ламиной или ядерной пластинкой (рис.37). Белки ядерного матрикса ламины соединяются с последовательностями ДНК, которые называются МАR-последовательностями (matrix attachment regions).
Рис.36. Модели закрепления оснований ДНК в ядерном матриксе (Razin 1995), (черными кружками обозначены МАR-последовательности; серая полоса-скаффолд, состоящий из белков ядерного матрикса. Из: Жимулев, 2007).
Рис.37.Схема ядерной мембраны (СЯМ – сетчатый ядерный матрикс)
(Из: Фаллер, 2003)
В результате такой спирализации хроматиновая фибрилла диаметром 30 нм преобразуется в структуру диаметром 300 нм, называемую интерфазной хромонемой. Отдельные участки хромонемы подвергаются дальнейшей компактизации : соседние петли объединяются в структурные блоки в виде розеток (рис.38), петли которых, сильно спирализуясь, образуют хромомеры, небольшие, сильно окрашивающиеся компактные тельца (0,1-0,20мкм), различающиеся по форме и размеру. Число и рисунок хромомер у данного организма на данной стадии клеточного цикла одинаковы и постоянны (рис.39).
Рис.38. Спирализация хромонем с об - разованием розетковидных участков: петли фибриллы диаметром 30 нм(А) соединяются в розетки (Б); в резуль- тате упаковки (спирализации) каж- дой петли розетки образуются ком -пактные тельца – хромомеры (В);
( Из: Захаров и др., 1982)
Рис. 92. Хромомеры хромосомы XII тритона: а – в нитях хромосом клеток Allium cepa; б) в нитях сестринских хроматид (черные точки)
Петлевые домены и хромомеры расположены неравномерно . Неодинаковая степень спирализации разных участков хромосом имеет большое значение; в зависимости от степени спирализации выделяют эухроматин и гетерохроматин.
Р
ис.40.
Эухроматин (светлые участки) и
гетерохроматин (темные участки) в
кариотипе дрозофилы (из Жимулев, 2007):
цифры – номера хромосом.
Эухроматин – это участки хроматина, имеющие меньшую степень спирализа- ции в неделящихся клетках; на препаратах выглядят как более светлые участки (рис.40). Эухроматин является активной областью хроматина, здесь постоянно идет транскрипция ДНК. На время митоза эти участки сильно спирализуются и транскрипция с них прекращается.
Гетерохроматин (рис.40) – это сильно спирализованные, компактно конденсированные, неактивные участки хроматина. Транскрипция биологической информации в их пределах не происходит. Чаще всего гетерохроматин располагается в прицентромерных, иногда в теломерных участках хромосом или, весьма редко, как вкрапления в эухроматине. Такой гетерохроматин называется интеркалярным. В световом микроскопе он виден в виде глыбок или гранул. Часть гетерохроматина прилежит к кариолемме (примембранный хроматин),часть сосредоточена вокруг ядрышек (перинуклеарный хроматин).
Различают два вида гетерохроматина: конституционный и факультативный.
Конституционный гетерохроматин – это хроматин, с которого ни в одной клетке никогда не идет считывания информации в виде мRНК. Расположен в прицентромерных и теломерных областях хромосомы. Его роль заключается:
1 - в поддержании структуры ядра;
2 - в прикреплении хроматина к ядерной оболочке;
3 - в узнавании гомологичных хромосом в мейозе;
4 - участие в в регуляции активности генов и разделении соседних генов.
Факультативный гетерохроматин – это участки хроматина, спирализация (конденсация) которых служит механизмом выключения из активной функции генов, транскрипция которых не требуется в клетках определенной специализа- ции. Его практически нет в эмбриональных клетках, по мере их диф- ференциации количество этого хроматина увеличивается. Другим примером является одна из двух Х-хромосом женского пола, которая плотно упакована в виде телец Бара (тельца полового хроматина). Гены этой хромосомы не транскрибируются.
Образование хромонемы и хромомер укорачивают длину ДНК в 1000 раз.
Петельно – доменная структура хроматина имеет диаметр 300 нм и является интерфазной хромосомой. Её дальнейшая спирализация ведёт к образованию хроматиды с диаметром 600-700 нм.
Последняя степень спирализации (в 7000 раз ) происходит в профазе митоза; в результате образуется метафазная хромосома с диаметром 1400нм. Укладка хроматиновой нити на этой ступени спирализации представляет собой её многократное складывание по длине хромосомы (рис.41). Этот процесс начинается в профазе митоза, достигает максимального выражения в метафазе. В телофазе митоза происходит декомпактизация (деспирализация) вещества хромосомам, что приводит к восстановлению интерфазного хроматина.
Рис. 94. Схема метафазной хромосомы (Из: Хадорн, 1988):
А) 1 - центромера с кинетохором; 2 – гетерохроматин; 3 – эухроматин;
4 - вторичная перетяжка; 5 – спутник;
Б) участок с более сильным увеличением (сверхспирализация)