
- •Содержание
- •1 Аналитический обзор 11
- •2 Методическая часть 29
- •3. Экспериментальная часть 37
- •4 Обсуждение результатов эксперимента 44
- •Условные обозначения
- •Введение
- •1 Аналитический обзор
- •1.1 Регулярные мультимолекулярные структуры
- •1.2 Хроматография
- •1.2.1 Металл-аффинная хроматография – сочетание принципов лигандообменной и аффинной хроматографии
- •1.3 Методы характеризации сорбентов
- •1.3.1 Удельная поверхность
- •1.3.2 Емкость сорбента, влажность
- •1.3.3 Электрокинетический потенциал
- •1.4 Maldi масс-спектрометрия
- •1.5 Идентификация белков – метод pmf
- •1.6 Тандемная масс-спектрометрия (мс-мс) и идентификация пептиов по фрагментным масс-спектрам
- •1.7 Идентификация пост-трансляционных модификаций
- •1.8 Аддукты зомана с сывороточным альбумином
- •2 Методическая часть
- •2.1 Используемые материалы:
- •2.2 Методики получения сорбента и исследования
- •2.2.1 Получение рмм (FeIii) сорбента
- •2.2.2 Определение удельной поверхности сорбента
- •2.2.3 Определение сорбционной емкости сорбента
- •2.2.3.1 Проведение металл-аффинного анализа
- •2.2.3.2 Определение влажности рмм Fe(III) сорбента
- •2.2.3.3 Определение влажности коммерческого сорбента
- •2.2.4 Анализ фосфорилированных пептидов казеина молока коровы
- •2.2.4.1 Выделение суммарного белка из обезжиренного сухого молока
- •2.2.4.2 Гидролиз суммарного белка молока коровы в присутствии трипсина
- •2.2.5 Анализ фосфонилированных пептидов сывороточного альбумина человека
- •2.2.5.1 Гидролиз сывороточного альбумина человека в присутствии пепсина
- •2.2.6 Масс-спектрометрический анализ
- •2.2.6.1 Масс-спектрометрический анализ методом maldi-tof и maldi-tof-tof
- •2.2.6.2 Обработка данных масс-спектрометрического анализа
- •3. Экспериментальная часть
- •3.1. Получение рмм Fe(III) сорбента
- •3.2 Определение удельной поверхности
- •3.3 Определение электрокинетического потенциала и размера частиц.
- •3.4 Определение сорбционной емкости сорбента
- •3.4.1Проведение металл-аффинного анализа
- •3.4.2 Определение содержание пептида в проскоке и контрольном образце
- •3.4.3 Определение влажности коммерческого сорбента и рммс Fe(III)
- •3.5 Анализ фосфорилированных пептидов казеина молока коровы
- •3.5.1 Приготовление микроколонки с сорбентом
- •3.5.2 Металл-аффинная хроматография на коммерческом сорбенте
- •3.5.3 Металл-аффинная хроматография на рммс Fe(III)
- •3.6 Анализ фосфонилированных пептидов сывороточного альбумина человека
- •3.6.1 Приготовление металл-аффинной колонки
- •3.6.2 Выбор элюэнта
- •3.6.3 Металл-аффинная хроматография на коммерческом сорбенте
- •3.6.4 Металл-аффинная хроматография на рммс Fe(III)
- •3.7 Масс-спектрометрический анализ
- •3.7.1 Проведение масс-спектрометрического анализа
- •4 Обсуждение результатов эксперимента
- •4.1 Охарактеризация сорбента
- •4.1.1. Получение рмм сорбента, содержащего ионы железа (III) и приготовление хроматографических колонок.
- •4.1.2 Определение удельной поверхности
- •4.1.3 Определение емкости сорбента
- •4.1.4 Микроэлектрофоретические исследования.
- •4.1.4.1 Определение электрокинетического потенциала
- •4.1.4.2 Расчет удельной поверхности рмм сорбента
- •4.2 Исследование возможности специфичного выделения фосфорилированных пептидов из биологического образца методом металл-аффинной хроматографии с использованием рммс(Fe III)
- •4.3 Разработка метода металл-аффинного выделения прямых ковалентных аддуктов зомана с сывороточным альбумином с помощью рмм сорбентов Fe(III) для последующего масс-спектрометрического анализа
- •4.3.1 Поиск и идентификация аддуктов сывороточного альбумина человека с зоманом
- •4.3.2 Выделение фосфонилированных пептидов сывороточного альбумина человека с использованием рммс (Fe III)
- •4.3.2 Масс-спектрометрическая идентификация сайтов связывания зомана с альбумином при взаимодействии с белками in vitro
- •Выводы по работе:
- •Список использованных источников.
- •Приложение а Технико-экономическая оценка научно-исследовательской работы Обоснование договорной цены на разработку
- •Расчет затрат на научно-исследовательскую разработку
- •Расчет затрат на сырье, материалы, реактивы, покупные изделия и полуфабрикаты
- •Расчет затрат на энергоресурсы
- •Расчет затрат на приборы, оборудование для научно-экспериментальных работ и суммы амортизационных отчислений
- •Расчет затрат на оплату труда с обязательными начислениями
- •Прочие затраты Расчет суммы расходов по использованию вычислительной техники.
- •Затраты на выполнение специальных анализов.
- •Расчет суммы накладных расходов
- •Расчет сметы затрат на разработку
- •Приложение б Охрана труда и окружающей среды
- •1 Опасные и вредные производственные факторы
- •2 Пожарная безопасность
- •3 Обеспечение санитарно-гигиенических условий
- •4 Вентиляция
- •5 Аптечка и ее содержание
- •6 Освещение помещения
- •7 Безопасность выполнения работы в лаборатории
- •8 Анализ технологических операций
- •9 Меры первой помощи
- •Охрана окружающей среды
- •Приложение в
- •Приложение г Масс-спектры смеси триптических пептидов казеина, элюированных с колонки с сорбентом, содержащим ионы железа.
4.1.4 Микроэлектрофоретические исследования.
4.1.4.1 Определение электрокинетического потенциала
Для новых видов адсорбентов для металл-аффинной хроматографии необходимо изучить поверхностные свойства созданных частиц. Одним из параметров, характеризующих электрические и структурные свойства поверхности, является электрокинетический потенциал. Ранее было показано [15] близкое совпадение данных зависимости электрокинетического потенциала от рН для различных по способу образования поверхностей.
В ходе эксперимента электрокинетический потенциал определяли по методу микроэлектрофореза и рассчитывали по формуле Гельмгольца –Смолуховского без введения поправок.
Таблица 4.1.4.1 Значения ξ(zeta)-потенциала в зависимости от рН раствора KCl.
Значение рН |
Значение ξ - потенциала |
Значение рН |
Значение ξ -потенциала |
СКCl=10-3 |
СКCl=10-4 |
||
1,8 |
19,5 |
2,2 |
17,1 |
3,44 |
2,89 |
3,26 |
7,2 |
4,51 |
-35,2 |
3,52 |
-7,39 |
5,89 |
-38,1 |
4,5 |
-45,5 |
7 |
-56,2 |
5,85 |
-52 |
|
|
7,9 |
-43,2 |
Рисунок 4.1.4.1 зависимость ζ - потенциала для ММС стеаратов железа(III) в зависимости от рН раствора КCl концентрации 10-3 и 10-4М/ литр
Как следует из приведенных данных, в кислой области рН поверхность заряжена положительно.
Положительный заряд образуется из-за того, что ММС состоят в основном из молекул FeSt2OH, следовательно, в данном диапазоне рН происходит реакция нейтрализации и на поверхности образуется катион FeSt2+. По мере уменьшения кислотности среды положительный заряд уменьшается и становится равен нулю при рН=3.5 (изоэлектрическая точка). Для двух исследованных концентраций изоэлектрические точки практически совпадают. Это говорит об отсутствии специфической адсорбции ионов на поверхности ММС.
При дальнейшем уменьшении кислотности наблюдается рост отрицательного заряда поверхности. Это с одной стороны может быть объяснено усилением диссоциации стеариновой кислоты, которая не перешла в соль, по реакции:
HSt = H+ + St-
Но только этим процессом нельзя объяснить столь высокие значения электрокинетического потенциала. Так как стеарат железа является практически нерастворимым соединением, то мало вероятно, чтобы стеарат железа диссоциировал с образованием стеарат- ионов.
При рН ≥ 4 наблюдается гидролиз ионов трехвалентного железа и следовательно в этой области рН могут образовываться отрицательно заряженные формы гидроксо ионов трехвалентного железа
FeSt2OH + Н2О = FeSt2 (OH)2-
Причем при смещении в более щелочную область отрицательный заряд поверхности будет расти из-за образования более сложных гидратных форм. Образования подобных ионов возможно из-за донорно- акцепторного взаимодействия неподеленной электронной пары кислорода с вакантными d-орбиталями атома железа.