Добавил:
ivanov666
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз:
Предмет:
Файл:Клональное разнообразие и механизмы его формирования у однополых видов ящериц рода Darevskia. Монография
.pdf
Ê
ЛОНАЛЬНОЕ РАЗНООБРАЗИЕ И МЕХАНИЗМЫ ЕГО ФОРМИРОВАНИЯ У ЯЩЕРИЦ РОДА
Darevskia
Изучение мутационных изменений микросателлитов дрозофилы показало, что большинство нарушений представляют собой сложный процесс. Особенностью этой работы являлось то,
что все изучаемые повторяющиеся последовательности характеризовались небольшим числом звеньев и низким уровнем гетерозиготности. Была показана положительная корреляция между полиморфизмом микросателлита и числом повторов в нем,
связь структуры микросателлита
со структурой фланкирующих
участков ДНК, а также подтверждена роль мутационных процессов в поддержании размера микросателлита. При этом выявлено два очень необычных явления:
накопление несовершенных повторов;
возникновение крупных делеций с одновременным
накоплением аллелей с незначительным уменьшением
числа повторов, что, вероятно, способствует деградации микросателлитных локусов в ряду поколений.
В геномах многих организмов были обнаружены повторяющиеся последовательности ДНК, специфичные для таксономических групп и обладающие свойствами ретропозонов.
Исследования показали, что некоторые мини- и микросателлиты встречаются в
геноме в тесной связи с ретропозон-подобными элементами. В геноме человека и приматов существуют
Alu-повторы, ретропозиция которых происходит с большой частотой. Эти элементы могут являться источником возникновения в геноме некоторых микросателлитных повторов, например
типа, а следовательно, и связанного с ними полиморфизма
(AC)
n
ДНК [Arcot et al., 1995]. Существует несколько моделей возникновения микросателлитов при участии Alu-элементов:
1) изменение некоего исходного микросателлита в результате встраивания в его последовательность Alu-элемента;
2) встраивание в геном Alu-элемента, изменившегося в процессе обратной транскрипции. Изменения могут затрагивать области элемента, обогащенные А-основаниями
(3’ концевая область и/или центральная зона Alu-повтора) [Arcot et al., 1995].
Изучение генома мыши выявило семейство вариабельных
последовательностей MMS10, специфичных для грызунов,
повторяющееся звено которых представлено GGCAGA
олигонуклеотидом. Выделенные из генома и клонированные
g 31 G

À.À. Â
ЕРГУН
, À.Å. Ã
ИРНЫК
, Ô.À. Î
СИПОВ
, À.Â. Î
МЕЛЬЧЕНКО
последовательности были окружены участками ДНК, гомологичными B1 SINE элементу мыши. Это позволило предположить, что семейство B1 элементов является источником возникновения MMS10 тандемно организованных вариабельных повторов [Bois et al., 1998]. Было показано, что гипервариабельные
мышиные минисателлиты Ms6-hm и Hm-2 возникли в резуль-
изменений, связанных с ретропозонподобными элемен-
тате
ми. Эти минисателлиты окружены длинными концевыми по-
та
вторами (LTR — long terminal repeats) и содержат (GGGCA)
и (GGCA)
олигонуклеотидные повторы, присутствующие в цен-
n
n
тральной области некоторых LINE элементов млекопитающих
[Kelly, 1994].
Таким образом, существование диспергированных повторов
со свойствами ретропозонов является еще одним источником
полиморфизма ДНК. Обладая способностью к перемещению,
SINE и LINE элементы, встраиваясь в различные участки генома, приводят к появлению различных изменений. Например,
предполагается, что некоторые SINE элементы представлены в
геноме
в виде тандемно организованных кластеров, и изменение
числа повторяющихся единиц или мутации в отдельном звене
могут приводить к появлению ДНК-полиморфизма [Spruell et
al., 1996]. Последовательности со свойствами ретропозонов могут являться источниками возникновения мини- и микросателлитов и, следовательно, связанным с ними полиморфизмом ДНК
[Bois et al., 1998; Spruell et al., 1996; Kelly, 1994]. Предполагается,
что длинные концевые повторы, окружающие некоторые мини-
микросателлиты, и образующиеся в результате обратной транс-
и
крипции LINE элементов, могут регулировать мутационные события в тандемно организованных последовательностях. LTRповторы могут являться горячими точками гомологичной рекомбинации или cis-действующими промоторами в геноме млекопитающих [Kelly, 1994].
g 32 G

Ê
ЛОНАЛЬНОЕ РАЗНООБРАЗИЕ И МЕХАНИЗМЫ ЕГО ФОРМИРОВАНИЯ У ЯЩЕРИЦ РОДА
Darevskia
7. ПАРТЕНОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ВИДЫ
АВКАЗСКИХ СКАЛЬНЫХ ЯЩЕРИЦ
К
РОДА Darevskia (семейство Lacertidae)
В настоящее время известно около 40 видов однополых ящериц, а также три или четыре вида, принадлежащих к двум семействам мелких роющих змей. Все перечисленные однополые
виды рептилий размножаются облигатным партеногенезом и составляют менее 1% современной мировой фауны ящериц и змей
[Коул, 1984; Darevsky, 1993].
Одними из наиболее интересных представителей клонально
размножающихся рептилий
казские скальные ящерицы рода Darevskia (2n = 38: 36 аутосом
и WZ половые хромосомы), входящие в saxicola-комплекс [Murphy et al., 1997], включающий 17 двуполых и 7 однополых видов
ящериц рода Darevskia (сем. Lacertidae) [Arribas, 1999], обитающих в Закавказье и соседних районах Турции. Партеногенетические ящерицы впервые были открыты в Армении И.С. Даревским. Он обнаружил, что популяции Армянской
meniaca) состоят из одних самок, которые способны откладывать неоплодотворенные, но вполне жизнеспособные яйца [Даревский, 1958]. Все однополые виды ящериц, входящие в saxi-
cola-комплекс, на большей части ареала аллопатричны со своими родительскими формами, однако местами между ними сохраняются зоны симпатрии, в которых обычно возникают стерильные триплоидные
генома от матери и геном от отца [Даревский, 1993; Darevsky,
1993]. Однополые виды часто встречаются в областях, неблагоприятных для обитания бисексуальных форм.
Места обитания ящериц рода Darevskia обычно связаны с различными типами каменистых поверхностей. Некоторые из них
являются партеногенетические Кав-
ящерицы (D. ar-
гибриды обоих полов, получающие два
g 33 G

À.À. Â
ЕРГУН
, À.Å. Ã
ИРНЫК
, Ô.À. Î
СИПОВ
, À.Â. Î
МЕЛЬЧЕНКО
вторично заселяют участки леса и узкие полосы горных лугов,
прилежащих к скалам. Однополые виды ящериц достаточно хорошо адаптируются в новых условиях обитания. Так, например,
в 1963 году Даревским был проведен эксперимент по интродукции партеновида D. armeniaca из Армении на Украину. Ящерицы были отловлены в Армении в гористой местности на высоте
1600 метров над уровнем моря и выпущены на Украине в сходные по климатическим условиям местообитания на высоте 200
метров над уровнем моря [Даревский, Щербак, 1968]. Последующие наблюдения показали, что интродукция прошла успешно,
образовалась новая устойчивая популяция, которая постоянно
занимала все большие территории и заселяла биотопы, нехарактерные для данного вида, например
, участки смешанного леса.
Самки этой популяции откладывали яйца на две недели раньше, чем в Армении, что является адаптацией к новым климатическим условиям [Даревский и др., 1998].
Адаптация к новым условиям обитания является преимуществом партеногенетических видов по сравнению с бисексуальными. Однако самым главным преимуществом является сам
способ размножения,
так как увеличивается темп размножения
за счет того, что все особи популяции способны оставлять потомство, в то время как при бисексуальном размножении только
половина. При партеногенетическом способе размножения очень
малое число особей, попавших в благоприятные условия обитания, могут образовать новую популяцию, что было показано
для ряда островных видов [Даревский
, 1993]. Популяции партеногенетических видов представляют собой клоны — группы
генетически идентичных особей, происходящих от одного предка. При таком способе размножения отсутствует комбинатор-
изменчивость, поэтому все изменения носят случайный
ная
характер и, вероятно, отражают мутационные или рекомбинационные процессы, происходящие в геноме партеногенетических особей.
Сравнительный анализ изменчивости сайтов рестрикции
митохондриальной ДНК у бисексуальных и партеногенетических видов, аллозимный анализ, а также кариологические
исследования позволили говорить о гибридном происхождении
партеногенетических видов рода Darevskia [Moritz et al., 1992],
g 34 G

Ê
ЛОНАЛЬНОЕ РАЗНООБРАЗИЕ И МЕХАНИЗМЫ ЕГО ФОРМИРОВАНИЯ У ЯЩЕРИЦ РОДА
Darevskia
а также однополых видов некоторых других родов, например,
ящериц-бегунов рода Cnemidophorus (Мексика, юг США) [Коул,
1984]. Степень дивергенции митохондриального генома между
особями материнского бисексуального вида и партеногенетического вида позволяет определить возраст однополого вида; например, приблизительный возраст двух партеногенетических
видов D. unisexualis и D. rostombekowi 5000 лет. Степень дивергенции митохондриального генома между
материнскими и
соответствующими партеногенетическими видами кавказских
скальных ящериц составляет 0%–0.6%, что свидетельствует
о недавнем возникновении партеногенетического типа размножения в роде Darevskia, вероятно, около 10000 лет назад, после
ледникового периода [Moritz et al., 1992].
Происхождение партеновидов кавказских скальных ящериц
можно описать при помощи теории «сетчатого видообразования» [Даревский, 1993] — то есть путем гибридизации между
пятью предковыми бисексуальными видами, причем гибридизация в разных сочетаниях одних и тех же родительских
форм
приводила к возникновению различных партеногенетических
гибридных видов [Даревский, 1993; Darevsky, 1993]. Это подтверждается обнаруженной высокой фиксированой гетерозиготностью аллозимных локусов и результатами анализа митохондриальной ДНК [Moritz et al., 1992; Murphy et al., 1997]. Один из бисексуальных видов является материнским, а другой — отцовским, т. е. в процессе гибридизации участвовали самки одного
вида и самцы другого. Материнский вид
определяли путем сравнительного анализа полиморфизма митохондриальной ДНК
особей партеногенетического вида и предполагаемого бисексуального родительского вида, т. к. наследование митохондриального генома происходит по материнской линии [Moritz et al.,
1992]. Значительное сходство последовательностей митохондриальной ДНК партеногенетических видов и родственных им
двуполых видов рода Darevskia говорит о сравнительно недавнем возникновении партеногенеза (около 10 000–12 000
лет на-
зад, после ледникового периода).
Отцовские бисексуальные виды определяли с помощью аллозимного анализа [Moritz et al., 1992]. В результате были обозначены предполагаемые родительские виды для каждого партеногенетического вида кавказских лацерт (табл. 1).
g 35 G

À.À. Â
ЕРГУН
, À.Å. Ã
ИРНЫК
, Ô.À. Î
СИПОВ
, À.Â. Î
МЕЛЬЧЕНКО
Таблица 1
И
СХОДНЫЕ РОДИТЕЛЬСКИЕ ВИДЫ ДЛЯ СЕМИ ПАРТЕНОГЕНЕТИЧЕСКИХ ВИДОВ
РОДА Darevskia [MORITZ ET AL., 1992; FU ET AL., 2000А]
ТЦОВСКИЙ»
О
ДНОПОЛЫЙ ВИД
«М
АТЕРИНСКИЙ» ВИД
D. rostombekowi D. raddei D. portschinskii
D. armeniaca D. mixta D. valentini
D. dahli D. mixta D. portschinskii
D. unisexualis D. nairensis D. valentini
D. sapphirina D. raddei или D. nairensis D. valentini
D. bendimahiensis D. raddei или D. nairensis D. valentini
D. uzzelli D. valentini D. nairensis
С помощью морфологического и молекулярно-генетического анализа в видовом комплексе D. raddei — D. nairensis было выявлено два
подвида (D. raddei nairensis и D. raddei raddei), видовой статус кото-
рых на сегодняшний день является спорным [Moritz et al., 1992; Grechko
et al., 1997; Гречко и др., 1998; Рябинина и др., 1998; Murphy et al.,
2000; Омельченко и др., 2016]
«О
ВИД
Аналогичным образом, в результате гибридизации бисексуальных родительских форм образовались и многочисленные
диплоидные и триплоидные партеногенетические виды американских тейидных ящериц рода Cnemidophorus [Даревский,
1993], представленных примерно 12-ю видами из 40 видов этого рода [Cole, Townsend, 1975; Cole et al., 1988]. Для других
партеногенетических видов, например, гекконов рода Hemidac-
их
tylus, показано, что
зацией. Партеногенез
происхождение не связано с гибриди-
в этой группе имеет негибридную природу. Данная группа включает три триплоидных морфологически близких вида, которые резко различаются кариологически.
Близкие по кариотипу бисексуальные формы отсутствуют, что
свидетельствует в пользу становления этих видов в результате
хромосомных перестроек у некоего исходного, автотриплоидного, вида [Даревский,1993].
Наиболее детально механизм мейоза установлен у
лых ящериц рода
Cnemidophorus
. Доказано, что у этих видов
однопо-
имеет место премейотическое восстановление соматического
g 36 G

Ê
ЛОНАЛЬНОЕ РАЗНООБРАЗИЕ И МЕХАНИЗМЫ ЕГО ФОРМИРОВАНИЯ У ЯЩЕРИЦ РОДА
Darevskia
набора хромосом. Изучение образования яиц у однополых ящериц-бегунов показало, что в клетках яичников [Коул, 1984] происходит премейотический эндомитоз, благодаря чему удваивается число хромосом в яйцеклетках [Dawley, 1989], и клетки
становятся полиплоидными. У диплоидных видов образуются
тетраплоидные клетки, а у триплоидных — гексаплоидные
[Коул, 1984]. Мейоз начинается с образования пар между идентичными
хромосомами. Между идентичными хромосомами
происходит синапсис, что приводит к формированию псевдобивалентов. Дальше мейоз протекает как и у двуполых видов
[Dawley, 1989], но происходящий при кроссинговере обмен
ДНК не имеет генетических последствий, т. к. в нем участвуют
идентичные молекулы ДНК [Коул, 1984]. Когда хромосомы переходят во вторую стадию мейотического деления, создается
впечатление, что премейотической дупликации не
происходило
и первое деление мейоза отсутствовало [Dawley, 1989]. Как это
обычно бывает при созревании половых клеток, вслед за кроссинговером клетки дважды делятся. И, в конечном счете, образуются яйца, в каждом из которых столько же хромосом и та
же комбинация генов, что и в исходной клетке яичника до дупликации. С генетической
точки зрения, такое зрелое яйцо полноценно, в отличие от гаплоидного у самок двуполых видов, и может развиваться без оплодотворения [Коул, 1984].
Механизмы мейоза у партеногенетических видов ящериц
рода Darevskia изучены недостаточно хорошо. К настоящему
времени известно, что редукционное деление мейоза протекает
без нарушений, формируется первое полярное тельце и метафазная пластинка второго (эквационного) деления. Однако второе полярное тельце не формируется. Число бивалентов в метафазе I, также как и число хромосом в метафазе II, не превышает
гаплоидного набора (n = 19). Вероятно
, диплоидное число хромосом восстанавливается или путем слияния ядер после эквационного деления, или подавлением второго мейотического деления и, таким образом, анафаза второго деления мейоза не доходит до конца [Darevsky, 1985].
Все изученные партеногенетические вида рода Darevskia
несут в кариотипе редуцированную и в разной степени гетерохроматизированную половую хромосому W/w. Данная
хромо-
сома «наследуется» от родителького материнского вида и играет
g 37 G

À.À. Â
ЕРГУН
, À.Å. Ã
ИРНЫК
, Ô.À. Î
СИПОВ
, À.Â. Î
МЕЛЬЧЕНКО
доминирующую роль в формировании типа гонад и определении
пола [Куприянова, 1997]. Также были обнаружены явления
инактивации W/w хромосомы и импринтинга в гибридных дии триплоидных геномах — появления диплоидных особей WZ
с семенниками и «ovotestis», интерсексы с семенниками, триплоидные и мозаичные стерильные особи. Хромосомный анализ
гибридов между самкой D. unisexualis (w
— половая хромо-
nZv
сома w от материнского вида D. nairensis и хромосома Z от отцовского вида D. valentini) и самцом двуполого отцовского вида
D. valentini (Z
(w
) встречаются как стерильные «самцы», так и
nZvZv
) показал, что среди таких триплоидных особей
vZv
стериль-
ные «самки». Триплоидные гибриды от скрещивания самок
D. unisexualis (wnZv) и самцов двуполого материнского вида
D. nairensis (Z
) имели в кариотипе половые хромосомы wnZnZv
vZv
и были самками, хотя и стерильными.
В потомстве партеногенетических лацерт очень редко (примерно 1:1000) встречаются мужские особи. Большинство из
них гибнет на разных стадиях эмбриогенеза. Немногие из этих
самцов достигают половой зрелости, однако фертильность их
заметно снижена. Цитологическим механизмом, контролирующим возникновение самцов у партеногенетических видов ящериц, может являться
инактивация w-хромосомы и/или имприн-
тинг Z-хромосом [Куприянова, 1997].
7.1. КЛОНАЛЬНОЕ РАЗНООБРАЗИЕ D. dahli
Вид Darevskia dahli — один из семи облигатно-партеногенетических диплоидных видов рода Darevskia, обитающий на территории Грузии и Армении (рис. 6), возникший в результате
межвидовой гибридизации бисексуальных видов D. portschin-
skii и D. mixta. Родительские виды в настоящее время аллопатричны [Darevsky et al., 1967] — ареал D. portschinskii представлен популяциями в южной Грузии, северной Армении и запад-
Азербайджане, D. mixta встречается только в Грузии [Da-
ном
revsky, 1967]. Согласно данным митохондриального анализа, материнским видом является вид D. mixta, что было подтверждено
и таксонопринтным методом [Гречко и др., 1993]. Отцовский вид
был определен с помощью анализа аллозимных локусов и метода полимеразной цепной реакции со случайными праймерами
g 38 G

Ê
Р
Ар—
ЛОНАЛЬНОЕ РАЗНООБРАЗИЕ И МЕХАНИЗМЫ ЕГО ФОРМИРОВАНИЯ У ЯЩЕРИЦ РОДА
Darevskia
Рис. 6. Ареал партеногенетического вида Darevskia dahli на террито-
рии Армении. Кругами и цифрами обозначены места обитания:
1 — Ваагни (Туманян); 2 — Дендропарк (окр. г. Степанаван); 3 —
Дзорагет (окр. г. Степанаван); 4 — Папанино (окр. г. Дилижан);
5 — Фиолетово; 6 — Шагали (Туманян)
[Гречко и др., 1993]. Darevskia dahli характеризуется типичным
для рода Darevskia диплоидным набором (2n = 38) и морфологией хромосом (акроцентрические, А), в геноме присутствуют
микрохромосомы. В Армении D. dahli населяет умеренно сухие
скальные ущелья и склоны в лесной зоне на высоте от 700 до
1500 метров над уровнем моря, а также каменистые местообитания в горной степи,
kelyan, 2011]. Популяции
ранее бывшиt лесными участками [Ara-
D. dahli
довольно многочисленны
и изолированы друг от друга. Некоторые популяции симпатричны с другими партеногенетическими и двуполыми видами рода
Darevskia. Например, в регионе Дзорагет (недалеко от г. Степанавана), D. dahli симпатричен с бисексуальным родительским
видом D. portschinskii и партеногенетическим видом D. arme-
niaca; в окрестностях деревни Севкар — он обитает совместно
с однополыми видами D. rostombekowi и D. armeniaca, и
бисексуальным видом D. raddei. Межвидовые гибриды, встречающиеся в зонах симпатрии, являются триплоидными и стерильными
[Davoyan, 2007]. Опираясь на данные аллозимного анализа и на
g 39 G

À.À. Â
ЕРГУН
, À.Å. Ã
ИРНЫК
, Ô.À. Î
СИПОВ
, À.Â. Î
МЕЛЬЧЕНКО
современную аллопатричность родительских бисексуальных
видов, Мёрфи и соавторы [Murphy et al., 1997] предположили,
что в межвидовой гибридизации (с образованием партеновида)
участвовало ограниченное число особей двуполых видов, и успешный клон (т. е. фертильный гибрид, давший начало однополому виду) возник только однажды.
На основании анализа 35-ти аллозимных локусов в популя-
циях партеновида D. dahli было выявлено
пять аллозимных клонов. Один из них был широко распространен по всему ареалу,
а четыре — только в некоторых популяциях Армении, и были
представлены малым числом особей [Murphy et al., 1997]. В одной из популяций (Папанино, окр. г. Дилижан) по окраске брюшка было выявлено две морфоформы, самки одной из них имели
ярко-желтую
окраску нижней стороны тела и в отличие от самок другой морфоформы, которые имели бледно-желтую окраску, откладывали меньше яиц и были менее устойчивы к засушливым условиям [Murphy et al., 1997].
С помощью мультилокусного ДНК-фингерпринтинга было
показано, что особи D. dahli характеризуются видоспецифическим спектром маркеров, и по ряду микросателлитсодержащих
локусов в исследованных
популяциях удается выявить значительный уровень генетического полиморфизма. C использованием М13-минисателлитной и (ТСС)
-микросателлитной проб
50
в сочетании с двумя эндонуклеазами рестрикции BsuRI и MvaI
изучали геномную вариабельность в природных популяциях
D. dahli [Кан и др., 1998]. Индексы сходства в каждом из проведенных вариантов мультилокусного анализа ДНК у D. dahli
незначительно варьировали в пределах от 0,926 до 1. По данным
кластерного анализа изученных особей разделили на 12 групп,
которые различались единичными или несколькими вариантами
фрагментов ДНК. Природа выявленных различий остается неизвестной. По-видимому, они возникают в
результате мутаций
в сайтах рестрикции ДНК или сложных внутригеномных реорганизаций.
Молекулярно-генетические исследования индивидуальных
микросателлитсодержащих локусов позволяют получать более
полные данные относительно генетической вариабельности и
формирования клонов у
D. dahli
, а также о количестве
возможных
g 40 G
Соседние файлы в предмете [НЕСОРТИРОВАННОЕ]
