Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

Клональное разнообразие и механизмы его формирования у однополых видов ящериц рода Darevskia. Монография

.pdf
Скачиваний:
0
Добавлен:
07.09.2026
Размер:
2 Мб
Скачать
Ê
ЛОНАЛЬНОЕ РАЗНООБРАЗИЕ И МЕХАНИЗМЫ ЕГО ФОРМИРОВАНИЯ У ЯЩЕРИЦ РОДА
Darevskia
Изучение мутационных изменений микросателлитов дрозо­филы показало, что большинство нарушений представляют со­бой сложный процесс. Особенностью этой работы являлось то, что все изучаемые повторяющиеся последовательности харак­теризовались небольшим числом звеньев и низким уровнем ге­терозиготности. Была показана положительная корреляция ме­жду полиморфизмом микросателлита и числом повторов в нем, связь структуры микросателлита
со структурой фланкирующих участков ДНК, а также подтверждена роль мутационных про­цессов в поддержании размера микросателлита. При этом вы­явлено два очень необычных явления:
накопление несовершенных повторов; возникновение крупных делеций с одновременным
накоплением аллелей с незначительным уменьшением числа повторов, что, вероятно, способствует деграда­ции микросателлитных локусов в ряду поколений.
В геномах многих организмов были обнаружены повторяю­щиеся последовательности ДНК, специфичные для таксономи­ческих групп и обладающие свойствами ретропозонов.
Исследования показали, что некоторые мини- и микросател­литы встречаются в
геноме в тесной связи с ретропозон-подоб­ными элементами. В геноме человека и приматов существуют Alu-повторы, ретропозиция которых происходит с большой час­тотой. Эти элементы могут являться источником возникнове­ния в геноме некоторых микросателлитных повторов, например
типа, а следовательно, и связанного с ними полиморфизма
(AC)
n
ДНК [Arcot et al., 1995]. Существует несколько моделей воз­никновения микросателлитов при участии Alu-элементов:
1) изменение некоего исходного микросателлита в резуль­тате встраивания в его последовательность Alu-элемента;
2) встраивание в геном Alu-элемента, изменившегося в про­цессе обратной транскрипции. Изменения могут затраги­вать области элемента, обогащенные А-основаниями (3’ концевая область и/или центральная зона Alu-пов­тора) [Arcot et al., 1995].
Изучение генома мыши выявило семейство вариабельных последовательностей MMS10, специфичных для грызунов, повторяющееся звено которых представлено GGCAGA олигонуклеотидом. Выделенные из генома и клонированные
g 31 G
À.À. Â
ЕРГУН
, À.Å. Ã
ИРНЫК
, Ô.À. Î
СИПОВ
, À.Â. Î
МЕЛЬЧЕНКО
последовательности были окружены участками ДНК, гомоло­гичными B1 SINE элементу мыши. Это позволило предполо­жить, что семейство B1 элементов является источником возник­новения MMS10 тандемно организованных вариабельных по­второв [Bois et al., 1998]. Было показано, что гипервариабельные мышиные минисателлиты Ms6-hm и Hm-2 возникли в резуль-
изменений, связанных с ретропозонподобными элемен-
тате
ми. Эти минисателлиты окружены длинными концевыми по-
та вторами (LTR — long terminal repeats) и содержат (GGGCA) и (GGCA)
олигонуклеотидные повторы, присутствующие в цен-
n
n
тральной области некоторых LINE элементов млекопитающих [Kelly, 1994].
Таким образом, существование диспергированных повторов со свойствами ретропозонов является еще одним источником полиморфизма ДНК. Обладая способностью к перемещению, SINE и LINE элементы, встраиваясь в различные участки гено­ма, приводят к появлению различных изменений. Например, предполагается, что некоторые SINE элементы представлены в геноме
в виде тандемно организованных кластеров, и изменение числа повторяющихся единиц или мутации в отдельном звене могут приводить к появлению ДНК-полиморфизма [Spruell et al., 1996]. Последовательности со свойствами ретропозонов мо­гут являться источниками возникновения мини- и микросател­литов и, следовательно, связанным с ними полиморфизмом ДНК [Bois et al., 1998; Spruell et al., 1996; Kelly, 1994]. Предполагается, что длинные концевые повторы, окружающие некоторые мини-
микросателлиты, и образующиеся в результате обратной транс-
и крипции LINE элементов, могут регулировать мутационные со­бытия в тандемно организованных последовательностях. LTR­повторы могут являться горячими точками гомологичной ре­комбинации или cis-действующими промоторами в геноме мле­копитающих [Kelly, 1994].
g 32 G
Ê
ЛОНАЛЬНОЕ РАЗНООБРАЗИЕ И МЕХАНИЗМЫ ЕГО ФОРМИРОВАНИЯ У ЯЩЕРИЦ РОДА
Darevskia
7. ПАРТЕНОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ВИДЫ
АВКАЗСКИХ СКАЛЬНЫХ ЯЩЕРИЦ
К
РОДА Darevskia (семейство Lacertidae)
В настоящее время известно около 40 видов однополых яще­риц, а также три или четыре вида, принадлежащих к двум се­мействам мелких роющих змей. Все перечисленные однополые виды рептилий размножаются облигатным партеногенезом и со­ставляют менее 1% современной мировой фауны ящериц и змей [Коул, 1984; Darevsky, 1993].
Одними из наиболее интересных представителей клонально размножающихся рептилий казские скальные ящерицы рода Darevskia (2n = 38: 36 аутосом и WZ половые хромосомы), входящие в saxicola-комплекс [Mur­phy et al., 1997], включающий 17 двуполых и 7 однополых видов ящериц рода Darevskia (сем. Lacertidae) [Arribas, 1999], обитаю­щих в Закавказье и соседних районах Турции. Партеногенети­ческие ящерицы впервые были открыты в Армении И.С. Дарев­ским. Он обнаружил, что популяции Армянской meniaca) состоят из одних самок, которые способны отклады­вать неоплодотворенные, но вполне жизнеспособные яйца [Да­ревский, 1958]. Все однополые виды ящериц, входящие в saxi- cola-комплекс, на большей части ареала аллопатричны со свои­ми родительскими формами, однако местами между ними со­храняются зоны симпатрии, в которых обычно возникают сте­рильные триплоидные генома от матери и геном от отца [Даревский, 1993; Darevsky, 1993]. Однополые виды часто встречаются в областях, неблаго­приятных для обитания бисексуальных форм.
Места обитания ящериц рода Darevskia обычно связаны с раз­личными типами каменистых поверхностей. Некоторые из них
являются партеногенетические Кав-
ящерицы (D. ar-
гибриды обоих полов, получающие два
g 33 G
À.À. Â
ЕРГУН
, À.Å. Ã
ИРНЫК
, Ô.À. Î
СИПОВ
, À.Â. Î
МЕЛЬЧЕНКО
вторично заселяют участки леса и узкие полосы горных лугов, прилежащих к скалам. Однополые виды ящериц достаточно хо­рошо адаптируются в новых условиях обитания. Так, например, в 1963 году Даревским был проведен эксперимент по интродук­ции партеновида D. armeniaca из Армении на Украину. Ящери­цы были отловлены в Армении в гористой местности на высоте 1600 метров над уровнем моря и выпущены на Украине в сход­ные по климатическим условиям местообитания на высоте 200 метров над уровнем моря [Даревский, Щербак, 1968]. Последую­щие наблюдения показали, что интродукция прошла успешно, образовалась новая устойчивая популяция, которая постоянно занимала все большие территории и заселяла биотопы, нехарак­терные для данного вида, например
, участки смешанного леса. Самки этой популяции откладывали яйца на две недели рань­ше, чем в Армении, что является адаптацией к новым климати­ческим условиям [Даревский и др., 1998].
Адаптация к новым условиям обитания является преимуще­ством партеногенетических видов по сравнению с бисексуаль­ными. Однако самым главным преимуществом является сам способ размножения,
так как увеличивается темп размножения за счет того, что все особи популяции способны оставлять по­томство, в то время как при бисексуальном размножении только половина. При партеногенетическом способе размножения очень малое число особей, попавших в благоприятные условия оби­тания, могут образовать новую популяцию, что было показано для ряда островных видов [Даревский
, 1993]. Популяции пар­теногенетических видов представляют собой клоны — группы генетически идентичных особей, происходящих от одного пред­ка. При таком способе размножения отсутствует комбинатор-
изменчивость, поэтому все изменения носят случайный
ная характер и, вероятно, отражают мутационные или рекомбина­ционные процессы, происходящие в геноме партеногенетиче­ских особей.
Сравнительный анализ изменчивости сайтов рестрикции митохондриальной ДНК у бисексуальных и партеногенетиче­ских видов, аллозимный анализ, а также кариологические
ис­следования позволили говорить о гибридном происхождении партеногенетических видов рода Darevskia [Moritz et al., 1992],
g 34 G
Ê
ЛОНАЛЬНОЕ РАЗНООБРАЗИЕ И МЕХАНИЗМЫ ЕГО ФОРМИРОВАНИЯ У ЯЩЕРИЦ РОДА
Darevskia
а также однополых видов некоторых других родов, например, ящериц-бегунов рода Cnemidophorus (Мексика, юг США) [Коул, 1984]. Степень дивергенции митохондриального генома между особями материнского бисексуального вида и партеногенетиче­ского вида позволяет определить возраст однополого вида; на­пример, приблизительный возраст двух партеногенетических видов D. unisexualis и D. rostombekowi 5000 лет. Степень дивер­генции митохондриального генома между
материнскими и
со­ответствующими партеногенетическими видами кавказских скальных ящериц составляет 0%–0.6%, что свидетельствует о недавнем возникновении партеногенетического типа размно­жения в роде Darevskia, вероятно, около 10000 лет назад, после ледникового периода [Moritz et al., 1992].
Происхождение партеновидов кавказских скальных ящериц можно описать при помощи теории «сетчатого видообразова­ния» [Даревский, 1993] — то есть путем гибридизации между пятью предковыми бисексуальными видами, причем гибриди­зация в разных сочетаниях одних и тех же родительских
форм приводила к возникновению различных партеногенетических гибридных видов [Даревский, 1993; Darevsky, 1993]. Это подтвер­ждается обнаруженной высокой фиксированой гетерозиготно­стью аллозимных локусов и результатами анализа митохондри­альной ДНК [Moritz et al., 1992; Murphy et al., 1997]. Один из би­сексуальных видов является материнским, а другой — отцов­ским, т. е. в процессе гибридизации участвовали самки одного вида и самцы другого. Материнский вид
определяли путем срав­нительного анализа полиморфизма митохондриальной ДНК особей партеногенетического вида и предполагаемого бисексу­ального родительского вида, т. к. наследование митохондриаль­ного генома происходит по материнской линии [Moritz et al., 1992]. Значительное сходство последовательностей митохонд­риальной ДНК партеногенетических видов и родственных им двуполых видов рода Darevskia говорит о сравнительно недав­нем возникновении партеногенеза (около 10 000–12 000
лет на-
зад, после ледникового периода).
Отцовские бисексуальные виды определяли с помощью ал­лозимного анализа [Moritz et al., 1992]. В результате были обо­значены предполагаемые родительские виды для каждого пар­теногенетического вида кавказских лацерт (табл. 1).
g 35 G
À.À. Â
ЕРГУН
, À.Å. Ã
ИРНЫК
, Ô.À. Î
СИПОВ
, À.Â. Î
МЕЛЬЧЕНКО
Таблица 1
И
СХОДНЫЕ РОДИТЕЛЬСКИЕ ВИДЫ ДЛЯ СЕМИ ПАРТЕНОГЕНЕТИЧЕСКИХ ВИДОВ
РОДА Darevskia [MORITZ ET AL., 1992; FU ET AL., 2000А]
ТЦОВСКИЙ»
О
ДНОПОЛЫЙ ВИД
«М
АТЕРИНСКИЙ» ВИД
D. rostombekowi D. raddei D. portschinskii D. armeniaca D. mixta D. valentini D. dahli D. mixta D. portschinskii D. unisexualis D. nairensis D. valentini D. sapphirina D. raddei или D. nairensis D. valentini D. bendimahiensis D. raddei или D. nairensis D. valentini D. uzzelli D. valentini D. nairensis
С помощью морфологического и молекулярно-генетического анали­за в видовом комплексе D. raddeiD. nairensis было выявлено два подвида (D. raddei nairensis и D. raddei raddei), видовой статус кото- рых на сегодняшний день является спорным [Moritz et al., 1992; Grechko
et al., 1997; Гречко и др., 1998; Рябинина и др., 1998; Murphy et al., 2000; Омельченко и др., 2016]
«О
ВИД
Аналогичным образом, в результате гибридизации бисексу­альных родительских форм образовались и многочисленные диплоидные и триплоидные партеногенетические виды амери­канских тейидных ящериц рода Cnemidophorus [Даревский, 1993], представленных примерно 12-ю видами из 40 видов это­го рода [Cole, Townsend, 1975; Cole et al., 1988]. Для других партеногенетических видов, например, гекконов рода Hemidac-
их
tylus, показано, что зацией. Партеногенез
происхождение не связано с гибриди-
в этой группе имеет негибридную при­роду. Данная группа включает три триплоидных морфологиче­ски близких вида, которые резко различаются кариологически. Близкие по кариотипу бисексуальные формы отсутствуют, что свидетельствует в пользу становления этих видов в результате хромосомных перестроек у некоего исходного, автотриплоид­ного, вида [Даревский,1993].
Наиболее детально механизм мейоза установлен у
лых ящериц рода
Cnemidophorus
. Доказано, что у этих видов
однопо-
имеет место премейотическое восстановление соматического
g 36 G
Ê
ЛОНАЛЬНОЕ РАЗНООБРАЗИЕ И МЕХАНИЗМЫ ЕГО ФОРМИРОВАНИЯ У ЯЩЕРИЦ РОДА
Darevskia
набора хромосом. Изучение образования яиц у однополых яще­риц-бегунов показало, что в клетках яичников [Коул, 1984] про­исходит премейотический эндомитоз, благодаря чему удваива­ется число хромосом в яйцеклетках [Dawley, 1989], и клетки становятся полиплоидными. У диплоидных видов образуются тетраплоидные клетки, а у триплоидных — гексаплоидные [Коул, 1984]. Мейоз начинается с образования пар между иден­тичными
хромосомами. Между идентичными хромосомами происходит синапсис, что приводит к формированию псевдо­бивалентов. Дальше мейоз протекает как и у двуполых видов [Dawley, 1989], но происходящий при кроссинговере обмен ДНК не имеет генетических последствий, т. к. в нем участвуют идентичные молекулы ДНК [Коул, 1984]. Когда хромосомы пе­реходят во вторую стадию мейотического деления, создается впечатление, что премейотической дупликации не
происходило и первое деление мейоза отсутствовало [Dawley, 1989]. Как это обычно бывает при созревании половых клеток, вслед за крос­синговером клетки дважды делятся. И, в конечном счете, обра­зуются яйца, в каждом из которых столько же хромосом и та же комбинация генов, что и в исходной клетке яичника до дуп­ликации. С генетической
точки зрения, такое зрелое яйцо полно­ценно, в отличие от гаплоидного у самок двуполых видов, и мо­жет развиваться без оплодотворения [Коул, 1984].
Механизмы мейоза у партеногенетических видов ящериц рода Darevskia изучены недостаточно хорошо. К настоящему времени известно, что редукционное деление мейоза протекает без нарушений, формируется первое полярное тельце и мета­фазная пластинка второго (эквационного) деления. Однако вто­рое полярное тельце не формируется. Число бивалентов в мета­фазе I, также как и число хромосом в метафазе II, не превышает гаплоидного набора (n = 19). Вероятно
, диплоидное число хро­мосом восстанавливается или путем слияния ядер после эква­ционного деления, или подавлением второго мейотического де­ления и, таким образом, анафаза второго деления мейоза не до­ходит до конца [Darevsky, 1985].
Все изученные партеногенетические вида рода Darevskia несут в кариотипе редуцированную и в разной степени гетеро­хроматизированную половую хромосому W/w. Данная
хромо-
сома «наследуется» от родителького материнского вида и играет
g 37 G
À.À. Â
ЕРГУН
, À.Å. Ã
ИРНЫК
, Ô.À. Î
СИПОВ
, À.Â. Î
МЕЛЬЧЕНКО
доминирующую роль в формировании типа гонад и определении пола [Куприянова, 1997]. Также были обнаружены явления инактивации W/w хромосомы и импринтинга в гибридных ди­и триплоидных геномах — появления диплоидных особей WZ с семенниками и «ovotestis», интерсексы с семенниками, трип­лоидные и мозаичные стерильные особи. Хромосомный анализ гибридов между самкой D. unisexualis (w
половая хромо-
nZv
сома w от материнского вида D. nairensis и хромосома Z от от­цовского вида D. valentini) и самцом двуполого отцовского вида
D. valentini (Z (w
) встречаются как стерильные «самцы», так и
nZvZv
) показал, что среди таких триплоидных особей
vZv
стериль-
ные «самки». Триплоидные гибриды от скрещивания самок
D. unisexualis (wnZv) и самцов двуполого материнского вида D. nairensis (Z
) имели в кариотипе половые хромосомы wnZnZv
vZv
и были самками, хотя и стерильными.
В потомстве партеногенетических лацерт очень редко (при­мерно 1:1000) встречаются мужские особи. Большинство из них гибнет на разных стадиях эмбриогенеза. Немногие из этих самцов достигают половой зрелости, однако фертильность их заметно снижена. Цитологическим механизмом, контролирую­щим возникновение самцов у партеногенетических видов яще­риц, может являться
инактивация w-хромосомы и/или имприн-
тинг Z-хромосом [Куприянова, 1997].
7.1. КЛОНАЛЬНОЕ РАЗНООБРАЗИЕ D. dahli
Вид Darevskia dahli — один из семи облигатно-партеногене­тических диплоидных видов рода Darevskia, обитающий на тер­ритории Грузии и Армении (рис. 6), возникший в результате межвидовой гибридизации бисексуальных видов D. portschin- skii и D. mixta. Родительские виды в настоящее время аллопат­ричны [Darevsky et al., 1967] — ареал D. portschinskii представ­лен популяциями в южной Грузии, северной Армении и запад-
Азербайджане, D. mixta встречается только в Грузии [Da-
ном revsky, 1967]. Согласно данным митохондриального анализа, ма­теринским видом является вид D. mixta, что было подтверждено и таксонопринтным методом [Гречко и др., 1993]. Отцовский вид был определен с помощью анализа аллозимных локусов и ме­тода полимеразной цепной реакции со случайными праймерами
g 38 G
Ê
Р
Ар
ЛОНАЛЬНОЕ РАЗНООБРАЗИЕ И МЕХАНИЗМЫ ЕГО ФОРМИРОВАНИЯ У ЯЩЕРИЦ РОДА
Darevskia
Рис. 6. Ареал партеногенетического вида Darevskia dahli на террито-
рии Армении. Кругами и цифрами обозначены места обитания: 1 — Ваагни (Туманян); 2 — Дендропарк (окр. г. Степанаван); 3 — Дзорагет (окр. г. Степанаван); 4 — Папанино (окр. г. Дилижан); 5 — Фиолетово; 6 — Шагали (Туманян)
[Гречко и др., 1993]. Darevskia dahli характеризуется типичным для рода Darevskia диплоидным набором (2n = 38) и морфоло­гией хромосом (акроцентрические, А), в геноме присутствуют микрохромосомы. В Армении D. dahli населяет умеренно сухие скальные ущелья и склоны в лесной зоне на высоте от 700 до 1500 метров над уровнем моря, а также каменистые местооби­тания в горной степи, kelyan, 2011]. Популяции
ранее бывшиt лесными участками [Ara-
D. dahli
довольно многочисленны и изолированы друг от друга. Некоторые популяции симпатрич­ны с другими партеногенетическими и двуполыми видами рода Darevskia. Например, в регионе Дзорагет (недалеко от г. Степа­навана), D. dahli симпатричен с бисексуальным родительским видом D. portschinskii и партеногенетическим видом D. arme- niaca; в окрестностях деревни Севкарон обитает совместно с однополыми видами D. rostombekowi и D. armeniaca, и
бисек­суальным видом D. raddei. Межвидовые гибриды, встречающие­ся в зонах симпатрии, являются триплоидными и стерильными [Davoyan, 2007]. Опираясь на данные аллозимного анализа и на
g 39 G
À.À. Â
ЕРГУН
, À.Å. Ã
ИРНЫК
, Ô.À. Î
СИПОВ
, À.Â. Î
МЕЛЬЧЕНКО
современную аллопатричность родительских бисексуальных видов, Мёрфи и соавторы [Murphy et al., 1997] предположили, что в межвидовой гибридизации (с образованием партеновида) участвовало ограниченное число особей двуполых видов, и ус­пешный клон (т. е. фертильный гибрид, давший начало однопо­лому виду) возник только однажды.
На основании анализа 35-ти аллозимных локусов в популя-
циях партеновида D. dahli было выявлено
пять аллозимных кло­нов. Один из них был широко распространен по всему ареалу, а четыре — только в некоторых популяциях Армении, и были представлены малым числом особей [Murphy et al., 1997]. В од­ной из популяций (Папанино, окр. г. Дилижан) по окраске брюш­ка было выявлено две морфоформы, самки одной из них имели ярко-желтую
окраску нижней стороны тела и в отличие от са­мок другой морфоформы, которые имели бледно-желтую окра­ску, откладывали меньше яиц и были менее устойчивы к за­сушливым условиям [Murphy et al., 1997].
С помощью мультилокусного ДНК-фингерпринтинга было показано, что особи D. dahli характеризуются видоспецифиче­ским спектром маркеров, и по ряду микросателлитсодержащих локусов в исследованных
популяциях удается выявить значи­тельный уровень генетического полиморфизма. C использова­нием М13-минисателлитной и (ТСС)
-микросателлитной проб
50
в сочетании с двумя эндонуклеазами рестрикции BsuRI и MvaI изучали геномную вариабельность в природных популяциях D. dahli [Кан и др., 1998]. Индексы сходства в каждом из про­веденных вариантов мультилокусного анализа ДНК у D. dahli незначительно варьировали в пределах от 0,926 до 1. По данным кластерного анализа изученных особей разделили на 12 групп, которые различались единичными или несколькими вариантами фрагментов ДНК. Природа выявленных различий остается неиз­вестной. По-видимому, они возникают в
результате мутаций в сайтах рестрикции ДНК или сложных внутригеномных реор­ганизаций.
Молекулярно-генетические исследования индивидуальных микросателлитсодержащих локусов позволяют получать более полные данные относительно генетической вариабельности и формирования клонов у
D. dahli
, а также о количестве
возможных
g 40 G
Соседние файлы в предмете [НЕСОРТИРОВАННОЕ]