- •Упаковка днк в хромосомах. Хромосомы эукариот. Гистоны, нуклеосомы, негистоновые белки. Хромосомы прокариот.
- •2. Репликация днк. Схема репликации днк. Днк-полимеразы. Типы днк-полимераз, активности днк-полимераз, инициация синтеза днк, днк-полимеразы про- и эукариот.
- •Инициация синтеза днк у прокариот (например, Escherichia coli)
- •Распознавание и связывание с origin (oriC):
- •Образование репликационной вилки:
- •Синтез рнк-праймера:
- •Присоединение днк-полимеразы III:
- •Инициация синтеза днк у эукариот
- •Распознавание репликационного начала:
- •Загрузка геликаз:
- •Синтез рнк-праймера:
- •Присоединение днк-полимераз:
- •4. Репликация днк. Схема репликации днк. Точки начала репликации (origin). Инициация образования новых цепей днк. Рнк-праймеры, праймаза (праймосома), необычные случаи инициации.
- •5. Репликация днк. Схема репликации днк. Терминация репликации. Теломерная днк и теломераза.
- •6. Репликация рнк. Репликация геномов ретровирусов. Обратная транскриптаза. Репликация рнк с образованием рнк.
- •7. Репарация днк. Повреждения в структуре днк. Репарация путем прямого восстановления исходной структуры. Репарация путем замены модифицированных остатков. Значение репарации днк.
- •12. Трансляция мРнк у прокариот. Условия инициации. Элонгация полипептидной цепи. Терминация элонгации полипептидной цепи.
- •13. Регуляция экспрессии лактозного оперона.
- •14. Регуляция экспрессии триптофанового оперона.
- •15. Рнк интерференция.
- •16. Доставка эукариотических белков к клеточным мембранам и проникновение через них. Транспорт белков в эукариотические клеточные органеллы. Транспорт белков в клетках прокариот.
- •Основные этапы везикулярного транспорта:
- •Два основных механизма везикулярного переноса:
- •Роль сигнального (лидерного) пептида
- •Ядерный транспорт
- •Транспорт в митохондрии и хлоропласты
- •Транспорт в эндоплазматический ретикулум (эр)
- •Транспорт через Гольджи аппарат и лизосомы
- •Транспорт белков в клетках прокариот
- •1. Система Sec (общий секреторный путь):
- •2. Система Tat (путь протонного градиента):
- •18. Транскрипция у эукариот. Регуляторные участки гена эукариот: инициация транскрипции, энхансеры, сайленсеры и инсуляторы. Терминация транскрипции с участием рнк-полимераз I, II и III.
- •19. Структурная часть гена эукариот. Мозаичные единицы транскрипции. Экзоны и интроны. Сплайсинг рнк: альтернативный сплайсинг, локализация генов в интронах.
- •1. Промотор
- •Конститутивный и альтернативный сплайсинг
- •Роль альтернативного сплайсинга в клетке
- •20. Сплайсинг рнк. Сплайсинг ядерной про-мРнк. Интроны, вырезаемые при помощи автокаталитического сплайсинга.
- •21. Строение эукариотического гена. Расположение генов в хромосомах эукариот. Структура генома эукариот.
- •22. Мобильные элементы генома. Классификация мобильных элементов.
- •1. Транспозоны:
- •2. Ретровирусы:
- •23. Мобильные элементы генома. Ретротранспозоны.
- •24. Мобильные элементы генома. Мобильные элементы прокариот: is-элементы, транспозоны. Is-элементы и транспозоны в плазмидах. Бактериофаг Mu.
- •Мобильные элементы прокариот
- •Бактериофаг Mu.
- •25. Функциональное значение мобильных элементов генома. (Васина)
- •26. Рибонуклеиновые кислоты. Структура рнк. Типы рнк и их распространённость. Минорные рнк. Рибозимы. Вирусные рнк. Мультифункциональность рнк. (Васина)
Инициация синтеза днк у прокариот (например, Escherichia coli)
Распознавание и связывание с origin (oriC):
Белок DnaA DnaA — входит в белковое семейство AAA+ ATPаз (ATPases associated with diverse cellular activities). распознает и связывается с определенными участками на репликационном начале oriC. Эти участки представляют собой специфические последовательности ДНК, которые являются мишенью для белка DnaA. После связывания DnaA с oriC, происходит локальное "распаковывание" двойной спирали ДНК, что позволяет другим белкам доступ к одиночным цепям ДНК.
Образование репликационной вилки:
ДНК-геликаза DnaB разрывает водородные связи между комплементарными основаниями в ДНК, чтобы разделить двойную спираль на две одноцепочечные молекулы ДНК. Это образование репликационной вилки — структуры, где происходит синтез новых цепей ДНК.
Белок DnaC помогает DnaB связаться с одноцепочечными участками ДНК и стабилизирует его активность, что важно для поддержания репликационной вилки.
Синтез рнк-праймера:
Примаза (Primase, также известная как DnaG) синтезирует короткий фрагмент РНК, называемый праймером. Этот праймер служит стартовой точкой для добавления новых нуклеотидов ДНК, так как ДНК-полимераза не может начать синтез без праймера.
РНК-праймер синтезируется с использованием одноцепочечной ДНК как шаблона.
Присоединение днк-полимеразы III:
ДНК-полимераза III (или DNA polymerase III) является основным ферментом, который синтезирует новые цепи ДНК. Она присоединяется к 3'-концу РНК-праймера и начинает добавление дезоксирибонуклеотидов, используя одноцепочечную ДНК как шаблон.
ДНК-полимераза III работает в комплексе с другими белками, такими как γ-комплекс (который помогает в создании и поддержании репликационной вилки), и кольцевым слайдерами (clamp), обеспечивающими высокую процессивность (долгосрочное присоединение к ДНК).
Инициация синтеза днк у эукариот
Инициация синтеза ДНК у эукариот более сложная из-за их генетической организации и множества регуляторных механизмов, но основные этапы и белки схожи с таковыми у прокариот.