- •1) Микроорганизмы – важнейшие объекты селекции продуцентов
- •2) Цели и задачи селекции продуцентов
- •3) Основные направления развития селекции продуцентов
- •4) Принципы подбора исходного штамма для селекции
- •5) Требования предъявляемые к промышленным штаммам
- •6) Подготовка исходного штамма к селекции
- •7) Мутагенез in vivo. Типы мутагенов, используемых при индуцированном мутагенезе.
- •8) Способы отбора мутантов
- •9) Методы повышение продуктивности мутантов
- •10) Получение рекомбинантов у грибов и дрожжей методом гибридизации.
- •11) Конъюгация у бактерий
- •12) Создание систем конъюгационного переноса плазмид
- •13)Трансдукция как метод создания рекомбинантных геномов
- •14)Способы сближения att-сайтов
- •15) Трансформация бактерий фаговыми и плазмидными днк.
- •16) Особенности трансформации у дрожжей
- •17) Мобильные генетические элементы эу- и прокариот.
- •Мобильные генетические элементы эукариот
- •18) Характер мутаций, вызываемых мгэ
- •19) Транспозонный матугенез
- •20) Векторы, используемые для введения транспозонов
- •21) Методы получения рекомбинантной днк
- •22) Протопласты и сферопласты микрорганизмов
- •23)Способы получения протопластов у грамположительных, грамотрицательных бактерий, грибов и дрожжей. Отредачить
- •Подавление синтеза
- •24)Метод слияния протопластов и его использование для получения рекомбинантов у бактерий, грибов и дрожжей
- •25) Характеристика ферментов, используемых в генной инженерии
- •26) Векторные молекулы днк
- •27) Определение вектора. Требования, предъявляемые векторам.
- •28) Плазмидные векторы, используемые для клонирования в клетка прокариот.
- •29) Векторы для клонирования крупных фрагментов днk
- •30) Космиды. Особенности клонирования генов с помощью космид.
- •31) Фазмиды. Характеристика фазмидных векторов
- •32. Векторы на основе днк нитевидных фагов
- •33. Создание геномной библиотеки
- •34. Скрининг полученной коллекции???
- •35. Скрининг с помощью гибридизации, иммуннологический скринин, скрининг по активности белка
- •36. Селекция продуцентов ак
- •37. Характеристика основных групп микроорганизмов-продуцентов аминокислот редачить
- •38. Основные тенденции в развитии селекции продуцентов аминокислот
- •39. Селекция продуцентов аминокислот семейства аспарагиновой кислоты редачить
- •40. Селекция продуцентов ароматических аминокислот
- •41. Селекция продуцентов аминокислот семейства глутаминовой кислоты
- •42. Селекция продуцентов пролина и гистидина
- •43. Селекция продуцентов ферментов.
- •44. Преимущества использования микроорганизмов для создания продуцентов ферментов
- •45. Основные тенденции в развитии селекции продуцентов ферментов
- •46. Важнейшие классы ферментов, получаемые ферментов, получаемых микробиологическим способом, их основные продуценты. Способы создания продуцентов ферментов.
- •47. Мировое производство ферментов, основные производители
- •48. Селекция продуцентов полисахаридов(?)
- •49. Использование полисахаридов, получаемых микробиологическим способом
- •50. Тенденции в развитии селекции продуцентов полисахаридов
- •51. Селекция продуцентов липидов
- •52. Характеристика микробных липидов
- •53. Основные продуценты липидов среди бактерий, грибов и дрожжей
- •54. Селекция продуцентов липидов у дрожжей
- •55. Селекция продуцентов органических кислот
- •56. Селекция продуцентов витаминов
- •57. Характеристика микробных витаминов
- •58. Использование бактерий, грибов и дрожжей для создания витаминов.
- •59. Селекция продуцентов фитогормонов
- •60. Селекция продуцентов антибиотиков.
- •61. Разнообразие антибиотических веществ, продуцируемых микроорганизмами.
- •62. Методы создания продуцентов антибиотиков и способы повышения их продуктивности редачить
46. Важнейшие классы ферментов, получаемые ферментов, получаемых микробиологическим способом, их основные продуценты. Способы создания продуцентов ферментов.
Класс I. Оксидоредуктазы катализируют окислительно-восстановительные реакции, являясь, ключевыми в процессах синтеза органических веществ из неорганических и в процессах клеточного дыхания (Penicillium, Candida, Streptococcus)
Класс II. Трансферазы переносят химические группы от одной молекулы к другой (Bacillus, Escherichia).
Класс III. Гидролазы - ферменты, осуществляющие гидролиз субстрата (Trichoderma, Aspergillus)
Класс IV. Лиазы катализируют разрыв внутримолекулярных связей негидролитическим путём (Lactobacillus)
Класс V. Изомеразы катализируют изомерные превращения в пределах одной молекулы(Actinoplanes)
Класс VI. Лигазы катализируют присоединение двух молекул друг к другу с использованием энергии макроэргических связей(Escherichia, Bacillus)
Способы
В селекции продуцентов ферментов используются как традиционные в селекции микроорганизмов подходы (мутагенез и ступенчатый отбор на сверхсинтез), так и методы генной инженерии (получение генетических рекомбинантов и клонирование генов). Все эти методы традиционно направлены на изменение или полное снятие регуляции синтеза ферментов. Известно, что эта регуляция осуществляется на пяти основных стадиях: 1) связывание РНК-полимеразы и инициация транскрипции; 2) индукция или дерепрессия транскрипции; 3) катаболитная репрессия транскрипции; 4) связывание рибосом и стабильность мРНК; 5) проникновение фермента через мембрану и стенку клетки с последующим процессингом (если это внеклеточный фермент).
Мутанты по РНК-полимеразе легко выделяют с помощью селекции на антибиотикоустойчивость (например, к рифампицину или стрептолидигину). Такой подход использовался в получении продуцентов а-амилазы у B. subtilis. Нарушение синтеза данного фермента происходило, очевидно, вследствие изменения узнавания мутировавшей РНК-полимеразой промоторов для генов а-амилазы.
Примером получения продуцента промышленного масштаба может служить синтез глюкоизомеразы у Streptomyces phaechromogenes. Этот фермент используется для метаболизма ксилозы и ликсозы, однако ликсоз не индуцирует его синтез. Поэтому проводят отбор мутантов, выросших на среде с ликсозой, поскольку они будут иметь конститутивный синтез этого фермента. Мутанты, нечувствительные к катаболитной репрессии, представляют ценность в нескольких отношениях. Во-первых, они синтезируют ферменты на ранних стадиях ростового цикла культуры. Во-вторых, они всегда секретируют ферменты на более высоком уровне и допускают использование дешевых субстратов. Такие мутанты получают несколькими путями: • простой отбор мутантов на агаризованных средах, содержащих высокие концентрации глюкозы или глацерола; • путем селекции на рост в присутствии антиметаболитов, например целлобиозы.
47. Мировое производство ферментов, основные производители
Ферменты широко применяются в различных отраслях промышленности, а достижения современной энзимологии еще значительнее расширили возможности применения ферментов, и в первую очередь, в медицине и пищевой промышленности. Рынок ферментов растет из года в год, причем он очень четко ориентирован на тенденции того рынка, где применяются ферменты. Его развитие зависит от двух взаимосвязанных факторов: экономической целесообразности их применения и возможности их промышленного производства. С деятельностью ферментов человечество знакомо очень хорошо с древних времен, хотя и не догадывалось об этом.
В настоящее время в промышленности применяют три вида штаммов: природные штаммы, нередко улучшенные естественным или искусственным отбором; штаммы, измененные в результате индуцированных мутаций; штаммы, полученные методами генной или клеточной инженерии.
Значительное увеличение выпуска ферментов наметилось в последние годы в связи с бурным ростом производства биоэтанола. Создание промышленных способов получения недорогих амилолитических ферментных препаратов произвело революционный прорыв в технологии, который повлиял на мировую экономику. С помощью современных ферментных технологий из зерна получают биоэтанол - недорогое жидкое моторное топливо, которое уже стало альтернативой бензину, что дает возможность странам, не имеющим нефтяных месторождений, стать независимыми от поставок нефти. И это еще не все, на что способны ферменты. В будущем с их помощью можно будет получать биоэтанол из целлюлозосодержащего сырья, т.е. жидкое топливо из опилок - реальность завтрашнего дня. Сегодня биотехнология, особенно производство ферментных препаратов - огромный потенциал мировой экономики.
Одна из ведущих фирм по производству ферментных препаратов датская компания Novozymes начала в 2008 году строительство нового завода по производству ферментов для получения этанола в г. Бдэр (США). Эта компания считается непревзойденным лидером в области производства ферментов для получения этанола. Положительный пример не остается без поддержки. Компании Dupont и Genencor, подразделение Danisco A/S также объявили о создании совместного предприятия, которое будет выпускать биоэтанол из целлюлозосодержащего сырья, рынок которого оценивается в 75 млрд долларов.
На сегодняшний день рынок ферментов достаточно стабилен. Главными игроками на нем остаются такие компании, как Novozymes, Danisco, Genzyme, Roche, Allergen, DSM и BASF. Компания Novozymes контролирует 46% рынка ферментных препаратов, из которых, по данным исследовательского агентства Freedonia Group, более 26% приходится на ферменты для пищевой промышленности. Остальная часть (36%) поделена между Danisco, Genzyme, Roche, Allergen, DSM и BASF.
