- •Введение в биохимию
- •Биохимия
- •Признаки живой материи:
- •Признаки живой материи:
- •Место в структуре программы специалитета. Биохимия относится к дисциплинам базовой части.
- •Объекты биохимических исследований. Современные направления исследований.
- •Биохимические анализы крови, мочи, ликвора, слюны -
- •Клиническая биохимия -
- •Структура дисциплины
- •Успехов в освоении дисциплины!
- •Вся наша жизнь - нелепое чудо, пробившееся в реальность вопреки всем законам мироздания.
- •Проблемы и задачи протеомики в медицине
- •Основные вопросы лекции:
- •Белки (протеины)
- •«Жизнь есть способ существования белковых тел» Ф. Энгельс
- •Международный проект «Протеом человека» (Human Proteome Project, НРР)
- •Белки – высокомолекулярные органические полимеры, построенные из аминокислот, связанных между собой
- •В процессе биосинтеза белка в полипептидную цепь включаются 20 α-аминокислот, кодируемых генетическим кодом
- •Качественный состав белка зависит от состава аминокислот.
- •Строение белков
- •Первичная структура белка. Аминокислоты могут ковалентно связываться друг
- •Характеристика пептидной связи
- •Пептидные связи очень прочны и самопроизвольно не разрываются при нормальных условиях.
- •Количество аминокислот в составе пептидов (белков) может сильно варьировать.
- •В организме вырабатывается множество пептидов, участвующих в регуляции биологических процессов и обладающих высокой
- •Молекулярная масса (ММ) белка зависит от количества
- •Роль первичной структуры
- •Вторичная структура белков -
- •Пептидные цепи могут приобретать структуры 2 типов:
- •β- структура
- •Нерегулярные вторичные структуры
- •Третичная структура белков -
- •Третичная структура белка
- •Фолдинг -
- •Форма белковой молекулы
- •Растворимость белка определяется его структурой
- •ИЭТ – индивидуальная характеристика белка
- •Центр связывания белка (активный центр) - участок
- •Этапы формирования функционально активного белка. В основе функционирования любого белка лежит его способность
- •Домен белка— элемент третичной структуры белка.
- •Сложные белки (холопротеины)
- •Сложные белки
- •Белки обладают антигенными свойствами.
- •Конформационная лабильность белков -
- •Четвертичная структура белков. Характеризуются белки, состоящие из 2 и более полипептидных цепей.
- •ОСОБЕННОСТИ ФУНКЦИОНИРОВАНИЯ ОЛИГОМЕРНЫХ БЕЛКОВ
- •Гемоглобин (НЬ) — олигомерный белок, состоит из 4 протомеров
- •Кооперативные изменения конформации протомеров Нb ускоряют нагрузку О2 в легких и разгрузку в
- •Изменение конформации облегчает взаимодействие следующего
- •Характерная для гемоглобина S-образная кривая насыщения О2 свидетельствует, что связывание первой молекулы О2
- •Размер белка может измеряться в числе аминокислотных остатков или в дальтонах (молекулярная масса,
- •Денатурация белка -
- •Денатурация белка. Ренативация белка.
- •Применение денатурирующих агентов в биологических исследованиях и медицине
- •Полиморфизм белков -
- •Полиморфизм белков в онтогенезе. Изофункциональные белки.
- •Полиморфизм белков при патологии. ИЗМЕНЕНИЯ БЕЛКОВОГО СОСТАВА ОРГАНИЗМА
- •Первичные протеинопатии.
- •Прионы
- •Вторичные протеинопатии: причины и следствия
- •Благодарю за внимание!
Пептидные цепи могут приобретать структуры 2 типов:
α-спираль и β-структура.
o α-спираль
oВодородные связи ориентированы вдоль оси спирали. На один виток α-спирали приходится 3,6 АК.
Водородные связи относят к разряду слабых (разрушаются при повышении температуры!), но их количество обеспечивает max стабильность молекулы.
В результате образования α-спиралей полипептидная цепь укорачивается.
α- cпираль - наиболее устойчивая конформация пептидного остова, отвечающая min свободной энергии.
β- структура
формируется за счёт образования водородных связей между атомами пептидных групп линейных областей одной полипептидной цепи, делающей изгибы, или между разными полипептидными цепями.
β-структура образует фигуру, подобную листу, сложенному гармошкой
(β-складчатый слой).
Лайнус Полинг (1901 – 1994) - американский химик, кристаллограф, Лауреат Нобелевских премий:
по химии (1954), премии мира (1962). Известен открытием основных элементов вторичной структуры белка:
α-спирали и β-листа, первой идентификацией молекулярного заболевания
(серповидно-клеточной анемии).
Нерегулярные вторичные структуры
В белках отмечают области
снерегулярной вторичной структурой, которые часто называют
беспорядочными клубками, надвторичными структурами.
Они представлены петлеобразными и кольцеобразными структурами, имеющими меньшую регулярность укладки, чем описанные выше
α-спираль и β-
структура.
Третичная структура белков -
способ укладки полипептидной цепи
втрехмерном пространстве. Стабилизируется связями между боковыми радикалами аминокислот.
Связи,
формирующие
третичную
структуру
Нековалентные Ковалентные гидрофобные
дисульфидные ионные, водородные
Третичная структура белка
Формирование трёхмерной структуры (конформации) белков - важнейший биологический процесс, от которого зависит их биологическая функция.
Функционально активную конформацию называют
нативной структурой белка (от лат. Nativus - врожденный), т.е. находящийся в природном состоянии, не модифицированный, сохранивший структуру, присущую ему в живой клетке.
Фолдинг -
это процесс сворачивания полипептидной цепи в правильную пространственную структуру (конформацию) в процессе
биосинтеза белка на рибосомах; способствует формированию нативной структуры белка.
Фолдинг протекает при участии специальной группы белков в клетке,
которые называются шапероны. В полости шаперонового комплекса происходит перебор возможных конформаций синтезированного белка, пока не будет найдена единственная, энергетически наиболее выгодная.
Форма белковой молекулы
Пространственная
структура
|
|
|
|
Глобулярная |
|
|
|
Фибриллярная |
||||||||
|
|
|
Форма: |
сферическая |
Форма: нитевидная |
|||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Функции: |
|
разнообразные |
|
|
Функции: |
|
|
опорные |
|||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Фибриллярные белки нерастворимы в воде! Фибриллярные белки не перевариваются в ЖКТ человека!
Растворимость белка определяется его структурой
идругими факторами.
Растворимость глобулярных белков становится возможной при формировании третичной структуры:
Гидрофобные (неполярные) радикалы аминокислот локализованы внутри глобулы.
Гидрофильные (полярные) радикалы локализованы на поверхности глобулы (-СОО-, -NH3+, -OH и др.).
Заряженные и полярные группировки белков притягивают к себе молекулы воды, и вокруг них формируется гидратная оболочка, которая обусловливает их растворимость в воде.
Вследствие наличия свободных -СОО- и -NH3+ групп белки
являются амфотерными электролитами, т. е. диссоциируют как кислоты и как основания.
В водном растворе белок находится в ионизированном состоянии.
При пропускании через раствор белка электрического тока молекулы перемещаются в зависимости от реакции среды к положительному или отрицательному полюсу (электрофорез).
При определенном pH, количество положительных и отрицательных зарядов в молекуле белка может оказаться одинаковым.
Величина pH среды, при которой белки находятся в изоэлектрическом состоянии, называется изоэлектрической точкой (ИЭТ).
ИЭТ – индивидуальная характеристика белка
В ИЭТ белки легко выпадают в осадок (обратимое осаждение).
Наличие заряда — один из факторов устойчивости белка в растворе;
Другой важнейший фактор — наличие гидратной оболочки.
Разрушение гидратной оболочки под влиянием солей щелочных металлов (высаливание)
также приводит к обратимому осаждению белков.