
- •Метилирование ДНК – самая стабильная эпигенетическа модификация
- •Интегрированные в клеточный геном метилированные последовательности ДНК (CpG метилирование) остаются метилированными после ряда
- •BISULFIT SEQUENCING
- •acBio platform позволяет определять позиции метилированных оснований епосредственно по ходу сиквенирования
- •MBD domain – связывание с метилированными CpG динуклеотидами
- •MBD1 is involved in directing histone methylation to sites of DNA methylation
- •я метилирование ДНК традиционно рассматривается как репрессивная модификац чение метилирования зависит от контекста.
- •ы связывания транскрипционных факторов, узнаваемые при наличии илирования и при отсутствии метилирования могут
- •гены, уровень экспрессии которых позитивно коррелирует с метилированием
- •На ранних стадиях дробления происходит полное деметилирование генома, после чего специфический статус метилирования
- •Изменения в уровне метилирования ДНК по ходу развития мышиного эмбриона
- •Удаление 5-метилцитозина осуществляется непрямым способом
- •Тотальное удаление метилированного цитозина, за исключением импринтированных генов
- •Инактивация генов, ответственных за плюрипотентность, происходит в несколько этапов:
- •Метилирование de novo осуществляют Dnmt3a и Dnmt3b
- •de novo метилирование ДНК может направляться белками Polycomb
- •принтинг – выключение определенной группы генов в отцовских хром перекрывающейся группы генов в
- •В зародышевых клетках происходит полное деметилирование, включая импринтированные районы. Потом цетнры установления импринтинга
- •Establishment, maintenance and erasure of genomic imprints during mouse development.
- •механизмы дозовой компенсации (координация уровней экспрессии
- •Dosage compensation mechanisms
- •В отличие от импринтинга инактивация происходит случайным образом
- •• X inactivation center (XIC)Near centromereContains 12 genes
- •• Xist gene (X inactive-specific transcript)
- •Неактивная копия Х-хромосомы характеризуется присутствием
- •recruits PRC2 and macroH2A to inactivating X chromosome
- •Анализ пространственной конфигурации неактивной копии Х-хромосомы показал, что первичные места депонирования Xist РНК
- •места первичной посадки Xist не заданы на уровне нуклеотидной последовательности и не специфичны
- •часто говорят, что Xist РНК покрывает всю неактивную копию Х-хромосом ствительности ее не
- •A complex interplay between XIC components
- •лучайной инактивации одной из Х-хромосом предшествует кратковременн аривание двух Х-хромосом, по ходу которого
- •osaicism
- •Heterozygous females:
- •Heterozygous females:
- •Полное подавление экспрессии одного из родительских аллелей, происходящее на ранних стадиях развития (random
- •Дозовая компенсация у дрозофилы
- •The role of roX ncRNAs in dosage compensation in Drosophila
- •Acetylated lysines
- •MSL complex (dosage compensation complex, DCC) spreading
- •Specific loading of MSL complex on DNA.

В зародышевых клетках происходит полное деметилирование, включая импринтированные районы. Потом цетнры установления импринтинга метилируются, как правило в ооцитах, но есть и исключения

Establishment, maintenance and erasure of genomic imprints during mouse development.
Robert N. Plasschaert, and Marisa S. Bartolomei
Development 2014;141:1805-1813
механизмы дозовой компенсации (координация уровней экспрессии
генов в половых хромосомах и аутосомах)

Dosage compensation mechanisms

В отличие от импринтинга инактивация происходит случайным образом
Инактивация происходит после нескольких циклов дробления в силу чего в одних клетках активна отцовская Х хромосома, а в других - материнская

• X inactivation center (XIC)Near centromereContains 12 genes
7 genes code for proteins
5 genes code for untranslated RNA
cen
XIC

• |
Xist and Tsix |
Two genes actively involved in inactivating an X chromosome
Antagonistic roles
Xi Xist expression
Tsix expression
Xa Xist expression
Tsix expression

• Xist gene (X inactive-specific transcript)
Encodes a large RNA molecule
Coats Xi from the XIC near
the centromere outward along the X chromosome
(Lyon, 2003)
cen |
Xa |
Xist RNA
cen |
Xi |

Неактивная копия Х-хромосомы характеризуется присутствием
1. Xist РНК
2. macroH2A Эти компоненты колокализуются
3. H3K27met (Polycomb)
4. H3K9met (HP1) |
|
Там, где нет Xist РНК, macroH2A и H3K27met |
|
cen |
Xa |
macroH2A |
|
|
H3 K27met |
cen |
Xi |
K9met |
|
|

recruits PRC2 and macroH2A to inactivating X chromosome
uction of X-inactivation, Xist is no longer required for its maint d delrtion of XIC does not casuse de-repression)