Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:
Лаб.3,4,5.doc
Скачиваний:
205
Добавлен:
17.09.2014
Размер:
1.53 Mб
Скачать

3. Практические задания

Упражнение № 1. Создание электронной таблицы с исходными данными для основных операций над переменными в системе Statistica.

1. Произведите запуск программы Statistica. С этой целью нажмите кнопку «Пуск». Затем выберите среди меню программы пункт Statistica, затем  Basic Statistics and Tables.

2. Щелкните в строке меню системы по пункту «File».

3. Создайте новый файл для работы. Для этого выберите из меню, открывающегося после щелчка по пункту File, пункт New Data и щелкните по нему. В диалоговом окне новому файлу будет предложено имя new.sta. Откорректируйте имя следующим образом: newl.sta.

4. Откроется электронная таблица. Электронная таблица системы состоит из строк и столбцов, имеющих разные смысловые значения. Столбцы таблицы имеют название Variables (переменные), а строки  Cases (случаи). В качестве переменных обычно вводят названия исследуемых величин, а в случаи  значения переменных и их динамику.

5. Заполните электронную таблицу значениями, указанными в таблице 3.1.

При заполнении таблицы следует выполнить следующие действия:

 Подведите указатель мыши к имени переменной VAR1 и дважды щелкните по нему мышью. В результате откроется диалог, где в окне Name нужно удалить имя VAR1 и ввести сокращенное название первого столбца  НАТРИЙ 1. Далее нажать ENTER и произвести аналогичные действия с переменными VAR2-VAR4 (АЛЬДОСТЕРОН1НАТРИЙ2АЛЬДОСТЕРОН2).

 Далее введите соответствующие значения переменных в элект­ронную таблицу.

6. Сохраните созданную электронную таблицу путем последовательного выбора пунктов File и Save As и введения имени файла: statistl.sta.

Содержание натрия в плазме крови (моль/л) и величины суточной экскреции альдостерона с мочой (мкг/сут) у больных с эссенциальной гипертензией IIII стадии (1-я группа) и у лиц контрольной группы (2-я группа)

1-я группа

2-я группа

Натрий плазмы,

ммоль/л

Экскреция альдостерона,

мкг/сут

Натрий плазмы,

ммоль/л

Экскреция альдостерона,

мкг/сут

146,500

27,200

137,000

11,200

150,000

25,100

136,000

12,100

155,000

24,400

132,000

11,800

140,000

29,300

140,000

10,300

160,000

28,700

132,000

13,400

158,000

28,900

131,000

9,000

161,000

31,300

133,000

10,700

142,000

32,000

129,000

11,100

143,000

31,000

134,000

11,300

156,000

34,000

131,000

11,800

144,000

32,000

138,000

11,900

152,000

34,000

139,000

11,400

153,000

33,700

140,000

10,000

169,000

34,000

129,000

12,300

164,000

34,000

127,000

11,900

147,000

33,000

133,000

10,700

155,000

34,000

129,000

9,000

163,000

35,000

131,000

11,000

159,000

36,000

128,000

11,300

152,000

33,900

126,000

10,000

151,000

33,200

128,000

11,500

158,000

32,200

133,000

11,200

150,000

31,300

132,000

10,800

149,000

34,000

131,000

14,000

151,300

26,000

127,000

11,800

Упражнение № 2. Вычисление описательных статистик в си­стеме Statistica.

Описательные статистики служат для характеристики самых общих свойств наблюдаемых величин. К числу основных описательных статистик относятся: среднее, выборочная дисперсия, стандартное отклонение, медиана, мода, максимальное и минимальное значения, размах и др.

1. Откройте файл statist1.sta. В данном файле представлены значения концентрации натрия в плазме крови (ммоль/л), величины суточной экскреции альдостерона с мочой (мкг/сут.) у больных с эссенциальной гипертензией I-III стадий (1-я группа) и у лиц контрольной группы (2-я группа).

Выделите мышью 4 верхние строки со значениями переменных в столбцах НАТРИЙ1, АЛВДОСТЕРОН1, НАТРИЙ2, АЛВДОСТЕРОН2.

2. Нажмите кнопку Quick Basic Stats (быстрые основные статистики) на панели инструментов электронной таблицы.

Кнопка Quick Basic Stats (быстрые основные статистики) позволяет быстро рассчитать основные статистики для одной или целого списка переменных. В данном случае статистические вели­чины будут рассчитаны для всех рядов переменных. После нажатия кнопки на экране появится выпадающее меню.

3. В выпадающем меню выделите верхнюю строчку Descriptives of НАТРИЙ1-АЛБДОСТЕРОН2 (описательные переменные НАТРИЙ 1-АЛБДОСТЕРОН2). Электронная таблица с основными описательными статистиками для выбранных переменных появится на экране.

Таблица результатов отличается от таблицы с исходными данными. Этот специальный тип таблиц носит название scroilsheets.

4. Прокручивая электронную таблицу результатов слева напра­во, познакомьтесь со следующими описательными статистиками:

 Valid N  истинное число наблюдений (число наблюдений без пропусков)

 Mean  выборочное среднее

 Confid95%  нижняя граница 95% доверительного интервала для среднего

 Confid+95%  верхняя граница 95% доверительного интервала для среднего

 Sum  сумма значений

 Minimum  минимальное значение

 Maximum  максимальное значение

 Range  размах (разница между максимумом и минимумом)

 Variance  выборочная дисперсия

 Std. Dev.  стандартное отклонение

 Std. Err. стандартная ошибка

 Skewness  выборочный коэффициент асимметрии

 Std. Err. Skewness  стандартная ошибка коэффициента асимметрии

 Kurtosis  выборочный коэффициент эксцесса

 Std. Err. Kurtosis  стандартная ошибка эксцесса.

Просмотрите результаты расчетов и сделайте вывод о содержа­нии натрия в плазме крови и суточной экскреции альдостерона с мочой у больных с эссенциальной гипертензией I-III стадий и у лиц контрольной группы в сравнительном аспекте.

Сравните расчетные коэффициенты асимметрии и эксцесса с табличными, сделайте вывод о характере распределения изучае­мых переменных.

Упражнение № 3. Сравнение выборочных средних в двух груп­пах с помощью t-критерия.

1. Откройте файл statist l.sta.

В данном файле представлены значения концентрации натрия в плазме крови (ммоль/л), величины суточной экскреции альдос­терона с мочой (мкг/сут.) у больных с эесенциальной гипертензи­ей I-III стадий (1-я группа) и у лиц контрольной группы (2-я груп­па). Причем содержание натрия в плазме крови у пациентов двух групп подчиняется нормальному распределению, что следует из сопоставления расчетных значений коэффициентов асиммет­рии и эксцесса с табличными. Сравним средние значения содер­жания натрия в плазме крови у двух групп с помощью t-крите­рия Стьюдента.

2. Откройте стартовое окно модуля Basic Statistics /Tables (ос­новные статистики/таблицы), щелкнув в строке меню по кнопке Analysis (анализ).

3. В появившемся окне выберите пункт t-test for independent samples (t-критерий для независимых выборок), щелкните по нему мышью.

4. В появившемся окне задайте в строке Input File Each variable contains the data for one group.

5. Выберите группирующую переменную и независимую переменную. Группирующей переменной является НАТРИЙ 1, зави­симой переменной  НАТРИЙ2.

Для того чтобы задать переменные, щелкните по кнопке Variables (переменные) и в левом списке выберите переменную НАТРИЙ1 (допускается выбор только одной переменной), а в пра­вом списке выберите переменную НАТРИЙ2 (допускается выбор нескольких переменных).

6. Щелкните по кнопке T-tests. На экране появится таблица со значениям, среди которых уровень значимости р отража­ет вероятность гипотезы об отсутствии различия средних.

7. Зададим уровень значимости р, с которым будем сравнивать расчетное р в заголовке таблицы: Scrollsheet Titles. Для этого дважды щелкните в заголовке таблицы и в строке Second line введите р<0,05. В случае достоверного различия средних вся строка маркируется красным цветом.

8. Поскольку маркировка красным цветом присутствует и уровень значимости р = 0,012564 имеет низкое значение, то делаем вывод о достоверном различии содержания натрия в плазме крови у больных с эссенциальной гипертензией и у здоровых людей.

Значения описательных статистик исследования

Показатели

Натрий1

Альдостерон1

Натрий2

Альдостерон2

Число наблюдений

25

25

25

25

Выборочное среднее

153,2080

31,5280

132,2400

11,2600

Нижняя граница довер. инт.  95%

150,1970

30,2049

130,5369

10,7916

Верхняя граница довер. инт. +95%

156,2190

32,8511

133,9431

11,7284

Сумма

3830,200

788,200

3306,000

281,500

Минимум

140,0000

24,0000

126,0000

9,0000

Максимум

169,0000

36,0000

140,0000

14,0000

Размах

29,00000

11,60000

14,00000

5,00000

Выборочная дисперсия

53,20993

10,27460

17,02333

1,28750

Стандартное отклонение

7,294514

3,205402

4,125934

1,134681

Стандартная ошибка

1,458903

,641080

,825187

,226936

Выборочный коэффициент асимметрии

,133248

,929423

,521971

,144454

Стандартная ошибка асимметрии

,463684

,463684

,463684

,463684

Выборочный коэффициент эксцесса

,367072

,096140

,612114

1,038015

Стандартная ошибка эксцесса

,901721

,901721

,901721

,901721

Упражнение № 4. Сравнение выборочных средних в двух группах с помощью Т-критерия Уилкоксона.

1. Откройте файл statistl.sta.

2. Откройте стартовое окно модуля Basic Statistics /Tables (основные статистики/таблицы), щелкнув в строке меню по кнопке Analysis (анализ).

Выберите пункт меню Analysis Other Statistics (другие статистики), а затем пункт Nonparametrics/dictrib (непараметричес­кие критерии). Нажмите кнопку Switch To (переключиться в). В открывшемся окне щелкните в строке меню по пункту Analysis, a затем  по Startup Panel (стартовая панель).

3. Выберите критерий Wilcoxon matched pains test критерий Уилкоксона. В открывшемся окне выберите переменные АЛЬДОСТЕРОН1 и АЛЬДОСТЕРОН2. Именно для распределения значений суточной экскреции альдостерона с мочой в двух группах имеет место отличие распределения от нормального. Нажмите «Ok».

4. В появившейся таблице значений будут присутствовать значения Т-критерия Уилкоксона и уровень значимости. Поскольку Т-критерий намного меньше табличного значения (см. приложение №5, двусторонний критерий), то различие средних статистически значимо.

При сравнивании расчетного и табличного значений Т-критериев Уилкоксона нужно помнить, что если не указано направление (знак) различия, проверяемого на значимость (например, не при­нимается во внимание альтернатива X1 < Х2 или X1 > Х2), то исполь­зуют двусторонний критерий. В тех случаях, когда априори указано направление (знак) оцениваемого различия (например, когда с ну­левой гипотезой X1 = Х2 сравнивают X1 < Х2, но не X1 > Х2), нужно использовать односторонний критерий.

Упражнение № 5. Определение диагностической чувстви­тельности, специфичности, эффективности иммунологических и микробиологических серологических тестов, предсказатель­ной (прогностической) значимости положительных и отрицатель­ных результатов у больных с лихорадкой неизвестного проис­хождения.

1. Рассмотрите результаты серологических тестов, представленные в таблице 2.6.

Примечание. ИО  истинно отрицательные, ЛО  ложно отрицательные, ИП  истинно положительные, ЛП  ложно положительные.

2. Запустите программу Excel (Пуск => Программы => Microsoft Excel).

Заполните электронную таблицу, как показано на рис. 2.1.

3. Последовательно в ячейки Н4, I4, J4, К4, L4 введите формулы для расчетов:

=С4/СУММ(С4:F4)

=Е5/СУММ(D5:Е5)

=С4/СУММ(С4:D5)* 100

=Е5/СУММ(F4:Е5)*100

=СУММ(С4:Е5)/СУММ(С4:D5:Е5:F4)*100.

4. Рассчитайте диагностическую чувствительность, специфичность, эффективность представленных иммунологических и микробиологических серологических тестов, предсказательной (прогностической) значимости положительных и отрицательных результатов у больных лихорадкой неизвестного происхожде­ния и сделайте выводы.

Для этого в ячейки С4, D5, Е5, F4 поочередно введите значения по каждому исследованию. После оформления значений по одно­му исследованию происходит автоматический расчет изучаемых показателей теста. Занесите их в тетрадь, удалите предыдущие зна­чения и введите следующие. Затем проведите сравнительный ана­лиз результатов.

Результаты проведения тестов у больных с лихорадкой неизвестного происхождения и у людей, страдающих другими болезнями с одним из симптомов лихорадки

Исследования

Обследуемые

Результаты исследований

Положительные

Отрицательные

Антиядерные антитела

Больные

7 (ИП)

13 (ЛО)

Небольные

2 (ЛП)

15 (ИО)

Антинейтрофильное цитоплазматическое антитело

Больные

10 (ИП)

20 (ЛО)

Небольные

2 (ЛП)

7 (ИО)

Антитело к двуспиральной ДНК

Больные

13 (ИП)

0 (ЛО)

Небольные

0 (ЛП)

3 (ИО)

Кожный тест на производное очищенного белка

Больные

10 (ИП)

0 (ЛО)

Небольные

0 (ЛП)

0 (ИО)

Ревматоидные факторы

Больные

4 (ИП)

4 (ЛО)

Небольные

1 (ЛП)

1 (ИО)

Криоглобулин

Больные

50 (ИП)

0 (ЛО)

Небольные

3 (ЛП)

0 (ИО)

Рисунок 2.1. Электронная таблица для расчетов показателей лабораторных тестов

Контрольные вопросы

  1. Что такое структура исследования?

  2. Дайте характеристику поперечных медицинских исследований.

  3. Дайте характеристику продольных медицинских исследований.

  4. Что такое ретроспективное и проспективное медицинское ис­следование? Дайте их характеристики.

  5. Перечислите основные биостатистические термины, используе­мые для представления результатов исследования.

  6. Что такое диагностическая чувствительность и диагностическая чувствительность лабораторного теста? Как их рассчитать?

  7. Что такое диагностическая эффективность лабораторного тес­ та? Как ее рассчитать?

  8. Перечислите возможности систем компьютерной математики.

  9. Перечислите основные системы компьютерной математики и укажите их особенности.

Соседние файлы в предмете Медицинская информатика