![](/user_photo/_userpic.png)
- •Министерство образования Российской Федерации
- •Содержание
- •2.1. Статистические термины и показатели, используемые для представления результатов медико-биологических исследований
- •6. Проверка нормальности распределения с помощью показа телей асимметрии и эксцесса.
- •8. Для попарно связанных выборок применяется знакоранговый т-критерий Уилкоксона.
- •3. Практические задания
- •Лабораторная работа №4 Создание комплексных медицинских документов
- •1. Цель работы
- •2. Теоретическая часть
- •3. Практические задания
- •К3 Динамика болезни
- •Контрольные вопросы
- •3. Практические задания
- •Приложение №1 Критические точки двустороннего
- •Приложение №2
- •Критические значения коэффициента
- •Асимметрии (as), используемого для проверки
- •Гипотезы о нормальности распределения
- •Приложение №3
- •Критические значения коэффициента
- •Эксцесса (ex), используемого для проверки
- •Гипотезы о нормальности распределения
- •Приложение №4 Критические значения u-критерия Манна-Утни
- •Приложение №5 Критические значения статистики парного
- •Список литературы
- •1. Информатика. Базовый курс. Под ред. Симоновича с. В. И др. СПб.: Издательство «Питер», 1999. 640 с.
3. Практические задания
Упражнение № 1. Создание электронной таблицы с исходными данными для основных операций над переменными в системе Statistica.
1. Произведите запуск программы Statistica. С этой целью нажмите кнопку «Пуск». Затем выберите среди меню программы пункт Statistica, затем Basic Statistics and Tables.
2. Щелкните в строке меню системы по пункту «File».
3. Создайте новый файл для работы. Для этого выберите из меню, открывающегося после щелчка по пункту File, пункт New Data и щелкните по нему. В диалоговом окне новому файлу будет предложено имя new.sta. Откорректируйте имя следующим образом: newl.sta.
4. Откроется электронная таблица. Электронная таблица системы состоит из строк и столбцов, имеющих разные смысловые значения. Столбцы таблицы имеют название Variables (переменные), а строки Cases (случаи). В качестве переменных обычно вводят названия исследуемых величин, а в случаи значения переменных и их динамику.
5. Заполните электронную таблицу значениями, указанными в таблице 3.1.
При заполнении таблицы следует выполнить следующие действия:
Подведите указатель мыши к имени переменной VAR1 и дважды щелкните по нему мышью. В результате откроется диалог, где в окне Name нужно удалить имя VAR1 и ввести сокращенное название первого столбца НАТРИЙ 1. Далее нажать ENTER и произвести аналогичные действия с переменными VAR2-VAR4 (АЛЬДОСТЕРОН1НАТРИЙ2АЛЬДОСТЕРОН2).
Далее введите соответствующие значения переменных в электронную таблицу.
6. Сохраните созданную электронную таблицу путем последовательного выбора пунктов File и Save As и введения имени файла: statistl.sta.
Содержание натрия в плазме крови (моль/л) и величины суточной экскреции альдостерона с мочой (мкг/сут) у больных с эссенциальной гипертензией IIII стадии (1-я группа) и у лиц контрольной группы (2-я группа)
1-я группа |
2-я группа | ||
Натрий плазмы, ммоль/л |
Экскреция альдостерона, мкг/сут |
Натрий плазмы, ммоль/л |
Экскреция альдостерона, мкг/сут |
146,500 |
27,200 |
137,000 |
11,200 |
150,000 |
25,100 |
136,000 |
12,100 |
155,000 |
24,400 |
132,000 |
11,800 |
140,000 |
29,300 |
140,000 |
10,300 |
160,000 |
28,700 |
132,000 |
13,400 |
158,000 |
28,900 |
131,000 |
9,000 |
161,000 |
31,300 |
133,000 |
10,700 |
142,000 |
32,000 |
129,000 |
11,100 |
143,000 |
31,000 |
134,000 |
11,300 |
156,000 |
34,000 |
131,000 |
11,800 |
144,000 |
32,000 |
138,000 |
11,900 |
152,000 |
34,000 |
139,000 |
11,400 |
153,000 |
33,700 |
140,000 |
10,000 |
169,000 |
34,000 |
129,000 |
12,300 |
164,000 |
34,000 |
127,000 |
11,900 |
147,000 |
33,000 |
133,000 |
10,700 |
155,000 |
34,000 |
129,000 |
9,000 |
163,000 |
35,000 |
131,000 |
11,000 |
159,000 |
36,000 |
128,000 |
11,300 |
152,000 |
33,900 |
126,000 |
10,000 |
151,000 |
33,200 |
128,000 |
11,500 |
158,000 |
32,200 |
133,000 |
11,200 |
150,000 |
31,300 |
132,000 |
10,800 |
149,000 |
34,000 |
131,000 |
14,000 |
151,300 |
26,000 |
127,000 |
11,800 |
Упражнение № 2. Вычисление описательных статистик в системе Statistica.
Описательные статистики служат для характеристики самых общих свойств наблюдаемых величин. К числу основных описательных статистик относятся: среднее, выборочная дисперсия, стандартное отклонение, медиана, мода, максимальное и минимальное значения, размах и др.
1. Откройте файл statist1.sta. В данном файле представлены значения концентрации натрия в плазме крови (ммоль/л), величины суточной экскреции альдостерона с мочой (мкг/сут.) у больных с эссенциальной гипертензией I-III стадий (1-я группа) и у лиц контрольной группы (2-я группа).
Выделите мышью 4 верхние строки со значениями переменных в столбцах НАТРИЙ1, АЛВДОСТЕРОН1, НАТРИЙ2, АЛВДОСТЕРОН2.
2. Нажмите кнопку Quick Basic Stats (быстрые основные статистики) на панели инструментов электронной таблицы.
Кнопка Quick Basic Stats (быстрые основные статистики) позволяет быстро рассчитать основные статистики для одной или целого списка переменных. В данном случае статистические величины будут рассчитаны для всех рядов переменных. После нажатия кнопки на экране появится выпадающее меню.
3. В выпадающем меню выделите верхнюю строчку Descriptives of НАТРИЙ1-АЛБДОСТЕРОН2 (описательные переменные НАТРИЙ 1-АЛБДОСТЕРОН2). Электронная таблица с основными описательными статистиками для выбранных переменных появится на экране.
Таблица результатов отличается от таблицы с исходными данными. Этот специальный тип таблиц носит название scroilsheets.
4. Прокручивая электронную таблицу результатов слева направо, познакомьтесь со следующими описательными статистиками:
Valid N истинное число наблюдений (число наблюдений без пропусков)
Mean выборочное среднее
Confid95% нижняя граница 95% доверительного интервала для среднего
Confid+95% верхняя граница 95% доверительного интервала для среднего
Sum сумма значений
Minimum минимальное значение
Maximum максимальное значение
Range размах (разница между максимумом и минимумом)
Variance выборочная дисперсия
Std. Dev. стандартное отклонение
Std. Err. стандартная ошибка
Skewness выборочный коэффициент асимметрии
Std. Err. Skewness стандартная ошибка коэффициента асимметрии
Kurtosis выборочный коэффициент эксцесса
Std. Err. Kurtosis стандартная ошибка эксцесса.
Просмотрите результаты расчетов и сделайте вывод о содержании натрия в плазме крови и суточной экскреции альдостерона с мочой у больных с эссенциальной гипертензией I-III стадий и у лиц контрольной группы в сравнительном аспекте.
Сравните расчетные коэффициенты асимметрии и эксцесса с табличными, сделайте вывод о характере распределения изучаемых переменных.
Упражнение № 3. Сравнение выборочных средних в двух группах с помощью t-критерия.
1. Откройте файл statist l.sta.
В данном файле представлены значения концентрации натрия в плазме крови (ммоль/л), величины суточной экскреции альдостерона с мочой (мкг/сут.) у больных с эесенциальной гипертензией I-III стадий (1-я группа) и у лиц контрольной группы (2-я группа). Причем содержание натрия в плазме крови у пациентов двух групп подчиняется нормальному распределению, что следует из сопоставления расчетных значений коэффициентов асимметрии и эксцесса с табличными. Сравним средние значения содержания натрия в плазме крови у двух групп с помощью t-критерия Стьюдента.
2. Откройте стартовое окно модуля Basic Statistics /Tables (основные статистики/таблицы), щелкнув в строке меню по кнопке Analysis (анализ).
3. В появившемся окне выберите пункт t-test for independent samples (t-критерий для независимых выборок), щелкните по нему мышью.
4. В появившемся окне задайте в строке Input File Each variable contains the data for one group.
5. Выберите группирующую переменную и независимую переменную. Группирующей переменной является НАТРИЙ 1, зависимой переменной НАТРИЙ2.
Для того чтобы задать переменные, щелкните по кнопке Variables (переменные) и в левом списке выберите переменную НАТРИЙ1 (допускается выбор только одной переменной), а в правом списке выберите переменную НАТРИЙ2 (допускается выбор нескольких переменных).
6. Щелкните по кнопке T-tests. На экране появится таблица со значениям, среди которых уровень значимости р отражает вероятность гипотезы об отсутствии различия средних.
7. Зададим уровень значимости р, с которым будем сравнивать расчетное р в заголовке таблицы: Scrollsheet Titles. Для этого дважды щелкните в заголовке таблицы и в строке Second line введите р<0,05. В случае достоверного различия средних вся строка маркируется красным цветом.
8. Поскольку маркировка красным цветом присутствует и уровень значимости р = 0,012564 имеет низкое значение, то делаем вывод о достоверном различии содержания натрия в плазме крови у больных с эссенциальной гипертензией и у здоровых людей.
Значения описательных статистик исследования
Показатели |
Натрий1 |
Альдостерон1 |
Натрий2 |
Альдостерон2 |
Число наблюдений |
25 |
25 |
25 |
25 |
Выборочное среднее |
153,2080 |
31,5280 |
132,2400 |
11,2600 |
Нижняя граница довер. инт. 95% |
150,1970 |
30,2049 |
130,5369 |
10,7916 |
Верхняя граница довер. инт. +95% |
156,2190 |
32,8511 |
133,9431 |
11,7284 |
Сумма |
3830,200 |
788,200 |
3306,000 |
281,500 |
Минимум |
140,0000 |
24,0000 |
126,0000 |
9,0000 |
Максимум |
169,0000 |
36,0000 |
140,0000 |
14,0000 |
Размах |
29,00000 |
11,60000 |
14,00000 |
5,00000 |
Выборочная дисперсия |
53,20993 |
10,27460 |
17,02333 |
1,28750 |
Стандартное отклонение |
7,294514 |
3,205402 |
4,125934 |
1,134681 |
Стандартная ошибка |
1,458903 |
,641080 |
,825187 |
,226936 |
Выборочный коэффициент асимметрии |
,133248 |
,929423 |
,521971 |
,144454 |
Стандартная ошибка асимметрии |
,463684 |
,463684 |
,463684 |
,463684 |
Выборочный коэффициент эксцесса |
,367072 |
,096140 |
,612114 |
1,038015 |
Стандартная ошибка эксцесса |
,901721 |
,901721 |
,901721 |
,901721 |
Упражнение № 4. Сравнение выборочных средних в двух группах с помощью Т-критерия Уилкоксона.
1. Откройте файл statistl.sta.
2. Откройте стартовое окно модуля Basic Statistics /Tables (основные статистики/таблицы), щелкнув в строке меню по кнопке Analysis (анализ).
Выберите пункт меню Analysis Other Statistics (другие статистики), а затем пункт Nonparametrics/dictrib (непараметрические критерии). Нажмите кнопку Switch To (переключиться в). В открывшемся окне щелкните в строке меню по пункту Analysis, a затем по Startup Panel (стартовая панель).
3. Выберите критерий Wilcoxon matched pains test критерий Уилкоксона. В открывшемся окне выберите переменные АЛЬДОСТЕРОН1 и АЛЬДОСТЕРОН2. Именно для распределения значений суточной экскреции альдостерона с мочой в двух группах имеет место отличие распределения от нормального. Нажмите «Ok».
4. В появившейся таблице значений будут присутствовать значения Т-критерия Уилкоксона и уровень значимости. Поскольку Т-критерий намного меньше табличного значения (см. приложение №5, двусторонний критерий), то различие средних статистически значимо.
При сравнивании расчетного и табличного значений Т-критериев Уилкоксона нужно помнить, что если не указано направление (знак) различия, проверяемого на значимость (например, не принимается во внимание альтернатива X1 < Х2 или X1 > Х2), то используют двусторонний критерий. В тех случаях, когда априори указано направление (знак) оцениваемого различия (например, когда с нулевой гипотезой X1 = Х2 сравнивают X1 < Х2, но не X1 > Х2), нужно использовать односторонний критерий.
Упражнение № 5. Определение диагностической чувствительности, специфичности, эффективности иммунологических и микробиологических серологических тестов, предсказательной (прогностической) значимости положительных и отрицательных результатов у больных с лихорадкой неизвестного происхождения.
1. Рассмотрите результаты серологических тестов, представленные в таблице 2.6.
Примечание. ИО истинно отрицательные, ЛО ложно отрицательные, ИП истинно положительные, ЛП ложно положительные.
2. Запустите программу Excel (Пуск => Программы => Microsoft Excel).
Заполните электронную таблицу, как показано на рис. 2.1.
3. Последовательно в ячейки Н4, I4, J4, К4, L4 введите формулы для расчетов:
=С4/СУММ(С4:F4)
=Е5/СУММ(D5:Е5)
=С4/СУММ(С4:D5)* 100
=Е5/СУММ(F4:Е5)*100
=СУММ(С4:Е5)/СУММ(С4:D5:Е5:F4)*100.
4. Рассчитайте диагностическую чувствительность, специфичность, эффективность представленных иммунологических и микробиологических серологических тестов, предсказательной (прогностической) значимости положительных и отрицательных результатов у больных лихорадкой неизвестного происхождения и сделайте выводы.
Для этого в ячейки С4, D5, Е5, F4 поочередно введите значения по каждому исследованию. После оформления значений по одному исследованию происходит автоматический расчет изучаемых показателей теста. Занесите их в тетрадь, удалите предыдущие значения и введите следующие. Затем проведите сравнительный анализ результатов.
Результаты проведения тестов у больных с лихорадкой неизвестного происхождения и у людей, страдающих другими болезнями с одним из симптомов лихорадки
Исследования |
Обследуемые |
Результаты исследований | |||
Положительные |
Отрицательные | ||||
Антиядерные антитела |
Больные |
7 (ИП) |
13 (ЛО) | ||
Небольные |
2 (ЛП) |
15 (ИО) | |||
Антинейтрофильное цитоплазматическое антитело |
Больные |
10 (ИП) |
20 (ЛО) | ||
Небольные |
2 (ЛП) |
7 (ИО) | |||
Антитело к двуспиральной ДНК |
Больные |
13 (ИП) |
0 (ЛО) | ||
Небольные |
0 (ЛП) |
3 (ИО) | |||
Кожный тест на производное очищенного белка |
Больные |
10 (ИП) |
0 (ЛО) | ||
Небольные |
0 (ЛП) |
0 (ИО) | |||
Ревматоидные факторы |
Больные |
4 (ИП) |
4 (ЛО) | ||
Небольные |
1 (ЛП) |
1 (ИО) | |||
Криоглобулин |
Больные |
50 (ИП) |
0 (ЛО) | ||
Небольные |
3 (ЛП) |
0 (ИО) |
Рисунок 2.1. Электронная таблица для расчетов показателей лабораторных тестов
Контрольные вопросы
Что такое структура исследования?
Дайте характеристику поперечных медицинских исследований.
Дайте характеристику продольных медицинских исследований.
Что такое ретроспективное и проспективное медицинское исследование? Дайте их характеристики.
Перечислите основные биостатистические термины, используемые для представления результатов исследования.
Что такое диагностическая чувствительность и диагностическая чувствительность лабораторного теста? Как их рассчитать?
Что такое диагностическая эффективность лабораторного тес та? Как ее рассчитать?
Перечислите возможности систем компьютерной математики.
Перечислите основные системы компьютерной математики и укажите их особенности.