Приложение б. Уточнение и упрощение исходной модели.

Блок реакций внешней теназы оставляем без изменений, только переобозначаем равные константы ( ).

Приложение в. Упрощенная исходная модель.

	Все константы относятся к системе слева. Отсутствие черточек над некоторыми из них – опечатка.

Приложение г. Нормированная система.

	Кинетические константы
	k, мин-1		h, мин-1
	3.18		1.36
	0.30
	0.0158	2.48	0.051
	0.182	0.179	0.204
	4.01		2
	15.5		0.31
	14		0.341
	0.253		0.1
	0.0816	0.00804
	252 288

Константы нормированной системы.

Безразмерные константы:
Константы, мин-1:

Приложение д. Редуцированная модель.

Список литературы.

1. Физиология человека, т.2, под редакцией Р. Шмидта и Г. Тевса, М.:Мир, 1996.

2. Шиффман Ф.Дж. Патофизиология крови. М.:Binom Publishers, 2000.

3. Крымская О. А. Исследование влияния везикул, образующихся из тромбоцитов при активации, на динамику роста фибринового сгустка. Дипломная работа. Кафедра Биофизики Физического ф-та МГУ. М.:2002.

4. Березин И.В., Мартинек К. Основы физической химии ферментативного катализа. М.:"Высшая школа", 1977.

5. Козлов А.А., Берковский А.Л., Качалова Н.Д., Простакова Т.М. Пособие для врачей-лаборантов по методам исследования гемостаза. М.:ГНЦ РАМН, 2001.

6. Исследование системы крови в клинической практике. М.:"Триада-Х", 1998.

7. Баркаган З.С., Момот А.П. Основы диагностики нарушений гемостаза. М.:Ньюдиамед-АО, 1999.

8. Broze G. J. Jr., Girard T. J., Novotny W. F. Regulation of coagulation by a multivalent Kunitz-type inhibitor. Biochemistry,1990, vol. 29, pp. 7539-7546.

9. Broze G. J. Jr., Warren L. A., Novotny W. F., Higuchi D. A., Girard J. J., Miletich J. P. The lipoprotein-associated coagulation inhibitor that inhibits the factor VII-tissue factor complex also inhibits factor Xa: insight into its possible mechanism of action. Blood,1988, vol. 71, pp. 335-343, 1988.

10. Rao L. V., Rapaport S. I. Studies of a mechanism inhibiting the initiation of the extrinsic pathway of coagulation. Blood, 1987, vol. 69, pp. 645-651.

11. Rapaport S. I. The extrinsic pathway inhibitor: a regulator of tissue factor-dependent blood coagulation. Thromb. Haemostasis, 1991, vol. 66, pp.6-15.

12. Bajaj M. S., Birktoft J. J., Steer S. A., Bajaj S. P. Structure and biology of tissue factor pathway inhibitor . Thromb. Haemost., 2001, vol. 86, pp. 959-72.

13. Wuillemin W. A., Eldering E., Citarella F., de Ruig C. P., ten Cate H., Hack C. E. Modulation of contact system proteases by glycosaminoglycans. Selective enhancement of the inhibition of factor XIa. J. Biol. Chem, 1996, vol. 271, pp. 12913-12918.

14. van 't Veer C., Butenas S., Golden N. J., Mann K. G. Regulation of prothrombinase activity by protein S. Thromb. Haemost., 1999, vol. 82, pp. 80-87.

15. van 't Veer C., Golden N. J., Kalafatis M., Mann K. G. Inhibitory mechanism of the protein C pathway on tissue factor-induced thrombin generation. Synergistic effect in combination with tissue factor pathway inhibitor. J Biol Chem., 1997, vol. 272, pp. 7983-7994.

16. van 't Veer C., Mann K. G. Regulation of tissue factor initiated thrombin generation by the stoichiometric inhibitors tissue factor pathway inhibitor, antithrombin-III, and heparin cofactor-II. J. Biol. Chem., 1997, vol. 272, pp. 4367-4377.

17. Cawthern K.M., van 't Veer C, Lock J.B., DiLorenzo M.E., Branda R.F., Mann K.G. Blood coagulation in hemophilia A and hemophilia C. Blood, 1998, Jun 15;91(12):4581-92.

18. Solymoss S., Tucker M. M., Tracy P. B. Kinetics of inactivation of membrane-bound factor Va by activated protein C. Protein S modulates factor Xa protection. J. Biol. Chem., 1988, vol. 263, pp. 14884-14890.

19. Esmon N. L., DeBault L. E., Esmon C.T. Proteolytic formation and properties of gamma-carboxyglutamic acid-domainless protein C. J Biol Chem., 1983, vol. 258, pp. 5548-5553.

20. Mann K.G., Nesheim M.E., Church W.R., Haley P, Krishnaswamy S. Surface-dependent reactions of the vitamin K-dependent enzyme complexes. Blood, 1990, Jul 1;76(1):1-16.

21. Krishnaswamy S, Nesheim M.E., Pryzdial E.L., Mann K.G. Assembly of prothrombinase complex. Methods Enzymol, 1993, 222:260-80.

22. Butenas S., Mann K.G. Kinetics of human factor VII activation, Biochemistry, 1996, vol. 35, N 1904-1910.

23. Mann K.G, Krishnaswamy S, Lawson J.H. Surface-dependent hemostasis. Semin Hematol., 1992, Jul;29(3):213-26.

24. Nesheim M.E., Mann K.G. Thrombin-catalyzed activation of single chain bovine factor V. J Biol Chem., 1979, Feb 25;254(4):1326-34.

25. Nesheim M.E., Taswell J.B., Mann K.G. The contribution of bovine Factor V and Factor Va to the activity of prothrombinase. J Biol Chem., 1979, Nov 10;254(21):10952-62.

26. Jones C. J., Mann K. G. A model for the tissue factor pathway to thrombin. II. A mathematical simulation. J. Biol. Chem., 1994, vol. 269, pp. 23367-23373.

27. Stoylova S.S., Lenting P.J., Kemball-Cook G, Holzenburg A. Electron crystallography of human blood coagulation factor VIII bound to phospholipid monolayers. J Biol Chem., 1999, Dec 17;274(51):36573-8.

28. Eichinger S, Mannucci P.M., Tradati F, Arbini A.A., Rosenberg R.D., Bauer K.A. Determinants of plasma factor VIIa levels in humans. Blood, 1995, Oct 15;86(8):3021-5 Related Articles, Links

29. Morrissey J.H., Macik B.G., Neuenschwander P.F., Comp P.C. Quantitation of activated factor VII levels in plasma using a tissue factor mutant selectively deficient in promoting factor VII activation. Blood, 1993, Feb 1;81(3):734-44

30. Wildgoose P, Nemerson Y, Hansen L.L., Nielsen F.E., Glazer S, Hedner U. Measurement of basal levels of factor VIIa in hemophilia A and B patients. Blood, 1992, Dec 15;80(12):3255-6.

31. Hemker H.C. et al. Kinetick aspects of the interaction of blood clotting enzymes. I. Derivation of basic formulas. Thromb. Diath. Haemorrh, 1965, v.13, pp.155-175.

32. Hemker H.C. et al. General kinetics of enzime cascade. Proc. Roy. Soc. Lon., 1969, v.B173, №1032, p.411.

33. Hemker H.C., Willems G.M., Beguin S. A computer assisted method to obtain the prothrombin activation velocity in whole plasma independent of thrombin decay processes. Thromb Haemost., 1986, Aug 20;56(1):9-17.

34. Willems G. M., Lindhout T., Hermens W. T., Hemker H. C. Simulation model for thrombin generation in plasma. Haemostasis, 1991, vol. 21, pp. 197-207.

35. Hemker H.C., Wielders S., Kessels H., Beguin S. Continuous registration of thrombin generation in plasma, its use for the determination of the thrombin potential. Thromb. Haemost., 1993, 70:617-624.

36. Hoffman M, Monroe D.M. 3rd. A cell-based model of hemostasis. Thromb Haemost. 2001;85(6):958-65.

37. Monroe D.M., Hoffman M, Roberts H.R. Transmission of a procoagulant signal from tissue factor-bearing cell to platelets. Blood Coagul Fibrinolysis, 1996, Jun;7(4):459-64.

38. Hoffman M, Monroe D.M., Oliver J.A., Roberts H.R. Factors IXa and Xa play distinct roles in tissue factor-dependent initiation of coagulation. Blood, 1995, Sep 1;86(5):1794-801.

39. Monroe D.M., Roberts H.R., Hoffman M. Platelet procoagulant complex assembly in a tissue factor-initiated system. Br. J. Haematol., 1994, Oct;88(2):364-71.

40. Allen G.A, Monroe D.M. 3rd, Roberts H.R., Hoffman M. The effect of factor X level on thrombin generation and the procoagulant effect of activated factor VII in a cell-based model of coagulation. Blood Coagul Fibrinolysis, 2000, Apr;11 Suppl 1:S3-7.

41. Monroe D.M., Hoffman M., Oliver J.A., Roberts H.R. Platelet activity of hight-dose factor VIIa is independent of tissue factor. British Journal of Haematology, 1997, v.99: 542-547.

42. Monroe D.M., Hoffman M, Oliver J.A., Roberts H.R. A possible mechanism of action of activated factor VII independent of tissue factor. Blood Coagul Fibrinolysis., 1998, Mar 9, Suppl 1:S15-20.

43. Ованесов М.В. Влияние факторов внутреннего пути свертывания крови на пространственную динамику роста сгустка. Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук. М.: 2002.

44. Levine S.N. Enzyme amplifiez kinetics. Science, 1966, vol.152, N3722, pp. 651-653.

45. Khanin M.A., Semenov V.V. A Mathematical model of the Kinetics of Blood Coagulation. J.Theor.Biol., 1989, v.136, 127-134.

46. Семенов В.В., Ханин М.А. Нелинейные эффекты в кинетике гемокоагуляции. Биофизика, 1990, т.35, с139-140.

47. Зарницына В.И. Исследование механизмов остановки роста тромба. Диссертация на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук. М.: 1997.

48. Jesty J, Beltrami E, Willems G. Mathematical analysis of a proteolytic positive-feedback loop: dependence of lag time and enzyme yields on the initial conditions and kinetic parameters. Biochemistry, 1993, Jun 22;32(24):6266-74.

49. Beltrami E, Jesty J. Mathematical analysis of activation thresholds in enzyme-catalyzed positive feedbacks: application to the feedbacks of blood coagulation. Proc Natl Acad Sci USA. 1995, Sep 12;92(19):8744-8.

50. Leipold R.J., Bozarth T.A., Racanelli A.L., Dicker I.B. Mathematical model of serine protease inhibition in the tissue factor pathway to thrombin. J. Biol. Chem., 1995, vol. 270, pp. 25383-25387.

51. Kuharsky A. L., Fogelson A. L. Surface-mediated control of blood coagulation: the role of binding site densities and platelet deposition. Biophys J., 2001, vol. 80, pp. 1050-1074.

52. Ataullakhanov F.I, Pohilko A.V., Sinauridze E.I., Volkova R.I. Calcium threshold in human plasma clotting kinetics. Thromb.Res., 1994, v.75, p.383.

53. Похилко А.В. Пороговые свойства системы свертывания крови. Диссертация на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук. Пущино: 1994.

54. Ataullakhanov F. I., Molchanova D. A., Pokhilko A. V. A simulated mathematical model of the blood coagulation system intrinsic pathway, Biophysics, 1995, vol. 40, pp. 413-421.

55. Zarnitsina V. I., Ataullakhanov F. I., Lobanov A. I., Morozova O. L. Dynamics of spatially nonuniform patterning in the model of blood coagulation. Chaos, 2001, vol.11, pp. 57-69.

56. Ataullakhanov F. I., Zarnitsina, Pokhilko A.V., Lobanov A. I., Morozova O. L. Spatio-Temporal Dynamics of blood coagulation and pattern formation. A theoretical approach. Intern.J.of Bifurcation and Chaos, 2002, vol.12, №9, pp. 1985-2002.

57. Похилко А.В., Атауллаханов Ф.И. Пространственная динамика свертывания крови. Математическая модель. Биологические мембраны, 2002, т.19, №3, с.250-263.

58. Атауллаханов Ф.И., Гурия Г.Т. Пространственные аспекты свертывания крови. I.Гипотеза. Биофизика, 1994,39:89-96.

59. Атауллаханов Ф.И., Гурия Г.Т., Сафрошкина А.И. Пространственные аспекты динамики свертывания крови. II. Феноменологическая модель. Биофизика, 1994, т. 39, стр. 97-106.

60. Лобанова Е.С. Сложные режимы поведения в системах уравнений реакция-диффузия. Диссертация на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук. (в процессе апробации).

61. Атауллаханов Ф.И., Зарницына В.И., Кондратович А.Ю., Лобанова Е.С., Сарбаш В.И. Особый класс автоволн - автоволны с остановкой - определяет пространственную динамику свертывания крови. Успехи физических наук, 2002, т.172, №6, с.671-690.

62. Пантелеев М.А., Зарницына В.И., Морозова О.Л., Лобанов А.И., Ованесов М.В., Коротина Н.Г., Лобанова Е.С., Атауллаханов Ф.И. Математическое моделирование пространственно-временной динамики свертывания крови. Труды международной конференции "Параллельные вычисления и задачи управления (РАСО'2001)", (Москва, 2-4 октября 2001г.). М.: 2001:54-78.

63. Zarnitsina V. I., Pokhilko A. V., Ataullakhanov F. I. A mathematical model for the spatio-temporal dynamics of in-trinsic pathway of blood coagulation. I. The model description. Thrombosis Research, 1996, vol. 84, pp. 225-236.

64. Zarnitsina V. I., Pokhilko A. V., Ataullakhanov F. I. A mathematical model for the spatio-temporal dynamics of in-trinsic pathway of blood coagulation. II. Results. Thrombosis Research, 1996, vol. 84, pp. 333-344.

65. Хайрер Э., Нерсетт С., Ваннер Г., Решение обыкновенных дифференциальных уравнений. Нежесткие задачи. М.: Мир, 1990.