- •Оглавление.
- •V. Выводы. 70
- •Введение.
- •I. Обзор литературы.
- •1. Гемостаз.
- •1.1. Плазменная система свертывания крови.
- •1.1.1. Состав, каскадная структура.
- •1.1.2. Сборка мебранных комплексов внутреннй теназы и протромбиназы.
- •1.2. Нарушения свертывания крови.
- •2. Экспериментальные исследования свертывания in vitro.
- •2.1. Стандартные гомогенные тесты.
- •2.2. Исследование пространственных эффектов в гомогенной постановке.
- •2.3. Пространственная динамика роста сгустка в неперемешиваемой плазме крови.
- •3. Математические модели плазменного звена свертывания крови.
- •3.1. Модели свертывания, основанные на каскадном устройстве системы и описывающие ее на качественном уровне.
- •3.1.1. Открытый ферментативный каскад.
- •3.1.2. Каскад с утечкой.
- •3.1.3. Учет положительных обратных связей через кофакторы.
- •3.1.4. Модельные ферментативные каскады.
- •3.2. Детальные, количественные модели свертывания.
- •3.2.1. Гомогенное тромбообразование.
- •3.2.2. Тромбообразование в ространственно-распределенной системе.
- •3.2.3. Механизменная модель свертывания крови в системе без перемешивания.
- •3.2.4. Феноменологическая автоволновая модель тромбообразования в системе без перемешивания.
- •3.3. Описание исходной модели.
- •II. Методы.
- •1. Методы численного решения уравнений.
- •2. Программа для расчета.
- •III. Результаты.
- •1. Уточнение исходной модели
- •1.1. Роль редуцированных ранее переменных – концентраций мембранных комплексов.
- •1.2. Учет реакций активации факторов IX и X фактором viIa.
- •1.3. Варьирование константы активации фактора XI тромбином.
- •2. Первоначальное упрощение исходной модели.
- •3. Вклад диффузионных членов в динамику поведения системы.
- •4. Редукция факторов VII и viIa. Введение новых переменных.
- •5. Аппроксимация формы бегущих импульсов факторов viiIa, Va и xIa.
- •5.1. Аппроксимация формы бегущего импульса фактора viiIa.
- •5.2. Распространение подхода на факторы Va и xIa.
- •6. Вклад диффузии мембранных комплексов и переход к концентрации свободного фактора Xa.
- •7. Верификация редуцированной модели.
- •IV. Обсуждение результатов.
- •1. Реальная размерность системы.
- •2. Характер поведения системы на различных стадиях свертывания.
- •3. Численное решение диффузионной задачи.
- •4. Упрощение алгебраических выражений в кинетических уравнениях.
- •5. Нормировка концентраций факторов.
- •6. Применение теоремы Тихонова к системе уравнений вида “реакция-диффузия”.
- •7. Смысл переменной е.
- •8. Аппроксимация формы бегущих импульсов факторов viiIa, Va и xIa.
- •9. Редукция блока внешней теназы.
- •V. Выводы.
- •Приложение а. Исходная модель.
- •Приложение б. Уточнение и упрощение исходной модели.
- •Приложение в. Упрощенная исходная модель.
- •Приложение г. Нормированная система.
- •Приложение д. Редуцированная модель.
- •Список литературы.
3.2.2. Тромбообразование в ространственно-распределенной системе.
В работе [53] показано, что учет реакции активации фактора XI тромбином не влияет на кинетику процесса при значениях константы скорости активации от 0 до 10-4мин-1 (точное значение этой константы неизвестно, но, согласно литературным данным, ее значение ниже 10-4мин-1). Однако в пространственно-распределенной системе наличие этой реакции приводит к способности свертывания самоподдерживающимся образом распространяться от активирующей поверхности вглубь плазмы. Численно решалась система уравнений, полученная из (5) добавлением кинетического уравнения для фактора XIa и диффузионных членов в правые части всех уравнений. Рассматривался вток фактора XIa с левой стенки отрезка, на котором проводилось интегрирование, граничные и начальные условия для всех остальных факторов брались нулевыми. Установлен пороговый характер поведения системы по величине потока фактора XIa с левой стенки и константы активации фактора XIa тромбином. При их запороговых значениях скорость движения волны тромбина быстро выходит на постоянное значение.
Дальнейшеее развитие работа [53, 54] получила в [55,56]. Авторами используется система уравнений, переменными которой являются концентрации всех активных факторов внутреннего пути, включая факторы XIa и pCa, а редуцированы только концентрации мембранных комплексов протромбиназы и внутренней теназы. Пренебрегается исчерпанием всех предшественников активных факторов, кроме протромбина. В работе [57] рассматривается активация как по внутреннему, так и внешнему пути. В [57,63,64] рост сгустка, в отсутствие реакции активации фактора XI тромбином, происходит внутри диффузионной зоны активных факторов у поверхности активатора и ограничен размером этой зоны; запороговые значения константы скорости активации фактора XIa тромбином приводят к неограниченному росту сгустка. Получены осциллирующие режимы поведения системы при больших константах активации протеина С, характеризующиеся рождением повторных концентрационных волн тромбина у поверхности активатора. Модели находятся в хорошем согласии с экспериментальными данными как по гомогенной, так и по пространственной динамике свертывания: они дают количественные оценки для пороговых уровней активации свертывания по внешнему и внутреннему путям в гомогенном случае и в системе без перемешивания и показывают слабую (логарифмическую) зависимость размера сгустка от величины активации.
Для количественного описания экспериментальных данных по кинетике пространственного роста сгустка в [47, 55, 56, 61] была предложена гипотеза, согласно которой возможно переключение активности тромбина по отношению к его субстратам под действием вещества, образующегося при активации протеина С. После такого переключения тромбин должен расщеплять pC с большей скоростью, обеспечивая автокаталитическое производство pCa.
Рис. 10. Схема реакций переключения активности тромбина [61]. Стрелки с минусами внутри показывают петлю отрицательной обратной связи.
Этот подход продиктован, во-первых, результатами феноменологической модели [58, 59, 61], рассматриваемой ниже, в которой предположение о существовании в крови ингибитора тромбина, автокаталитически увеличивающего свое производство, привело к хорошему качественному описанию всех известных режимов поведения системы, и, во-вторых, тем, что переключение активности тромбина из прокоагулянтного (тромбин I) в антикоагулянтное (тромбин II) состояние действительно экспериментально установлено (п. 1.1.1). Авторы [47, 55, 56, 61], выдвигая гипотезу о существовании пептида, образующегося в одной из реакций отрицательной обратной связи через протеин С, рассматривыют один из возможных вариантов: пептид Р образуется при активации протеина С тромбином (рис. 10). Другие возможные варианты образования Р (отщепление при инактивации активированным протеином С кофакторов V и VIII, продукт взаимодействия pCа с тромбином) не рассматриваются. Варьируя константы активации фактора XI тромбином и pC тромбином II, получено количественное описание экспериментальных данных по неограниченному равномерному росту сгустка и остановки его роста.
Развитие этой модели происходит в двух направлениях: в сторону уточнения (учет максимального количества реакций, протекающих при свертывании, детализация их механизмов и т.д.) и в сторону упрощения. Первое направление описывается в параграфе 3.3 ”Описание исходной модели”. Сейчас рассмотрим второе направление.
