- •Оглавление.
- •V. Выводы. 70
- •Введение.
- •I. Обзор литературы.
- •1. Гемостаз.
- •1.1. Плазменная система свертывания крови.
- •1.1.1. Состав, каскадная структура.
- •1.1.2. Сборка мебранных комплексов внутреннй теназы и протромбиназы.
- •1.2. Нарушения свертывания крови.
- •2. Экспериментальные исследования свертывания in vitro.
- •2.1. Стандартные гомогенные тесты.
- •2.2. Исследование пространственных эффектов в гомогенной постановке.
- •2.3. Пространственная динамика роста сгустка в неперемешиваемой плазме крови.
- •3. Математические модели плазменного звена свертывания крови.
- •3.1. Модели свертывания, основанные на каскадном устройстве системы и описывающие ее на качественном уровне.
- •3.1.1. Открытый ферментативный каскад.
- •3.1.2. Каскад с утечкой.
- •3.1.3. Учет положительных обратных связей через кофакторы.
- •3.1.4. Модельные ферментативные каскады.
- •3.2. Детальные, количественные модели свертывания.
- •3.2.1. Гомогенное тромбообразование.
- •3.2.2. Тромбообразование в ространственно-распределенной системе.
- •3.2.3. Механизменная модель свертывания крови в системе без перемешивания.
- •3.2.4. Феноменологическая автоволновая модель тромбообразования в системе без перемешивания.
- •3.3. Описание исходной модели.
- •II. Методы.
- •1. Методы численного решения уравнений.
- •2. Программа для расчета.
- •III. Результаты.
- •1. Уточнение исходной модели
- •1.1. Роль редуцированных ранее переменных – концентраций мембранных комплексов.
- •1.2. Учет реакций активации факторов IX и X фактором viIa.
- •1.3. Варьирование константы активации фактора XI тромбином.
- •2. Первоначальное упрощение исходной модели.
- •3. Вклад диффузионных членов в динамику поведения системы.
- •4. Редукция факторов VII и viIa. Введение новых переменных.
- •5. Аппроксимация формы бегущих импульсов факторов viiIa, Va и xIa.
- •5.1. Аппроксимация формы бегущего импульса фактора viiIa.
- •5.2. Распространение подхода на факторы Va и xIa.
- •6. Вклад диффузии мембранных комплексов и переход к концентрации свободного фактора Xa.
- •7. Верификация редуцированной модели.
- •IV. Обсуждение результатов.
- •1. Реальная размерность системы.
- •2. Характер поведения системы на различных стадиях свертывания.
- •3. Численное решение диффузионной задачи.
- •4. Упрощение алгебраических выражений в кинетических уравнениях.
- •5. Нормировка концентраций факторов.
- •6. Применение теоремы Тихонова к системе уравнений вида “реакция-диффузия”.
- •7. Смысл переменной е.
- •8. Аппроксимация формы бегущих импульсов факторов viiIa, Va и xIa.
- •9. Редукция блока внешней теназы.
- •V. Выводы.
- •Приложение а. Исходная модель.
- •Приложение б. Уточнение и упрощение исходной модели.
- •Приложение в. Упрощенная исходная модель.
- •Приложение г. Нормированная система.
- •Приложение д. Редуцированная модель.
- •Список литературы.
3.2.4. Феноменологическая автоволновая модель тромбообразования в системе без перемешивания.
Автоволновое распространение импульса тромбина с постоянной скоростью можно описать многими феноменологическими моделями, предполагающими автокаталитическое образование активатора и его уничтожение ингибитором, каторый производится активатором. Стационарное распространение автоволны – поведение, типичное для активных сред. В работах [58, 59, 61] предложена модель, демонстрирующая как распространение автоволны тромбина с постоянной скоростью и амплитудой, так и режимы остановки волны и ее распространения с пульсирующей амплитудой. Идея модели состоит в том, что автоволну тромбина может догнать и погасить автоволна ингибитора. Уравнения модели имеют следующий вид:
(7)
Здесь u – концентрация активатора (тромбина), v – концентрация ингибитора. Это – гипотетический ингибитор, раельно вещества с такой кинетикой, как у v, в крови не существует.
Обычно в автоволновых моделях предполагается автокаталитическое образование активатора, скорость образования ингибитора пропорциональна концентрации активатора, а коэффициент диффузии ингибитора много больше, чем активатора, что позволяет ингибитору “ограничивать со всех сторон” бегущий пик активатора. В данной модели коэффициенты диффузии обоих реагентов одинаковы, а распространение ингибитора за границы активатора возможно вследствие автокаталитического производства ингибитора.
Появление этой модели, предсказавшей описанные выше режимы, стимулировало экспериментальные [43, 61] и теоретические [54,55,56,57,60,61,62] исследования свертывания крови в пространственно-распределенных системах.
3.3. Описание исходной модели.
В [62] предлагается детальная модель свертывания, учитывающая подавляющее большинство известных химических реакций, в которых участвуют факторы свертывания. Эта модель является результатом коренной переработки моделей [53-57]. Авторы предлагают 2 варианта модели: максимально полную модель и частично редуцированную. Первая модель состоит из 36 дифференциальных уравнений, в ней скорости всех реакций ферментативного катализа описываются выражениями, учитывающими конкуренцию нескольких субстратов за один фермент и насыщение субстрата ферментом при большой концентрации последнего:
,
где
и
-
каталитическая константа и константа
Михаэлиса в реакции превращения
j-го
субстрата
в j-й
продукт
под действием фермента
.
Вторая модель получена из первой редукцией быстрых (характерное время изменения меньше секунд) и медленных (характерное время изменения больше часа) переменных в соответствии с теоремой Тихонова. Она состоит из 16 дифференциальных уравнений. В пространственно-распределенной системе 13 из них являются уравнениями в частных производных (для факторов свертывания в объеме плазмы), 3 - обыкновенными дифференциальными уравнениями (для поверхностных концентраций факторов на активирующей поверхности) и добавляются 4 ненулевых граничных условия (образование поверхностных комплексов факторами VII и VIIа из объема плазмы, активация факторов IX и X комплексом внешней теназы на левом конце отрезка интегрирования).
Обе модели верифицированы по многочисленным экспериментальным данным. В гомогенном случае получено хорошее описание стандартных калибровочных кривых для тестов АЧТВ и ПВ и показано, что на временах от секунд до часа редуцированная система с точностью до 10% демонстрирует то же поведение, что и нередуцированная. В пространственном случае получено количественное описание кинетики роста сгустка в нормальной плазме (рис. 11). Моделирование тромбообразования в плазме донора, больного гемофилией А, привело к хорошему согласию с экспериментом (рис. 12). В настоящий момент (данные не опубликованы) установлено, что модель также хорошо описывает рост сгустка при гемофилии С.
В настоящей дипломной работе вторая модель использовалась как исходная при редукции. Ее уравнения в обозначениях, используемых в дипломе, приведены в Приложении А.
Рис. 11. Пространственная динамика свертывания в норме [62]. А - экспериментальные профили светорассеяния, Б - теоретические профили фибрина, В - экспериментальные (заполненные символы, приведены результаты 3 экспериментов) и теоретическая (непрерывная кривая) зависимости размера сгустка от времени. Здесь и далее промежуток времени между профилями составляет 2 минуты. Расчеты производились по вторй модел, концентрация клеток фибробластов на поверхности активатора была равна 100 кл/мм2.
Рис. 12. Пространственная динамика свертывания в плазме больного гемофилией А, содержащей менее 1% фактора VIII [62]. А - экспериментальные профили светорассеяния, Б - теоретические профили фибрина. Расчеты производились по второй модели, с той же величиной активации, что и на рис. 11, и содержанием фактора VIII 1% от нормы.
