- •Оглавление.
- •V. Выводы. 70
- •Введение.
- •I. Обзор литературы.
- •1. Гемостаз.
- •1.1. Плазменная система свертывания крови.
- •1.1.1. Состав, каскадная структура.
- •1.1.2. Сборка мебранных комплексов внутреннй теназы и протромбиназы.
- •1.2. Нарушения свертывания крови.
- •2. Экспериментальные исследования свертывания in vitro.
- •2.1. Стандартные гомогенные тесты.
- •2.2. Исследование пространственных эффектов в гомогенной постановке.
- •2.3. Пространственная динамика роста сгустка в неперемешиваемой плазме крови.
- •3. Математические модели плазменного звена свертывания крови.
- •3.1. Модели свертывания, основанные на каскадном устройстве системы и описывающие ее на качественном уровне.
- •3.1.1. Открытый ферментативный каскад.
- •3.1.2. Каскад с утечкой.
- •3.1.3. Учет положительных обратных связей через кофакторы.
- •3.1.4. Модельные ферментативные каскады.
- •3.2. Детальные, количественные модели свертывания.
- •3.2.1. Гомогенное тромбообразование.
- •3.2.2. Тромбообразование в ространственно-распределенной системе.
- •3.2.3. Механизменная модель свертывания крови в системе без перемешивания.
- •3.2.4. Феноменологическая автоволновая модель тромбообразования в системе без перемешивания.
- •3.3. Описание исходной модели.
- •II. Методы.
- •1. Методы численного решения уравнений.
- •2. Программа для расчета.
- •III. Результаты.
- •1. Уточнение исходной модели
- •1.1. Роль редуцированных ранее переменных – концентраций мембранных комплексов.
- •1.2. Учет реакций активации факторов IX и X фактором viIa.
- •1.3. Варьирование константы активации фактора XI тромбином.
- •2. Первоначальное упрощение исходной модели.
- •3. Вклад диффузионных членов в динамику поведения системы.
- •4. Редукция факторов VII и viIa. Введение новых переменных.
- •5. Аппроксимация формы бегущих импульсов факторов viiIa, Va и xIa.
- •5.1. Аппроксимация формы бегущего импульса фактора viiIa.
- •5.2. Распространение подхода на факторы Va и xIa.
- •6. Вклад диффузии мембранных комплексов и переход к концентрации свободного фактора Xa.
- •7. Верификация редуцированной модели.
- •IV. Обсуждение результатов.
- •1. Реальная размерность системы.
- •2. Характер поведения системы на различных стадиях свертывания.
- •3. Численное решение диффузионной задачи.
- •4. Упрощение алгебраических выражений в кинетических уравнениях.
- •5. Нормировка концентраций факторов.
- •6. Применение теоремы Тихонова к системе уравнений вида “реакция-диффузия”.
- •7. Смысл переменной е.
- •8. Аппроксимация формы бегущих импульсов факторов viiIa, Va и xIa.
- •9. Редукция блока внешней теназы.
- •V. Выводы.
- •Приложение а. Исходная модель.
- •Приложение б. Уточнение и упрощение исходной модели.
- •Приложение в. Упрощенная исходная модель.
- •Приложение г. Нормированная система.
- •Приложение д. Редуцированная модель.
- •Список литературы.
4. Редукция факторов VII и viIa. Введение новых переменных.
После отбрасывания диффузионных членов часть уравнений пространственной части системы становятся уравнениями в полных производных. Можно легко проинтегрировать уравнение для концентрации фактора VIIa. Так как этот фактор не ингибируется, а отток его и фактора VII на активирующую поверхность (в комплексы с TF) пренебрежимо мал вследствие малой концентрации TF (в расчетах концентрация TF принималась равной 2.510-6 нМ/мм2 в пространственно-распределенной системе и 0.025 нМ в гомогенной), то суммарная концентрация факторов VII и VIIa в любой точке остается постоянной втечение всего времени свертывания, а изменение концентраций факторов VII и VIIa происходит только в результате работы факторов Xa и IIa. Можно показать, что через довольно короткое время после начала свертывания (порядка tlag), когда в системе образуется заметное количество тромбина, вклад последнего в протеолиз фактора VII становится определяющим, и реакцией активации фактора VII фактором Xa можно пренебречь.
В новых переменных в начальный момент времени y7=1, x7=0.01. В целях расчета действия антигемофильного препарата NovoSeven, тестируемого в нашей лаборатории и представляющего собой рекомбинантный фактор VIIa, введем параметр g7, равный концентрации добавленного фактора VIIa. Тогда имеем
Здесь мы вводим новую переменную
,
отражающую суммарное количество работы
тромбина в данной точке пространства
за все время с начала свертывания.
Фактически T()
- это тромбиновый потенциал в данной
точке. В дифференциальной форме T()
можно задать уравнением
с начальным условием T(t=0)=0
и граничными условиями непротекания
на концах отрезка.
Обозначая
,
получаем однозначно связанную с T()
переменную, которая в дифференциальной
форме задается в виде
Выражение для концентрации фактора VIIa принимает вид
.
5. Аппроксимация формы бегущих импульсов факторов viiIa, Va и xIa.
В общем виде скорость изменения концентрации любого активного фактора с учетом его исчерпания и без учета диффузии задается уравнением
с начальным условием x(t=0)=0; для фактора VIIa x7(t=0)=0.01.
Здесь x - концентрация активного фактора, 1-x - концентрация его предшественника, А - концентрация активатора, k и h - константы скоростей реакций активации и ингибирования, соответственно. При запороговой активации на начальном этапе ингибирование практически не сказывается на кинетике x(t) [44,48], т.к. фактора еще очень мало и скорость его ингибирования гораздо меньше скорости образования. Поэтому начальная кинетика хорошо описывается уравнением
,
имеющим решение
(8)
Но при t>>0 это решение стремится к 1, и переменная x ведет себя как триггер: весь предшественник, согласно этому решению, необратимо переходит в активную форму.
5.1. Аппроксимация формы бегущего импульса фактора viiIa.
Предполагая квазистационарность концентрации фактора VIIIa (константа его образования и образования фактора Va на порядок больше других констант обезразмеренной системы) в той области фронта его активации, где концентрации всех факторов уже сильно отличаются от 0, и учитывая выражение (8) для начальной кинетики активного фактора, концентрацию фактора VIIIa можно описать уравнением
Здесь s8=x8+y8
- суммарная концентрация факторов VIIIа
и VIII,
g8=y8(t=0)=s8(t=0)
- начальная концентрация фактора VIII.
Член
описывает начальную кинетику образования
фактора VIIIa (в подошве
фронта его активации), а
- выражение для квазистационарной
концентрации фактора VIIIa
в области левее подошвы (там
).
Введя новую переменную s8, два дифференциальных уравнения для x8 и y8 мы заменили одним:
с начальным условием s8(t=0)=g8 и граничными условиями непротекания на концах отрезка. Это уравнение описывает уменьшение суммарной концентрации факторов VIII и VIIIa в результате диссоциации последнего.
