- •Оглавление.
- •V. Выводы. 70
- •Введение.
- •I. Обзор литературы.
- •1. Гемостаз.
- •1.1. Плазменная система свертывания крови.
- •1.1.1. Состав, каскадная структура.
- •1.1.2. Сборка мебранных комплексов внутреннй теназы и протромбиназы.
- •1.2. Нарушения свертывания крови.
- •2. Экспериментальные исследования свертывания in vitro.
- •2.1. Стандартные гомогенные тесты.
- •2.2. Исследование пространственных эффектов в гомогенной постановке.
- •2.3. Пространственная динамика роста сгустка в неперемешиваемой плазме крови.
- •3. Математические модели плазменного звена свертывания крови.
- •3.1. Модели свертывания, основанные на каскадном устройстве системы и описывающие ее на качественном уровне.
- •3.1.1. Открытый ферментативный каскад.
- •3.1.2. Каскад с утечкой.
- •3.1.3. Учет положительных обратных связей через кофакторы.
- •3.1.4. Модельные ферментативные каскады.
- •3.2. Детальные, количественные модели свертывания.
- •3.2.1. Гомогенное тромбообразование.
- •3.2.2. Тромбообразование в ространственно-распределенной системе.
- •3.2.3. Механизменная модель свертывания крови в системе без перемешивания.
- •3.2.4. Феноменологическая автоволновая модель тромбообразования в системе без перемешивания.
- •3.3. Описание исходной модели.
- •II. Методы.
- •1. Методы численного решения уравнений.
- •2. Программа для расчета.
- •III. Результаты.
- •1. Уточнение исходной модели
- •1.1. Роль редуцированных ранее переменных – концентраций мембранных комплексов.
- •1.2. Учет реакций активации факторов IX и X фактором viIa.
- •1.3. Варьирование константы активации фактора XI тромбином.
- •2. Первоначальное упрощение исходной модели.
- •3. Вклад диффузионных членов в динамику поведения системы.
- •4. Редукция факторов VII и viIa. Введение новых переменных.
- •5. Аппроксимация формы бегущих импульсов факторов viiIa, Va и xIa.
- •5.1. Аппроксимация формы бегущего импульса фактора viiIa.
- •5.2. Распространение подхода на факторы Va и xIa.
- •6. Вклад диффузии мембранных комплексов и переход к концентрации свободного фактора Xa.
- •7. Верификация редуцированной модели.
- •IV. Обсуждение результатов.
- •1. Реальная размерность системы.
- •2. Характер поведения системы на различных стадиях свертывания.
- •3. Численное решение диффузионной задачи.
- •4. Упрощение алгебраических выражений в кинетических уравнениях.
- •5. Нормировка концентраций факторов.
- •6. Применение теоремы Тихонова к системе уравнений вида “реакция-диффузия”.
- •7. Смысл переменной е.
- •8. Аппроксимация формы бегущих импульсов факторов viiIa, Va и xIa.
- •9. Редукция блока внешней теназы.
- •V. Выводы.
- •Приложение а. Исходная модель.
- •Приложение б. Уточнение и упрощение исходной модели.
- •Приложение в. Упрощенная исходная модель.
- •Приложение г. Нормированная система.
- •Приложение д. Редуцированная модель.
- •Список литературы.
3.2.3. Механизменная модель свертывания крови в системе без перемешивания.
Редукция модели [47, 55, 56, 61] привела к системе из трех уравнений, показывающей все экспериментально известные режимы поведения системы свертывания. Редукция состояла из двух этапов [47, 55, 56, 61]. На первом этапе, пренебрегая диффузионными членами факторов IXa, Xa, Va и VIIIa, предполагая квазистационарность их концентраций и концентрации комплекса внешней теназы VIIa-TF и вводя ограничение концентрации тромбина в 1000 нМ вместо кинетического уравнения для концентрации его предшественника – протромбина – система редуцирована до трех уравнений. После обезразмеривания и упрощения алгебраических выражений в правых частях дифференциальных уравнений система приняла вид
Здесь u – концентрация тромбина, v – концентрация протеина С, w – концентрация фактора XIa. Авторы называют эту модель “механизменной”, чтобы отличать ее от “феноменологической”, предложенной в их лаборатории ранее (см. п. 3.2.4). Уравнения этих двух моделей имеют сходство, но в механизменной модели нет явного автокатализа производства ингибитора, а автокатализ активатора реализуется через переменную w.
В гомогенном случае эта система может иметь от 1 до 3 стационарных точек в области неотрицательности значений переменных. Количество стационарных точек и характер их устойчивости зависят от значения констант системы. Нижняя (нулевая) особая точка устойчива при любых значения констант и соответствует жидкому состоянию крови. Кроме простейшего перехода в верхнюю устойчивую особую точку при потере нижней особой точкой устойчивости (нормальное свертывание крови), в системе возможны колебательные режимы (существование предельного цикла) и хаотическое поведение. Тип поведения задается в-основном константой инактивации протеина С (K6).
При исследовании пространственного поведения системы (6) активация моделировалась локальным повышением значения переменной u на левой границе рассматриваемого отрезка. В зависимости от значения параметров, система демонстрирует режимы поведения с затухающим движением импульса тромбина (остановка роста сгустка), бесконечным его распростронением, в том числе с пульсирующей амплитудой или хаотичным делением импульсов (образование слоистых тромбов), распростронение волны переброса u. Получен также новый для систем типа реакция-диффузия режим: формирование неподвижного уединенного пика. Этот режим реализуется, если двигающийся из зоны активации импульс тромбина после остановки не диссипирует: этому мешает ингибитор, пик которого ограничивает, окружает пик тромбина.
Построение и исследование этой модели [47, 55, 56, 61] и экспериментальные исследования ([43], п. 2.3) привели к более глубокому пониманию процессов, определяющих поведение системы свертывания крови в целом: разделение в пространстве и во времени фаз инициации свертывания, роста сгустка и остановки его роста, причины слабой зависимости поведения системы свертывания в фазе роста от активации и того, что это поведение в-основном определяется внутренним устройством системы. В частности, они помогли раскрыть загадку гемофилий – кровоточивость при недостатке одного из факторов внутреннего пути свертывания. Теперь понятно, что недостаток фактора внутреннего пути приводит к нарушению фазы роста сгустка даже при нормальной активации свертывания.
Модель явилась также важным вкладом в теорию динамических систем, показав новый, ранее неизвестный тип поведения систем типа реакция-диффузия, и в настоящий момент, даже достаточно автономно от свертывания, представляет интерес для специалистов в области нелинейной динамики [60].
