
- •3.Біологічні макромолекули та їх роль в клітині
- •4.Формування просторової структури білків,біологічне значення цього процесу
- •6.Захиснафункціябілків
- •7. Пояснити біологічну зумовленість різноманітності та специфічності білкових структур.
- •8. Унікальні властивості днк
- •10. Молекулярна організація Хромосом
- •12.Організація тРнк та функціональне значення її ділянок
- •14.Сутність та біологічне значення функціональних зв'язків між білками та нуклеїновими кислотами
- •15.Особливості мітохондріальних геномів
- •15.Особливості мітохондріальних геномів
- •18. Функціональна різноманітність ферментного комплексу реплікації.
- •19. Механізм реплікативного та репараційного синтезу днк.
- •20. Функціональні зв’язки в системі днк-білки. (ст.. 89)
- •22. Біологічний сенс і-рнк, її роль в реалізації генетичної інформації.
- •23. (Ст. 133)Структура рнк-полімерази, роль у процесах реалізації генетичної інформації.
- •24. Механізми транскрипції.
- •25. Молекулярні основи експресії генів.
- •31. Особливості взаємодії геному та апарату трансляції в бактеріальних клітинах.
- •32. Генетичний код, його властивості.
- •33. Трансляція в прокаріотичних клітинах та мітохондріях.
- •34. Дозрівання білкових молекул.
- •35. Шаперони і фолдази, їх роль у фолдингу.
- •45. Синтез р-рнк та її роль у клітині
- •48. Рекомбінація молекули днк та її біологічне значення
- •49. Гіпотеза походження двомембранних органел
- •50. Взаємодія ядерного та мітохондріального геномів.
- •51.Функціональна роль компартментації цитоплазми.
- •52.Молекулярні основи поділу та розмноження клітин.
- •53.Роль циклонів та циклін-залежних кіназ у поділі клітини.
- •54.Теломери та роль теломерази у підтриманні мітотичної активності клітин.
35. Шаперони і фолдази, їх роль у фолдингу.
Зрозуміло, що все це неможливо здійснити in vivo - достатньо сказати, що загальна середня концентрація білків у клітині становить ~100 мг/мл або більше. Тобто клітинні умови є дуже агресивними для поліпептидного ланцюга, що перебуває у процесі пошуку своєї нативної конформації, і без спеціальних механізмів більшість білків просто не встигли б після свого синтезу таку конформацію знайти, швидко опинившись у складі агрегату. Такі механізми - створення рівноважних умов поступового пошуку нативної структури та захист від агрегації - забезпечуються спеціальними білками – шаперонами (від фр. Chaperon - капюшон, або особа, що супроводжує незайману дівчину).
Шаперони не визначають ані нативну структуру білка, ані шлях її укладання - і те, й інше детермінується амінокислотною послідовністю. Головна функція шаперонів - забезпечити умови для швидкого пошуку нативної конформації, створюючи своєрідний «інкубатор» для неструктурованого поліпептидного ланцюга.
Серед досить великої кількості шаперонів є специфічні - зокрема такі, що обслуговують процеси збирання мультибілкових комплексів і субодиничних білків. Більш універсальні шаперони відносять до родини hsp - білків теплового шоку (heat shock proteins). Білки hsp є загальним компонентом клітин для всіх таксономічних груп, у пойкілотермних організмів транскрипція на генах hsp активується у відповідь на зростання температури до 30 - 40 °С при гальмуванні транскрипції більшості інших генів(тепловий шок).
Процес згортання пептидного ланцюга в просторову структуру і досягнення білком правильної конфігурації називається фолдигом. Для невеликих білків характерно мимовільне утворення третинної структури, а для фолдингу великих білків необхідні спеціальні допоміжні білки - шаперони і ферменти - фолдази. Фолдинг за участю фолдаз і шаперонів зазвичай призводить поліпептидних ланцюг до «правильної», найбільш оптимальної в енергетичному та функціональному відношеннях, структури.
Шаперони: вони являються білками, основна функція яких залежить у відновленні третинної структури пошкоджених білків, а також утворення та дисоціація білкових комплексів. Температура сильно впливає на холдинг білка. Шаперони здатні синтезувати тільки що утворених білків, коли вони виходять з рибосоми. Фолдази: приймають участь у згортанні поліпептидних ланцюгів. Формування та ізомеризація дисульфідних зв’язків еукаріот.
37. Виділяють такі основні функції біологічних мембран:
1) бар’єрна функція (забезпечує селективний, регульований, пасивний і активний обмін речовин клітини з оточуючим середовищем (селективний – означає вибірковий: одні речовини переносяться через біологічні мембрани, інші – ні; регульований – проникність мембрани для певних речовин змінюється залежно від функціонального стану клітини; активний – перенесення проти градієнту концентрації); завдяки напівпроникності забезпечується селективний транспорт і розподіл іонів між клітиною та середовищем);
2) матрична функція (забезпечує взаємне розташування та орієнтацію мембранних білків, їх оптимальну взаємодію (наприклад, взаємодію мембранних ферментів));
3) механічна функція (забезпечує міцність та автономність клітини і внутрішньоклітинних структур);
4) енергетична функція (забезпечує синтез АТФ на внутрішніх мембранах мітохондрій, фотосинтез вуглеводів у мембранах хлоропластів);
5) генерація та проведення біопотенціалів (включає канали, насоси та обмінники, забезпечує транспорт іонів);
6) рецепторна функція (механічна, акустична, зорова, хімічна, терморецепція);
7) адгезивна (забезпечує міжклітинні взаємодії);
8) рухлива (забезпечує процес руху клітин);
9) секреторна (забезпечує процес екзо- та ендоцитозу) та ін.
Отже, біомембрани відіграють важливу роль як у структурній організації, так і в функціонуванні клітин і клітинних органел. Вони:
відділяють клітини від оточуючого середовища;
поділяють клітину на компартменти (відсіки);
регулюють транспорт речовин до клітини та в органели або зворотному напрямку;
забезпечують специфіку міжклітинних контактів;
сприймають, посилюють і передають всередину клітини сигнали із
зовнішнього середовища.
Основні (загальні) принципи структурної організації усіх мембран подібні, однак плазматична мембрана, ендоплазматичний ретикулум, апарат Гольджі, мітохондріальна і ядерна мембрани мають свої суттєві структурні особливості.
Призначення клітинних мембран: 1) механіко-просторова функція; 2)сенсорно-сигнальна; 3) трансформація енергії; 4) захисна.
Розглянемо будову (структурний склад) і властивості біомембран на прикладі мембрани еритроцитів. Еритроцити – традиційна модель для біофізичних досліджень при вивченні структурної і функціональної організації клітинних мембран. У чистому вигляді їх отримати порівняно нескладно, оскільки вони не містять внутрішньоклітинних мембран. Згідно з рідинно- мозаїчною моделлю, еритроцитарні мембрани розглядають як неперервний твердопружний білковий каркас, комірки якого заповнені ліпідним бішаром. Він представляє собою єдину сітку, організовану за рахунок чисельних слабких зв’язків (іонних, водневих, Ван-дер-ваальсових та ін.), які діють як на стиках протомерів, так і всередині них. Цей каркас характеризується високою еластичністю та обумовлює в’язкопружні властивості інтактних мембран як цілого. Білковий каркас разом з ліпідною фазою контролює рухливість мембранних рецепторів і ферментів, а також механічні та морфологічні властивості клітин.
Еритроцитарна мембрана складається з білків (50%), ліпідів (40%) і вуглеводів (10%). Більша частина вуглеводів (93%) зв’язана з білками, інша – з ліпідами. У мембрані еритроцитів ідентифіковано близько 200 різних ліпідів. Ліпіди у мембрані розміщені асиметрично. Ця асиметрія підтримується,__ ймовірно, за рахунок поперечного переміщення фосфоліпідів у мембрані, яке відбувається за допомогою мембранних білків та за рахунок енергії метаболізму. Спонтанне перевертання (фліп-флоп) сфінголіпідів та
фосфогліцеридів у мембрані – процес повільний, утруднений нездатністю полярних голівок проникати через гідрофобний шар. У внутрішньому шар еритроцитарної мембрани знаходиться головним чином фосфатидилінозитол, фосфатидилетаноламін, фосфатидилсерин, а у зовнішньому – фосфатидилхолін.
До складу плазматичної мембрани еритроцитів входить не менше ста різних білків. Найбільш дослідженими з них є такі: спектрин (виконує структурну роль, є периферичним білком, зв’язаним з внутрішньою частиною еритроцитарної мембрани), анкірин (периферичний білок), білок, що утворює аніонний канал, так звані білки смужки 3 (назва походить від рухливості при електрофорезі в поліакриламідному гелі, складається з 900 амінокислотних залишків, ймовірно, бере участь у полегшеній дифузії аніонів гідрокарбонату та іонів хлору через мембрану) та смужки 4.1, глікофорин (інтегральний глікопротеїн, містить 131 амінокислотний залишок), актиноподібні білки. Інтегральними комплексами, які виступають над поверхнею, є глікофорин та білок смужки 3, з ними зв’язаніпідмембранні елементи цитоскелету. Білок смужки 3 зв’язаний у цитозолі з анкірином, який, у свою чергу, зв’язаний зі спектрином. Спектрин міцно асоційований з актиноподібними білками еритроцитарної мембрани, утворюючи подібну до актоміозину АТФ-залежну систему. В цілому, за рахунок структурних білків, які забезпечують форму еритроцита і визначають механічні властивості мембран, формується цитоскелетний каркас, який надає еритроциту характерну двояковвігнуту форму. Дефекти білків цитоскелету лежать в основі їх руйнування при старінні, а також деяких захворювань (серповодноклітинна анемія та ін.). Вуглеводневі компоненти глікофорину виконують рецепторну функцію для вірусів грипу, гемаглютинінів, деяких гормонів.
38. Сучасні моделі. Рідинно-мозаїчна модель. Сукупність результатів,отриманих фізико-хімічними методами досліджень, сприяли появі нової моделі будови біологічних мембран – рідинно-мозаїчної (Сингер і Нікольсон, 1972 р.)(рис. 1.2). Структурну основу біологічної мембрани складає подвійний шар ліпідів (плинний фосфоліпідний бішар, у який занурені білки), інкрустований білками,подібно мозаїці. Розрізняють поверхневі (або периферичні) та інтегральні білки.За фізіологічних умов ліпіди знаходяться у рідкому агрегатному стані. Це дозволяє порівняти мембрану з фосфоліпідним «морем», в якому плавають білкові «айсберги». Рідинно-мозаїчна модель будови мембрани є сьогодні загальноприйнятою. Проте, не всі білки вільно дифундують у рідкому ліпідному бішарі. Деякі ділянки мембран відрізняються за своєю структурою від класичного ліпідного бішару внаслідок ліпідного поліморфізму. В межах однієї мембрани можуть знаходитися ділянки з різним ліпідним складом і функціями. Вважають, що така складна динамічна структура біомембран, для якої характерні викривлення, фазові переходи, різна товщина, утворення небішарових структур, визначається взаємодією мембранних білків з ліпідами.
Рис. 1.2. Модель структурної організації біомембрани за Сингером-Нікольсоном.
Ці взаємодії багато в чому забезпечують ефективне виконання мембранами різноманітних клітинних функцій. Як наслідок, існують різні моделі організації мембрани, які ми розглянемо далі
39. Мембранні білки — молекули білків, що містяться в біологічних мембранамах клітини або її органел або зв'язані з ними. Більш ніж половина всіх білків тим чи іншим чином взаємодіють з мембранами. За топологічним розташоуванням відносно мембрани мембранні білки можуть бути поділені на монототні (на одній стороні) та політопні (на обох сторонах мембрани), за спорсобом зв'язування з мембраною — на інтегральні та периферійні, що дає 3 можливі підгрупи:
Інтегральні мембранні білки постійно перебувають у мембрані. Для відділення від мембрани вони вимагають детергентів (наприклад SDS або Тритон X-100) або неполярних розчинників. У свою чергу, ці білки класифікаються у дві групи згідно з їхнім розташуванням у ліпідному бішарі:
Трансмембранні білки проходять крізь всю мембрану. Трансмембранні ділянки білків мають структуру або альфа-спіралей, або бета-барелей. Спіральні трансмембранні білки присутні у всіх видах біологічних мембран, включаючи цитоплазматичну. Тоді як трансмембранні білки у з альфа-спіральною структурою існують у всіх типів клітин, бета-барелі знайдені тільки в зовнішній мембрані грам-негативних бактерій, клітинній стінці грам-позитивних бактерій і зовнішній мембрані мітохондрій і хлоропластів.
Інтегральні монотопні білки розташовані тільки на одній стороні мембрани.
Периферійні мембранні білки тимчасово зв'язуються із ліпідним бішаром або з інтегральними мембранними білками за допомогою гідрофобних, електростатичних та інших нековалентних взаємодій. Периферійні білки від'єднуються під дією деяких полярних речовин, наприклад, розчину з високим pH або високими концентраціями солі.
Інтегральні та периферійні білки можуть бути змінені за допомогою посттрансляційної модифікації, зокрема додаванням жирних кислот, фенільних ланцюжків, або GPI(глікофосфоділінозитолу), що допомогоє їм міцніше приєднатися до ліпідного бішару.
Деякі пептидні токсини, такі як колхіцин-A або альфа-гемолізин, та деякі білки, залучені в регулювання апоптозу, одночасно входять до різних категорій цієї класифікації. Ці білки водорозчинні, але вони можуть агрегувати та необоротно зв'язуватися з мембранами, де формують трансмембранні альфа-спіралі або бета-барелі. Часто ці білки називаютьсяамфітрофними.
Мембранні білки: структура та функції. Основна роль ліпідів у складімембран полягає у стабілізації бішарової структури. Як вже зазначалось, білки мембран відрізняються за своїм положенням у мембрані. Мембранні білки, якіконтактують з гідрофобною ділянкою ліпідного бішару, повинні бути амфіфільними, тобто мати неполярний домен. Отже, важливий момент використання методів для досліджень мембранних білків – способи їх прикріплення до мембрани:
1) зв’язування з білками, зануреними у бішар (рис. 6.1).
Як приклад, можна навести F1-частину Н+-АТФази, яка зв’язується з F0- частиною, зануреною у мембрану, білки цитоскелету;
Рис. 6.1. Приклад зв’язування з білками зануреними у бішар [6].
2) зв’язування з поверхнею бішару (рис. 6.2).
Ця взаємодія має електростатичну природу (наприклад, білок мієлину), або гідрофобну (наприклад, деякі поверхневоактивні пептиди). На поверхні деяких мембранних білків є гідрофобні домени, які утворюються завдяки особливостям вторинної або третинної структури. Ці поверхневі взаємодії можуть використовуватися як додаткові до інших взаємодій, наприклад, до трансмембранного заякорювання;
Рис. 6.2. Зв’язування з поверхнею бішару [6].
3) зв’язування за допомогою гідрофобного «якоря» (рис. 6.3).
Рис.
6.3. Прикріплення
мембранних білків за допомогою
гідрофобного «якоря» [6].
Ця структура, як правило, є послідовністю неполярних амінокислотних залишків (наприклад, у цитохромі b5). Деякі мембранні білки використовують, як якір, ковалентно зв’язані з ними жирні кислоти або фосфоліпіди;
4) трансмембранні білки (рис. 6.4).
Деякі з них пересікають мембрану лише один раз (наприклад, глікофорин), а інші – кілька разів (наприклад, лактозопермеаза, бактеріородопсин).
Рис. 6.4. Приклади трансмембранного розміщення мембранних білків [6].
Також для визначення методів дослідження білків мембран необхідно враховувати функціональну класифікацію мембранних білків, а саме: 1. ферментативні; 2. транспортні; 3. рецепторні; 4. каналоутворюючі; 5. ворітні; 6. структурні, а також їх класифікацію за локалізацією по відношенню до ліпідів: 1. інтегральні, 2. периферичні, Відмінності між зовнішніми (або периферичними) і внутрішніми (або інтегральними) мембранними білками не задається однозначно способом їх прикріплення до бішару. Вони визначають лише відносну силу їх зв’язування
40. Міжкліти́нні конта́кти — спеціалізовані ділянки поверхні клітини, якими вона кріпиться до інших клітин або позаклітинного матриксу[1]. До основних функцій міжклітинних контактів належить утримання клітин разом, забезпечення «спілкування» між ними, правильна їх орієнтація одна відносно іншої, регулювання переміщення клітин[2].
Злипання клітин між собою та приєднання їх до міжклітинного матриксу забезпечують молекули клітинної адгезії : кадгерини, інегрини, білки суперродини імунглобулінів, муцини та селектини. Цитоплазматична частина цих білків зазвичай приєднана до елементів цитоскелету. Більшість CAM рівномірно розподілені по поверхні цитоплазматичної мембрани і їх здебільшого достатньо для утримання клітин разом, проте в деяких тканинах на поверхні клітин формуються спеціалізовані ділянки скупчення молекул адгезії, саме для означення таких ділянок і використовують термін «міжклітинні контакти»
У залежності від того, чи контакти утворюються між однаковими чи різними клітинами, вони поділяються на гомо- та гетерофільні відповідно
На основі структури і функцій клітинні контакти класифікують на чотири основні групи
Якірні контакти (англ. anchoring junctions) — включають як з'єднання двох клітин, так і з'єднання клітин із позаклітинним матриксом завжди асоційовані з елементами цитоскелету: актиновими або проміжними філаментами. Не зважаючи на те, що якірні контакти мають відмінності у структурі, для них всіх характерна наявність трьох основних елементів: молекули клітинної адгезії (кадгеринів у випадку взаємодії клітина-клітина або інтегринів у випадку взаємодії клітина-позаклітинний матрикс), адаптерного білка, що кріпить CAM до цитоскелету, та пучка актинових або проміжних філаментів
Адгезивні контакти (англ. adhesive junctions) або зони злипання — з'єднують пучки актинових волокон у сусідніх клітинах. Сполучають латеральні поверхні епітеліальних клітин, навколо яких утворюють пояски, що розташовуються відразу ж під зоною щільних контактів[3][4].
Контакти із позаклітинним матриксом, приєднані до актинових філаментів;
Десмосоми або пластинки прикріплення — з'єднують пучки проміжних філаментів у сусідніх клітинах;
Гемідесмосоми — контакти клітини із позаклітинним матриксом, схожі за будовою до десмосом.
Замикальні контакти (англ. occluding junctions) — контакти, що «зшивають» клітини між собою, при цьому їхні мембрани максимально зближуються, внаслідок чого формуються непроникні або вибірково проникні щільні шари.
Щільні контакти (англ. tight junctions, zonula occludens) — замикальні контакти хребетних тварин;
Септовані контакти (англ. septate junctions) — замикальні контакти безхребетних тварин.
Контакти, що формують канали, або комунікативні контакти сполучають цитоплазму сусідніх клітин і допомагають інтегрувати їхній метаболізм:
Щілинні контакти або нексуси (англ. gap junctions) — комунікативні контакти тварин;
Плазмодесми — цитоплазматичні містки між рослинними клітинами.
Контакти, що передають сигнали, беруть участь у передачі інформації між клітинами через мембрани.
Хімічні синапси;
Імунологічні синапси;
Трансмембранні клітинні контакти ліганд-рецептор (наприклад Delta-Notch, ephrin-Eph). Будь-який із трьох інших типів клітинних контактів може виконувати крім структурної сигнальну функцію.
41. . 41.види транспорту молекул та іонів через біологічні мембрани Мембрани регулюють процес транспорту до клітини потрібних речовин та виведення із неї відходів. Розрізняють наступні види клітинного транспорту:
Пасивний транспорт — рух речовин через мембрану за градієнтом концентрації (від ділянки з більшою концентрацією до ділянок із меншою концентрацією) без витрат енергії:
Проста дифузія — рух речовин (наприклад гідрофобних молекул або розчинених газів) безпосередньо через ліпідний бішар. Різновидом простої дифузії є осмос — рух води через напівпроникну мембрану з ділянки з меншою концентрацією розчину до ділянки з більшою концентрацією.
Полегшена дифузія — рух молекул через особливі білкові канали або за посередництва білкових переносників за градієнтом концентрації (наприклад рух неорганічних іонів через іонні канали).
Активний транспорт — рух речовин через мембрану проти градієнту концентрації, що відбувається із витратою енергії та здійснюється за допомогою спеціальних білків-насосів. Розрізняють первинний активний транспорт, для якого використовується енергія гідролізу АТФ, та вторинний активний транспорт, за якого для транспорту однієї речовини проти градієнту концентрації інша транспортується за градієнтом.
Ендоцитоз та екзоцитоз — енерговитратні процеси транспортування речовин і часточок у клітину (ендоцитоз) або з клітини (екзоцитоз) за участі мембранних везикул (пухирців).
ТРАНСПОРТ РЕЧОВИН ЧЕРЕЗ БІОЛОГІЧНІ МЕМБРАНИ
Класифікація. Розрізняють: прямий і опосередкований транспорт. Прямий - без участі переносщиків, опосередкований - за їх участю. Наприклад, транспорт глюкози за участю переносщика.
Опосередкований транспорт здійснюється з витратою енергії (активний транспорт) або без витрати енергії (полегшена дифузія). Прямий транспорт завжди йде по типу пасивного транспорту.
З сказаного ясно, що другий варіант класифікації - це виділення двох основних видів транспорту речовин - пасивного і активного.
Третій варіант класифікації - транспорт із зміною архітектури мембрани (екзоцитоз, ендоцитоз) або без зміни структури мембрани (всі інші види транспорту).
Четвертий варіант класифікації - це транспорт, спряжений із переносом двох речовин (котранспорт), що може протікати по типі симпорта (дві речовини йдуть в одному напрямку - наприклад Nа + глюкоза) або по типу ангипорта (одна речовина йде в клітину, друга -з клітини або навпаки - Nа і K). Антипод котранспорту - звичайний транспорт, або уніпорт, тобто коли переноситься одна речовина, наприклад, молекули глюкози.
Пасивний транспорт. Розрізняють два його види - просту дифузію і полегшену дифузію. Проста дифузія йде відповідно до закону Фіка - за хімічним або електрохімічним градієнтом. Наприклад, в клітині натрію 14 ммоль, а в середовищі - 140 ммоль, в цьому випадку пасивний потік повинний бути спрямований в клітину. В живих системах цей вид транспорту використовуеться обмежено. Кисень, вуглекислий газ, вода - вони можуть у такий спосіб здійснювати перехід із клітини в середовище або навпаки. Важливо, що для пасивної простої дифузії речовина повинна бути жиророзчинна. Гiдрофiльнi речовини пройти у фосфолiпiдному шарі мембрани не можуть. В цілому, витрати енергії на цей процес не стається, тому що дифузія йде за градієнтом. Полегшена дифузія проходить по двох варiантах- за участю переносщиків або при наявності спецiалiзованих каналів. Виявлено, що в мембранах є спеціальні бiлки-переносщики, які специфiчно зв`язуються із транспортованою молекулою, сприяють її переносу за градіентом концентрації. Таким чином, витрат енергії не відбувається, а шлях через мембрану полегшується за рахунок наявності специфічного переносщика. Специфічність проявляється,наприклад, в тому, що D-iзомери цукрiв транспортуються таким чином, а L-iзомери нi, або L-амiнокислоти транспортуються, а D-амiнокислоти нi. Іонні канали - це iнтегральнi бiлки мембрани, яки виконують функцію транспорту для вiдповiдного iона. Селективнiсть каналу забезпечується за рахунок геометрiї ( дiаметр селективного фiльтра), за рахунок внутрiшньоканального розташування заряджених частинок (наприклад, для катiон-пропускаючих каналiв - анiоннi частинки).Кожен iонний канал мiстить устя, селективний фiльтр, ворота i механiзм управління воротами. Частина каналів керується за рахунок різниці потенціалів на мембрані (потенцiал- залежнi іонні канали) - для цього поруч із каналом є електричний сенсор, що в залежності від величимни мембранного потенціалу або відчиняє ворота каналів, або тримає їх закритими. Другий варіант іонних каналів - ворота каналів керуються за рахунок рецептора, розташованого на поверхні мембрани: при взаємодії медiатора (лiганда) з цим рецептором може відбуватися відкриття іонних каналів. В деяких рецептокеруючих каналах між рецептором і ворiтним механізмом є проміжна стадія (посередник типу цАМФ, протеiнкiнизи i т.п.).
Селективнiсть iонних каналів багато в чому визначається геометрією каналу. Наприклад, кристалічний діаметр іона натрію - 0,19 нм, разом із гiдратною оболонкою його діаметр становить біля 0,3 нм. Устя каналу 0,3-0,5 нм. Для того, щоб пройти через канал (головне - через селективний фільтр), іон натрію або iнший іон повинен звільнитися від гiдратної оболонки і тільки в «голому» виглядi може пройти через канал. Занадто великий іон не може ввійти в канал, занадто маленький не спроможний віддати гiдратну оболонку в селективному фільтрі, тому не може вискочити з каналу.
Натрієві канали мають устя, селективний фільтр, ворiтний механізм. Ворота в них двох типів - активацiйнi (м-ворота) і iнактивацiйнi (h-ворота). В умовах спокою (МП=80 м, наприклад), активацiйнi ворота закриті, але готовi в будь-яку хвилину відчинитися, а iнактивацiйнi ворота відкриті. При зниженні МП (наприклад, до 60 м) активацiйнi ворота вiдчиняються і впускають іони натрію в клітину, але незабаром починають закриватися iнактивацiйнi ворота (відбувається iнактивацiя натрієвих каналів). Через якiсь час закриваються активацiйнi ворота, вiдчиняються iнактивацiйнi ворота, і канал готовий до нового циклу. Канал блокується тетродоксином, місцевими анестетиками (новокаїном, іншими речовинами). Це використовується в медичній практицi.
Калієві канали теж достатньо селективні - в основному пропускають іони калію. Вони блокуються тетраетиламонiєвим. Процеси iнактивацii в них виражені слабко.
Кальцієві канали - мають всі атрибути іонного каналу (устя, ворiтний механізм, фільтр). Блокуються іонами марганцю, нікелю, кадмiю (двовалентні іони), а також лікарськими речовинами - верапамiлом, нiфедипiном, дильтиаземом, що використовуються в клінічній практицi.
Активний транспорт: розрізняють первинно-активний транспорт, при якому енергія використовуеться на перенос даної речовини проти градіенту його концентрації, а також вторинно-активний транспорт, при якому енергія на перенос даної речовини (наприклад, молекули глюкози) використовується за рахунок механізму переносу іншої речовини (наприклад, натрію).
Первинно-активний транспорт широко представлений в організмі. Це калій -натрієва помпа, натрій-водневий обмінний механізм, натрій-кальцієвий обмінний механізм, кальцієва помпа і т.д. Суть його складається в тому, що в мембрані є переносщик, який володіє АТФ-азною активністю, тобто він спроможний розщеплювати АТФ і вивільнювати енергію, що і використовується на перенос речовини. Конкретно: калiй- натрiєва помпа «викачує» із клітини іони натрію, а «вкачує» іони калію (проти градієнту концентрації). Щоб здійснити перенос натрію з клітини в середовище, переносщик (калiй- натрiєва АТФ-аза) всередині клітини з'єднується з іонами натрію, в результаті активується АТФ-азна активність переносщика, відбувається гiдролiз АТФ, це викликає звільнення енергії, в результаті - переносщик переносить натрій у середовище. Тут він втрачає спорідненість до натрію, але набуває спорідненості до калію і приєднує його іони. В результаті - змінюється конформація переносщика, і він (якимось чином?) знову повертається до внутрішньої поверхні мембрани, вносячи в клітину іони калію. Тут знову він втрачає спорідненість до іонів калію, але набуває спорідненість до іонів натрію, і цикл повторюється. Помпа iнгiбується уабаiном (строфантин С). Конкретні механізми роботи помпи ще багато в чому не ясні.
Вторинно-активний транспорт. В основному представлений в ентероцитах, в епітелії нирок. Суть його полягає в слiдуючому (на прикладі транспорту молекули глюкози). Молекула глюкози повинна ввійти в клітину, де її концентрація набагато вища, ніж у середовищi. Для того, щоб це вiдбулося, необхідні витрати енергії. Але витрачається енергія, що раніше була витрачена на транспорт натрію. Справа в тому, що в цій клітині створюються за рахунок роботи калiй-натрiєвої помпи низькі концентрації натрію. При наявності високих концентрацій натрію в середовищi - натрій захоче ввiйти в клітину (за градієнтом). Отже, молекула глюкози приєднується до специфічного перенощика, до якого приеднується іон натрію. В результаті градієнту концентрації (для натрію) цей «комбайн» (переносщик + глюкоза + іон натрію) переноситься всередину клітини, де глюкоза і натрій вiдщеплюються від переносщика, а переносщик «іде» знову виконувати свою роботу. Натрій вiдкачується помпою, а глюкоза покидає клітину з iншоi сторони вже по градіенту концентрації (полегшена дифузія по типу «транспорт за участю переносщика»).
В цілому, представлені приклади демонструють наявність у живих системах котранспорту, коли одним механізмом транспортується одночасно дві молекули. У випадку калiй- натрiєвої помпи має місце антипорт (калій йде в одну сторону, натрій у протилежну), у випадку вторинно-активного транспорту має місце симпорт.
Ендоцитоз і екзоцитоз. Це варіанти транспорту, при яких змінюється архітектура мембран. Він здійснюється з витратою енергії. Ендоцитоз - це введення великомолекулярних частинок з середовища в клiтину. Один його варiант- фагоцитоз, другий- пiноцитоз. Пiноцитоз представляє собою спосiб утворення клiтиною білкової молекули без її попереднього гiдролiзу. Такий механiзм, наприклад, має місце в новонароджених, що із молоком матері одержують антитiла (iмуноглобулiни), через ентероцити, які потрапляють в організм дитини, будучи цілком незруйнованими і спроможними до виконання своїх функцій.
Екзоцитоз - це виділення великих молекул із клітини. Приклад тому - виділення квантів медiатора з везикули в синапсi.
42. Ядро - найбільша органела клітини, її найважливіший регулюючий центр. Клітина має одне ядро, але існують клітини двохядерні і багатоядерні. У деяких організмах можуть зустрічатися клітини, позбавлені ядер. Ядро забезпечує найважливіші метаболічні і генетичні функції клітини. За формою ядро може бути кулястим, овальним, лопатевим, лінзовидним і так далі. Розмір, форма і структура ядер змінюються залежно від функціонального стану клітин, швидко реагуючи на зміну зовнішніх умов. Форма ядра зазвичай округла або овальна. Діаметр ядра може коливатися від 5-10 мкм до 20 мкм.
Зовні ядро оточене подвійною мембраною (ядерною оболонковою або кариолеммой), в якій є ядерні пори; через ці пори здійснюється зв'язок ядра з цитоплазмою. Поступають в ядро з цитоплазми нуклеотиди, білки і виходять з ядра в цитоплазму молекули РНК, рибосомні субодиниці. Ядерні пори не просто пропускають різні речовини з ядра в цитоплазму і назад, але і регулюють цей рух.
Внутрішній зміст ядра - каріоплазма. У нім знаходяться такі структури, як хромосоми, ядерця а також нуклеотиди, білки, солі, іони та ін.
Ядерце - структура, складена з розташованих рядом ділянок декількох різних хромосом. Ці ділянки є великими петлями ДНК, що містить гени рибосомальной РНК (рРНК).
Функції ядра:
-регулює і контролює усі обмінні процеси, що протікають в клітині;
-містить хромосоми, є хранителем генетичної інформації;
- бере участь в реалізації генетичної інформації (тобто в синтезі білків), саме в ядрі проходить транскрипція - перший етап синтезу поліпептиду;
- його ділення лежить в основі ділення клітин.
Хромосоми - структурні елементи ядра клітини эукариот, ДНК, що містить, в якій знаходиться спадкова інформація організму.
Структура клітинного ядра:
Хроматин
Величезна довжина молекул ДНК еукаріот визначила появу спеціальних механізмів зберігання, реплікації і реалізації генетичного матеріалу. Хроматином називають молекули хромосомної ДНК у комплексі зі специфічними білками, необхідними для здійснення цих процесів. Основну масу складають «білки зберігання», так звані гістони. З цих білків побудовані нуклеосоми - структури, на які намотані нитки молекул ДНК. Нуклеосоми розташовуються досить регулярно, так що утворюється структура нагадує намисто. Нуклеосома складається з білків чотирьох типів: H2A, H2B, H3 і H4. В одну нуклеосому входять по два білки кожного типу - всього вісім білків. Гистон H1, більш великий ніж інші гістони, зв'язується з ДНК у місці її входу на нуклеосому. Нуклеосома разом з H1 називається хроматосомой Нитка ДНК з Нуклеосома утворює нерегулярну соленоїд-подібну структуру завтовшки близько 30 нанометрів, так звану 30 нм фибриллу. Подальша упаковка цій фібрили може мати різну щільність. Якщо хроматин упакований щільно, його називають конденсованим або гетерохроматином, він добре бачимо під мікроскопом. ДНК, що знаходиться в гетерохроматин, не транскрибується, зазвичай це стан характерний для незначущих або молчащих ділянок. В інтерфазі гетерохроматин звичайно розташовується по периферії ядра (пристінковий гетерохроматин). Повна конденсація хромосом відбувається перед поділом клітини. Якщо хроматин упакований нещільно, його називають ЕУ-або інтерхроматіном. Цей вид хроматину набагато менш щільний при спостереженні під мікроскопом і зазвичай характеризується наявністю транскрипционной активності. Щільність упаковки хроматину в чому визначається модифікаціями гистонов - ацетилюванням і фосфорилюванням.
Вважається, що в ядрі існують так звані функціональні домени хроматину (ДНК одного домену містить приблизно 30 тисяч пар основ), тобто кожна ділянка хромосоми має власну «територію». На жаль, питання просторового розподілу хроматину в ядрі вивчений поки недостатньо. Відомо, що теломерна (кінцеві) та центромерного (відповідають за зв'язування сестринських хроматид у мітозі) ділянки хромосом закріплені на білках ядерної ламіни.
Ядерна оболонка, ядерна Ламіна і ядерні пори (каріолемми)Від цитоплазми ядро відділене ядерною оболонкою, утвореної за рахунок розширення і злиття один з одним цистерн ендоплазматичної мережі таким чином, що у ядра утворилися подвійні стінки за рахунок оточуючих його вузьких компартментов. Порожнину ядерної оболонки називається люмен або перінуклеарним простором. Внутрішня поверхня ядерної оболонки стелить ядерної ламін, жорсткої білковою структурою, утвореної білками-ламін, до якої прикріплені нитки хромосомної ДНК. Ламіни прикріплюються до внутрішньої мембрані ядерної оболонки за допомогою заякореного в ній трансмембранних білків - рецепторів ламін. У деяких місцях внутрішня і зовнішня мембрани ядерної оболонки зливаються і утворюють так звані ядерні пори, через які відбувається матеріальний обмін між ядром і цитоплазмою. Пора не є діркою в ядрі, а має складну структуру, організовану кількома десятками спеціалізованих білків - нуклеопорінов. Під електронним мікроскопом вона видна як вісім пов'язаних між собою білкових гранул з зовнішньої і стільки ж з внутрішньої сторони ядерної оболонки.
Ядерце. Ядерце знаходиться усередині ядра, і не має власної мембранної оболонки, однак добре помітно під світловим і електронним мікроскопом. Основною функцією ядерця є синтез рибосом. У геномі клітини є спеціальні ділянки, так звані ядерцеві організатори, які містять гени рибосомної РНК (рРНК), навколо яких і формуються ядерця. У полісом відбувається синтез рРНК РНК полімеразою I, її дозрівання, зборка рибосомних субчастиц. У полісом локалізуються білки, що беруть участь в цих процесах. Деякі з цих білків мають спеціальну послідовність - сигнал ядерцевих локалізації (NoLS, від англ. Nucleolus Localization Signal). Слід зазначити, найвища концентрація білка в клітині спостерігається саме в полісом. У цих структурах було локалізовано близько 600 видів різних білків, причому вважається, що лише невелика їх частина дійсно необхідна для здійснення ядерцевих функцій, а інші потрапляють туди неспецифічно.
Під електронним мікроскопом в полісом виділяють кілька субкомпартментов. Так звані Фібрилярні центри оточені ділянками щільного фібрилярного компонента, де і відбувається синтез рРНК. Зовні від щільного фібрилярного компонента розташований гранулярний компонент, що представляє собою скупчення дозріваючих рибосомних субчастиц
ядерний матрикс. Ядерним матриксом деякі дослідники називають нерозчинний внутрішньоядерної каркас. Вважається, що матрикс побудований переважно з негістонових білків, що формують складну розгалужену мережу, що сполучається з ядерної ламін. Можливо, ядерний матрикс бере участь у формуванні функціональних доменів хроматину. У геномі клітини є спеціальні незначущі А-Т-багаті ділянки прикріплення до ядерного матриксу (англ. S / MAR - Matrix / Scaffold Attachment Regions), службовці, як передбачається, для заякоріванню петель хроматину на білках ядерного матриксу. Втім, не всі дослідники визнають існування ядерного матриксу.
43. Ген— структурна і функціональна одиниця спадковості живих організмів. Геном є послідовність ДНК, задаючу послідовність певного поліпептиду або функціональної РНК. Гени визначають спадкові ознаки організмів, що передаються від батьків потомству при розмноженні. При цьому деякі органели (мітохондрії, пластиди) мають власну, визначаючу їх ознаки, ДНК, що не входить в геном організму.
Транскриптон —оперон, транскриптон. Ділянка бактерійної хромосоми, що містить декілька структурних генів, транскрибіруємих з утворенням однієї поліцистронною молекулою мРНК. транскриптон — кодуюча і операторна частини гена.
Цистрон —позначає ділянку ДНК, відповідальну за синтез певного білка. В прокаріот гени, що виконують схожі метаболічні функції, часто розташовуються у функціональні одиниці, звані оперонами і їх експресія регулюється спільно.