
- •БиооргаНическая химия
- •Содержание
- •1. Строение и номенклатура органических соединений. Химическая связь. Электронные эффекты
- •1.1 Введение
- •1.2 Теории строения органических соединений
- •Основные положения теории строения органических соединений а.М. Бутлерова
- •Алкены Алкадиены Алкины
- •1.4 Номенклатура органических соединений
- •1.5 Изомерия органических соединений
- •1.6 Электронное строение атома углерода, гибридизация
- •1.7 Сопряженные системы
- •1.8 Электронные эффекты (индуктивный и мезомерный)
- •1.9 Кислотность и основность органических соединений
- •2. Общая характеристика реакций органических соединений.
- •2.1 Общая характеристика химических реакций
- •2.2 Радикальные реакции
- •2.3 Реакции электрофильного присоединения
- •2.5 Нуклеофильные реакции
- •2.6 Окислительно-восстановительные реакции (овр)
- •3. Поли- и гетерофункциональные соединения, участвующие в процессах жизнедеятельности
- •3.5. Классы гетерофункциональных соединений
- •3.6 Гетерофункциональные производные бензола как лекарственные средства
- •4. Биологически важные гетероциклические соединения
- •5. Аминокислоты, пептиды, белки
- •5.3 Пептиды.
- •5.5 Пространственное строение полипептидов и белков
- •6. Углеводы: моно, ди- и полисахариды
- •6.4 Олиго- и полисахариды
- •7. Нуклеотиды и нуклеиновые кислоты
- •7.1. Нуклеозиды.
- •7.2. Нуклеотиды.
- •8. Липиды и низкомолекулярные биорегуляторы
- •8. 1 Простые омыляемые липиды
- •8.2. Сложные омыляемые липиды
- •8.3 Неомыляемые липиды или низкомолекулярные биорегуляторы
- •9. Практикум лабораторный
- •9.1. Правила техники безопасности при работе в химической лаборатории
- •9.2. Общие закономерности реакционной способности органических соединений
- •3. Строение и свойства биополимеров
- •Литература
- •Биоорганическая химия Учебное пособие
1.6 Электронное строение атома углерода, гибридизация
Для валентного электронного слоя атома С, находящегося в главной подгруппе четвёртой группы второго периода Периодической таблицы Д.И. Менделеева главное квантовое число n = 2, побочное (орбитальное) квантовое число l = 0 (s-орбиталь) и 1 (р-орбиталь); магнитное квантовое число m = 0 (при l = 0) и –1, 0, 1 (при l = 1).
В возбуждённом состоянии на внешнем электронном слое атома С по одному электрону находится на одной s-орбитали и трёх р-орбиталях. Для алканов характерна sр3- гибридизация (участвуют все 4 атомные орбитали внешнего электронного уровня). В непредельных соединениях одна или две негибридизованные р-орбитали участвуют в образовании -связей, при этом тип гибридизации атома углерода – sр2 для алкенов и sр для алкинов.
Гибридные орбитали алканов располагаются в пространстве симметрично и направлены к вершинам тетраэдра. Связь С–Н образуется перекрыванием s-орбитали атома Н и гибридизованной орбитали атома С, связь С–С образуется за счет перекрывания 2-х гибридизованных орбиталей (направление связи – по оси между атомами). Это - связь.
Свойства -связи:
– высокая прочность и относительная химическая инертность;
– максимум электронной плотности расположен симметрично относительно ос, соединяющей атомы, поэтому возможно свободное вращение вдоль этой оси без изменения перекрывания орбиталей (конформеры);
– длина связи 0,154 нм; угол между направлениями орбиталей 109,5;
– электроотрицательность атома С в sр3-гибридном состоянии 2,51.
Атом углерода, связанный двойной связью с другим атомом углерода, находится в состоянии sр2-гибридизации (одна негибридизованная р-орбиталь образует -связь, в гибридизации участвуют 1s- и 2 р-орбитали внешнего электронного уровня). Гибридные орбитали располагаются в пространстве симметрично в одной плоскости, содержащей ядра С. Оставшаяся негибридизированная р-орбиталь ориентирована перпендикулярно этой плоскости. Связь С–Н образуется перекрыванием s-орбитали атома Н и гибридизованной орбитали атома С. Связь С–С образуется за счет перекрывания 2-х гибридизованных орбиталей (направление – по оси между атомами, в плоскости молекулы). Это -связь. Две негибридизованные р-орбитали перекрываются выше и ниже плоскости молекулы – образуется -связь.
Отличие двойной связи от одинарной:
– расстояние между атомами углерода при двойной связи меньше, чем при одинарной (0,134 нм); угол между гибридными орбиталями 120;
– электроотрицательность гибридизованного атома углерода 2,69;
– затрудненное вращение вокруг линии, соединяющей атомы углерода;
– двойная связь более прочна, т.к. увеличивается электронная плотность на связывающих молекулярных орбиталях между атомами углерода (так, термическая стойкость этилена выше, чем этана);
– высокая реакционная способность -связи, что объясняется большей подвижностью электронов вне плоскости молекулы;
– повышенная электронная плотность по сравнению с одинарной связью, причем на периферии молекулы. Это приводит к тому, что к двойной связи притягиваются положительно заряженные ионы или полярные молекулы своим положительным полюсом.
Связи С–Н в ацетилене относятся к числу -связей, образованных путем перекрывания s-орбитали водорода с гибридизованной sp-орбиталью углерода; в молекуле имеется одна углерод-углеродная -связь (образованная перекрыванием двух гибридизованных sp-орбиталей углерода) и две углерод-углеродные -связи (результат перекрывания двух взаимно перпендикулярных пар негибридизованных р-орбиталей (ру и рz)атомов углерода).
Свойства тройной связи:
– атомы углерода, связанные тройной связью, имеют электроотрицательность 2,75;
– длина СС-связи составляет 0,120 нм;
– валентные углы в ацетилене равны 180° и молекула имеет линейную конфигурацию, что делает невозможной цис-транс-изомерию при тройной связи;
– связь сильно поляризована, т.к. в sр- гибридной форме углеродный атом сильнее удерживает электроны, чем в sр2 и sр3 – гибридных формах; следовательно; электронная пара СН-связи в молекуле ацетилена ближе у ядру С, чем в случае этилена, атом Н более подвижен, обладает слабыми кислотными свойствами (в отличие от алканов и алкенов).